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'bamA, yaeT, yzzN, yzzY, b0177, JW0172' ? K12 ? ? ? ? 'Escherichia coli (strain K12)' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 392 ? ? 'bamB, yfgL, b2512, JW2496' ? K12 ? ? ? ? 'Escherichia coli (strain K12)' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 344 ? ? 'bamC, dapX, nlpB, b2477, JW2462' ? K12 ? ? ? ? 'Escherichia coli (strain K12)' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 'Biological sequence' 1 245 ? ? 'bamD, yfiO, b2595, JW2577' ? K12 ? ? ? ? 'Escherichia coli (strain K12)' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 123 ? ? 'bamE, smpA, b2617, JW2598' ? K12 ? ? ? ? 'Escherichia coli (strain K12)' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP BAMA_ECOLI P0A940 ? 1 ;MAMKKLLIASLLFSSATVYGAEGFVVKDIHFEGLQRVAVGAALLSMPVRTGDTVNDEDISNTIRALFATGNFEDVRVLRD GDTLLVQVKERPTIASITFSGNKSVKDDMLKQNLEASGVRVGESLDRTTIADIEKGLEDFYYSVGKYSASVKAVVTPLPR NRVDLKLVFQEGVSAEIQQINIVGNHAFTTDELISHFQLRDEVPWWNVVGDRKYQKQKLAGDLETLRSYYLDRGYARFNI DSTQVSLTPDKKGIYVTVNITEGDQYKLSGVEVSGNLAGHSAEIEQLTKIEPGELYNGTKVTKMEDDIKKLLGRYGYAYP RVQSMPEINDADKTVKLRVNVDAGNRFYVRKIRFEGNDTSKDAVLRREMRQMEGAWLGSDLVDQGKERLNRLGFFETVDT DTQRVPGSPDQVDVVYKVKERNTGSFNFGIGYGTESGVSFQAGVQQDNWLGTGYAVGINGTKNDYQTYAELSVTNPYFTV DGVSLGGRLFYNDFQADDADLSDYTNKSYGTDVTLGFPINEYNSLRAGLGYVHNSLSNMQPQVAMWRYLYSMGEHPSTSD QDNSFKTDDFTFNYGWTYNKLDRGYFPTDGSRVNLTGKVTIPGSDNEYYKVTLDTATYVPIDDDHKWVVLGRTRWGYGDG LGGKEMPFYENFYAGGSSTVRGFQSNTIGPKAVYFPHQASNYDPDYDYECATQDGAKDLCKSDDAVGGNAMAVASLEFIT PTPFISDKYANSVRTSFFWDMGTVWDTNWDSSQYSGYPDYSDPSNIRMSAGIALQWMSPLGPLVFSYAQPFKKYDGDKAE QFQFNIGKTW ; 1 2 UNP BAMB_ECOLI P77774 ? 2 ;MQLRKLLLPGLLSVTLLSGCSLFNSEEDVVKMSPLPTVENQFTPTTAWSTSVGSGIGNFYSNLHPALADNVVYAADRAGL VKALNADDGKEIWSVSLAEKDGWFSKEPALLSGGVTVSGGHVYIGSEKAQVYALNTSDGTVAWQTKVAGEALSRPVVSDG LVLIHTSNGQLQALNEADGAVKWTVNLDMPSLSLRGESAPTTAFGAAVVGGDNGRVSAVLMEQGQMIWQQRISQATGSTE IDRLSDVDTTPVVVNGVVFALAYNGNLTALDLRSGQIMWKRELGSVNDFIVDGNRIYLVDQNDRVMALTIDGGVTLWTQS DLLHRLLTSPVLYNGNLVVGDSEGYLHWINVEDGRFVAQQKVDSSGFQTEPVAADGKLLIQAKDGTVYSITR ; 1 3 UNP BAMC_ECOLI P0A903 ? 3 ;MAYSVQKSRLAKVAGVSLVLLLAACSSDSRYKRQVSGDEAYLEAAPLAELHAPAGMILPVTSGDYAIPVTNGSGAVGKAL DIRPPAQPLALVSGARTQFTGDTASLLVENGRGNTLWPQVVSVLQAKNYTITQRDDAGQTLTTDWVQWNRLDEDEQYRGR YQISVKPQGYQQAVTVKLLNLEQAGKPVADAASMQRYSTEMMNVISAGLDKSATDAANAAQNRASTTMDVQSAADDTGLP MLVVRGPFNVVWQRLPAALEKVGMKVTDSTRSQGNMAVTYKPLSDSDWQELGASDPGLASGDYKLQVGDLDNRSSLQFID PKGHTLTQSQNDALVAVFQAAFSK ; 1 4 UNP BAMD_ECOLI P0AC02 ? 4 ;MTRMKYLVAAATLSLFLAGCSGSKEEVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYY KNADLPLAQAAIDRFIRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYT TDATKRLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKIIAA NSSNT ; 1 5 UNP BAME_ECOLI P0A937 ? 5 ;MRCKTLTAAAAVLLMLTAGCSTLERVVYRPDINQGNYLTANDVSKIRVGMTQQQVAYALGTPLMSDPFGTNTWFYVFRQQ PGHEGVTQQTLTLTFNSSGVLTNIDNKPALSGN ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7NBX A 1 ? 810 ? P0A940 1 ? 810 ? 1 810 2 2 7NBX B 1 ? 392 ? P77774 1 ? 392 ? 1 392 3 3 7NBX C 1 ? 344 ? P0A903 1 ? 344 ? 1 344 4 4 7NBX D 1 ? 245 ? P0AC02 1 ? 245 ? 1 245 5 5 7NBX E 1 ? 113 ? P0A937 1 ? 113 ? 1 113 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7NBX CYS A 435 ? UNP P0A940 GLU 435 'engineered mutation' 435 1 1 7NBX CYS A 665 ? UNP P0A940 SER 665 'engineered mutation' 665 2 1 7NBX SER A 690 ? UNP P0A940 CYS 690 'engineered mutation' 690 3 1 7NBX SER A 700 ? UNP P0A940 CYS 700 'engineered mutation' 700 4 5 7NBX GLY E 114 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 114 5 5 7NBX GLY E 115 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 115 6 5 7NBX HIS E 116 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 116 7 5 7NBX HIS E 117 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 117 8 5 7NBX HIS E 118 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 118 9 5 7NBX HIS E 119 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 119 10 5 7NBX HIS E 120 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 120 11 5 7NBX HIS E 121 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 121 12 5 7NBX HIS E 122 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 122 13 5 7NBX HIS E 123 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 123 14 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7NBX _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7NBX _struct.title 'Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7NBX _struct_keywords.text 'Outer membrane protein assembly, beta-barrel, Gram negative bacteria, protein foldase, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 38 ? MET A 46 ? ALA A 38 MET A 46 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 57 ? PHE A 67 ? GLU A 57 PHE A 67 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 106 ? GLY A 118 ? LYS A 106 GLY A 118 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 129 ? GLY A 145 ? THR A 129 GLY A 145 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU A 192 ? PHE A 197 ? GLU A 192 PHE A 197 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 GLN A 215 ? LEU A 231 ? GLN A 215 LEU A 231 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 AA7 HIS A 280 ? THR A 288 ? HIS A 280 THR A 288 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 AA8 GLY A 298 ? TYR A 315 ? GLY A 298 TYR A 315 1 ? 18 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 380 ? GLY A 393 ? ASP A 380 GLY A 393 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 448 ? THR A 452 ? ASN A 448 THR A 452 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 GLN A 542 ? GLY A 553 ? GLN A 542 GLY A 553 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 726 ? ASN A 731 ? SER A 726 ASN A 731 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO D 31 ? ASP D 45 ? PRO D 31 ASP D 45 1 ? 15 HELX_P HELX_P14 AB5 TRP D 48 ? TYR D 62 ? TRP D 48 TYR D 62 1 ? 15 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR D 67 ? ALA D 83 ? TYR D 67 ALA D 83 1 ? 17 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP D 84 ? ASN D 99 ? ASP D 84 ASN D 99 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN D 104 ? ASP D 121 ? ASN D 104 ASP D 121 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO D 137 ? TYR D 154 ? PRO D 137 TYR D 154 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP D 162 ? GLY D 189 ? ASP D 162 GLY D 189 1 ? 28 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL D 192 ? TYR D 205 ? VAL D 192 TYR D 205 1 ? 14 HELX_P HELX_P21 AC3 THR D 208 ? ASP D 213 ? THR D 208 ASP D 213 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 ALA D 214 ? MET D 225 ? ALA D 214 MET D 225 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 GLN D 230 ? ASN D 241 ? GLN D 230 ASN D 241 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN E 41 ? ILE E 46 ? ASN E 41 ILE E 46 5 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 THR E 51 ? GLY E 60 ? THR E 51 GLY E 60 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_conn.id disulf1 _struct_conn.conn_type_id disulf _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.ptnr1_label_asym_id A _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 435 _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id A _struct_conn.ptnr2_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 665 _struct_conn.ptnr2_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id A _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 435 _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id A _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 665 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.details ? _struct_conn.pdbx_dist_value 2.031 _struct_conn.pdbx_value_order ? _struct_conn.pdbx_role ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 16 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 6 7 ? anti-parallel AA6 7 8 ? anti-parallel AA6 8 9 ? anti-parallel AA6 9 10 ? anti-parallel AA6 10 11 ? anti-parallel AA6 11 12 ? anti-parallel AA6 12 13 ? anti-parallel AA6 13 14 ? anti-parallel AA6 14 15 ? anti-parallel AA6 15 16 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASP A 28 ? 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N ALA B 133 O ALA B 142 ? O ALA B 142 AB3 1 2 N VAL B 162 ? N VAL B 162 O LEU B 174 ? O LEU B 174 AB3 2 3 N ALA B 173 ? N ALA B 173 O LYS B 182 ? O LYS B 182 AB4 1 2 N THR B 201 ? N THR B 201 O VAL B 208 ? O VAL B 208 AB4 2 3 N ALA B 207 ? N ALA B 207 O VAL B 219 ? O VAL B 219 AB4 3 4 N ALA B 218 ? N ALA B 218 O TRP B 228 ? O TRP B 228 AB5 1 2 N VAL B 252 ? N VAL B 252 O PHE B 259 ? O PHE B 259 AB5 2 3 N VAL B 258 ? N VAL B 258 O LEU B 270 ? O LEU B 270 AB5 3 4 N LEU B 267 ? N LEU B 267 O ARG B 281 ? O ARG B 281 AB6 1 2 N ILE B 296 ? N ILE B 296 O LEU B 308 ? O LEU B 308 AB6 2 3 N VAL B 305 ? N VAL B 305 O GLN B 319 ? O GLN B 319 AB7 1 2 N VAL B 331 ? N VAL B 331 O VAL B 338 ? O VAL B 338 AB8 1 2 N LEU B 346 ? N LEU B 346 O GLN B 360 ? O GLN B 360 AB9 1 2 N GLN E 34 ? N GLN E 34 O ARG E 78 ? O ARG E 78 AB9 2 3 N TRP E 73 ? N TRP E 73 O LEU E 93 ? O LEU E 93 AB9 3 4 N THR E 94 ? N THR E 94 O ASN E 103 ? 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VMD was then used to setup cMDFF simulations that were run using NAMD. Both 7BNQ and 5LJO were used as initial models, with the best fitting parts of each then combined and flexibly fit again to generate the final conformation. This was then Real Space Refined in Phenix to generate the final structure ; _em_3d_fitting.overall_b_value 211 _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 1 1 ? A 24-675 7BNQ 1 2 ? A 702-810 7BNQ 1 3 ? A 720-734 5LJO 1 4 ? A 807-808 5LJO 1 5 ? B ? 7BNQ 1 6 ? C ? 7BNQ 1 7 ? D ? 7BNQ 1 8 ? 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