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Hybridoma ? 3 1 sample 1 214 Mouse 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Hybridoma ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A3Q3ANV4_CHICK A0A3Q3ANV4 ? 1 ;MTLTEKLRERISRAFYNHGLLCASYPIPIILFTGLCILACCYPLLKLPLPGTGPVEFSTPVKDYFPPSPDVVSQQGDLSE RPDWYVGAPVAYIQQIFVKATVSPWQKNFLAVDVFRSPLSRVFQLVEEIRNHALRDSSGVKSLEEVCLQVTDLLPGLKKL RNLLPEHGCLLLSPGNFWQNDRERFNADPDIIKTIHQHEPKALQTSATLKDLLFGLPGKYSGVNLYNRKRVVSYTVTLGL QRYDSRFLSSLRSRLKLLHPSPNCTLREDSIVHVHFKEEIGIAELIPLVTTYIILFAYIYFSTRKIDMVKSKWGLALAAV VTVLSSLLMSVGLCTLFGLTPTLNGGEIFPYLVVVIGLENVLVLTKSVVSTPVDLEVKLRIAQGLSNESWSIMKNMATEL GIILIGYFTLVPAIQEFCLFAVVGLVSDFFLQMLFFTTVLSIDIRRMELADLNKRLPAEACLPPAKPASRSQRYERQPAV RPATPHTITLQPSSFRNLRLPKRLRVIYFFARTRLAQRLIMAGTVIWIGILVYTDPAGLRTYLTSQVTEQSPLGEAGLPP MPVPGGVLPAGDPKIDLSVFPSDPIQLSENQTQQREQQAGLEPLGRLETNQHSWAQGPEGRGNGQTELGTEAEVTWGAED EEIWRKLSFRHWPSLFSYYNITLAKRYISILPAIPVTLYLNPQEALEVRHPQEANRYHPFLSSSGGKLNAEAQPDQTSSR LQGHRDVTLYKVAALGLASGILLVLLLFCLYRLLCPKNYGQNGLSHSRRRRGDLPCDDYGYSPPETEIVPLVLRGHLMDI ECLASDGMLLVSCCLVGQIRVWDAQTGDCLTVIPKPRLRRDSSGIFDYQESWDHSPDGKTGLDDSFESSHQLKRMLSPPQ PPLFCDQPDLTSLIDTNFSEQVKVAESEPRLRAVGGRQKEAGYDFSSLVGKVYEEHSTSNCMNFGGLSAPHGQAGFCVGG STARSLGCGSEEGGCGGRRRSLGDESLSGFDKSSPLPSWGGDFESSVWSLDLQGNLIVAGRSNGKLEVWDAIEGTLRSSN DESQSGITALVFLNNRIVAARLNGSLDFFSLETHTSLNHLQFRGAPSRSSIPSSPLFSSSDVIVCQLTHTVSCAHQKPIT ALKAAAGRLVTGSQDHTLRVFRLEDSCCLFTLQGHSGAITAVYIDQTMVLASGGQDGAICLWDVLTGSKVSHMYAHRGDV TSLTCTTSCVISSGLDDVISIWDRSSGIKLYSIQQEMGCGSSLGVISDNLLVTGGQGCVSFWDIGYGDLLQTVYLGKSNE SQPARQILVLENAAIVCNFGSELSLVYVPSVLEKLD ; 1 2 PDB 7LKF 7LKF ? 2 ? 1 3 PDB 7LKF 7LKF ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7LKF A 1 ? 1316 ? A0A3Q3ANV4 1 ? 1316 ? 1 1323 2 2 7LKF H 1 ? 231 ? 7LKF -4 ? 226 ? -4 226 3 3 7LKF L 1 ? 214 ? 7LKF 1 ? 214 ? 1 214 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7LKF ASP A 1317 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1324 1 1 7LKF TYR A 1318 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1325 2 1 7LKF LYS A 1319 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1326 3 1 7LKF ASP A 1320 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1327 4 1 7LKF ASP A 1321 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1328 5 1 7LKF ASP A 1322 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1329 6 1 7LKF ASP A 1323 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 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'expression tag' 1345 22 1 7LKF LYS A 1339 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1346 23 1 7LKF ASP A 1340 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1347 24 1 7LKF ASP A 1341 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1348 25 1 7LKF ASP A 1342 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1349 26 1 7LKF ASP A 1343 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1350 27 1 7LKF LYS A 1344 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1351 28 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7LKF _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 47.01 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7LKF _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4242 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.589 ? 5769 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 20.570 ? 575 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.046 ? 639 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 737 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7LKF _struct.title 'WT Chicken Scap L1-L7 / Fab 4G10 complex focused refinement' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7LKF _struct_keywords.text 'Cholesterol, LIPID BINDING PROTEIN, SREBP' _struct_keywords.pdbx_keywords 'LIPID BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 110 ? VAL A 114 ? LEU A 110 VAL A 114 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 PHE A 115 ? ARG A 121 ? PHE A 115 ARG A 121 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 121 ? HIS A 132 ? ARG A 121 HIS A 132 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 142 ? VAL A 146 ? SER A 142 VAL A 146 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 LEU A 157 ? ARG A 161 ? LEU A 157 ARG A 161 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 173 ? 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GLU L 79 ILE L 83 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 147 SG ? ? ? 1_555 A CYS 169 SG ? ? A CYS 147 A CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 27 SG ? ? ? 1_555 B CYS 101 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? covale1 covale one ? A ASN 660 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 667 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale2 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 61 ? TYR A 64 ? VAL A 61 TYR A 64 AA1 2 SER A 270 ? HIS A 275 ? SER A 270 HIS A 275 AA1 3 TYR A 667 ? ILE A 670 ? TYR A 674 ILE A 677 AA1 4 TYR A 92 ? VAL A 102 ? TYR A 92 VAL A 102 AA1 5 VAL A 231 ? LEU A 240 ? VAL A 231 LEU A 240 AA1 6 LEU A 171 ? LEU A 172 ? LEU A 171 LEU A 172 AA2 1 VAL A 61 ? TYR A 64 ? VAL A 61 TYR A 64 AA2 2 SER A 270 ? HIS A 275 ? SER A 270 HIS A 275 AA2 3 TYR A 667 ? ILE A 670 ? TYR A 674 ILE A 677 AA2 4 TYR A 92 ? VAL A 102 ? TYR A 92 VAL A 102 AA2 5 ILE A 674 ? LEU A 680 ? ILE A 681 LEU A 687 AA3 1 GLN A 149 ? VAL A 150 ? GLN A 149 VAL A 150 AA3 2 GLY A 168 ? CYS A 169 ? GLY A 168 CYS A 169 AA4 1 GLN B 8 ? GLN B 11 ? GLN H 3 GLN H 6 AA4 2 VAL B 23 ? SER B 30 ? VAL H 18 SER H 25 AA4 3 THR B 83 ? LEU B 88 ? THR H 78 LEU H 83 AA4 4 ALA B 73 ? ASP B 78 ? ALA H 68 ASP H 73 AA5 1 GLU B 15 ? VAL B 17 ? GLU H 10 VAL H 12 AA5 2 THR B 119 ? VAL B 123 ? THR H 114 VAL H 118 AA5 3 ALA B 97 ? ARG B 103 ? ALA H 92 ARG H 98 AA5 4 ILE B 39 ? ARG B 45 ? ILE H 34 ARG H 40 AA5 5 GLY B 49 ? ILE B 56 ? GLY H 44 ILE H 51 AA5 6 THR B 63 ? TYR B 65 ? THR H 58 TYR H 60 AA6 1 MET C 4 ? GLN C 6 ? MET L 4 GLN L 6 AA6 2 VAL C 19 ? ALA C 25 ? VAL L 19 ALA L 25 AA6 3 ASP C 70 ? ILE C 75 ? ASP L 70 ILE L 75 AA6 4 PHE C 62 ? SER C 67 ? PHE L 62 SER L 67 AA7 1 SER C 10 ? ALA C 13 ? SER L 10 ALA L 13 AA7 2 THR C 102 ? ILE C 106 ? THR L 102 ILE L 106 AA7 3 THR C 85 ? GLN C 90 ? THR L 85 GLN L 90 AA7 4 LEU C 33 ? GLN C 38 ? LEU L 33 GLN L 38 AA7 5 VAL C 44 ? TYR C 49 ? VAL L 44 TYR L 49 AA7 6 ARG C 53 ? LEU C 54 ? ARG L 53 LEU L 54 AA8 1 SER C 10 ? ALA C 13 ? SER L 10 ALA L 13 AA8 2 THR C 102 ? ILE C 106 ? THR L 102 ILE L 106 AA8 3 THR C 85 ? GLN C 90 ? THR L 85 GLN L 90 AA8 4 THR C 97 ? PHE C 98 ? THR L 97 PHE L 98 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ASP A 63 ? N ASP A 63 O HIS A 273 ? O HIS A 273 AA1 2 3 N VAL A 272 ? N VAL A 272 O ILE A 670 ? O ILE A 677 AA1 3 4 O SER A 669 ? O SER A 676 N ILE A 93 ? N ILE A 93 AA1 4 5 N TYR A 92 ? N TYR A 92 O LEU A 240 ? O LEU A 240 AA1 5 6 O THR A 237 ? O THR A 237 N LEU A 172 ? N LEU A 172 AA2 1 2 N ASP A 63 ? N ASP A 63 O HIS A 273 ? O HIS A 273 AA2 2 3 N VAL A 272 ? N VAL A 272 O ILE A 670 ? O ILE A 677 AA2 3 4 O SER A 669 ? O SER A 676 N ILE A 93 ? N ILE A 93 AA2 4 5 N LYS A 99 ? N LYS A 99 O VAL A 676 ? O VAL A 683 AA3 1 2 N VAL A 150 ? N VAL A 150 O GLY A 168 ? O GLY A 168 AA4 1 2 N GLN B 8 ? N GLN H 3 O SER B 30 ? O SER H 25 AA4 2 3 N CYS B 27 ? N CYS H 22 O ALA B 84 ? O ALA H 79 AA4 3 4 O THR B 83 ? O THR H 78 N ASP B 78 ? N ASP H 73 AA5 1 2 N GLU B 15 ? N GLU H 10 O THR B 120 ? O THR H 115 AA5 2 3 O LEU B 121 ? O LEU H 116 N ALA B 97 ? N ALA H 92 AA5 3 4 O VAL B 98 ? O VAL H 93 N GLN B 44 ? N GLN H 39 AA5 4 5 N LYS B 43 ? N LYS H 38 O GLU B 51 ? O GLU H 46 AA5 5 6 N ARG B 55 ? N ARG H 50 O ARG B 64 ? O ARG H 59 AA6 1 2 N THR C 5 ? N THR L 5 O ARG C 24 ? O ARG L 24 AA6 2 3 N CYS C 23 ? N CYS L 23 O TYR C 71 ? O TYR L 71 AA6 3 4 O SER C 72 ? O SER L 72 N SER C 65 ? N SER L 65 AA7 1 2 N ALA C 13 ? N ALA L 13 O GLU C 105 ? O GLU L 105 AA7 2 3 O THR C 102 ? O THR L 102 N TYR C 86 ? N TYR L 86 AA7 3 4 O THR C 85 ? O THR L 85 N GLN C 38 ? N GLN L 38 AA7 4 5 N TRP C 35 ? N TRP L 35 O LEU C 47 ? O LEU L 47 AA7 5 6 N TYR C 49 ? N TYR L 49 O ARG C 53 ? O ARG L 53 AA8 1 2 N ALA C 13 ? N ALA L 13 O GLU C 105 ? O GLU L 105 AA8 2 3 O THR C 102 ? O THR L 102 N TYR C 86 ? N TYR L 86 AA8 3 4 N GLN C 90 ? N GLN L 90 O THR C 97 ? O THR L 97 # _atom_sites.entry_id 7LKF _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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'Tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id _em_entity_assembly_molwt.id _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag _em_entity_assembly_molwt.units _em_entity_assembly_molwt.value 1 1 NO ? ? 1 2 NO MEGADALTONS 0.172 1 3 NO MEGADALTONS 0.05 3 1 ? ? ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 2 ? ? 9031 ? ? 'Gallus gallus' ? ? 2 3 ? ? 10090 ? ? 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RELION 3.1 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 5 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R35GM116387 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R01GM136976 2 'National Institutes of Health/National Heart, Lung, and Blood Institute (NIH/NHLBI)' 'United States' P01HL020948 3 'Welch Foundation' 'United States' I-1770 4 'Welch Foundation' 'United States' I-1793 5 'Welch Foundation' 'United States' I-1944 6 'Mallinckrodt Foundation' 'United States' ? 7 'Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT)' 'United States' RR160082 8 'Leducq Foundation' France 19CVD04 9 'American Heart Association' 'United States' 18POST34080141 10 'Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT)' 'United States' RP170644 11 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 4 NAG 1 B NAG 1 A NAG 712 n D 4 NAG 2 B NAG 2 A NAG 713 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #