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_citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'McCallum, M.' 1 ? primary 'De Marco, A.' 2 ? primary 'Lempp, F.A.' 3 ? primary 'Tortorici, M.A.' 4 ? primary 'Pinto, D.' 5 ? primary 'Walls, A.C.' 6 ? primary 'Beltramello, M.' 7 ? primary 'Chen, A.' 8 ? primary 'Liu, Z.' 9 ? primary 'Zatta, F.' 10 ? primary 'Zepeda, S.' 11 ? primary 'di Iulio, J.' 12 ? primary 'Bowen, J.E.' 13 ? primary 'Montiel-Ruiz, M.' 14 ? primary 'Zhou, J.' 15 ? primary 'Rosen, L.E.' 16 ? primary 'Bianchi, S.' 17 ? primary 'Guarino, B.' 18 ? primary 'Fregni, C.S.' 19 ? primary 'Abdelnabi, R.' 20 ? primary 'Foo, S.C.' 21 ? primary 'Rothlauf, P.W.' 22 ? primary 'Bloyet, L.M.' 23 ? primary 'Benigni, F.' 24 ? primary 'Cameroni, E.' 25 ? primary 'Neyts, J.' 26 ? primary 'Riva, A.' 27 ? primary 'Snell, G.' 28 ? primary 'Telenti, A.' 29 ? primary 'Whelan, S.P.J.' 30 ? primary 'Virgin, H.W.' 31 ? primary 'Corti, D.' 32 ? primary 'Pizzuto, M.S.' 33 ? primary 'Veesler, D.' 34 ? # loop_ _entity.id 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 ? 6183 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7LXZ _struct.title 'SARS-CoV-2 S/S2M11/S2L28 Global Refinement' _struct.pdbx_descriptor ;Spike glycoprotein, S2M11 Fab Light Chain variable region, S2M11 Fab Heavy Chain variable region, S2L28 Fab Heavy Chain variable region, S2L28 Fab Light Chain variable region ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7LXZ _struct_keywords.text ;Antibody, VIRAL PROTEIN, Structural Genomics, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease, SSGCID, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? 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J CYS 19 SG ? ? ? 1_555 J CYS 87 SG ? ? I CYS 22 I CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf37 disulf ? ? K CYS 15 SG ? ? ? 1_555 K CYS 136 SG ? ? K CYS 15 K CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf38 disulf ? ? K CYS 131 SG ? ? ? 1_555 K CYS 166 SG ? ? K CYS 131 K CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf39 disulf ? ? K CYS 291 SG ? ? ? 1_555 K CYS 301 SG ? ? K CYS 291 K CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf40 disulf ? ? K CYS 336 SG ? ? ? 1_555 K CYS 361 SG ? ? K CYS 336 K CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf41 disulf ? ? K CYS 379 SG ? ? ? 1_555 K CYS 432 SG ? ? K CYS 379 K CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? ? disulf42 disulf ? ? K CYS 391 SG ? ? ? 1_555 K CYS 525 SG ? ? K CYS 391 K CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? ? disulf43 disulf ? ? K CYS 480 SG ? ? ? 1_555 K CYS 488 SG ? ? K CYS 480 K CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf44 disulf ? ? K CYS 538 SG ? ? ? 1_555 K CYS 590 SG ? ? K CYS 538 K CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf45 disulf ? ? K CYS 617 SG ? ? ? 1_555 K CYS 649 SG ? ? K CYS 617 K CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf46 disulf ? ? K CYS 662 SG ? ? ? 1_555 K CYS 671 SG ? ? K CYS 662 K CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf47 disulf ? ? K CYS 738 SG ? ? ? 1_555 K CYS 760 SG ? ? K CYS 738 K CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? ? disulf48 disulf ? ? K CYS 743 SG ? ? ? 1_555 K CYS 749 SG ? ? K CYS 743 K CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? ? disulf49 disulf ? ? K CYS 1032 SG ? ? ? 1_555 K CYS 1043 SG ? ? K CYS 1032 K CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf50 disulf ? ? K CYS 1082 SG ? ? ? 1_555 K CYS 1126 SG ? ? K CYS 1082 K CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf51 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf52 disulf ? ? M CYS 21 SG ? ? ? 1_555 M CYS 95 SG ? ? M CYS 22 M CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf53 disulf ? ? N CYS 22 SG ? ? ? 1_555 N CYS 96 SG ? ? N CYS 22 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf54 disulf ? ? O CYS 19 SG ? ? ? 1_555 O CYS 87 SG ? ? O CYS 22 O CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? ? covale1 covale one ? A ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 17 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? A ASN 122 A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.500 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 149 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 165 A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 282 A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 331 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 343 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? A ASN 603 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? A ASN 616 A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? A ASN 657 A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? A ASN 709 A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 717 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 801 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 1074 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? A ASN 1074 A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? A ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? A ASN 1098 A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? A ASN 1134 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? A ASN 1134 A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? F ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 17 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? F ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? B ASN 61 B NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? F ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? B ASN 122 B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? F ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 149 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? F ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? B ASN 165 B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? F ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? B ASN 234 B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? F ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? B ASN 282 B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? F ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? B ASN 331 B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? F ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? B ASN 343 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? F ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? B ASN 603 B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? F ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? B ASN 616 B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? F ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? B ASN 657 B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? F ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? B ASN 709 B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? F ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 717 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? F ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 801 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? F ASN 1074 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? B ASN 1074 B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? F ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? B ASN 1098 B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? F ASN 1134 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? B ASN 1134 B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? K ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? K ASN 17 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? 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K ASN 343 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? K ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? K ASN 603 K NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? K ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? K ASN 616 K NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? K ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? K ASN 657 K NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? K ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? K ASN 709 K NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? K ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? K ASN 717 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? K ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? K ASN 801 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? K ASN 1074 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? K ASN 1074 K NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? K ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? K ASN 1098 K NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? K ASN 1134 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? K ASN 1134 K NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale55 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? ? covale56 covale both ? P NAG . O6 ? ? ? 1_555 P FUC . C1 ? ? P NAG 1 P FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? ? covale57 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale58 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale59 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? ? covale60 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale61 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? ? covale62 covale both ? T NAG . O6 ? ? ? 1_555 T FUC . C1 ? ? T NAG 1 T FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? ? covale63 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? ? covale64 covale both ? U NAG . O6 ? ? ? 1_555 U FUC . C1 ? ? U NAG 1 U FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? ? covale65 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale66 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale67 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? ? covale68 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale69 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? ? covale70 covale both ? Y NAG . O6 ? ? ? 1_555 Y FUC . C1 ? ? Y NAG 1 Y FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? ? covale71 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? ? covale72 covale both ? Z NAG . O6 ? ? ? 1_555 Z FUC . C1 ? ? Z NAG 1 Z FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? ? covale73 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale74 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale75 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale76 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? ? covale77 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? ? covale78 covale both ? DA NAG . O6 ? ? ? 1_555 DA FUC . C1 ? ? d NAG 1 d FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 6 B . ? SER 7 D PRO 7 B ? PRO 8 D 1 -5.90 2 SER 6 G . ? SER 7 C PRO 7 G ? PRO 8 C 1 -5.88 3 SER 6 L . ? SER 7 L PRO 7 L ? 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