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EMD-23636 'other EM volume' PDB . 7M3P unspecified EMDB 'Engineered disulfide cross-linked closed conformation of the Yeast gamma-TuRC(SS)' EMD-23635 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7M2W _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-03-17 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Brilot, A.F.' 1 0000-0001-8548-4224 'Lyon, A.S.' 2 ? 'Zelter, A.' 3 ? 'Viswanath, S.' 4 ? 'Maxwell, A.' 5 ? 'MacCoss, M.J.' 6 0000-0003-1853-0256 'Muller, E.G.' 7 0000-0002-3915-4520 'Sali, A.' 8 0000-0003-0435-6197 'Davis, T.N.' 9 0000-0003-4797-3152 'Agard, D.A.' 10 0000-0003-3512-695X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Elife _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2050-084X _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 10 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'CM1-driven assembly and activation of yeast gamma-tubulin small complex underlies microtubule nucleation.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.7554/eLife.65168 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33949948 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Brilot, A.F.' 1 ? primary 'Lyon, A.S.' 2 ? primary 'Zelter, A.' 3 ? primary 'Viswanath, S.' 4 ? primary 'Maxwell, A.' 5 ? primary 'MacCoss, M.J.' 6 ? primary 'Muller, E.G.' 7 ? primary 'Sali, A.' 8 ? primary 'Davis, T.N.' 9 ? primary 'Agard, D.A.' 10 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Tubulin gamma chain' 52733.340 4 ? 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'fall armyworm' 'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? Sf9 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TBG_YEAST P53378 ? 1 ;MGGEIITLQAGQCGNHVGKFLWSQLAKEHAIGTDGLSQLPDSSTERDDDTKPFFRENSRNKFTPRAIMMDSEPSVIADVE NTFRGFFDPRNTWVASDGASAGNSWANGYDIGTRNQDDILNKIDKEIDSTDNFEGFQLLHSVAGGTGSGLGSNLLEALCD RYPKKILTTYSVFPARSSEVVVQSYNTILALRRLIEDSDATVVFDNASLLNISGKVFRNPNIDLQHTNQLISTIISSVTN SIRFPSYMYSSMSSIYSTLIPSPELHFLSPSFTPFTSDYIHDDIAHKGHSSYDVMLDLLDPSNSLVSTAMNNPTYFNVYN TIIGNVEPRQISRAMTKLQQRIKFPSWSSSAMHVNIGRRSPYLPLQPNENEVSGMMLSNMSTVVNVFENACNTFDKVFAK GAFLNNYNVGDLFQSMQNVQDEFAESREVVQSLMEDYVAAEQDSYLDDVLVDDENMVGELEEDLDADGDHKLV ; 1 2 UNP SPC97_YEAST P38863 ? 2 ;MEIKEVDDRAELLRYTNNIPLLGKLVNHQPLWSTNPKLKSFSLEKISAPDQRRVQEALVVKDLLNVLIGLEGTYIRYFND YEPSDPETPIEFKIAKKMDPSFKTFSRRIVRYGKQYMILTRAYEKWSDTSFGMVLQRFAYEIRRFLEDVYLKTLVERLER DFNKVPNFSIRELEQIINETEVNKQMELLYNIYEEIFREIEERRTNQSSQEDFNNFMDSMKNESSLHLRLMVAFDTTVYP VPKGGAILKIFQQKILENLGDRSSVMFLKKLLNNISQDYCTMLYEWLTQGILNDPYQEFMTYDDLEGKTDNIFDTRDRAW DTQYFIRKDVLLRDCDSEEDKNLLFKMLRTGILLKVVRASLQIPTIPSNSSDITIQEINDFADLMEGSNLELYVDKCYSR ANEIFLKLFFQGYDLINVLKHLQQIFLGYQSGHNVLKFLTKNMGELTKHYRNDNNANYDKLLQNFELERQSENPNNLMRQ LLMIQFDTETLPQVLSHYLQIYPEVPENNSANDDSDPLMHANNFKNMNAILFDELSKERTGAYHGSNLELYTPKSAIYHL KFDINIPYPLNIIISRTCMIKYQIILRYQLVLQYHSRLLDETWMDLNKTPSWKYRGYSHTVKRRIVRATRVLHAKMNHFI KTIMEYFNQNVIDKEVYSLEKCYRNPTLAVAIQNELEGGLTNIMTNRCLSDLIPLQLQIFDIVYKFCKFIKSMRAKLCQL DPVLYEKHKSGMMKTLNEGYRTNNGGQEDVGYQEDAALELIQKLIEYISNASSIFRKCLINFTQELSTEKFDFYDSSSVD AAGIERVLYSIVPPRSASASSQR ; 1 3 UNP SPC98_YEAST P53540 ? 3 ;MELEPTLFGIIEALAPQLLSQSHLQTFVSDVVNLLRSSTKSATQLGPLIDFYKLQSLDSPETTIMWHKIEKFLDALFGIQ NTDDMVKYLSVFQSLLPSNYRAKIVQKSSGLNMENLANHEHLLSPVRAPSIYTEASFENMDRFSERRSMVSSPNRYVPSS TYSSVTLRQLSNPYYVNTIPEEDILKYVSYTLLATTSALFPFDHEQIQIPSKIPNFESGLLHLIFEAGLLYQSLGYKVEK FRMLNISPMKKALIIEISEELQNYTAFVNNLVSSGTVVSLKSLYREIYENIIRLRIYCRFTEHLEELSGDTFLIELNIFK SHGDLTIRKIATNLFNSMISLYYEYLMNWLTKGLLRATYGEFFIAENTDTNGTDDDFIYHIPIEFNQERVPAFIPKELAY KIFMIGKSYIFLEKYCKEVQWTNEFSKKYHVLYQSNSYRGISTNFFEIINDQYSEIVNHTNQILNQKFHYRDVVFALKNI LLMGKSDFMDALIEKANDILATPSDSLPNYKLTRVLQEAVQLSSLRHLMNSPRNSSVINGLDARVLDLGHGSVGWDVFTL DYILYPPLSLVLNVNRPFGRKEYLRIFNFLWRFKKNNYFYQKEMLKSNDIIRSFKKIRGYNPLIRDIINKLSRISILRTQ FQQFNSKMESYYLNCIIEENFKEMTRKLQRTENKSQNQFDLIRLNNGTIELNGILTPKAEVLTKSSSSKPQKHAIEKTLN IDELESVHNTFLTNILSHKLFATNTSEISVGDYSGQPYPTSLVLLLNSVYEFVKVYCNLNDIGYEIFIKMNLNDHEASNG LLGKFNTNLKEIVSQYKNFKDRLYIFRADLKNDGDEELFLLSKSLR ; 1 4 UNP SP110_YEAST P32380 ? 4 ;MDEASHLPNGSLKNMEFTPVGFIKSKRNTTQTQVVSPTKVPNANNGDENEGPVKKRQRRSIDDTIDSTRLFSEASQFDDS FPEIKANIPPSPRSGNVDKSRKRNLIDDLKKDVPMSQPLKEQEVREHQMKKERFDRALESKLLGKRHITYANSDISNKEL YINEIKSLKHEIKELRKEKNDTLNNYDTLEEETDDLKNRLQALEKELDAKNKIVNSRKVD ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7M2W B 1 ? 473 ? P53378 1 ? 473 ? 1 473 2 1 7M2W A 1 ? 473 ? P53378 1 ? 473 ? 1 473 3 1 7M2W C 1 ? 473 ? P53378 1 ? 473 ? 1 473 4 1 7M2W D 1 ? 473 ? P53378 1 ? 473 ? 1 473 5 2 7M2W E 1 ? 823 ? P38863 1 ? 823 ? 1 823 6 3 7M2W F 1 ? 846 ? P53540 1 ? 846 ? 1 846 7 2 7M2W G 1 ? 823 ? P38863 1 ? 823 ? 1 823 8 3 7M2W H 1 ? 846 ? P53540 1 ? 846 ? 1 846 9 4 7M2W U 1 ? 220 ? P32380 1 ? 220 ? 1 220 10 4 7M2W K 1 ? 220 ? P32380 1 ? 220 ? 1 220 11 4 7M2W X 1 ? 220 ? P32380 1 ? 220 ? 1 220 12 4 7M2W Y 1 ? 220 ? P32380 1 ? 220 ? 1 220 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7M2W CYS B 58 ? UNP P53378 SER 58 'engineered mutation' 58 1 1 7M2W CYS B 288 ? UNP P53378 GLY 288 'engineered mutation' 288 2 2 7M2W CYS A 58 ? UNP P53378 SER 58 'engineered mutation' 58 3 2 7M2W CYS A 288 ? UNP P53378 GLY 288 'engineered mutation' 288 4 3 7M2W CYS C 58 ? UNP P53378 SER 58 'engineered mutation' 58 5 3 7M2W CYS C 288 ? UNP P53378 GLY 288 'engineered mutation' 288 6 4 7M2W CYS D 58 ? UNP P53378 SER 58 'engineered mutation' 58 7 4 7M2W CYS D 288 ? UNP P53378 GLY 288 'engineered mutation' 288 8 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GTP non-polymer n "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O14 P3' 523.180 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7M2W _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7M2W _struct.title 'Engineered disulfide cross-linked closed conformation of the Yeast gamma-TuRC(SS)' _struct.pdbx_descriptor 'Tubulin gamma chain, Spindle pole body component SPC97, Spindle pole body component SPC98, Spindle pole body component 110' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7M2W _struct_keywords.text 'microtubule nucleation, CELL CYCLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 5 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 11 ? HIS A 29 ? GLY B 11 HIS B 29 1 ? 19 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 72 ? PHE A 83 ? GLU B 72 PHE B 83 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 88 ? ARG A 90 ? ASP B 88 ARG B 90 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 104 ? ASN A 115 ? SER B 104 ASN B 115 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 115 ? SER A 129 ? ASN B 115 SER B 129 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 144 ? TYR A 162 ? GLY B 144 TYR B 162 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 179 ? SER A 198 ? GLU B 179 SER B 198 1 ? 20 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN A 206 ? PHE A 217 ? ASN B 206 PHE B 217 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 223 ? PHE A 244 ? ASP B 223 PHE B 244 1 ? 22 HELX_P HELX_P10 AB1 SER A 251 ? ILE A 260 ? SER B 251 ILE B 260 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 SER A 290 ? LEU A 298 ? SER B 290 LEU B 298 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 300 ? SER A 304 ? ASP B 300 SER B 304 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU A 327 ? ILE A 342 ? GLU B 327 ILE B 342 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 THR A 382 ? VAL A 386 ? THR B 382 VAL B 386 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 PHE A 387 ? PHE A 398 ? PHE B 387 PHE B 398 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 PHE A 403 ? ASN A 408 ? PHE B 403 ASN B 408 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP A 411 ? GLN A 414 ? ASP B 411 GLN B 414 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 AB9 SER A 415 ? GLU A 441 ? SER B 415 GLU B 441 1 ? 27 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN A 442 ? ASP A 447 ? GLN B 442 ASP B 447 5 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY B 11 ? HIS B 29 ? GLY A 11 HIS A 29 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU B 72 ? PHE B 83 ? GLU A 72 PHE A 83 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP B 88 ? ARG B 90 ? ASP A 88 ARG A 90 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 AC5 SER B 104 ? ASN B 115 ? SER A 104 ASN A 115 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN B 115 ? SER B 129 ? ASN A 115 SER A 129 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY B 144 ? TYR B 162 ? GLY A 144 TYR A 162 1 ? 19 HELX_P HELX_P26 AC8 GLU B 179 ? ASP B 197 ? GLU A 179 ASP A 197 1 ? 19 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN B 206 ? PHE B 217 ? ASN A 206 PHE A 217 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 LEU B 224 ? HIS B 226 ? LEU A 224 HIS A 226 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 AD2 THR B 227 ? PHE B 244 ? THR A 227 PHE A 244 1 ? 18 HELX_P HELX_P30 AD3 SER B 251 ? ILE B 260 ? SER A 251 ILE A 260 1 ? 10 HELX_P HELX_P31 AD4 SER B 290 ? LEU B 298 ? SER A 290 LEU A 298 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 GLU B 327 ? ILE B 342 ? GLU A 327 ILE A 342 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 AD6 VAL B 384 ? PHE B 398 ? VAL A 384 PHE A 398 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA B 399 ? GLY B 401 ? ALA A 399 GLY A 401 5 ? 3 HELX_P HELX_P35 AD8 PHE B 403 ? TYR B 407 ? PHE A 403 TYR A 407 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 SER B 415 ? GLU B 441 ? SER A 415 GLU A 441 1 ? 27 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP B 443 ? VAL B 451 ? ASP A 443 VAL A 451 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 GLY C 11 ? HIS C 29 ? GLY C 11 HIS C 29 1 ? 19 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU C 72 ? PHE C 83 ? GLU C 72 PHE C 83 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 AE4 SER C 104 ? ARG C 114 ? SER C 104 ARG C 114 1 ? 11 HELX_P HELX_P41 AE5 ASN C 115 ? SER C 129 ? ASN C 115 SER C 129 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 AE6 GLY C 144 ? CYS C 159 ? GLY C 144 CYS C 159 1 ? 16 HELX_P HELX_P43 AE7 GLU C 179 ? ASP C 197 ? GLU C 179 ASP C 197 1 ? 19 HELX_P HELX_P44 AE8 ASN C 206 ? PHE C 217 ? ASN C 206 PHE C 217 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 AE9 ASP C 223 ? PHE C 244 ? ASP C 223 PHE C 244 1 ? 22 HELX_P HELX_P46 AF1 SER C 251 ? ILE C 260 ? SER C 251 ILE C 260 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 AF2 SER C 290 ? LEU C 298 ? SER C 290 LEU C 298 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 AF3 GLU C 327 ? ILE C 342 ? GLU C 327 ILE C 342 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 AF4 VAL C 384 ? PHE C 398 ? VAL C 384 PHE C 398 1 ? 15 HELX_P HELX_P50 AF5 ASP C 411 ? GLN C 414 ? ASP C 411 GLN C 414 5 ? 4 HELX_P HELX_P51 AF6 SER C 415 ? ALA C 440 ? SER C 415 ALA C 440 1 ? 26 HELX_P HELX_P52 AF7 GLN C 442 ? TYR C 445 ? GLN C 442 TYR C 445 5 ? 4 HELX_P HELX_P53 AF8 LEU C 446 ? VAL C 451 ? LEU C 446 VAL C 451 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 GLY D 11 ? GLU D 28 ? GLY D 11 GLU D 28 1 ? 18 HELX_P HELX_P55 AG1 PRO D 73 ? PHE D 83 ? PRO D 73 PHE D 83 1 ? 11 HELX_P HELX_P56 AG2 SER D 104 ? ASN D 115 ? SER D 104 ASN D 115 1 ? 12 HELX_P HELX_P57 AG3 ASN D 115 ? SER D 129 ? ASN D 115 SER D 129 1 ? 15 HELX_P HELX_P58 AG4 GLY D 144 ? ARG D 161 ? GLY D 144 ARG D 161 1 ? 18 HELX_P HELX_P59 AG5 GLU D 179 ? ASP D 197 ? GLU D 179 ASP D 197 1 ? 19 HELX_P HELX_P60 AG6 ASN D 206 ? PHE D 217 ? 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D ASN 228 D GTP 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 273 A . ? THR 273 B PRO 274 A ? PRO 274 B 1 -7.53 2 THR 273 C . ? THR 273 C PRO 274 C ? PRO 274 C 1 -12.17 3 TYR 568 E . ? TYR 568 E PRO 569 E ? PRO 569 E 1 -0.35 4 PRO 566 F . ? PRO 566 F PRO 567 F ? PRO 567 F 1 4.77 5 TYR 568 G . ? TYR 568 G PRO 569 G ? PRO 569 G 1 -0.45 6 PRO 566 H . ? PRO 566 H PRO 567 H ? PRO 567 H 1 4.53 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 10 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 9 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA1 6 7 ? parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 9 10 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA3 6 7 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel AA6 5 6 ? parallel AA6 6 7 ? anti-parallel AA6 7 8 ? anti-parallel AA6 8 9 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 92 ? TRP A 93 ? THR B 92 TRP B 93 AA1 2 ALA A 66 ? MET A 69 ? ALA B 66 MET B 69 AA1 3 GLU A 4 ? ALA A 10 ? GLU B 4 ALA B 10 AA1 4 PHE A 133 ? SER A 141 ? PHE B 133 SER B 141 AA1 5 ILE A 166 ? PHE A 173 ? ILE B 166 PHE B 173 AA1 6 ALA A 200 ? ASP A 205 ? ALA B 200 ASP B 205 AA1 7 PHE A 267 ? THR A 273 ? PHE B 267 THR B 273 AA1 8 SER A 373 ? MET A 380 ? SER B 373 MET B 380 AA1 9 TYR A 315 ? ILE A 323 ? TYR B 315 ILE B 323 AA1 10 MET A 352 ? GLY A 357 ? MET B 352 GLY B 357 AA2 1 PHE A 54 ? GLU A 56 ? PHE B 54 GLU B 56 AA2 2 PHE A 62 ? PRO A 64 ? PHE B 62 PRO B 64 AA3 1 THR B 92 ? TRP B 93 ? THR A 92 TRP A 93 AA3 2 ALA B 66 ? MET B 69 ? ALA A 66 MET A 69 AA3 3 ILE B 5 ? ALA B 10 ? ILE A 5 ALA A 10 AA3 4 GLY B 135 ? LEU B 139 ? GLY A 135 LEU A 139 AA3 5 ILE B 166 ? PHE B 173 ? ILE A 166 PHE A 173 AA3 6 ALA B 200 ? ASP B 205 ? ALA A 200 ASP A 205 AA3 7 PHE B 267 ? LEU B 268 ? PHE A 267 LEU A 268 AA4 1 PHE B 54 ? GLU B 56 ? PHE A 54 GLU A 56 AA4 2 PHE B 62 ? PRO B 64 ? PHE A 62 PRO A 64 AA5 1 HIS B 353 ? GLY B 357 ? HIS A 353 GLY A 357 AA5 2 TYR B 315 ? ILE B 323 ? TYR A 315 ILE A 323 AA5 3 SER B 373 ? MET B 380 ? SER A 373 MET A 380 AA6 1 ALA C 66 ? MET C 69 ? ALA C 66 MET C 69 AA6 2 GLU C 4 ? ALA C 10 ? GLU C 4 ALA C 10 AA6 3 PHE C 133 ? SER C 141 ? PHE C 133 SER C 141 AA6 4 ILE C 166 ? PHE C 173 ? ILE C 166 PHE C 173 AA6 5 ALA C 200 ? ASP C 205 ? ALA C 200 ASP C 205 AA6 6 PHE C 267 ? THR C 273 ? PHE C 267 THR C 273 AA6 7 VAL C 372 ? MET C 380 ? VAL C 372 MET C 380 AA6 8 TYR C 315 ? GLY C 324 ? TYR C 315 GLY C 324 AA6 9 MET C 352 ? GLY C 357 ? MET C 352 GLY C 357 AA7 1 PHE C 54 ? GLU C 56 ? PHE C 54 GLU C 56 AA7 2 PHE C 62 ? PRO C 64 ? PHE C 62 PRO C 64 AA8 1 ALA D 66 ? MET D 69 ? ALA D 66 MET D 69 AA8 2 GLU D 4 ? ALA D 10 ? GLU D 4 ALA D 10 AA8 3 PHE D 133 ? PHE D 136 ? PHE D 133 PHE D 136 AA9 1 PHE D 54 ? ASN D 57 ? PHE D 54 ASN D 57 AA9 2 LYS D 61 ? PRO D 64 ? LYS D 61 PRO D 64 AB1 1 LEU D 138 ? LEU D 139 ? LEU D 138 LEU D 139 AB1 2 THR D 168 ? PHE D 173 ? THR D 168 PHE D 173 AB1 3 ALA D 200 ? ASP D 205 ? ALA D 200 ASP D 205 AB1 4 PHE D 267 ? LEU D 268 ? PHE D 267 LEU D 268 AB2 1 HIS D 353 ? GLY D 357 ? HIS D 353 GLY D 357 AB2 2 TYR D 315 ? GLY D 324 ? TYR D 315 GLY D 324 AB2 3 VAL D 372 ? MET D 380 ? VAL D 372 MET D 380 AB3 1 ILE E 75 ? TYR E 77 ? ILE E 75 TYR E 77 AB3 2 PHE E 92 ? ILE E 94 ? PHE E 92 ILE E 94 AB4 1 THR E 301 ? TYR E 302 ? THR E 301 TYR E 302 AB4 2 TYR E 324 ? ARG E 327 ? TYR E 324 ARG E 327 AB4 3 VAL E 232 ? ASP E 235 ? VAL E 232 ASP E 235 AB4 4 HIS L 147 ? THR L 149 ? HIS Y 147 THR Y 149 AB5 1 LEU E 482 ? PHE E 486 ? LEU E 482 PHE E 486 AB5 2 LEU E 560 ? ILE E 564 ? LEU E 560 ILE E 564 AB6 1 ILE F 364 ? GLU F 366 ? ILE F 364 GLU F 366 AB6 2 ILE F 383 ? PHE F 385 ? ILE F 383 PHE F 385 AB7 1 LEU F 541 ? VAL F 545 ? LEU F 541 VAL F 545 AB7 2 PHE F 558 ? TYR F 562 ? PHE F 558 TYR F 562 AB8 1 LEU F 681 ? ARG F 683 ? LEU F 681 ARG F 683 AB8 2 ILE F 689 ? LEU F 691 ? ILE F 689 LEU F 691 AB9 1 ILE G 75 ? 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ILE H 689 LEU H 691 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O TRP A 93 ? O TRP B 93 N MET A 68 ? N MET B 68 AA1 2 3 O ILE A 67 ? O ILE B 67 N THR A 7 ? N THR B 7 AA1 3 4 N LEU A 8 ? N LEU B 8 O LEU A 139 ? O LEU B 139 AA1 4 5 N LEU A 138 ? N LEU B 138 O TYR A 170 ? O TYR B 170 AA1 5 6 N PHE A 173 ? N PHE B 173 O PHE A 204 ? O PHE B 204 AA1 6 7 N THR A 201 ? N THR B 201 O LEU A 268 ? O LEU B 268 AA1 7 8 N SER A 271 ? N SER B 271 O MET A 376 ? O MET B 376 AA1 8 9 O MET A 375 ? O MET B 375 N THR A 321 ? N THR B 321 AA1 9 10 N ASN A 320 ? N ASN B 320 O ASN A 355 ? O ASN B 355 AA2 1 2 N ARG A 55 ? N ARG B 55 O THR A 63 ? O THR B 63 AA3 1 2 O TRP B 93 ? O TRP A 93 N MET B 68 ? N MET A 68 AA3 2 3 O ILE B 67 ? O ILE A 67 N THR B 7 ? N THR A 7 AA3 3 4 N LEU B 8 ? N LEU A 8 O GLN B 137 ? O GLN A 137 AA3 4 5 N LEU B 138 ? N LEU A 138 O TYR B 170 ? O TYR A 170 AA3 5 6 N THR B 169 ? N THR A 169 O VAL B 202 ? O VAL A 202 AA3 6 7 N THR B 201 ? N THR A 201 O LEU B 268 ? O LEU A 268 AA4 1 2 N ARG B 55 ? N ARG A 55 O THR B 63 ? O THR A 63 AA5 1 2 O HIS B 353 ? O HIS A 353 N ASN B 320 ? N ASN A 320 AA5 2 3 N ASN B 317 ? N ASN A 317 O ASN B 379 ? O ASN A 379 AA6 1 2 O MET C 69 ? O MET C 69 N GLN C 9 ? N GLN C 9 AA6 2 3 N LEU C 8 ? N LEU C 8 O GLN C 137 ? O GLN C 137 AA6 3 4 N LEU C 138 ? N LEU C 138 O THR C 168 ? O THR C 168 AA6 4 5 N PHE C 173 ? N PHE C 173 O PHE C 204 ? O PHE C 204 AA6 5 6 N VAL C 203 ? N VAL C 203 O LEU C 268 ? O LEU C 268 AA6 6 7 N SER C 271 ? N SER C 271 O MET C 376 ? O MET C 376 AA6 7 8 O MET C 375 ? O MET C 375 N THR C 321 ? N THR C 321 AA6 8 9 N ASN C 320 ? N ASN C 320 O ASN C 355 ? O ASN C 355 AA7 1 2 N ARG C 55 ? N ARG C 55 O THR C 63 ? O THR C 63 AA8 1 2 O MET D 69 ? O MET D 69 N GLN D 9 ? N GLN D 9 AA8 2 3 N GLU D 4 ? N GLU D 4 O GLU D 134 ? O GLU D 134 AA9 1 2 N ARG D 55 ? N ARG D 55 O THR D 63 ? O THR D 63 AB1 1 2 N LEU D 138 ? N LEU D 138 O TYR D 170 ? O TYR D 170 AB1 2 3 N SER D 171 ? N SER D 171 O VAL D 202 ? O VAL D 202 AB1 3 4 N VAL D 203 ? N VAL D 203 O LEU D 268 ? O LEU D 268 AB2 1 2 O GLY D 357 ? O GLY D 357 N ILE D 322 ? N ILE D 322 AB2 2 3 N ILE D 323 ? N ILE D 323 O SER D 373 ? O SER D 373 AB3 1 2 N ARG E 76 ? N ARG E 76 O LYS E 93 ? O LYS E 93 AB4 1 2 N TYR E 302 ? N TYR E 302 O PHE E 325 ? O PHE E 325 AB4 2 3 O ILE E 326 ? O ILE E 326 N ASP E 235 ? N ASP E 235 AB4 3 4 N PHE E 234 ? N PHE E 234 O HIS L 147 ? O HIS Y 147 AB5 1 2 N GLN E 485 ? N GLN E 485 O LYS E 561 ? O LYS E 561 AB6 1 2 N ALA F 365 ? N ALA F 365 O GLU F 384 ? O GLU F 384 AB7 1 2 N ARG F 544 ? N ARG F 544 O THR F 559 ? O THR F 559 AB8 1 2 N ILE F 682 ? N ILE F 682 O GLU F 690 ? O GLU F 690 AB9 1 2 N ARG G 76 ? N ARG G 76 O LYS G 93 ? O LYS G 93 AC1 1 2 N TYR G 302 ? N TYR G 302 O PHE G 325 ? O PHE G 325 AC1 2 3 O ILE G 326 ? O ILE G 326 N ASP G 235 ? N ASP G 235 AC1 3 4 O PHE G 234 ? O PHE G 234 N THR J 149 ? N THR K 149 AC2 1 2 N GLN G 485 ? N GLN G 485 O LYS G 561 ? O LYS G 561 AC3 1 2 N ALA H 365 ? N ALA H 365 O GLU H 384 ? O GLU H 384 AC4 1 2 N ARG H 544 ? N ARG H 544 O THR H 559 ? O THR H 559 AC5 1 2 N ILE H 682 ? N ILE H 682 O GLU H 690 ? O GLU H 690 # _atom_sites.entry_id 7M2W _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O P S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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L ASP 220 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 40 mM ? HEPES-KOH 1 2 100 mM ? 'Potassium Chloride' 1 3 2 mM ? 'Magnesium Chloride' 1 4 1 mM ? EGTA 1 5 1 mM ? 'Oxidized Glutathione' 1 6 0.5 mM ? GTP 1 7 2.5 %v/v ? Glycerol # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details 'Final reconstruction in cisTEM' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag YES _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location 'Spindle Pole Body' _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 4932 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle Nucleus _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Saccharomyces cerevisiae' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 7108 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Spodoptera frugiperda' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain SF9 # _em_helical_entity.id 1 _em_helical_entity.image_processing_id 1 _em_helical_entity.angular_rotation_per_subunit 0 _em_helical_entity.axial_rise_per_subunit 0.1 _em_helical_entity.axial_symmetry C1 _em_helical_entity.details ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 72 _em_image_recording.average_exposure_time 12 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 3024 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details 'Boxed approximately every 3 asymmetric units using a rise of 21 Angstroms, with a box size of 600 pixels (635.4A).' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 175500 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' e2helixboxer.py EMAN2 ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? SerialEM ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? cisTEM '1.0 beta' 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? PHENIX ? ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' ? Rosetta ? ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 12 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cisTEM '1.0 Beta' 1 ? ? 13 CLASSIFICATION 'Focused classification' cisTEM '1.0 Beta' 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ? cisTEM '1.0 Beta' 1 ? ? 15 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? 16 'MODEL REFINEMENT' ? Coot ? ? 1 ? 17 'MODEL REFINEMENT' ? Rosetta ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Howard Hughes Medical Institute (HHMI)' 'United States' 'David Agard' 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'R01 GM031627' 2 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'R35 GM118099' 3 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'P01 GM105537' 4 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'P41 GM103533' 5 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM083960 6 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM109824 7 'National Science Foundation (NSF, United States)' 'United States' 1144247 8 'National Institutes of Health/Office of the Director' 'United States' 1S10OD020054 9 'National Institutes of Health/Office of the Director' 'United States' 1S10OD021741 10 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'R01 GM124149' 11 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'P30 GM124169' 12 'Department of Energy (DOE, United States)' 'United States' DE-AC02-05CH11231 13 # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" _pdbx_entity_nonpoly.comp_id GTP # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #