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0000-0001-9959-7713 primary 'Gristick, H.B.' 2 ? primary 'Vielmetter, J.' 3 ? primary 'Keeffe, J.R.' 4 0000-0002-5317-6398 primary 'Gnanapragasam, P.N.P.' 5 ? primary 'Lee, Y.E.' 6 0000-0001-5989-326X primary 'Escolano, A.' 7 ? primary 'Gautam, R.' 8 ? primary 'Seaman, M.S.' 9 ? primary 'Martin, M.A.' 10 0000-0002-6845-9905 primary 'Nussenzweig, M.C.' 11 0000-0003-0592-8564 primary 'Bjorkman, P.J.' 12 0000-0002-2277-3990 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man '8ANC195 G52K5 Fab heavy chain' 26153.283 3 ? ? ? ? 2 polymer man '8ANC195 G52K5 Fab light chain' 23460.047 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'HIV-1 Envelope Glycoprotein BG505 SOSIP.664 gp41' 17146.482 3 ? ? ? ? 4 polymer man 'Envelope glycoprotein BG505 SOSIP.664 gp120' 53864.086 3 ? ? ? ? 5 polymer man 'Ab1245 Fab heavy chain' 28154.803 1 ? ? ? ? 6 polymer 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UNP Q2N0S6 LYS 507 'engineered mutation' 510 22 12 7MXE ARG P 477 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 511 23 12 7MXE ARG P 478 ? UNP Q2N0S6 ? ? insertion 512 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 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F CYS 94 SG ? ? ? 1_555 F CYS 164 SG ? ? G CYS 126 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 99 SG ? ? ? 1_555 F CYS 117 SG ? ? G CYS 131 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 186 SG ? ? ? 1_555 F CYS 215 SG ? ? G CYS 218 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf13 disulf ? ? F CYS 196 SG ? ? ? 1_555 F CYS 207 SG ? ? G CYS 228 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? F CYS 264 SG ? ? ? 1_555 F CYS 298 SG ? ? G CYS 296 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf15 disulf ? ? F CYS 345 SG ? ? ? 1_555 F CYS 411 SG ? ? G CYS 378 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf16 disulf ? ? F CYS 352 SG ? ? ? 1_555 F CYS 384 SG ? ? G CYS 385 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 99 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf18 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 42 SG ? ? J CYS 54 J CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf19 disulf ? ? 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L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf28 disulf ? ? J CYS 22 SG ? ? ? 1_555 J CYS 99 SG ? ? M CYS 22 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf29 disulf ? ? K CYS 23 SG ? ? ? 1_555 K CYS 89 SG ? ? O CYS 23 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf30 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 42 SG ? ? P CYS 54 P CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf31 disulf ? ? L CYS 87 SG ? ? ? 1_555 L CYS 173 SG ? ? P CYS 119 P CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf32 disulf ? ? L CYS 94 SG ? ? ? 1_555 L CYS 164 SG ? ? P CYS 126 P CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf33 disulf ? ? L CYS 99 SG ? ? ? 1_555 L CYS 117 SG ? ? P CYS 131 P CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf34 disulf ? ? L CYS 186 SG ? ? ? 1_555 L CYS 215 SG ? ? P CYS 218 P CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf35 disulf ? ? L CYS 196 SG ? ? ? 1_555 L CYS 207 SG ? ? P CYS 228 P CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf36 disulf ? ? L CYS 264 SG ? ? ? 1_555 L CYS 298 SG ? ? P CYS 296 P CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf37 disulf ? ? L CYS 345 SG ? ? ? 1_555 L CYS 411 SG ? ? P CYS 378 P CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf38 disulf ? ? L CYS 352 SG ? ? ? 1_555 L CYS 384 SG ? ? P CYS 385 P CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf39 disulf ? ? M CYS 41 SG ? ? ? 1_555 M CYS 116 SG ? ? R CYS 22 R CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf40 disulf ? ? N CYS 41 SG ? ? ? 1_555 N CYS 112 SG ? ? W CYS 23 W CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? covale1 covale one ? C ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? C ASN 611 C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? C ASN 637 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? D ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? D ASN 637 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? E ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? F ASN 611 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? E ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? F ASN 637 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? F ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? G ASN 88 G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? F ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? G ASN 133 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? F ASN 116 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? G ASN 156 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? F ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? G ASN 160 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? F ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? G ASN 197 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? F ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? G ASN 234 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? F ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? G ASN 262 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? F ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? G ASN 276 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? F ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? G ASN 295 G NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? F ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? G ASN 301 G NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? F ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? G ASN 332 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? F ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? G ASN 339 G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? F ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? G ASN 355 G NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? F ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? G ASN 363 G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? F ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? G ASN 386 G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? F ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? G ASN 392 G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? F ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? G ASN 448 G NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? H ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? J ASN 88 J NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? H ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? J ASN 133 J NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? H ASN 116 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? J ASN 156 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? H ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? J ASN 160 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? H ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? J ASN 197 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? H ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? J ASN 234 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? H ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? J ASN 262 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? H ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? J ASN 276 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? H ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? J ASN 295 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? H ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? J ASN 301 J NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? H ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? J ASN 332 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? H ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? J ASN 339 J NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? H ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? J ASN 355 J NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? H ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? J ASN 363 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? H ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? J ASN 386 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? H ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? J ASN 392 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? H ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? J ASN 448 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? L ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? P ASN 88 P NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? L ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? P ASN 133 P NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? L ASN 116 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? P ASN 156 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? L ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? P ASN 160 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? L ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? P ASN 197 P NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? L ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? P ASN 234 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? L ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? P ASN 262 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? L ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? P ASN 276 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? L ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? P ASN 295 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? L ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? P ASN 301 P NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? L ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? P ASN 332 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? L ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? P ASN 355 P NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? L ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? P ASN 363 P NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? L ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? P ASN 386 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? L ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? P ASN 392 P NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? L ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? P ASN 448 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale56 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale57 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale58 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale59 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale60 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale61 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale62 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale63 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale64 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale65 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale66 covale both ? W BMA . O3 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale67 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale68 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale69 covale both ? X BMA . O3 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale70 covale both ? X BMA . O6 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale71 covale both ? X MAN . O2 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? X MAN 4 X MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale72 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale73 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale74 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale75 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale76 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 4 Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale77 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 5 Y MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale78 covale both ? Y MAN . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 7 Y MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale79 covale both ? Y MAN . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 7 Y MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale80 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 8 Y MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale81 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 10 Y MAN 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale82 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale83 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale84 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale85 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale86 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale87 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale88 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale89 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale90 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale91 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA BMA . C1 ? ? h NAG 2 h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale92 covale both ? HA BMA . O3 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h BMA 3 h MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale93 covale both ? HA BMA . O6 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h BMA 3 h MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale94 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale95 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale96 covale both ? IA BMA . O3 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale97 covale both ? IA BMA . O6 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale98 covale both ? IA MAN . O2 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i MAN 4 i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale99 covale both ? IA MAN . O2 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i MAN 5 i MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale100 covale both ? IA MAN . O6 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i MAN 7 i MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale101 covale both ? IA MAN . O3 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i MAN 7 i MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale102 covale both ? IA MAN . O2 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i MAN 8 i MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale103 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale104 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA BMA . C1 ? ? j NAG 2 j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale105 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale106 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA BMA . C1 ? ? k NAG 2 k BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale107 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale108 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? m NAG 1 m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale109 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? n NAG 1 n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale110 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale111 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? p NAG 1 p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale112 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA BMA . C1 ? ? p NAG 2 p BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale113 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? q NAG 1 q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale114 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA BMA . C1 ? ? q NAG 2 q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale115 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale116 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA BMA . C1 ? ? r NAG 2 r BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale117 covale both ? RA BMA . O3 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r BMA 3 r MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale118 covale both ? RA BMA . O6 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r BMA 3 r MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale119 covale both ? RA MAN . O2 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r MAN 4 r MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale120 covale both ? RA MAN . O2 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r MAN 5 r MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale121 covale both ? RA MAN . O6 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r MAN 7 r MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale122 covale both ? RA MAN . O3 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r MAN 7 r MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale123 covale both ? RA MAN . O2 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? r MAN 8 r MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale124 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? s NAG 1 s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale125 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA BMA . C1 ? ? s NAG 2 s BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale126 covale both ? SA BMA . O3 ? ? ? 1_555 SA MAN . C1 ? ? s BMA 3 s MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale127 covale both ? SA BMA . O6 ? ? ? 1_555 SA MAN . C1 ? ? s BMA 3 s MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale128 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? t NAG 1 t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 B . ? SER 7 B PRO 8 B ? PRO 8 B 1 -3.76 2 TYR 95 B . ? TYR 94 B PRO 96 B ? PRO 95 B 1 -1.97 3 SER 7 I . ? SER 7 L PRO 8 I ? PRO 8 L 1 -3.10 4 TYR 95 I . ? TYR 94 L PRO 96 I ? PRO 95 L 1 -2.21 5 SER 7 K . ? SER 7 O PRO 8 K ? PRO 8 O 1 -2.63 6 TYR 95 K . ? TYR 94 O PRO 96 K ? PRO 95 O 1 -2.29 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 7 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 6 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 6 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 6 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 6 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 5 ? AE5 ? 5 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB3 6 7 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB7 5 6 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD2 5 6 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? parallel AD9 5 6 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE1 5 6 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE4 4 5 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 HIS A 3 ? VAL A 5 ? HIS A 3 VAL A 5 AA1 2 VAL A 18 ? TYR A 25 ? VAL A 18 TYR A 25 AA1 3 ILE A 81 ? ILE A 86 ? ILE A 77 ILE A 82 AA1 4 VAL A 67 ? VAL A 72 A VAL A 67 VAL A 71 AA2 1 GLU A 10 ? LYS A 12 ? GLU A 10 LYS A 12 AA2 2 THR A 126 ? VAL A 130 ? THR A 107 VAL A 111 AA2 3 VAL A 96 ? SER A 103 ? VAL A 89 SER A 96 AA2 4 TYR A 33 ? GLN A 40 ? TYR A 33 GLN A 39 AA2 5 LEU A 46 ? TRP A 53 ? LEU A 45 TRP A 53 AA2 6 LYS A 56 ? ALA A 59 ? LYS A 56 ALA A 59 AA3 1 HIS A 112 E HIS A 113 F HIS A 100 HIS A 100 AA3 2 VAL A 116 I MET A 117 J VAL A 100 MET A 100 AA4 1 THR B 5 ? SER B 7 ? THR B 5 SER B 7 AA4 2 VAL B 19 ? ARG B 24 ? VAL B 19 ARG B 24 AA4 3 ASP B 71 ? ILE B 76 ? ASP B 70 ILE B 75 AA4 4 PHE B 63 ? ALA B 68 ? PHE B 62 ALA B 67 AA5 1 THR B 10 ? ALA B 13 ? THR B 10 ALA B 13 AA5 2 LYS B 104 ? VAL B 107 ? LYS B 103 VAL B 106 AA6 1 ALA B 54 ? LEU B 55 ? ALA B 53 LEU B 54 AA6 2 PRO B 45 ? TYR B 50 ? PRO B 44 TYR B 49 AA6 3 VAL B 34 ? GLN B 39 ? VAL B 33 GLN B 38 AA6 4 THR B 86 ? GLN B 91 ? THR B 85 GLN B 90 AA7 1 CYS C 94 ? PRO C 98 ? CYS C 605 PRO C 609 AA7 2 TRP L 3 ? ASP L 15 ? TRP P 35 ASP P 47 AA7 3 TYR L 452 ? THR L 465 ? TYR P 486 THR P 499 AA7 4 PHE L 191 ? CYS L 196 ? PHE P 223 CYS P 228 AA7 5 VAL L 210 ? VAL L 213 ? VAL P 242 VAL P 245 AA7 6 GLU L 51 ? HIS L 53 ? GLU P 83 HIS P 85 AA8 1 CYS D 93 ? PRO D 98 ? CYS D 604 PRO D 609 AA8 2 TRP F 3 ? ASP F 15 ? TRP G 35 ASP G 47 AA8 3 LYS F 453 ? THR F 465 ? LYS G 487 THR G 499 AA8 4 PHE F 191 ? CYS F 196 ? PHE G 223 CYS G 228 AA8 5 VAL F 210 ? VAL F 213 ? VAL G 242 VAL G 245 AA8 6 ILE F 52 ? HIS F 53 ? ILE G 84 HIS G 85 AA9 1 CYS E 94 ? PRO E 98 ? CYS F 605 PRO F 609 AA9 2 TRP H 3 ? ASP H 15 ? TRP J 35 ASP J 47 AA9 3 TYR H 452 ? THR H 465 ? TYR J 486 THR J 499 AA9 4 PHE H 191 ? CYS H 196 ? PHE J 223 CYS J 228 AA9 5 VAL H 210 ? VAL H 213 ? VAL J 242 VAL J 245 AA9 6 ILE H 52 ? LEU H 54 ? ILE J 84 LEU J 86 AB1 1 GLU F 59 ? ASN F 62 ? GLU G 91 ASN G 94 AB1 2 THR F 204 ? CYS F 207 ? THR G 236 CYS G 239 AB2 1 LYS F 129 ? TYR F 137 ? LYS G 169 TYR G 177 AB2 2 LEU F 114 ? THR F 122 ? LEU G 154 THR G 162 AB2 3 LEU F 97 ? ASN F 101 ? LEU G 129 ASN G 133 AB2 4 LYS F 157 ? LEU F 161 ? LYS G 189 LEU G 193 AB2 5 VAL F 141 ? GLN F 143 ? VAL G 181 GLN G 183 AB3 1 LEU F 227 ? LEU F 229 ? LEU G 259 LEU G 261 AB3 2 ILE F 409 ? ARG F 422 ? ILE G 443 ARG G 456 AB3 3 VAL F 260 ? ARG F 266 ? VAL G 292 ARG G 298 AB3 4 ALA F 296 ? SER F 301 ? ALA G 329 SER G 334 AB3 5 SER F 379 ? LYS F 387 ? SER G 413 LYS G 421 AB3 6 GLU F 348 ? CYS F 352 ? GLU G 381 CYS G 385 AB3 7 HIS F 341 ? CYS F 345 ? HIS G 374 CYS G 378 AB4 1 MET F 239 ? ARG F 241 ? MET G 271 ARG G 273 AB4 2 ILE F 252 ? GLN F 255 ? ILE G 284 GLN G 287 AB4 3 ILE F 409 ? ARG F 422 ? ILE G 443 ARG G 456 AB4 4 THR F 433 ? PRO F 436 ? THR G 467 PRO G 470 AB4 5 ILE F 326 ? PHE F 328 ? ILE G 359 PHE G 361 AB4 6 THR F 361 ? TRP F 362 ? THR G 394 TRP G 395 AB5 1 ARG F 272 ? GLY F 278 ? ARG G 304 GLY G 312 AB5 2 GLN F 281 ? THR F 286 ? GLN G 315 THR G 320 AB6 1 HIS G 3 ? 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SerialEM ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION ? 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? 14 'MODEL REFINEMENT' ? Coot ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 4.7 _em_specimen.details ;Ab1245 was incubated with BG505 SOSIP at room temperature for 3 hours, after which 8ANC195 Fab was added and the complex was incubated overnight at RT before SEC purification and concentration to 4.7 mg/mL. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'HIVRAD P01 AI100148' 1 'Bill & Melinda Gates Foundation' 'United States' 'CAVD INV-002143' 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero O 7 NAG 1 E NAG 1 C NAG 705 n O 7 NAG 2 E NAG 2 C NAG 706 n P 7 NAG 1 I NAG 1 D NAG 705 n P 7 NAG 2 I NAG 2 D NAG 706 n Q 7 NAG 1 K NAG 1 F NAG 664 n Q 7 NAG 2 K NAG 2 F NAG 665 n R 7 NAG 1 N NAG 1 G NAG 508 n R 7 NAG 2 N NAG 2 G NAG 509 n S 7 NAG 1 Q NAG 1 G NAG 510 n S 7 NAG 2 Q NAG 2 G NAG 511 n T 7 NAG 1 S NAG 1 G NAG 515 n T 7 NAG 2 S NAG 2 G NAG 516 n U 7 NAG 1 T NAG 1 G NAG 517 n U 7 NAG 2 T NAG 2 G NAG 518 n V 7 NAG 1 U NAG 1 G NAG 562 n V 7 NAG 2 U NAG 2 G NAG 563 n W 8 NAG 1 V NAG 1 G NAG 572 n W 8 NAG 2 V NAG 2 G NAG 573 n W 8 BMA 3 V BMA 3 G BMA 574 n W 8 MAN 4 V MAN 4 G MAN 575 n X 9 NAG 1 X NAG 1 G NAG 577 n X 9 NAG 2 X NAG 2 G NAG 578 n X 9 BMA 3 X BMA 3 G BMA 579 n X 9 MAN 4 X MAN 4 G MAN 582 n X 9 MAN 5 X MAN 5 G MAN 583 n X 9 MAN 6 X MAN 6 G MAN 580 n Y 10 NAG 1 Y NAG 1 G NAG 584 n Y 10 NAG 2 Y NAG 2 G NAG 585 n Y 10 BMA 3 Y BMA 3 G BMA 586 n Y 10 MAN 4 Y MAN 4 G MAN 592 n Y 10 MAN 5 Y MAN 5 G MAN 593 n Y 10 MAN 6 Y MAN 6 G MAN 594 n Y 10 MAN 7 Y MAN 7 G MAN 587 n Y 10 MAN 8 Y MAN 8 G MAN 590 n Y 10 MAN 9 Y MAN 9 G MAN 591 n Y 10 MAN 10 Y MAN 10 G MAN 588 n Y 10 MAN 11 Y MAN 11 G MAN 589 n Z 7 NAG 1 Z NAG 1 J NAG 510 n Z 7 NAG 2 Z NAG 2 J NAG 511 n AA 7 NAG 1 a NAG 1 J NAG 515 n AA 7 NAG 2 a NAG 2 J NAG 516 n BA 7 NAG 1 b NAG 1 J NAG 517 n BA 7 NAG 2 b NAG 2 J NAG 518 n CA 7 NAG 1 c NAG 1 J NAG 533 n CA 7 NAG 2 c NAG 2 J NAG 534 n DA 7 NAG 1 d NAG 1 J NAG 545 n DA 7 NAG 2 d NAG 2 J NAG 546 n EA 7 NAG 1 e NAG 1 J NAG 548 n EA 7 NAG 2 e NAG 2 J NAG 549 n FA 7 NAG 1 f NAG 1 J NAG 550 n FA 7 NAG 2 f NAG 2 J NAG 551 n GA 7 NAG 1 g NAG 1 J NAG 562 n GA 7 NAG 2 g NAG 2 J NAG 563 n HA 11 NAG 1 h NAG 1 J NAG 578 n HA 11 NAG 2 h NAG 2 J NAG 579 n HA 11 BMA 3 h BMA 3 J BMA 580 n HA 11 MAN 4 h MAN 4 J MAN 582 n HA 11 MAN 5 h MAN 5 J MAN 581 n IA 12 NAG 1 i NAG 1 J NAG 583 n IA 12 NAG 2 i NAG 2 J NAG 584 n IA 12 BMA 3 i BMA 3 J BMA 585 n IA 12 MAN 4 i MAN 4 J MAN 590 n IA 12 MAN 5 i MAN 5 J MAN 591 n IA 12 MAN 6 i MAN 6 J MAN 592 n IA 12 MAN 7 i MAN 7 J MAN 586 n IA 12 MAN 8 i MAN 8 J MAN 587 n IA 12 MAN 9 i MAN 9 J MAN 588 n IA 12 MAN 10 i MAN 10 J MAN 589 n JA 13 NAG 1 j NAG 1 J NAG 593 n JA 13 NAG 2 j NAG 2 J NAG 594 n JA 13 BMA 3 j BMA 3 J BMA 595 n KA 13 NAG 1 k NAG 1 J NAG 596 n KA 13 NAG 2 k NAG 2 J NAG 597 n KA 13 BMA 3 k BMA 3 J BMA 598 n LA 7 NAG 1 l NAG 1 P NAG 510 n LA 7 NAG 2 l NAG 2 P NAG 511 n MA 7 NAG 1 m NAG 1 P NAG 515 n MA 7 NAG 2 m NAG 2 P NAG 516 n NA 7 NAG 1 n NAG 1 P NAG 533 n NA 7 NAG 2 n NAG 2 P NAG 534 n OA 7 NAG 1 o NAG 1 P NAG 553 n OA 7 NAG 2 o NAG 2 P NAG 554 n PA 13 NAG 1 p NAG 1 P NAG 562 n PA 13 NAG 2 p NAG 2 P NAG 563 n PA 13 BMA 3 p BMA 3 P BMA 564 n QA 13 NAG 1 q NAG 1 P NAG 572 n QA 13 NAG 2 q NAG 2 P NAG 573 n QA 13 BMA 3 q BMA 3 P BMA 574 n RA 12 NAG 1 r NAG 1 P NAG 577 n RA 12 NAG 2 r NAG 2 P NAG 578 n RA 12 BMA 3 r BMA 3 P BMA 579 n RA 12 MAN 4 r MAN 4 P MAN 585 n RA 12 MAN 5 r MAN 5 P MAN 586 n RA 12 MAN 6 r MAN 6 P MAN 587 n RA 12 MAN 7 r MAN 7 P MAN 580 n RA 12 MAN 8 r MAN 8 P MAN 581 n RA 12 MAN 9 r MAN 9 P MAN 582 n RA 12 MAN 10 r MAN 10 P MAN 583 n SA 11 NAG 1 s NAG 1 P NAG 588 n SA 11 NAG 2 s NAG 2 P NAG 589 n SA 11 BMA 3 s BMA 3 P BMA 590 n SA 11 MAN 4 s MAN 4 P MAN 591 n SA 11 MAN 5 s MAN 5 P MAN 592 n TA 7 NAG 1 t NAG 1 P NAG 594 n TA 7 NAG 2 t NAG 2 P NAG 595 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide 13 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 7 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 7 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 7 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 8 DManpa1-3DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 8 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 8 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 9 'DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 9 'WURCS=2.0/3,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-f1_d2-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 9 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 10 10 'DManpa1-2DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-2DManpa1-6]DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 11 10 ;WURCS=2.0/3,11,10/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-g1_d2-e1_e2-f1_g3-h1_g6-j1_h2-i1_j2-k1 ; WURCS PDB2Glycan 1.1.0 12 10 ;[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}[(6+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? 13 11 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 14 11 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 15 11 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 16 12 'DManpa1-2DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-2DManpa1-6[DManpa1-3]DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 17 12 ;WURCS=2.0/3,10,9/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-g1_d2-e1_e2-f1_g3-h1_g6-i1_i2-j1 ; WURCS PDB2Glycan 1.1.0 18 12 ;[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? 19 13 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 20 13 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 21 13 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 8 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 6 9 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 7 9 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 8 9 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 9 9 6 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 10 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 11 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 12 10 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 13 10 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 14 10 6 MAN C1 O1 5 MAN O2 HO2 sing ? 15 10 7 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 16 10 8 MAN C1 O1 7 MAN O3 HO3 sing ? 17 10 9 MAN C1 O1 8 MAN O2 HO2 sing ? 18 10 10 MAN C1 O1 7 MAN O6 HO6 sing ? 19 10 11 MAN C1 O1 10 MAN O2 HO2 sing ? 20 11 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 21 11 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 22 11 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 23 11 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 24 12 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 25 12 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 26 12 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 27 12 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 28 12 6 MAN C1 O1 5 MAN O2 HO2 sing ? 29 12 7 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 30 12 8 MAN C1 O1 7 MAN O6 HO6 sing ? 31 12 9 MAN C1 O1 8 MAN O2 HO2 sing ? 32 12 10 MAN C1 O1 7 MAN O3 HO3 sing ? 33 13 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 34 13 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 8 MAN 4 n 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n 9 BMA 3 n 9 MAN 4 n 9 MAN 5 n 9 MAN 6 n 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n 10 MAN 4 n 10 MAN 5 n 10 MAN 6 n 10 MAN 7 n 10 MAN 8 n 10 MAN 9 n 10 MAN 10 n 10 MAN 11 n 11 NAG 1 n 11 NAG 2 n 11 BMA 3 n 11 MAN 4 n 11 MAN 5 n 12 NAG 1 n 12 NAG 2 n 12 BMA 3 n 12 MAN 4 n 12 MAN 5 n 12 MAN 6 n 12 MAN 7 n 12 MAN 8 n 12 MAN 9 n 12 MAN 10 n 13 NAG 1 n 13 NAG 2 n 13 BMA 3 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 14 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'light scattering' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #