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'Cryptophycin 1' ;(3S,6R,10S,13E,16S)-10-[(3-chloro-4-methoxyphenyl)methyl]-6-methyl-3-(2-methylpropyl)-16-{(1S)-1-[(2R,3R)-3-phenyloxiran-2-yl]ethyl}-1,4-dioxa-8,11-diazacyclohexadec-13-ene-2,5,9,12-tetrone ; 'C35 H43 Cl N2 O8' 655.178 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7M18 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7M18 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.003 ? ? 6982 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_angle_d 0.994 ? ? 9495 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_dihedral_angle_d 8.668 ? ? 959 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_chiral_restr 0.046 ? ? 1032 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_plane_restr 0.005 ? ? 1234 'ELECTRON MICROSCOPY' ? # _struct.entry_id 7M18 _struct.title 'HeLa-tubulin in complex with cryptophycin 1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7M18 _struct_keywords.text 'anti-tumor, microtubule, tubulin-rings, polymerization-inhibitor, CELL CYCLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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THR P 80 ? VAL O 74 THR O 80 1 ? 7 HELX_P HELX_P273 BE3 ASN P 102 ? TYR P 108 ? ASN O 102 TYR O 108 1 ? 7 HELX_P HELX_P274 BE4 ILE P 110 ? GLU P 113 ? ILE O 110 GLU O 113 5 ? 4 HELX_P HELX_P275 BE5 ILE P 114 ? CYS P 129 ? ILE O 114 CYS O 129 1 ? 16 HELX_P HELX_P276 BE6 GLY P 144 ? TYR P 161 ? GLY O 144 TYR O 161 1 ? 18 HELX_P HELX_P277 BE7 ALA P 174 ? SER P 178 ? ALA O 174 SER O 178 5 ? 5 HELX_P HELX_P278 BE8 VAL P 182 ? HIS P 192 ? VAL O 182 HIS O 192 1 ? 11 HELX_P HELX_P279 BE9 ASN P 206 ? ASN P 216 ? ASN O 206 ASN O 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P280 BF1 THR P 223 ? ASP P 245 ? THR O 223 ASP O 245 1 ? 23 HELX_P HELX_P281 BF2 ASP P 251 ? VAL P 260 ? ASP O 251 VAL O 260 1 ? 10 HELX_P HELX_P282 BF3 SER P 287 ? PHE P 296 ? SER O 287 PHE O 296 1 ? 10 HELX_P HELX_P283 BF4 ASP P 306 ? GLY P 310 ? ASP O 306 GLY O 310 5 ? 5 HELX_P HELX_P284 BF5 VAL P 324 ? LYS P 336 ? VAL O 324 LYS O 336 1 ? 13 HELX_P HELX_P285 BF6 THR P 381 ? ALA P 383 ? THR O 381 ALA O 383 5 ? 3 HELX_P HELX_P286 BF7 ILE P 384 ? MET P 398 ? ILE O 384 MET O 398 1 ? 15 HELX_P HELX_P287 BF8 PHE P 404 ? GLY P 410 ? PHE O 404 GLY O 410 1 ? 7 HELX_P HELX_P288 BF9 GLY P 416 ? VAL P 435 ? GLY O 416 VAL O 435 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 4 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 2 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 2 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 2 ? AG5 ? 4 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 2 ? AG8 ? 2 ? AG9 ? 2 ? AH1 ? 2 ? AH2 ? 2 ? AH3 ? 2 ? AH4 ? 2 ? AH5 ? 4 ? AH6 ? 4 ? AH7 ? 2 ? AH8 ? 2 ? AH9 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA9 1 2 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB4 1 2 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC4 1 2 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC9 1 2 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD4 1 2 ? parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? parallel AD6 3 4 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD9 1 2 ? parallel AE1 1 2 ? parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? parallel AE4 1 2 ? parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? parallel AE6 3 4 ? parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? parallel AE9 1 2 ? parallel AF1 1 2 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? parallel AF4 1 2 ? parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? parallel AF6 1 2 ? parallel AF6 2 3 ? parallel AF6 3 4 ? parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? parallel AF9 1 2 ? parallel AG1 1 2 ? parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? parallel AG4 1 2 ? parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? parallel AG6 1 2 ? parallel AG6 2 3 ? parallel AG6 3 4 ? parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? parallel AG9 1 2 ? parallel AH1 1 2 ? parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH3 1 2 ? parallel AH4 1 2 ? parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH5 2 3 ? anti-parallel AH5 3 4 ? parallel AH6 1 2 ? parallel AH6 2 3 ? parallel AH6 3 4 ? parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH8 1 2 ? parallel AH9 1 2 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 2 ? 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TYR A 319 ARG A 320 AA9 2 ILE B 355 ? ASN B 356 ? ILE A 355 ASN A 356 AB1 1 ARG C 2 ? GLN C 8 ? ARG D 2 GLN D 8 AB1 2 CYS C 129 ? THR C 136 ? CYS D 129 THR D 136 AB2 1 TYR C 51 ? GLU C 53 ? TYR D 51 GLU D 53 AB2 2 TYR C 59 ? PRO C 61 ? TYR D 59 PRO D 61 AB3 1 VAL C 169 ? VAL C 170 ? VAL D 169 VAL D 170 AB3 2 ILE C 202 ? ASP C 203 ? ILE D 202 ASP D 203 AB4 1 THR C 199 ? TYR C 200 ? THR D 199 TYR D 200 AB4 2 PHE C 265 ? PHE C 266 ? PHE D 265 PHE D 266 AB5 1 GLY C 269 ? PHE C 270 ? GLY D 269 PHE D 270 AB5 2 SER C 364 ? ILE C 368 ? SER D 364 ILE D 368 AB5 3 ALA C 314 ? ARG C 318 ? ALA D 314 ARG D 318 AB5 4 ALA C 352 ? CYS C 354 ? ALA D 352 CYS D 354 AB6 1 GLU D 3 ? HIS D 8 ? GLU C 3 HIS C 8 AB6 2 LEU D 132 ? PHE D 138 ? LEU C 132 PHE C 138 AB6 3 LEU D 167 ? PHE D 169 ? LEU C 167 PHE C 169 AB6 4 CYS D 200 ? ALA D 201 ? CYS C 200 ALA C 201 AB7 1 PHE D 53 ? SER D 54 ? PHE C 53 SER C 54 AB7 2 VAL D 62 ? PRO D 63 ? VAL C 62 PRO C 63 AB8 1 ILE D 171 ? TYR D 172 ? ILE C 171 TYR C 172 AB8 2 VAL D 204 ? ASP D 205 ? VAL C 204 ASP C 205 AB9 1 TYR D 319 ? ARG D 320 ? TYR C 319 ARG C 320 AB9 2 ILE D 355 ? ASN D 356 ? ILE C 355 ASN C 356 AC1 1 ARG E 2 ? GLN E 8 ? ARG F 2 GLN F 8 AC1 2 CYS E 129 ? THR E 136 ? CYS F 129 THR F 136 AC2 1 TYR E 51 ? GLU E 53 ? TYR F 51 GLU F 53 AC2 2 TYR E 59 ? PRO E 61 ? TYR F 59 PRO F 61 AC3 1 VAL E 169 ? VAL E 170 ? VAL F 169 VAL F 170 AC3 2 ILE E 202 ? ASP E 203 ? ILE F 202 ASP F 203 AC4 1 THR E 199 ? TYR E 200 ? THR F 199 TYR F 200 AC4 2 PHE E 265 ? PHE E 266 ? PHE F 265 PHE F 266 AC5 1 GLY E 269 ? PHE E 270 ? GLY F 269 PHE F 270 AC5 2 SER E 364 ? ILE E 368 ? SER F 364 ILE F 368 AC5 3 ALA E 314 ? ARG E 318 ? ALA F 314 ARG F 318 AC5 4 ALA E 352 ? CYS E 354 ? ALA F 352 CYS F 354 AC6 1 GLU F 3 ? HIS F 8 ? GLU E 3 HIS E 8 AC6 2 LEU F 132 ? PHE F 138 ? LEU E 132 PHE E 138 AC6 3 LEU F 167 ? PHE F 169 ? LEU E 167 PHE E 169 AC6 4 CYS F 200 ? ALA F 201 ? CYS E 200 ALA E 201 AC7 1 PHE F 53 ? SER F 54 ? PHE E 53 SER E 54 AC7 2 VAL F 62 ? PRO F 63 ? VAL E 62 PRO E 63 AC8 1 ILE F 171 ? TYR F 172 ? ILE E 171 TYR E 172 AC8 2 VAL F 204 ? ASP F 205 ? VAL E 204 ASP E 205 AC9 1 TYR F 319 ? ARG F 320 ? TYR E 319 ARG E 320 AC9 2 ILE F 355 ? ASN F 356 ? ILE E 355 ASN E 356 AD1 1 ARG G 2 ? GLN G 8 ? ARG H 2 GLN H 8 AD1 2 CYS G 129 ? THR G 136 ? CYS H 129 THR H 136 AD2 1 TYR G 51 ? GLU G 53 ? TYR H 51 GLU H 53 AD2 2 TYR G 59 ? PRO G 61 ? TYR H 59 PRO H 61 AD3 1 VAL G 169 ? VAL G 170 ? VAL H 169 VAL H 170 AD3 2 ILE G 202 ? ASP G 203 ? ILE H 202 ASP H 203 AD4 1 THR G 199 ? TYR G 200 ? THR H 199 TYR H 200 AD4 2 PHE G 265 ? PHE G 266 ? PHE H 265 PHE H 266 AD5 1 GLY G 269 ? PHE G 270 ? GLY H 269 PHE H 270 AD5 2 SER G 364 ? ILE G 368 ? SER H 364 ILE H 368 AD5 3 ALA G 314 ? ARG G 318 ? ALA H 314 ARG H 318 AD5 4 ALA G 352 ? CYS G 354 ? ALA H 352 CYS H 354 AD6 1 GLU H 3 ? HIS H 8 ? GLU G 3 HIS G 8 AD6 2 LEU H 132 ? PHE H 138 ? LEU G 132 PHE G 138 AD6 3 LEU H 167 ? PHE H 169 ? 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