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14 ;MSRRNPPGSRNGGGPTNASPFIKRDRMRRNFLRMRMGQNGSNSSSPGVPNGDNSRGSLVKKDDPEYAEEREKMLLQIGVE ADAGRSNVKVKDEDPNEYNEFPLRAIPKEDLENMRTHLLKFQSKKKINPVTDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQ KEISEYKKKAEQERSTPNSGGMNKSGTVSLNNTVKDGSQTPTVDSVTKDNTANGVNSSIPTVTGSSVPPASPTTVSAVES NGLSNGSTSAANGLDGNASTANLANGRPLVTKLEDAGPAEDPTKVGMVKYDGKEVTNEPEFEEGTMDPLADVAPDGGGRA KRGNLRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNK YATLTIDEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRKLKAVADQQAMDEDDRDDNSEVELDYDEEFADDEEAP IIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDEEAPSENEEDELFGEKKIDEDGERIKKALQKTELAALYSSDENEINPYLS ESDIENKENESPVKKEEDSDTLSKSKRSSPKKQQKKATNAHVHKEPTLRVKSIKNCVIILKGDKKILKSFPEGEWNPQTT KAVDSSNNASNTVPSPIKQEEGLNSTVAEREETPAPTITEKDIIEAIGDGKVNIKEFGKFIRRKYPGAENKKLMFAIVKK LCRKVGNDHMELKKE ; 1 15 UNP A0A6A5PZ00_YEASX A0A6A5PZ00 ? 15 ;MSSGSAGAPALSNNSTNSVAKEKSGNISGDEYLSQEEEVFDGNDIENNETKVYEESLDLDLERSNRQVWLVRLPMFLAEK WRDRNNLHGQELGKIRINKDGSKITLLLNENDNDSIPHEYDLELTKKVVENEYVFTEQNLKKYQQRKKELEADPEKQRQA YLKKQEREEELKKKQQQQKRRNNRKKFNHRVMTDRDGRDRYIPYVKTIPKKTAIVGTVCHECQVMPSMNDPNYHKIVEQR RNIVKLNNKERITTLDETVGVTMSHTGMSMRSDNSNFLKVGREKAKSNIKSIRMPKKEILDYLFKLFDEYDYWSLKGLKE RTRQPEAHLKECLDKVATLVKKGPYAFKYTLRPEYKKLKEEERKATLGELADEQTGSAGDNAQGDAEADLEDEIEMEDVV ; 1 16 UNP A0A6A5PTU5_YEASX A0A6A5PTU5 ? 16 ;MDRPIDDIVKNLLKFVVRGFYGGSFVLVLDAILFHSVLAEDDLKQLLSINKTELGPLIARLRSDRLISIHKQREYPPNSK SVERVYYYVKYPHAIDAIKWKVHQVVQRLKDDLDKNSEPNGYMCPICLTKYTQLEAVQLLNFDRTEFLCSLCDEPLVEDD SGKKNKEKQDKLNRLMDQIQPIIDSLKKIDDSRIEENTFEIALARLIPPQNQSHAAYTYNPKKGSTMFRPGDSAPLPNLM GTALGNDSSRRAGANSQATLHINITTASDEVAQRELQERQAEEKRKQNAVPEWHKQSTIGKTALGRLDNEEEFDPVVTAS AMDSINPDNEPAQETSYQNNRTLTEQEMEERENEKTLNDYYAALAKKQAKLNKEEEEEEEEEEDEEEEEEEEMEDVMDDN DETARENALEDEFEDVTDTAGTAKTESNTSNDVKQESINDKTEDAVNATATASGPSANAKPNDGDDDDDDDDDEMDIEFE DV ; 1 17 UNP A0A6A5PS93_YEASX A0A6A5PS93 ? 17 ;MSKNRDPLLANLNAFKSKVKSAPVIAPAKVGQKKTNDTVITIDGNTRKRTASERAQENTLNSAKNPVLVDIKKEAGSNSS NAISLDDDDDDEDFGSSPSKKVRPGSIAAAALQANQTDISKSHDSSKLLWATEYIQKKGKPVLVNELLDYLSMKKDDKVI ELLKKLDRIEFDPKKGTFKYLSTYDVHSPSELLKLLRSQVTFKGISCKDLKDGWPQCDETINQLEEDSKILVLRTKKDKT PRYVWYNSGGNLKCIDEEFVKMWENVQLPQFAELPRKLQDLGLKPASVDPATIKRQTKRVEVKKKRQRKGKITNTHMTGI LKDYSHRV ; 1 18 UNP TBP_YEAST P13393 ? 18 ;MADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGCRL DLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQNI VGSCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEPELFPGLIYRMVKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM ; 1 19 PDB 7ML0 7ML0 ? 19 ? 1 20 PDB 7ML0 7ML0 ? 20 ? 1 21 UNP A0A6A5Q1C1_YEASX A0A6A5Q1C1 ? 21 ;MKFYIDDLPVLFPYPKIYPEQYNYMCDIKKTLDVGGNSILEMPSGTGKTVSLLSLTIAYQMHYPEHRKIIYCSRTMSEIE KALVELENLMDYRTKELGYQEDFRGLGLTSRKNLCLHPEVSKERKGTVVDEKCRRMTNGQAKRKLEEDPEANVELCEYHE NLYNIEVEDYLPKGVFSFEKLLKYCEEKTLCPYFIVRRMISLCNIIIYSYHYLLDPKIAERVSNEVSKDSIVIFDEAHNI DNVCIESLSLDLTTDALRRATRGANALDERISEVRKVDSQKLQDEYEKLVQGLHSADILTDQEEPFVETPVLPQDLLTEA IPGNIRRAEHFVSFLKRLIEYLKTRMKVLHVISETPKSFLQHLKQLTFIERKPLRFCSERLSLLVRTLEVTEVEDFTALK DIATFATLISTYEEGFLLIIEPYEIENAAVPNPIMRFTCLDASIAIKPVFERFSSVIITSGTISPLDMYPRMLNFKTVLQ KSYAMTLAKKSFLPMIITKGSDQVAISSRFEIRNDPSIVRNYGSMLVEFAKITPDGMVVFFPSYLYMESIVSMWQTMGIL DEVWKHKLILVETPDAQETSLALETYRKACSNGRGAILLSVARGKVSEGIDFDHQYGRTVLMIGIPFQYTESRILKARLE FMRENYRIRENDFLSFDAMRHAAQCLGRVLRGKDDYGVMVLADRRFSRKRSQLPKWIAQGLSDADLNLSTDMAISNTKQF LRTMAQPTDPKDQEGVSVWSYEDLIKHQNSRKDQGGFIENENKEGEQDEDEDEDIEMQ ; 1 22 PDB 7ML0 7ML0 ? 22 ? 1 23 PDB 7ML0 7ML0 ? 23 ? 1 24 PDB 7ML0 7ML0 ? 24 ? 1 25 UNP A0A6A5Q2X3_YEASX A0A6A5Q2X3 ? 25 ;MSDYSLKHSVTQYLEEIPQQVQNRLYTSPATCLAIYRILPPLAKFFIMAMVFNENEVPLLDLDKWVNSNGKLQFQNAIKS MKSLHLLIPNKSSGTLMINLNPTFKISLRNALTGGEVQNSFGVVVEENVVSLDLLDEYSANKWETILHFMVGTPLAKIPS EKVLNLLKHSKLMEEVNSTGEFKITNEGFQFLLQEINSQLWTLLLQYLKMIETSKMDLVDVLHFIFMLGALEVGKAYKID ALSETQRIMLQDMRDYGLVFQKHSNDSIFYPTKLALMLTSDTKTIRSASNAMDSVLRQNREEPSVNEDGANGKSTTDITT SDDLNKAGLKNQDIPDGSLIVETNFKIYSYSNSPLQIAVLSLFVHLKARFVNMVLGQITRESIRRALTNGITADQIIAYL ETHAHPQMRRLAEEKLEKKLELDPNCKEPLQVLPPTVVDQIRLWQLELDRVITYEGSLYSDFETSQEYNLLSKYAQDIGV LLWKDDKKKKFFISKEGNSQVLDFAKRKLKKKQ ; 1 26 UNP TFB5_YEAST Q3E7C1 ? 26 MARARKGALVQCDPSIKALILQIDAKMSDIVLEELDDTHLLVNPSKVEFVKHELNRLLSKNIYNPMDEEENQ 1 27 UNP A0A7I9BTI9_YEASX A0A7I9BTI9 ? 27 ;MLMDEYEENKDMCPICKTDRYLSPDVKFLVNPECYHRICESCVDRIFSLGPAQCPYKGCDKILRKNKFKTQIFDDVEVEK EVDIRKRVFNVFNKTIDDFNGDLVEYNKYLEEVEDIIYKLDHGIDVAKTEEKLRTYEELNKQLIMNNLERSRTEIESFEQ RQKFEKEMKLKKRLLERQIEEEERMNKEWTKKEIVNRLSTTTQDINETIEGVKNTVKLKKSSARRKLEELNRVLKNNPYF NSNVNVQNSRLKDAVPFTPFNGDREAHPRFTLKGSVYNDPFIKDLEHRKEFIASGFNTNYAYERVLTEAFMGLGCVISEE L ; 1 28 UNP RAD25_YEAST Q00578 ? 28 ;MTDVEGYQPKSKGKIFPDMGESFFSSDEDSPATDAEIDENYDDNRETSEGRGERDTGAMVTGLKKPRKKTKSSRHTAADS SMNQMDAKDKALLQDTNSDIPADFVPDSVSGMFRSHDFSYLRLRPDHASRPLWISPSDGRIILESFSPLAEQAQDFLVTI AEPISRPSHIHEYKITAYSLYAAVSVGLETDDIISVLDRLSKVPVAESIINFIKGATISYGKVKLVIKHNRYFVETTQAD ILQMLLNDSVIGPLRIDSDHQVQPPEDVLQQQLQQTAGKPATNVNPNDVEAVFSAVIGGDNEREEEDDDIDAVHSFEIAN ESVEVVKKRCQEIDYPVLEEYDFRNDHRNPDLDIDLKPSTQIRPYQEKSLSKMFGNGRARSGIIVLPCGAGKTLVGITAA CTIKKSVIVLCTSSVSVMQWRQQFLQWCTLQPENCAVFTSDNKEMFQTESGLVVSTYSMVANTRNRSHDSQKVMDFLTGR EWGFIILDEVHVVPAAMFRRVVSTIAAHAKLGLTATLVREDDKIGDLNFLIGPKLYEANWMELSQKGHIANVQCAEVWCP MTAEFYQEYLRETARKRMLLYIMNPTKFQACQFLIQYHERRGDKIIVFSDNVYALQEYALKMGKPFIYGSTPQQERMNIL QNFQYNDQINTIFLSKVGDTSIDLPEATCLIQISSHYGSRRQEAQRLGRILRAKRRNDEGFNAFFYSLVSKDTQEMYYST KRQAFLVDQGYAFKVITHLHGMENIPNLAYASPRERRELLQEVLLKNEEAAGIEVGDDADNSVGRGSNGHKRFKSKAVRG EGSLSGLAGGEDMAYMEYSTNKNKELKEHHPLIRKMYYKNLKK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7ML0 A 1 ? 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A0A6A5Q1C1 1 ? 778 ? 1 778 22 22 7ML0 1 1 ? 541 ? 7ML0 1 ? 642 ? 1 642 23 23 7ML0 4 1 ? 338 ? 7ML0 1 ? 338 ? 1 338 24 24 7ML0 6 1 ? 461 ? 7ML0 1 ? 461 ? 1 461 25 25 7ML0 2 1 ? 513 ? A0A6A5Q2X3 1 ? 513 ? 1 513 26 26 7ML0 5 1 ? 72 ? Q3E7C1 1 ? 72 ? 1 72 27 27 7ML0 3 1 ? 321 ? A0A7I9BTI9 1 ? 321 ? 1 321 28 28 7ML0 7 1 ? 843 ? Q00578 1 ? 843 ? 1 843 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7ML0 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7ML0 _struct.title 'RNA polymerase II pre-initiation complex (PIC1)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7ML0 _struct_keywords.text 'PIC, TFIIH, transcription, ITC, RNA polymerase II' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? 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PRO 7 585 ARG 7 601 1 ? 17 HELX_P HELX_P324 BJ9 ASN BA 611 ? LEU BA 620 ? ASN 7 611 LEU 7 620 1 ? 10 HELX_P HELX_P325 BK1 GLN BA 633 ? LEU BA 640 ? GLN 7 633 LEU 7 640 5 ? 8 HELX_P HELX_P326 BK2 VAL BA 657 ? SER BA 661 ? VAL 7 657 SER 7 661 5 ? 5 HELX_P HELX_P327 BK3 SER BA 679 ? LEU BA 687 ? SER 7 679 LEU 7 687 1 ? 9 HELX_P HELX_P328 BK4 LEU BA 687 ? ARG BA 692 ? LEU 7 687 ARG 7 692 1 ? 6 HELX_P HELX_P329 BK5 GLU BA 715 ? ALA BA 724 ? GLU 7 715 ALA 7 724 1 ? 10 HELX_P HELX_P330 BK6 PHE BA 725 ? GLY BA 730 ? PHE 7 725 GLY 7 730 5 ? 6 HELX_P HELX_P331 BK7 SER BA 752 ? ALA BA 770 ? SER 7 752 ALA 7 770 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? 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I CYS 78 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc27 metalc ? ? I CYS 103 SG ? ? ? 1_555 IA ZN . ZN ? ? I CYS 103 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? ? metalc28 metalc ? ? I CYS 106 SG ? ? ? 1_555 IA ZN . ZN ? ? I CYS 106 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? ? metalc29 metalc ? ? J CYS 7 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? J CYS 7 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? ? metalc30 metalc ? ? J CYS 10 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? J CYS 10 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? ? metalc31 metalc ? ? J CYS 45 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? J CYS 45 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? ? metalc32 metalc ? ? J CYS 46 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? J CYS 46 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? ? metalc33 metalc ? ? L CYS 31 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? L CYS 31 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? ? metalc34 metalc ? ? L CYS 34 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? L CYS 34 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? ? metalc35 metalc ? ? L CYS 48 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? L CYS 48 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? ? metalc36 metalc ? ? L CYS 51 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? L CYS 51 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? ? metalc37 metalc ? ? M CYS 24 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? M CYS 24 M ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc38 metalc ? ? M CYS 27 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? M CYS 27 M ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc39 metalc ? ? M CYS 45 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? M CYS 45 M ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? ? metalc40 metalc ? ? M CYS 48 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? M CYS 48 M ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? ? metalc41 metalc ? ? P CYS 124 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? W CYS 124 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc42 metalc ? ? P CYS 127 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? W CYS 127 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? ? metalc43 metalc ? ? P CYS 149 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? W CYS 149 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc44 metalc ? ? P CYS 152 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? W CYS 152 W ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? ? metalc45 metalc ? ? U CYS 115 SG ? ? ? 1_555 NA SF4 . FE1 ? ? 0 CYS 115 0 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? ? metalc46 metalc ? ? U CYS 133 SG ? ? ? 1_555 NA SF4 . FE3 ? ? 0 CYS 133 0 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? ? metalc47 metalc ? ? U MET 136 SD ? ? ? 1_555 NA SF4 . FE2 ? ? 0 MET 136 0 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc48 metalc ? ? U MET 136 SD ? ? ? 1_555 NA SF4 . FE3 ? ? 0 MET 136 0 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? ? metalc49 metalc ? ? U CYS 191 SG ? ? ? 1_555 NA SF4 . FE4 ? ? 0 CYS 191 0 SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? ? metalc50 metalc ? ? W CYS 289 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? 4 CYS 289 4 ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? ? metalc51 metalc ? ? W CYS 292 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? 4 CYS 292 4 ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? ? metalc52 metalc ? ? W CYS 305 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? 4 CYS 305 4 ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? ? metalc53 metalc ? ? W CYS 308 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . 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ZN ? ? 6 CYS 366 6 ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc63 metalc ? ? X CYS 403 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? 6 CYS 403 6 ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc64 metalc ? ? X CYS 406 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? 6 CYS 406 6 ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc65 metalc ? ? X CYS 429 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? 6 CYS 429 6 ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc66 metalc ? ? X CYS 432 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? 6 CYS 432 6 ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc67 metalc ? ? X CYS 437 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? 6 CYS 437 6 ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? ? metalc68 metalc ? ? X CYS 440 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? 6 CYS 440 6 ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc69 metalc ? ? X CYS 451 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? 6 CYS 451 6 ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? ? metalc70 metalc ? ? X CYS 454 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? 6 CYS 454 6 ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc71 metalc ? ? AA CYS 13 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . 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BA HIS 790 2804 1 Y 1 7 LYS 791 ? BA LYS 791 2805 1 Y 1 7 ARG 792 ? BA ARG 792 2806 1 Y 1 7 PHE 793 ? BA PHE 793 2807 1 Y 1 7 LYS 794 ? BA LYS 794 2808 1 Y 1 7 SER 795 ? BA SER 795 2809 1 Y 1 7 LYS 796 ? BA LYS 796 2810 1 Y 1 7 ALA 797 ? BA ALA 797 2811 1 Y 1 7 VAL 798 ? BA VAL 798 2812 1 Y 1 7 ARG 799 ? BA ARG 799 2813 1 Y 1 7 GLY 800 ? BA GLY 800 2814 1 Y 1 7 GLU 801 ? BA GLU 801 2815 1 Y 1 7 GLY 802 ? BA GLY 802 2816 1 Y 1 7 SER 803 ? BA SER 803 2817 1 Y 1 7 LEU 804 ? BA LEU 804 2818 1 Y 1 7 SER 805 ? BA SER 805 2819 1 Y 1 7 GLY 806 ? BA GLY 806 2820 1 Y 1 7 LEU 807 ? BA LEU 807 2821 1 Y 1 7 ALA 808 ? BA ALA 808 2822 1 Y 1 7 GLY 809 ? BA GLY 809 2823 1 Y 1 7 GLY 810 ? BA GLY 810 2824 1 Y 1 7 GLU 811 ? BA GLU 811 2825 1 Y 1 7 ASP 812 ? BA ASP 812 2826 1 Y 1 7 MET 813 ? BA MET 813 2827 1 Y 1 7 ALA 814 ? BA ALA 814 2828 1 Y 1 7 TYR 815 ? BA TYR 815 2829 1 Y 1 7 MET 816 ? BA MET 816 2830 1 Y 1 7 GLU 817 ? BA GLU 817 2831 1 Y 1 7 TYR 818 ? BA TYR 818 2832 1 Y 1 7 SER 819 ? BA SER 819 2833 1 Y 1 7 THR 820 ? BA THR 820 2834 1 Y 1 7 ASN 821 ? BA ASN 821 2835 1 Y 1 7 LYS 822 ? BA LYS 822 2836 1 Y 1 7 ASN 823 ? BA ASN 823 2837 1 Y 1 7 LYS 824 ? BA LYS 824 2838 1 Y 1 7 GLU 825 ? BA GLU 825 2839 1 Y 1 7 LEU 826 ? BA LEU 826 2840 1 Y 1 7 LYS 827 ? BA LYS 827 2841 1 Y 1 7 GLU 828 ? BA GLU 828 2842 1 Y 1 7 HIS 829 ? BA HIS 829 2843 1 Y 1 7 HIS 830 ? BA HIS 830 2844 1 Y 1 7 PRO 831 ? BA PRO 831 2845 1 Y 1 7 LEU 832 ? BA LEU 832 2846 1 Y 1 7 ILE 833 ? BA ILE 833 2847 1 Y 1 7 ARG 834 ? BA ARG 834 2848 1 Y 1 7 LYS 835 ? BA LYS 835 2849 1 Y 1 7 MET 836 ? BA MET 836 2850 1 Y 1 7 TYR 837 ? BA TYR 837 2851 1 Y 1 7 TYR 838 ? BA TYR 838 2852 1 Y 1 7 LYS 839 ? BA LYS 839 2853 1 Y 1 7 ASN 840 ? BA ASN 840 2854 1 Y 1 7 LEU 841 ? BA LEU 841 2855 1 Y 1 7 LYS 842 ? BA LYS 842 2856 1 Y 1 7 LYS 843 ? 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'Saccharomyces cerevisiae' ? ? 5 4 ? ? 4932 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 45 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? 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RELION 3.1 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7ML0 'double helix' 7ML0 'a-form double helix' 7ML0 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 S DA 1 1_555 T DT 66 1_555 -0.134 -0.364 -0.928 -10.974 -20.086 11.972 1 T_DA99:DT67_N T 99 ? 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