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EMD-23780 'other EM volume' EMDB 'BG505 SOSIP.v5.2(7S) in complex with the monoclonal antibodies Rh.33172 mAb.1 and RM19R' EMD-23801 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7MEP _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-04-07 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Antanasijevic, A.' 1 0000-0001-9452-8954 'Ward, A.B.' 2 0000-0001-7153-3769 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? 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;AIRMTQSPAILSLSPGERATLSCRASQSVDSRLAWYQQKPGQSPRLLIYDVSSRATGIPDRFSGSGSGTEFTLTISSLEP EDVAVYFCHQENDWPWTFGQGTKVEIK ; G,J,K ? 2 'polypeptide(L)' no no ;EVQLVESGPGLVRPSETLSLTCAVSGDSISTNNGWSWIRQTPGKGLEWIGYINGRSGSTRYNPSLQSRVTISTDTSGNQF SLKVNSVTAADTAKYYCAFFWSTYYKRFDVWGPGVRVTVSS ; ;EVQLVESGPGLVRPSETLSLTCAVSGDSISTNNGWSWIRQTPGKGLEWIGYINGRSGSTRYNPSLQSRVTISTDTSGNQF SLKVNSVTAADTAKYYCAFFWSTYYKRFDVWGPGVRVTVSS ; I,M,N ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETKKHNVWATHCCVPTD PNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELR DKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGP CTNVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVIIRSENITNNAKNILVQLNESVQINCTRPNNNTVKSIRIGPGQWFYYT GDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNT SVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWR SELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRRAVGIGAVSLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRA 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;QVQLVQSGAEVKMPGTSVKLSCKTSGYTFTSYNINWVRQAPGQALEWMGWINPNNGTTDYAQKFQGRVTMTRDTSTTTAY MQLNSLRSEDTAVYYCARARGGYEDDDGYHYTGYGLDSWGQGVVVTVSS ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSSLSASIGDRVTVTCRASQGINMQLCWYQLKPGKAPTLLIYGTSGLQTGVSSRFSGSGSGTNFTLTISSLQP EDVATYYCQQDYTTPFTFGPGTKLDIK ; ;DIQMTQSPSSLSASIGDRVTVTCRASQGINMQLCWYQLKPGKAPTLLIYGTSGLQTGVSSRFSGSGSGTNFTLTISSLQP EDVATYYCQQDYTTPFTFGPGTKLDIK ; L ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ALA n 1 2 ILE n 1 3 ARG n 1 4 MET n 1 5 THR n 1 6 GLN n 1 7 SER n 1 8 PRO n 1 9 ALA n 1 10 ILE n 1 11 LEU n 1 12 SER n 1 13 LEU n 1 14 SER n 1 15 PRO n 1 16 GLY n 1 17 GLU n 1 18 ARG n 1 19 ALA n 1 20 THR n 1 21 LEU n 1 22 SER n 1 23 CYS n 1 24 ARG n 1 25 ALA n 1 26 SER n 1 27 GLN n 1 28 SER n 1 29 VAL n 1 30 ASP n 1 31 SER n 1 32 ARG n 1 33 LEU n 1 34 ALA n 1 35 TRP n 1 36 TYR n 1 37 GLN n 1 38 GLN n 1 39 LYS n 1 40 PRO n 1 41 GLY n 1 42 GLN n 1 43 SER n 1 44 PRO n 1 45 ARG n 1 46 LEU n 1 47 LEU 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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7MEP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7MEP _struct.title 'BG505 SOSIP.v5.2(7S) in complex with the monoclonal antibodies Rh.33172 mAb.1 and RM19R' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7MEP _struct_keywords.text 'Immune complex, monoclonal antibodies, HIV-1, BG505 SOSIP, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? 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C CYS 379 SG ? ? ? 1_555 C CYS 445 SG ? ? A CYS 378 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 386 SG ? ? ? 1_555 C CYS 418 SG ? ? A CYS 385 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 501 SG ? ? ? 1_555 D CYS 607 SG ? ? A CYS 501 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 600 SG ? ? ? 1_555 D CYS 606 SG ? ? B CYS 598 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf15 disulf ? ? F CYS 23 SG ? ? ? 1_555 F CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf16 disulf ? ? G CYS 23 SG ? ? ? 1_555 G CYS 88 SG ? ? J CYS 23 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? ? disulf17 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 97 SG ? ? M CYS 22 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf18 disulf ? ? I CYS 56 SG ? ? ? 1_555 I CYS 75 SG ? ? C CYS 54 C CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf19 disulf ? ? I CYS 121 SG ? ? ? 1_555 I CYS 207 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf20 disulf ? ? I CYS 128 SG ? ? ? 1_555 I CYS 198 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf21 disulf ? ? I CYS 133 SG ? ? ? 1_555 I CYS 151 SG ? ? C CYS 131 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf22 disulf ? ? I CYS 220 SG ? ? ? 1_555 I CYS 249 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf23 disulf ? ? I CYS 230 SG ? ? ? 1_555 I CYS 241 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf24 disulf ? ? I CYS 298 SG ? ? ? 1_555 I CYS 332 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf25 disulf ? ? I CYS 379 SG ? ? ? 1_555 I CYS 445 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf26 disulf ? ? I CYS 386 SG ? ? ? 1_555 I CYS 418 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf27 disulf ? ? I CYS 501 SG ? ? ? 1_555 J CYS 607 SG ? ? C CYS 501 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf28 disulf ? ? J CYS 600 SG ? ? ? 1_555 J CYS 606 SG ? ? E CYS 598 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf29 disulf ? ? K CYS 23 SG ? ? ? 1_555 K CYS 88 SG ? ? K CYS 23 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? disulf30 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 97 SG ? ? N CYS 22 N CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? disulf31 disulf ? ? M CYS 56 SG ? ? ? 1_555 M CYS 75 SG ? ? D CYS 54 D CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf32 disulf ? ? M CYS 121 SG ? ? ? 1_555 M CYS 207 SG ? ? D CYS 119 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? disulf33 disulf ? ? M CYS 128 SG ? ? ? 1_555 M CYS 198 SG ? ? D CYS 126 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf34 disulf ? ? M CYS 133 SG ? ? ? 1_555 M CYS 151 SG ? ? D CYS 131 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf35 disulf ? ? M CYS 220 SG ? ? ? 1_555 M CYS 249 SG ? ? D CYS 218 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf36 disulf ? ? M CYS 230 SG ? ? ? 1_555 M CYS 241 SG ? ? D CYS 228 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf37 disulf ? ? M CYS 298 SG ? ? ? 1_555 M CYS 332 SG ? ? D CYS 296 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf38 disulf ? ? M CYS 379 SG ? ? ? 1_555 M CYS 445 SG ? ? D CYS 378 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf39 disulf ? ? M CYS 386 SG ? ? ? 1_555 M CYS 418 SG ? ? D CYS 385 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf40 disulf ? ? M CYS 501 SG ? ? ? 1_555 N CYS 607 SG ? ? D CYS 501 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf41 disulf ? ? N CYS 600 SG ? ? ? 1_555 N CYS 606 SG ? ? F CYS 598 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? covale1 covale one ? C ASN 90 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? A ASN 88 A NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? A ASN 133 A NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? C ASN 150 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 156 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 154 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? A ASN 160 A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 199 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? A ASN 197 A NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? C ASN 236 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? C ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? A ASN 241 A NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? C ASN 264 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 262 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.510 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? C ASN 278 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 276 A NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? C ASN 291 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? A ASN 289 A NAG 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? C ASN 297 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 295 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? C ASN 303 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 301 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 333 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 332 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 339 A NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 356 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 355 A NAG 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.510 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? C ASN 364 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? A ASN 363 A NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? C ASN 387 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? A ASN 386 A NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? C ASN 393 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 392 A NAG 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? C ASN 448 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 448 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? D ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? B ASN 611 B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? D ASN 620 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? B ASN 618 B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? D ASN 639 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? B ASN 637 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? I ASN 90 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? C ASN 88 C NAG 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? I ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? C ASN 133 C NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? I ASN 150 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 156 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? I ASN 154 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? C ASN 160 C NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? I ASN 199 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? C ASN 197 C NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? I ASN 236 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? I ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? C ASN 241 C NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? I ASN 264 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 262 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? I ASN 278 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? C ASN 276 C NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? I ASN 291 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? C ASN 289 C NAG 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? I ASN 297 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 295 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? I ASN 303 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? C ASN 301 C NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? I ASN 333 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 332 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? I ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? C ASN 339 C NAG 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? I ASN 356 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? C ASN 355 C NAG 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? I ASN 364 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? C ASN 363 C NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? I ASN 387 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? C ASN 386 C NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? I ASN 393 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? C ASN 392 C NAG 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? I ASN 448 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 448 C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? J ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? E ASN 611 E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? J ASN 620 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? E ASN 618 E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? J ASN 639 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? E ASN 637 E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? M ASN 90 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? D ASN 88 D NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? M ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? D ASN 133 D NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? M ASN 150 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? D ASN 156 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? M ASN 154 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? D ASN 160 D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? M ASN 199 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? D ASN 197 D NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? M ASN 236 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? D ASN 234 D NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? M ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? D ASN 241 D NAG 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? M ASN 264 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? D ASN 262 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? M ASN 278 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? D ASN 276 D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? M ASN 291 ND2 ? ? ? 1_555 VB NAG . C1 ? ? D ASN 289 D NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? M ASN 297 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? D ASN 295 D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? M ASN 303 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? D ASN 301 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? N-Glycosylation covale57 covale one ? M ASN 333 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? D ASN 332 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? N-Glycosylation covale58 covale one ? M ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 WB NAG . C1 ? ? D ASN 339 D NAG 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.530 ? N-Glycosylation covale59 covale one ? M ASN 356 ND2 ? ? ? 1_555 XB NAG . C1 ? ? D ASN 355 D NAG 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale60 covale one ? M ASN 364 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? D ASN 363 D NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? N-Glycosylation covale61 covale one ? M ASN 387 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? D ASN 386 D NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale62 covale one ? M ASN 393 ND2 ? ? ? 1_555 YB NAG . C1 ? ? D ASN 392 D NAG 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? N-Glycosylation covale63 covale one ? M ASN 448 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? D ASN 448 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? N-Glycosylation covale64 covale one ? N ASN 613 ND2 ? ? ? 1_555 BC NAG . C1 ? ? F ASN 611 F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? N-Glycosylation covale65 covale one ? N ASN 620 ND2 ? ? ? 1_555 AC NAG . C1 ? ? F ASN 618 F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? N-Glycosylation covale66 covale one ? N ASN 639 ND2 ? ? ? 1_555 ZB NAG . C1 ? ? F ASN 637 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? N-Glycosylation covale67 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? ? covale68 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? ? covale69 covale both ? O BMA . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? ? covale70 covale both ? O BMA . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? ? covale71 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? ? covale72 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? ? covale73 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? ? covale74 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale75 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? ? covale76 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? ? covale77 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.520 ? ? covale78 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? ? covale79 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? ? covale80 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? ? covale81 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? ? covale82 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? ? covale83 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? ? covale84 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? ? covale85 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? ? covale86 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? ? covale87 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.510 ? ? covale88 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? ? covale89 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? ? covale90 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 6 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 6 ? AD6 ? 7 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 6 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 5 ? AE4 ? 5 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 5 ? AF1 ? 3 ? AF2 ? 6 ? AF3 ? 7 ? 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'monoclonal antibodies Rh.33172 mAb.1 and RM19R' RECOMBINANT COMPLEX 1,2,4,5 ? ? 3 1 ? 'BG505 SOSIP.v5.2(7S)' RECOMBINANT COMPLEX 3 ? ? # _em_image_scans.entry_id 7MEP _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 38 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7MEP _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 1600 _em_imaging.nominal_defocus_min 700 _em_imaging.nominal_magnification 29000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'UltrAuFoil R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 283 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Blot force: 0 Wait time: 10s Blot time: 3-7s ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7MEP _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7MEP _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7MEP _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 CB G TYR 36 ? ? 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