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;PAMTLTEKLRERISRAFYNHGLLCASYPIPIILFTGLCILACCYPLLKLPLPGTGPVEFSTPVKDYFPPSPDVVSQQGDL SERPDWYVGAPVAYIQQIFVKATVSPWQKNFLAVDVFRSPLSRVFQLVEEIRNHALRDSSGVKSLEEVCLQVTDLLPGLK KLRNLLPEHGCLLLSPGNFWQNDRERFNADPDIIKTIHQHEPKALQTSATLKDLLFGLPGKYSGVNLYNRKRVVSYTVTL GLQRYDSRFLSSLRSRLKLLHPSPNCTLREDSIVHVHFKEEIGIAELIPLVTTYIILFAYIYFSTRKIDMVKSKWGLALA AVVTVLSSLLMSVGLCTLFGLTPTLNGGEIFPYLVVVIGLENVLVLTKSVVSTPVDLEVKLRIAQGLSNESWSIMKNMAT ELGIILIGYFTLVPAIQEFCLFAVVGLVSVFFLQMLFFTTVLSIDIRRMELADLNKRLPAEACLPPAKPASRSQRYERQP AVRPATPHTITLQPSSFRNLRLPKRLRVIYFFARTRLAQRLIMAGTVIWIGILVYTDPAGLRTYLTSQVTEQSPLGEAGL PPMPVPGGVLPAGDPKIDLSVFPSDPIQLSENQTQQREQQAGLEPLGRLETNQHSWAQGPEGRGNGQTELGTEAEVTWGA EDEEIWRKLSFRHWPSLFSYYNITLAKRYISILPAIPVTLYLNPQEALEVRHPQEANRYHPFLSSSGGKLNAEAQPDQTS SRLQGHRDVTLYKVAALGLASGILLVLLLFCLYRLLCPKNYGQNGLSHSRRRRGDLPCDDYGYSPPETEIVPLVLRGHLM DIECLASDGMLLVSCCLVGQIRVWDAQTGDCLTVIPKPRLRRDSSGIFDYQESWDHSPDGKTGLDDSFESSHQLKRMLSP PQPPLFCDQPDLTSLIDTNFSEQVKVAESEPRLRAVGGRQKEAGYDFSSLVGKVYEEHSTSNCMNFGGLSAPHGQAGFCV 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;DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDIRNYLNWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQ EDIATYFCQQTNTLPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDIRNYLNWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQ EDIATYFCQQTNTLPWTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; L ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 PRO n 1 2 ALA n 1 3 MET n 1 4 THR n 1 5 LEU n 1 6 THR n 1 7 GLU n 1 8 LYS n 1 9 LEU n 1 10 ARG n 1 11 GLU n 1 12 ARG n 1 13 ILE n 1 14 SER n 1 15 ARG n 1 16 ALA n 1 17 PHE n 1 18 TYR n 1 19 ASN n 1 20 HIS n 1 21 GLY n 1 22 LEU n 1 23 LEU n 1 24 CYS n 1 25 ALA n 1 26 SER n 1 27 TYR n 1 28 PRO n 1 29 ILE n 1 30 PRO n 1 31 ILE n 1 32 ILE n 1 33 LEU n 1 34 PHE n 1 35 THR n 1 36 GLY n 1 37 LEU n 1 38 CYS n 1 39 ILE n 1 40 LEU n 1 41 ALA n 1 42 CYS n 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'Hybridoma cell line' ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A3Q3ANV4_CHICK A0A3Q3ANV4 ? 1 ;MTLTEKLRERISRAFYNHGLLCASYPIPIILFTGLCILACCYPLLKLPLPGTGPVEFSTPVKDYFPPSPDVVSQQGDLSE RPDWYVGAPVAYIQQIFVKATVSPWQKNFLAVDVFRSPLSRVFQLVEEIRNHALRDSSGVKSLEEVCLQVTDLLPGLKKL RNLLPEHGCLLLSPGNFWQNDRERFNADPDIIKTIHQHEPKALQTSATLKDLLFGLPGKYSGVNLYNRKRVVSYTVTLGL QRYDSRFLSSLRSRLKLLHPSPNCTLREDSIVHVHFKEEIGIAELIPLVTTYIILFAYIYFSTRKIDMVKSKWGLALAAV VTVLSSLLMSVGLCTLFGLTPTLNGGEIFPYLVVVIGLENVLVLTKSVVSTPVDLEVKLRIAQGLSNESWSIMKNMATEL GIILIGYFTLVPAIQEFCLFAVVGLVSDFFLQMLFFTTVLSIDIRRMELADLNKRLPAEACLPPAKPASRSQRYERQPAV RPATPHTITLQPSSFRNLRLPKRLRVIYFFARTRLAQRLIMAGTVIWIGILVYTDPAGLRTYLTSQVTEQSPLGEAGLPP MPVPGGVLPAGDPKIDLSVFPSDPIQLSENQTQQREQQAGLEPLGRLETNQHSWAQGPEGRGNGQTELGTEAEVTWGAED EEIWRKLSFRHWPSLFSYYNITLAKRYISILPAIPVTLYLNPQEALEVRHPQEANRYHPFLSSSGGKLNAEAQPDQTSSR LQGHRDVTLYKVAALGLASGILLVLLLFCLYRLLCPKNYGQNGLSHSRRRRGDLPCDDYGYSPPETEIVPLVLRGHLMDI ECLASDGMLLVSCCLVGQIRVWDAQTGDCLTVIPKPRLRRDSSGIFDYQESWDHSPDGKTGLDDSFESSHQLKRMLSPPQ PPLFCDQPDLTSLIDTNFSEQVKVAESEPRLRAVGGRQKEAGYDFSSLVGKVYEEHSTSNCMNFGGLSAPHGQAGFCVGG STARSLGCGSEEGGCGGRRRSLGDESLSGFDKSSPLPSWGGDFESSVWSLDLQGNLIVAGRSNGKLEVWDAIEGTLRSSN DESQSGITALVFLNNRIVAARLNGSLDFFSLETHTSLNHLQFRGAPSRSSIPSSPLFSSSDVIVCQLTHTVSCAHQKPIT ALKAAAGRLVTGSQDHTLRVFRLEDSCCLFTLQGHSGAITAVYIDQTMVLASGGQDGAICLWDVLTGSKVSHMYAHRGDV TSLTCTTSCVISSGLDDVISIWDRSSGIKLYSIQQEMGCGSSLGVISDNLLVTGGQGCVSFWDIGYGDLLQTVYLGKSNE SQPARQILVLENAAIVCNFGSELSLVYVPSVLEKLD ; 1 2 PDB 7LKH 7LKH ? 2 ? 1 3 PDB 7LKH 7LKH ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7LKH A 3 ? 1318 ? A0A3Q3ANV4 1 ? 1316 ? 1 1323 2 2 7LKH H 1 ? 231 ? 7LKH -4 ? 226 ? -4 226 3 3 7LKH L 1 ? 214 ? 7LKH 1 ? 214 ? 1 214 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7LKH PRO A 1 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' -1 1 1 7LKH ALA A 2 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 0 2 1 7LKH VAL A 430 ? UNP A0A3Q3ANV4 ASP 428 'engineered mutation' 435 3 1 7LKH ASP A 1319 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1324 4 1 7LKH TYR A 1320 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1325 5 1 7LKH LYS A 1321 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1326 6 1 7LKH ASP A 1322 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1327 7 1 7LKH ASP A 1323 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1328 8 1 7LKH ASP A 1324 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1329 9 1 7LKH ASP A 1325 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1330 10 1 7LKH LYS A 1326 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1331 11 1 7LKH GLY A 1327 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1332 12 1 7LKH SER A 1328 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1333 13 1 7LKH ASP A 1329 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1334 14 1 7LKH TYR A 1330 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1335 15 1 7LKH LYS A 1331 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1336 16 1 7LKH ASP A 1332 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1337 17 1 7LKH ASP A 1333 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1338 18 1 7LKH ASP A 1334 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1339 19 1 7LKH ASP A 1335 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1340 20 1 7LKH LYS A 1336 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1341 21 1 7LKH GLY A 1337 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1342 22 1 7LKH SER A 1338 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1343 23 1 7LKH ASP A 1339 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1344 24 1 7LKH TYR A 1340 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1345 25 1 7LKH LYS A 1341 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1346 26 1 7LKH ASP A 1342 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1347 27 1 7LKH ASP A 1343 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1348 28 1 7LKH ASP A 1344 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1349 29 1 7LKH ASP A 1345 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1350 30 1 7LKH LYS A 1346 ? UNP A0A3Q3ANV4 ? ? 'expression tag' 1351 31 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7LKH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7LKH _struct.title 'Chicken Scap D435V L1-L7 domain / Fab complex focused map' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7LKH _struct_keywords.text 'Cholesterol, LIPID BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'LIPID BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 112 ? VAL A 116 ? LEU A 110 VAL A 114 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 PHE A 117 ? ARG A 123 ? PHE A 115 ARG A 121 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 123 ? HIS A 134 ? ARG A 121 HIS A 132 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 144 ? VAL A 148 ? SER A 142 VAL A 146 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 LEU A 159 ? ARG A 163 ? LEU A 157 ARG A 161 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 175 ? GLN A 181 ? SER A 173 GLN A 179 5 ? 7 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 183 ? ALA A 189 ? ASP A 181 ALA A 187 1 ? 7 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP A 192 ? GLN A 199 ? ASP A 190 GLN A 197 1 ? 8 HELX_P HELX_P9 AA9 THR A 210 ? GLY A 217 ? THR A 208 GLY A 215 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP A 246 ? HIS A 261 ? ASP A 244 HIS A 259 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 639 ? GLU A 643 ? GLY A 644 GLU A 648 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU A 644 ? LEU A 649 ? GLU A 649 LEU A 654 5 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 ARG A 652 ? TYR A 660 ? ARG A 657 TYR A 665 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN A 683 ? VAL A 690 ? ASN A 688 VAL A 695 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 HIS A 692 ? ALA A 696 ? HIS A 697 ALA A 701 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS B 33 ? ASP B 37 ? LYS H 28 ASP H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO B 67 ? GLN B 70 ? PRO H 62 GLN H 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 AB9 THR B 92 ? THR B 96 ? THR H 87 THR H 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 GLU C 79 ? ILE C 83 ? GLU L 79 ILE L 83 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 149 SG ? ? ? 1_555 A CYS 171 SG ? ? A CYS 147 A CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 27 SG ? ? ? 1_555 B CYS 101 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? covale1 covale one ? A ASN 662 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 667 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale2 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 63 ? TYR A 66 ? VAL A 61 TYR A 64 AA1 2 SER A 272 ? HIS A 277 ? SER A 270 HIS A 275 AA1 3 TYR A 669 ? ILE A 672 ? TYR A 674 ILE A 677 AA1 4 TYR A 94 ? VAL A 104 ? TYR A 92 VAL A 102 AA1 5 VAL A 234 ? LEU A 242 ? VAL A 232 LEU A 240 AA1 6 LEU A 173 ? LEU A 174 ? LEU A 171 LEU A 172 AA2 1 VAL A 63 ? TYR A 66 ? VAL A 61 TYR A 64 AA2 2 SER A 272 ? HIS A 277 ? SER A 270 HIS A 275 AA2 3 TYR A 669 ? ILE A 672 ? TYR A 674 ILE A 677 AA2 4 TYR A 94 ? VAL A 104 ? TYR A 92 VAL A 102 AA2 5 ILE A 676 ? LEU A 682 ? ILE A 681 LEU A 687 AA3 1 GLN A 151 ? VAL A 152 ? GLN A 149 VAL A 150 AA3 2 GLY A 170 ? CYS A 171 ? GLY A 168 CYS A 169 AA4 1 GLN B 8 ? GLN B 11 ? GLN H 3 GLN H 6 AA4 2 VAL B 23 ? SER B 30 ? VAL H 18 SER H 25 AA4 3 THR B 83 ? LEU B 88 ? THR H 78 LEU H 83 AA4 4 ALA B 73 ? ASP B 78 ? ALA H 68 ASP H 73 AA5 1 GLU B 15 ? VAL B 17 ? GLU H 10 VAL H 12 AA5 2 THR B 119 ? VAL B 123 ? THR H 114 VAL H 118 AA5 3 ALA B 97 ? ARG B 103 ? ALA H 92 ARG H 98 AA5 4 ILE B 39 ? GLN B 44 ? 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'Tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id _em_entity_assembly_molwt.id _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag _em_entity_assembly_molwt.units _em_entity_assembly_molwt.value 1 1 NO ? ? 1 2 NO MEGADALTONS 0.172 1 3 NO MEGADALTONS 0.05 3 1 ? ? ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 2 ? ? 9031 ? ? 'Gallus gallus' ? ? 2 3 ? ? 10090 ? ? 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RELION 3.1 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 5 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R35GM116387 1 'National Institutes of Health/National Heart, Lung, and Blood Institute (NIH/NHLBI)' 'United States' P01HL020948 2 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R01GM136976 3 'Welch Foundation' 'United States' I-1770 4 'Welch Foundation' 'United States' I-1793 5 'Welch Foundation' 'United States' I-1944 6 'Mallinckrodt Foundation' 'United States' ? 7 'Leducq Foundation' France 19CVD04 8 'Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT)' 'United States' RR160082 9 'Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT)' 'United States' RP170644 10 'American Heart Association' 'United States' 18POST34080141 11 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 4 NAG 1 B NAG 1 A NAG 712 n D 4 NAG 2 B NAG 2 A NAG 713 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #