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n 2 247 THR n 2 248 PHE n 2 249 LYS n 2 250 GLY n 2 251 LYS n 2 252 LEU n 2 253 HIS n 2 254 VAL n 2 255 PRO n 2 256 PHE n 2 257 VAL n 2 258 PRO n 2 259 VAL n 2 260 LYS n 2 261 ALA n 2 262 LYS n 2 263 CYS n 2 264 ILE n 2 265 ALA n 2 266 THR n 2 267 LEU n 2 268 ALA n 2 269 PRO n 2 270 GLU n 2 271 PRO n 2 272 LEU n 2 273 VAL n 2 274 GLU n 2 275 HIS n 2 276 LYS n 2 277 HIS n 2 278 ARG n 2 279 THR n 2 280 LEU n 2 281 ILE n 2 282 LEU n 2 283 HIS n 2 284 LEU n 2 285 HIS n 2 286 PRO n 2 287 ASP n 2 288 HIS n 2 289 PRO n 2 290 THR n 2 291 LEU n 2 292 LEU n 2 293 THR n 2 294 THR n 2 295 ARG n 2 296 SER n 2 297 LEU n 2 298 GLY n 2 299 SER n 2 300 ASP n 2 301 ALA n 2 302 ASN n 2 303 PRO n 2 304 THR n 2 305 ARG n 2 306 GLN n 2 307 TRP n 2 308 ILE n 2 309 GLU n 2 310 ARG n 2 311 PRO n 2 312 THR n 2 313 THR n 2 314 VAL n 2 315 ASN n 2 316 PHE n 2 317 THR n 2 318 VAL n 2 319 THR n 2 320 GLY n 2 321 GLU n 2 322 GLY n 2 323 LEU n 2 324 GLU n 2 325 TYR n 2 326 THR n 2 327 TRP n 2 328 GLY n 2 329 ASN n 2 330 HIS n 2 331 PRO n 2 332 PRO n 2 333 LYS n 2 334 ARG n 2 335 VAL n 2 336 TRP n 2 337 ALA n 2 338 GLN n 2 339 GLU n 2 340 SER n 2 341 GLY n 2 342 GLU n 2 343 GLY n 2 344 ASN n 2 345 PRO n 2 346 HIS n 2 347 GLY n 2 348 TRP n 2 349 PRO n 2 350 HIS n 2 351 GLU n 2 352 VAL n 2 353 VAL n 2 354 VAL n 2 355 TYR n 2 356 TYR n 2 357 TYR n 2 358 ASN n 2 359 ARG n 2 360 TYR n 2 361 PRO n 2 362 LEU n 2 363 THR n 2 364 THR n 2 365 ILE n 2 366 ILE n 2 367 GLY n 2 368 LEU n 2 369 CYS n 2 370 THR n 2 371 CYS n 2 372 VAL n 2 373 ALA n 2 374 ILE n 2 375 ILE n 2 376 MET n 2 377 VAL n 2 378 SER n 2 379 CYS n 2 380 VAL n 2 381 THR n 2 382 SER n 2 383 VAL n 2 384 TRP n 2 385 LEU n 2 386 LEU n 2 387 CYS n 2 388 ARG n 2 389 THR n 2 390 ARG n 2 391 ASN n 2 392 LEU n 2 393 CYS n 2 394 ILE n 2 395 THR n 2 396 PRO n 2 397 TYR n 2 398 LYS n 2 399 LEU n 2 400 ALA n 2 401 PRO n 2 402 ASN n 2 403 ALA n 2 404 GLN n 2 405 VAL n 2 406 PRO n 2 407 ILE n 2 408 LEU n 2 409 LEU n 2 410 ALA n 2 411 LEU n 2 412 LEU n 2 413 CYS n 2 414 CYS n 2 415 ILE n 2 416 LYS n 2 417 PRO n 2 418 THR n 2 419 ARG n 2 420 ALA n # loop_ _entity_src_gen.entity_id _entity_src_gen.pdbx_src_id _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag _entity_src_gen.pdbx_seq_type _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num _entity_src_gen.gene_src_common_name _entity_src_gen.gene_src_genus _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene _entity_src_gen.gene_src_species _entity_src_gen.gene_src_strain _entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 441 'EEEV, Eastern equine encephalomyelitis virus' ? ? ? 'Florida 91-469' ? ? ? ? 'Eastern equine encephalitis virus (strain Florida 91-469)' 374598 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Cricetinae gen. sp.' 36483 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 420 'EEEV, Eastern equine encephalomyelitis virus' ? ? ? 'Florida 91-469' ? ? ? ? 'Eastern equine encephalitis virus (strain Florida 91-469)' 374598 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Cricetinae gen. sp.' 36483 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP POLS_EEEVF Q4QXJ7 ? 1 ;YEHTAVMPNKVGIPYKALVERPGYAPVHLQIQLVNTRIIPSTNLEYITCKYKTKVPSPVVKCCGATQCTSKPHPDYQCQV FTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQMSEAYVERSEECSIDHAKAYKVHTGTVQAMVNITYGSVSWRSADVYVNGETPAKIGDA KLIIGPLSSAWSPFDNKVVVYGHEVYNYDFPEYGTGKAGSFGDLQSRTSTSNDLYANTNLKLQRPQAGIVHTPFTQAPSG FERWKRDKGAPLNDVAPFGCSIALEPLRAENCAVGSIPISIDIPDAAFTRISETPTVSDLECKITECTYASDFGGIATVA YKSSKAGNCPIHSPSGVAVIKENDVTLAESGSFTFHFSTANIHPAFKLQVCTSAVTCKGDCKPPKDHIVDYPAQHTESFT SAISATAWSWLKVLVGGTSAFIVLGLIATAVVALVLFFHRH ; 802 2 UNP POLS_EEEVF Q4QXJ7 ? 2 ;DLDTHFTQYKLARPYIADCPNCGHSRCDSPIAIEEVRGDAHAGVIRIQTSAMFGLKTDGVDLAYMSFMNGKTQKSIKIDN LHVRTSAPCSLVSHHGYYILAQCPPGDTVTVGFHDGPNRHTCTVAHKVEFRPVGREKYRHPPEHGVELPCNRYTHKRADQ GHYVEMHQPGLVADHSLLSIHSAKVKITVPSGAQVKYYCKCPDVREGITSSDHTTTCTDVKQCRAYLIDNKKWVYNSGRL PRGEGDTFKGKLHVPFVPVKAKCIATLAPEPLVEHKHRTLILHLHPDHPTLLTTRSLGSDANPTRQWIERPTTVNFTVTG EGLEYTWGNHPPKRVWAQESGEGNPHGWPHEVVVYYYNRYPLTTIIGLCTCVAIIMVSCVTSVWLLCRTRNLCITPYKLA PNAQVPILLALLCCIKPTRA ; 325 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7N69 A 1 ? 441 ? 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'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7N69 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7N69 _struct.title 'Pre-fusion state 2 of EEEV with localized reconstruction' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7N69 _struct_keywords.text 'EEEV, pre-fusion, localized reconstruction, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 1 ? L N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 239 ? ARG A 246 ? SER A 239 ARG A 246 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 251 ? ALA A 256 ? PRO A 251 ALA A 256 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 284 ? PHE A 288 ? PRO A 284 PHE A 288 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 SER C 239 ? ARG C 246 ? SER C 239 ARG C 246 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO C 284 ? PHE C 288 ? PRO C 284 PHE C 288 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 SER E 239 ? 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PRO K 284 PHE K 288 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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B CYS 89 SG ? ? ? 1_555 B CYS 103 SG ? ? B CYS 89 B CYS 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 150 SG ? ? ? 1_555 B CYS 263 SG ? ? B CYS 150 B CYS 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 49 SG ? ? ? 1_555 C CYS 114 SG ? ? C CYS 49 C CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 62 SG ? ? ? 1_555 C CYS 94 SG ? ? C CYS 62 C CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf14 disulf ? ? C CYS 63 SG ? ? ? 1_555 C CYS 96 SG ? ? C CYS 63 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf15 disulf ? ? C CYS 68 SG ? ? ? 1_555 C CYS 78 SG ? ? C CYS 68 C CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? disulf16 disulf ? ? C CYS 260 SG ? ? ? 1_555 C CYS 272 SG ? ? C CYS 260 C CYS 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf17 disulf ? ? C CYS 302 SG ? ? ? 1_555 C CYS 377 SG ? ? C CYS 302 C CYS 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? ? disulf18 disulf ? ? C CYS 307 SG ? ? ? 1_555 C CYS 381 SG ? ? C CYS 307 C CYS 381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf19 disulf ? ? 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