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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Roberts, G.A.' 1 ? primary 'Ozkan, B.' 2 ? primary 'Gachulincova, I.' 3 ? primary ;O'Dwyer, M.R. ; 4 ? primary 'Hall-Ponsele, E.' 5 ? primary 'Saxena, M.' 6 ? primary 'Robinson, P.J.' 7 ? primary 'Soufi, A.' 8 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7NL0 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? 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'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7NL0 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7NL0 _struct.title 'Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7NL0 _struct_keywords.text 'Reprogramming, Oct4 binding sites, Nucleosome, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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J 59 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DA 21 1_555 J DT 142 1_555 I DG 22 1_555 J DC 141 1_555 -0.395 -0.673 4.465 4.575 -0.416 34.848 -1.030 1.583 4.387 -0.690 -7.598 35.140 2 II_DA-58DG-57:DC57DT58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DG 22 1_555 J DC 141 1_555 I DT 23 1_555 J DA 140 1_555 -0.388 2.018 4.073 4.258 -26.558 43.774 4.365 0.774 2.495 -32.268 -5.173 51.029 3 II_DG-57DT-56:DA56DC57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DT 23 1_555 J DA 140 1_555 I DG 24 1_555 J DC 139 1_555 1.365 0.710 3.311 0.340 1.145 45.373 0.817 -1.739 3.336 1.484 -0.440 45.388 4 II_DT-56DG-55:DC55DA56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DG 24 1_555 J DC 139 1_555 I DG 25 1_555 J DC 138 1_555 -0.977 0.843 3.268 -5.781 -0.799 38.286 1.372 0.752 3.357 -1.209 8.752 38.712 5 II_DG-55DG-54:DC54DC55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 I DG 25 1_555 J DC 138 1_555 I DT 26 1_555 J DA 137 1_555 -0.244 -1.475 3.404 -2.692 -1.994 32.281 -2.269 -0.063 3.495 -3.575 4.825 32.450 6 II_DG-54DT-53:DA53DC54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? 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J 48 ? 1 I DA 31 1_555 J DT 132 1_555 I DT 32 1_555 J DA 131 1_555 -0.207 -0.570 3.413 -2.439 1.663 35.229 -1.194 -0.034 3.389 2.741 4.020 35.349 12 II_DA-48DT-47:DA47DT48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DT 32 1_555 J DA 131 1_555 I DT 33 1_555 J DA 130 1_555 0.654 0.571 3.313 2.496 -0.813 35.357 1.060 -0.701 3.337 -1.337 -4.103 35.452 13 II_DT-47DT-46:DA46DA47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DT 33 1_555 J DA 130 1_555 I DA 34 1_555 J DT 129 1_555 -0.100 1.564 3.719 -2.981 -3.959 41.101 2.686 -0.214 3.558 -5.615 4.228 41.386 14 II_DT-46DA-45:DT45DA46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 34 1_555 J DT 129 1_555 I DA 35 1_555 J DT 128 1_555 -0.797 1.334 3.428 -6.022 -5.248 39.770 2.535 0.451 3.314 -7.621 8.745 40.533 15 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 35 1_555 J DT 128 1_555 I DC 36 1_555 J DG 127 1_555 -0.490 -0.133 3.282 -9.051 1.475 33.158 -0.461 -0.618 3.289 2.526 15.495 34.368 16 II_DA-44DC-43:DG43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? 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