data_7NK7 # _entry.id 7NK7 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.352 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7NK7 pdb_00007nk7 10.2210/pdb7nk7/pdb WWPDB D_1292112789 ? ? EMDB EMD-12432 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-12377 'other EM volume' PDB . 7NJK unspecified EMDB 'Mycobacterium smegmatis ATP synthase F1 state 1' EMD-12432 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7NK7 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-02-17 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Montgomery, M.G.' 1 0000-0001-6142-9423 'Petri, J.' 2 ? 'Spikes, T.E.' 3 0000-0002-2432-8006 'Walker, J.E.' 4 0000-0001-7929-2162 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 118 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structure of the ATP synthase from Mycobacterium smegmatis provides targets for treating tuberculosis.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.2111899118 _citation.pdbx_database_id_PubMed 34782468 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Montgomery, M.G.' 1 0000-0001-6142-9423 primary 'Petri, J.' 2 ? primary 'Spikes, T.E.' 3 0000-0002-2432-8006 primary 'Walker, J.E.' 4 0000-0001-7929-2162 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7NK7 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7NK7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'ATP synthase subunit alpha' 58951.461 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer man 'ATP synthase subunit beta' 51670.453 3 7.1.2.2 ? ? 'Uniprot A0R200. The crossref text box is blank.' 3 polymer man 'ATP synthase gamma chain' 33439.836 1 ? ? ? ;This alignment is not correct. There are no mismatches but there are breaks in the peptide. UNIPROT A0R201. The crossref text box is missing below. ; 4 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 4 ? ? ? ? 5 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 5 ? ? ? ? 6 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 2 ? ? ? ? 7 water nat water 18.015 459 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP synthase F1 sector subunit alpha,F-ATPase subunit alpha' 2 'ATP synthase F1 sector subunit beta,F-ATPase subunit beta' 3 'ATP synthase F1 sector gamma subunit,F-ATPase gamma subunit' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLVRGVEVT DTGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGGKIALFG GAGVGKTVLIQEMINRIARNFGGTSVFAGVGERTREGNDLWVELADANVLKDTALVFGQMDEPPGTRMRVALSALTMAEF FRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSTLLGRMPSAVGYQPTLADEMGELQERITSTRGRSITSMQAVYVPADDYTDPAP ATTFAHLDATTELSRAVFSKGIFPAVDPLASSSTILDPAIVGDEHYRVAQEVIRILQRYKDLQDIIAILGIDELSEEDKQ LVNRARRIERFLSQNMMAAEQFTGQPGSTVPLKETIEAFDKLTKGEFDHLPEQAFFLIGGLDDLAKKAESLGAKL ; ;MTATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLVRGVEVT DTGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGGKIALFG GAGVGKTVLIQEMINRIARNFGGTSVFAGVGERTREGNDLWVELADANVLKDTALVFGQMDEPPGTRMRVALSALTMAEF FRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSTLLGRMPSAVGYQPTLADEMGELQERITSTRGRSITSMQAVYVPADDYTDPAP ATTFAHLDATTELSRAVFSKGIFPAVDPLASSSTILDPAIVGDEHYRVAQEVIRILQRYKDLQDIIAILGIDELSEEDKQ LVNRARRIERFLSQNMMAAEQFTGQPGSTVPLKETIEAFDKLTKGEFDHLPEQAFFLIGGLDDLAKKAESLGAKL ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MAATLRELRGRIRSAGSIKKITKAQELIATSRIAKAQARVEAARPYAAEITNMLTELAGASALDHPLLVERKQPKRAGVL VVSSDRGLCGAYNANVLRRAEELFSLLRDEGKDPVLYVVGRKALGYFSFRQRTVVESWTGFSERPTYENAREIADTLVNA FMAGADDEGDDAGADGILGVDELHIVFTEFRSMLSQTAVARRAAPMEVEYVGEVETGPRTLYSFEPDPETLFDALLPRYI ATRVYAALLEAAASESASRRRAMKSATDNADDLIKALTLAANRERQAQITQEISEIVGGANALAGSK ; ;MAATLRELRGRIRSAGSIKKITKAQELIATSRIAKAQARVEAARPYAAEITNMLTELAGASALDHPLLVERKQPKRAGVL VVSSDRGLCGAYNANVLRRAEELFSLLRDEGKDPVLYVVGRKALGYFSFRQRTVVESWTGFSERPTYENAREIADTLVNA FMAGADDEGDDAGADGILGVDELHIVFTEFRSMLSQTAVARRAAPMEVEYVGEVETGPRTLYSFEPDPETLFDALLPRYI ATRVYAALLEAAASESASRRRAMKSATDNADDLIKALTLAANRERQAQITQEISEIVGGANALAGSK ; G ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 GLU n 1 4 LEU n 1 5 THR n 1 6 ILE n 1 7 SER n 1 8 ALA n 1 9 ALA n 1 10 ASP n 1 11 ILE n 1 12 GLU n 1 13 GLY n 1 14 ALA n 1 15 ILE n 1 16 GLU n 1 17 ASP n 1 18 TYR n 1 19 VAL n 1 20 SER n 1 21 SER n 1 22 PHE n 1 23 SER n 1 24 ALA n 1 25 ASP 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PRO n 1 199 LYS n 1 200 GLN n 1 201 GLN n 1 202 VAL n 1 203 ARG n 1 204 CYS n 1 205 VAL n 1 206 TYR n 1 207 VAL n 1 208 ALA n 1 209 ILE n 1 210 GLY n 1 211 GLN n 1 212 LYS n 1 213 GLY n 1 214 THR n 1 215 THR n 1 216 ILE n 1 217 ALA n 1 218 SER n 1 219 VAL n 1 220 LYS n 1 221 ARG n 1 222 ALA n 1 223 LEU n 1 224 GLU n 1 225 GLU n 1 226 GLY n 1 227 GLY n 1 228 ALA n 1 229 MET n 1 230 GLU n 1 231 TYR n 1 232 THR n 1 233 THR n 1 234 ILE n 1 235 VAL n 1 236 ALA n 1 237 ALA n 1 238 PRO n 1 239 ALA n 1 240 SER n 1 241 ASP n 1 242 ALA n 1 243 ALA n 1 244 GLY n 1 245 PHE n 1 246 LYS n 1 247 TRP n 1 248 LEU n 1 249 ALA n 1 250 PRO n 1 251 TYR n 1 252 THR n 1 253 GLY n 1 254 SER n 1 255 ALA n 1 256 ILE n 1 257 GLY n 1 258 GLN n 1 259 HIS n 1 260 TRP n 1 261 MET n 1 262 TYR n 1 263 ASN n 1 264 GLY n 1 265 LYS n 1 266 HIS n 1 267 VAL n 1 268 LEU n 1 269 ILE n 1 270 VAL n 1 271 PHE n 1 272 ASP n 1 273 ASP n 1 274 LEU n 1 275 SER n 1 276 LYS n 1 277 GLN n 1 278 ALA n 1 279 ASP n 1 280 ALA n 1 281 TYR n 1 282 ARG n 1 283 ALA n 1 284 ILE n 1 285 SER n 1 286 LEU n 1 287 LEU n 1 288 LEU n 1 289 ARG n 1 290 ARG n 1 291 PRO n 1 292 PRO n 1 293 GLY n 1 294 ARG n 1 295 GLU n 1 296 ALA n 1 297 PHE n 1 298 PRO n 1 299 GLY n 1 300 ASP n 1 301 VAL n 1 302 PHE n 1 303 TYR n 1 304 LEU n 1 305 HIS n 1 306 SER n 1 307 ARG n 1 308 LEU n 1 309 LEU n 1 310 GLU n 1 311 ARG n 1 312 CYS n 1 313 ALA n 1 314 LYS n 1 315 LEU n 1 316 SER n 1 317 ASP n 1 318 GLU n 1 319 LEU n 1 320 GLY n 1 321 GLY n 1 322 GLY n 1 323 SER n 1 324 MET n 1 325 THR n 1 326 GLY n 1 327 LEU n 1 328 PRO n 1 329 ILE n 1 330 ILE n 1 331 GLU n 1 332 THR n 1 333 LYS n 1 334 ALA n 1 335 ASN n 1 336 ASP n 1 337 ILE n 1 338 SER n 1 339 ALA n 1 340 PHE n 1 341 ILE n 1 342 PRO n 1 343 THR n 1 344 ASN n 1 345 VAL n 1 346 ILE n 1 347 SER n 1 348 ILE n 1 349 THR n 1 350 ASP n 1 351 GLY n 1 352 GLN n 1 353 CYS n 1 354 PHE n 1 355 LEU n 1 356 GLU n 1 357 SER n 1 358 ASP n 1 359 LEU n 1 360 PHE n 1 361 ASN n 1 362 GLN n 1 363 GLY n 1 364 VAL n 1 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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 548 'Mycobacterium smegmatis' ? 'atpA, MSMEG_4938, MSMEI_4811' ? 'ATCC 700084 / mc(2)155' ? ? ? ? 'Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155)' 246196 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mycolicibacterium smegmatis' 1772 ? ? ? ? ? ? 'mc2 4517' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 475 'Mycobacterium smegmatis' ? 'atpD, MSMEG_4936, MSMEI_4809' ? 'ATCC 700084 / mc(2)155' ? ? ? ? 'Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155)' 246196 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mycolicibacterium smegmatis' 1772 ? ? ? ? ? ? 'mc2 4517' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 307 ? ? 'atpG, MSMEG_4937, MSMEI_4810' ? 'ATCC 700084 / mc(2)155' ? ? ? ? 'Mycobacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155)' 246196 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mycolicibacterium smegmatis' 1772 ? ? ? ? ? ? 'mc2 4517' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATPA_MYCS2 A0R202 ? 1 ;MAELTISAADIEGAIEDYVSSFSADTEREEIGTVIDAGDGIAHVEGLPSVMTQELLEFPGGVLGVALNLDEHSVGAVILG EFEKIEEGQQVKRTGEVLSVPVGDAFLGRVVNPLGQPIDGQGDIAAETRRALELQAPSVVQRQSVSEPLQTGIKAIDAMT PIGRGQRQLIIGDRKTGKTAVCVDTILNQREAWLTGDPKQQVRCVYVAIGQKGTTIASVKRALEEGGAMEYTTIVAAPAS DAAGFKWLAPYTGSAIGQHWMYNGKHVLIVFDDLSKQADAYRAISLLLRRPPGREAFPGDVFYLHSRLLERCAKLSDELG GGSMTGLPIIETKANDISAFIPTNVISITDGQCFLESDLFNQGVRPAINVGVSVSRVGGAAQIKAMKEVAGSLRLDLSQY RELEAFAAFASDLDAASKAQLDRGARLVELLKQPQYSPLAVEEQVVAIFLGTQGHLDSVPVEDVQRFESELLEHVKASHS DIFDGIRETKKLSEEAEEKLVSVINEFKKGFQASDGSSVVVSENAEALDPEDLEKESVKVRKPAPKKA ; 1 2 UNP ATPB_MYCS2 A0R200 ? 2 ;MTATAEKTAGRVVRITGPVVDVEFPRGSVPELFNALHAEITFGALAKTLTLEVAQHLGDSLVRCISMQPTDGLVRGVEVT DTGASISVPVGDGVKGHVFNALGDCLDDPGYGKDFEHWSIHRKPPAFSDLEPRTEMLETGLKVVDLLTPYVRGGKIALFG GAGVGKTVLIQEMINRIARNFGGTSVFAGVGERTREGNDLWVELADANVLKDTALVFGQMDEPPGTRMRVALSALTMAEF FRDEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSTLLGRMPSAVGYQPTLADEMGELQERITSTRGRSITSMQAVYVPADDYTDPAP ATTFAHLDATTELSRAVFSKGIFPAVDPLASSSTILDPAIVGDEHYRVAQEVIRILQRYKDLQDIIAILGIDELSEEDKQ LVNRARRIERFLSQNMMAAEQFTGQPGSTVPLKETIEAFDKLTKGEFDHLPEQAFFLIGGLDDLAKKAESLGAKL ; 1 3 UNP ATPG_MYCS2 A0R201 ? 3 ;MAATLRELRGRIRSAGSIKKITKAQELIATSRIAKAQARVEAARPYAAEITNMLTELAGASALDHPLLVERKQPKRAGVL VVSSDRGLCGAYNANVLRRAEELFSLLRDEGKDPVLYVVGRKALGYFSFRQRTVVESWTGFSERPTYENAREIADTLVNA FMAGADDEGDDAGADGILGVDELHIVFTEFRSMLSQTAVARRAAPMEVEYVGEVETGPRTLYSFEPDPETLFDALLPRYI ATRVYAALLEAAASESASRRRAMKSATDNADDLIKALTLAANRERQAQITQEISEIVGGANALAGSK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7NK7 A 1 ? 548 ? A0R202 1 ? 548 ? 1 548 2 1 7NK7 B 1 ? 548 ? A0R202 1 ? 548 ? 1 548 3 1 7NK7 C 1 ? 548 ? A0R202 1 ? 548 ? 1 548 4 2 7NK7 D 1 ? 475 ? A0R200 1 ? 475 ? 1 475 5 2 7NK7 E 1 ? 475 ? A0R200 1 ? 475 ? 1 475 6 2 7NK7 F 1 ? 475 ? A0R200 1 ? 475 ? 1 475 7 3 7NK7 G 1 ? 307 ? A0R201 1 ? 307 ? 1 307 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7NK7 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7NK7 _struct.title 'Mycobacterium smegmatis ATP synthase F1 state 1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7NK7 _struct_keywords.text 'complex, synthase, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 5 ? P N N 6 ? Q N N 4 ? R N N 5 ? S N N 7 ? T N N 7 ? U N N 7 ? V N N 7 ? W N N 7 ? X N N 7 ? Y N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 59 ? GLY A 61 ? PRO A 59 GLY A 61 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 81 ? ILE A 85 ? GLU A 81 ILE A 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 103 ? LEU A 107 ? GLY A 103 LEU A 107 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 ILE A 153 ? THR A 160 ? ILE A 153 THR A 160 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 177 ? GLN A 189 ? GLY A 177 GLN A 189 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 GLN A 189 ? THR A 195 ? GLN A 189 THR A 195 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 212 ? GLY A 226 ? LYS A 212 GLY A 226 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA A 242 ? TYR A 262 ? ALA A 242 TYR A 262 1 ? 21 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 273 ? LEU A 288 ? ASP A 273 LEU A 288 1 ? 16 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY A 293 ? PHE A 297 ? GLY A 293 PHE A 297 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP A 300 ? GLU A 310 ? ASP A 300 GLU A 310 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 316 ? GLY A 320 ? SER A 316 GLY A 320 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA A 339 ? THR A 349 ? ALA A 339 THR A 349 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU A 356 ? GLN A 362 ? GLU A 356 GLN A 362 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 VAL A 377 ? GLN A 382 ? VAL A 377 GLN A 382 5 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 ILE A 383 ? GLY A 391 ? ILE A 383 GLY A 391 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 SER A 392 ? GLU A 404 ? SER A 392 GLU A 404 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA A 405 ? ALA A 407 ? ALA A 405 ALA A 407 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP A 414 ? LYS A 432 ? ASP A 414 LYS A 432 1 ? 19 HELX_P HELX_P20 AC2 ALA A 440 ? GLN A 453 ? ALA A 440 GLN A 453 1 ? 14 HELX_P HELX_P21 AC3 PRO A 460 ? GLU A 462 ? PRO A 460 GLU A 462 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP A 463 ? HIS A 479 ? ASP A 463 HIS A 479 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 AC5 HIS A 479 ? LYS A 490 ? HIS A 479 LYS A 490 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 493 ? PHE A 511 ? SER A 493 PHE A 511 1 ? 19 HELX_P HELX_P25 AC7 GLU B 81 ? ILE B 85 ? GLU B 81 ILE B 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY B 103 ? LEU B 107 ? GLY B 103 LEU B 107 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 SER B 138 ? ARG B 142 ? SER B 138 ARG B 142 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE B 153 ? THR B 160 ? ILE B 153 THR B 160 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY B 177 ? ASN B 188 ? GLY B 177 ASN B 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 AD3 GLN B 189 ? THR B 195 ? GLN B 189 THR B 195 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 LYS B 212 ? GLY B 226 ? LYS B 212 GLY B 226 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 AD5 ALA B 228 ? GLU B 230 ? ALA B 228 GLU B 230 5 ? 3 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA B 242 ? TYR B 262 ? 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F MG 601 F HOH 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 272 A . ? ASP 272 A ASP 273 A ? ASP 273 A 1 7.04 2 ARG 365 A . ? ARG 365 A PRO 366 A ? PRO 366 A 1 0.45 3 ASP 272 B . ? ASP 272 B ASP 273 B ? 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