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'Eyring, J.' 3 0000-0001-6120-9834 'Irobalieva, R.N.' 4 0000-0003-3540-4294 'Kowal, J.' 5 0000-0003-4694-1896 'Lin, C.W.' 6 0000-0003-4777-2916 'Locher, K.P.' 7 0000-0002-8207-2889 'Aebi, M.' 8 0000-0003-1350-7153 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Glycobiology _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 9999 _citation.journal_id_ISSN 1460-2423 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 31 _citation.language ? _citation.page_first 1604 _citation.page_last 1615 _citation.title 'Functional analysis of Ost3p and Ost6p containing yeast oligosaccharyltransferases.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1093/glycob/cwab084 _citation.pdbx_database_id_PubMed 34974622 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Neuhaus, J.D.' 1 ? primary 'Wild, R.' 2 ? primary 'Eyring, J.' 3 ? primary 'Irobalieva, R.N.' 4 ? primary 'Kowal, J.' 5 ? primary 'Lin, C.W.' 6 ? primary 'Locher, K.P.' 7 ? primary 'Aebi, M.' 8 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7OCI _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7OCI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1' 54116.477 1 2.4.99.18 ? ? ? 2 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit OST2' 14712.531 1 2.4.99.18 ? ? ? 3 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit OST6' 37921.344 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit OST4' 3986.696 1 2.4.99.18 ? ? ? 5 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit OST5' 9525.090 1 2.4.99.18 ? ? ? 6 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3' 81604.539 1 2.4.99.18 ? ? ? 7 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit WBP1' 49444.438 1 2.4.99.18 ? ? ? 8 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit SWP1' 31682.832 1 2.4.99.18 ? ? ? 9 polymer nat 'Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit OST6 - TM1' 2060.531 1 2.4.99.18 ? ? 'alpha-helix modelled as poly-UNK' 10 branched syn '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 1 ? ? ? ? 11 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1235.105 1 ? ? ? ? 12 non-polymer syn 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine 744.034 6 ? ? ? ? 13 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 3 ? ? ? ? 14 non-polymer syn Digitonin 1229.312 2 ? ? ? ? 15 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 ? ? ? ? 16 non-polymer syn Dolichylphosphate 847.282 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Oligosaccharyl transferase 64 kDa subunit,Oligosaccharyl transferase subunit OST1,Oligosaccharyl transferase subunit alpha' 2 'Oligosaccharyl transferase subunit OST2,Oligosaccharyl transferase 16 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D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MTYEQLYKEFHSSKSFQPFIHLDTQPKFAICGLIVTLAVLSSALFAVGSKSSYIKKLFFYTILSVIGSLFAGLTTVFASN SFGVYV ; ;MTYEQLYKEFHSSKSFQPFIHLDTQPKFAICGLIVTLAVLSSALFAVGSKSSYIKKLFFYTILSVIGSLFAGLTTVFASN SFGVYV ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGSDRSCVLSVFQTILKLVIFVAIFGAAISSRLFAVIKFESIIHEFDPWFNYRATKYLVNNSFYKFLNWFDDRTWYPLGR VTGGTLYPGLMTTSAFIWHALRNWLGLPIDIRNVCVLFAPLFSGVTAWATYEFTKEIKDASAGLLAAGFIAIVPGYISRS VAGSYDNEAIAITLLMVTFMFWIKAQKTGSIMHATCAALFYFYMVSAWGGYVFITNLIPLHVFLLILMGRYSSKLYSAYT TWYAIGTVASMQIPFVGFLPIRSNDHMAALGVFGLIQIVAFGDFVKGQISTAKFKVIMMVSLFLILVLGVVGLSALTYMG LIAPWTGRFYSLWDTNYAKIHIPIIASVSEHQPVSWPAFFFDTHFLIWLFPAGVFLLFLDLKDEHVFVIAYSVLCSYFAG VMVRLMLTLTPVICVSAAVALSKIFDIYLDFKTSDRKYAIKPAALLAKLIVSGSFIFYLYLFVFHSTWVTRTAYSSPSVV LPSQTPDGKLALIDDFREAYYWLRMNSDEDSKVAAWWDYGYQIGGMADRTTLVDNNTWNNTHIAIVGKAMASPEEKSYEI LKEHDVDYVLVIFGGLIGFGGDDINKFLWMIRISEGIWPEEIKERDFYTAEGEYRVDARASETMRNSLLYKMSYKDFPQL FNGGQATDRVRQQMITPLDVPPLDYFDEVFTSENWMVRIYQLKKDDAQGRTLRDVGELTRSSTKTRRSIKRPELGLRV ; 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'Saccharomyces cerevisiae S288C' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 204508 ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP OST1_YEAST P41543 ? 1 ;MRQVWFSWIVGLFLCFFNVSSAAQYEPPATWENVDYKRTIDVSNAYISETIEITIKNIASEPATEYFTAFESGIFSKVSF FSAYFTNEATFLNSQLLANSTTAPGDDGESEIRYGIIQFPNAISPQEEVSLVIKSFYNTVGIPYPEHVGMSEEQHLLWET NRLPLSAYDTKKASFTLIGSSSFEEYHPPNDESLLGKANGNSFEFGPWEDIPRFSSNETLAIVYSHNAPLNQVVNLRRDI WLSHWASTIQFEEYYELTNKAAKLSKGFSRLELMKQIQTQNMRQTHFVTVLDMLLPEGATDHYFTDLVGLVSTSHAERDH FFIRPRFPIFGGWNYNFTVGWTNKLSDFLHVSSGSDEKFVASIPILNGPPDTVYDNVELSVFLPEGAEIFDIDSPVPFTN VSIETQKSYFDLNKGHVKLTFSYRNLISQVANGQVLIKYDYPKSSFFKKPLSIACYIFTALMGVFVLKTLNMNVTN ; 1 2 UNP OST2_YEAST P46964 ? 2 ;MAKAPKANTPKVTSTSSAVLTDFQETFKTSKRAYFAQIEKYPKLKLIDTFCFFLVLLGVIQCTFIILIRDNFPFNAFLAG FIICVGQFVLLMSLRLQLCNSFPGISKNRAFAEFIVASLILHFVCLHFIN ; 1 3 UNP OST6_YEAST Q03723 ? 3 ;MKWCSTYIIIWLAIIFHKFQKSTATASHNIDDILQLKDDTGVITVTADNYPLLSRGVPGYFNILYITMRGTNSNGMSCQL CHDFEKTYHAVADVIRSQAPQSLNLFFTVDVNEVPQLVKDLKLQNVPHLVVYPPAESNKQSQFEWKTSPFYQYSLVPENA ENTLQFGDFLAKILNISITVPQAFNVQEFVYYFVACMVVFIFIKKVILPKVTNKWKLFSMILSLGILLPSITGYKFVEMN AIPFIARDAKNRIMYFSGGSGWQFGIEIFSVSLMYIVMSALSVLLIYVPKISCVSEKMRGLLSSFLACVLFYFFSYFISC YLIKNPGYPIVF ; 1 4 UNP OST4_YEAST Q99380 ? 4 MISDEQLNSLAITFGIVMMTLIVIYHAVDSTMSPKN 1 5 UNP OST5_YEAST Q92316 ? 5 ;MTYEQLYKEFHSSKSFQPFIHLDTQPKFAICGLIVTLAVLSSALFAVGSKSSYIKKLFFYTILSVIGSLFAGLTTVFASN SFGVYV ; 1 6 UNP STT3_YEAST P39007 ? 6 ;MGSDRSCVLSVFQTILKLVIFVAIFGAAISSRLFAVIKFESIIHEFDPWFNYRATKYLVNNSFYKFLNWFDDRTWYPLGR VTGGTLYPGLMTTSAFIWHALRNWLGLPIDIRNVCVLFAPLFSGVTAWATYEFTKEIKDASAGLLAAGFIAIVPGYISRS VAGSYDNEAIAITLLMVTFMFWIKAQKTGSIMHATCAALFYFYMVSAWGGYVFITNLIPLHVFLLILMGRYSSKLYSAYT TWYAIGTVASMQIPFVGFLPIRSNDHMAALGVFGLIQIVAFGDFVKGQISTAKFKVIMMVSLFLILVLGVVGLSALTYMG LIAPWTGRFYSLWDTNYAKIHIPIIASVSEHQPVSWPAFFFDTHFLIWLFPAGVFLLFLDLKDEHVFVIAYSVLCSYFAG VMVRLMLTLTPVICVSAAVALSKIFDIYLDFKTSDRKYAIKPAALLAKLIVSGSFIFYLYLFVFHSTWVTRTAYSSPSVV LPSQTPDGKLALIDDFREAYYWLRMNSDEDSKVAAWWDYGYQIGGMADRTTLVDNNTWNNTHIAIVGKAMASPEEKSYEI LKEHDVDYVLVIFGGLIGFGGDDINKFLWMIRISEGIWPEEIKERDFYTAEGEYRVDARASETMRNSLLYKMSYKDFPQL FNGGQATDRVRQQMITPLDVPPLDYFDEVFTSENWMVRIYQLKKDDAQGRTLRDVGELTRSSTKTRRSIKRPELGLRV ; 1 7 UNP OSTB_YEAST P33767 ? 7 ;MRTDWNFFFCILLQAIFVVGTQTSRTLVLYDQSTEPLEEYSVYLKDLEQRNYKLEYLDINSTSTTVDLYDKEQRLFDNII VFPTKGGKNLARQIPVKQLIKFFENEGNILCMSSPGAVPNTIRLFLNELGIYPSPKGHVIRDYFSPSSEELVVSSNHLLN KYVYNARKSEDFVFGESSAALLENREQIVPILNAPRTSFTESKGKCNSWTSGSQGFLVVGFQNLNNARLVWIGSSDFLKN KNQDSNQEFAKELLKWTFNEKSVIKSVHAVHSHADGTSYDEEPYKIKDKVIYSVGFSEWNGEEWLPHIADDIQFELRQVD PYYRLTLSPSGNDSETQYYTTGEFILPDRHGVFTFLTDYRKIGLSFTTDKDVKAIRHLANDEYPRSWEISNSWVYISAIC GVIVAWIFFVVSFVTTSSVGKKLETFKKTN ; 1 8 UNP OSTD_YEAST Q02795 ? 8 ;MQFFKTLAALVSCISFVLAYVAQDVHVSFPSTAGKSRVMIGKVEPRIGIDETVPTTITVEDPNEVIQVNFAIESTNKPFQ NTLLIGLPNKNLEMAFEPEIKDNGKLSMYKYRIDLAKLDAALLQEASRSPEPIKATLILASSTAKPKENLFREILQLNLN FDVDHSDSSLVDKFGIKPEIHHIFHAEPKRVAKPIAVIFVLIIFITILSLIVTWLNSCAAAFNNIPTGVTAVYFLGFIAT IVGFEVIFARYYLGTSIFETLFSSLYLGAPGLLTSTKFLRSFGQTI ; 1 9 PDB 7OCI 7OCI ? 9 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7OCI A 1 ? 476 ? P41543 1 ? 476 ? 1 476 2 2 7OCI B 1 ? 130 ? P46964 1 ? 130 ? 1 130 3 3 7OCI C 1 ? 332 ? Q03723 1 ? 332 ? 1 332 4 4 7OCI D 1 ? 36 ? Q99380 1 ? 36 ? 1 36 5 5 7OCI E 1 ? 86 ? Q92316 1 ? 86 ? 1 86 6 6 7OCI F 1 ? 718 ? P39007 1 ? 718 ? 1 718 7 7 7OCI G 1 ? 430 ? P33767 1 ? 430 ? 1 430 8 8 7OCI H 1 ? 286 ? Q02795 1 ? 286 ? 0 286 9 9 7OCI I 1 ? 24 ? 7OCI 1 ? 24 ? 1 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight AJP non-polymer . Digitonin ? 'C56 H92 O29' 1229.312 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PEE non-polymer n 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine DOPE 'C41 H78 N O8 P' 744.034 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 V8K non-polymer . Dolichylphosphate ? 'C55 H91 O4 P' 847.282 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7OCI _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7OCI _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 17526 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.639 ? 23801 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.810 ? 6186 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.048 ? 2714 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 2920 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7OCI _struct.title 'Cryo-EM structure of yeast Ost6p containing oligosaccharyltransferase complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7OCI _struct_keywords.text 'N-glycosylation, Yeast, Complex, Endoplasmic reticulum, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 12 ? O N N 14 ? P N N 12 ? Q N N 12 ? R N N 14 ? S N N 15 ? T N N 12 ? U N N 16 ? V N N 13 ? W N N 13 ? X N N 12 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 71 ? SER A 76 ? GLU A 71 SER A 76 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 SER A 269 ? ILE A 277 ? SER A 269 ILE A 277 1 ? 9 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 442 ? PHE A 447 ? PRO A 442 PHE A 447 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 PHE A 447 ? LEU A 470 ? PHE A 447 LEU A 470 1 ? 24 HELX_P HELX_P5 AA5 GLN B 24 ? TYR B 41 ? GLN B 24 TYR B 41 1 ? 18 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU B 44 ? ILE B 68 ? LEU B 44 ILE B 68 1 ? 25 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO B 73 ? ASN B 100 ? PRO B 73 ASN B 100 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN B 108 ? ASN B 130 ? ASN B 108 ASN B 130 1 ? 23 HELX_P HELX_P9 AA9 TRP C 215 ? THR C 232 ? TRP C 215 THR C 232 1 ? 18 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY C 233 ? ASN C 240 ? GLY C 233 ASN C 240 1 ? 8 HELX_P HELX_P11 AB2 PHE C 264 ? VAL C 288 ? PHE C 264 VAL C 288 1 ? 25 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO C 289 ? ILE C 291 ? PRO C 289 ILE C 291 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 SER C 295 ? ASN C 325 ? SER C 295 ASN C 325 1 ? 31 HELX_P HELX_P14 AB5 SER D 3 ? SER D 33 ? SER D 3 SER D 33 1 ? 31 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR E 3 ? SER E 13 ? TYR E 3 SER E 13 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 THR E 24 ? SER E 49 ? THR E 24 SER E 49 1 ? 26 HELX_P HELX_P17 AB8 SER E 52 ? GLY E 83 ? SER E 52 GLY E 83 1 ? 32 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL F 8 ? SER F 31 ? VAL F 8 SER F 31 1 ? 24 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU F 33 ? LYS F 38 ? 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LEU F 369 ASP F 380 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS F 382 ? MET F 402 ? LYS F 382 MET F 402 1 ? 21 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU F 405 ? ASP F 430 ? LEU F 405 ASP F 430 1 ? 26 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO F 442 ? ALA F 473 ? PRO F 442 ALA F 473 1 ? 32 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP F 495 ? SER F 507 ? ASP F 495 SER F 507 1 ? 13 HELX_P HELX_P38 AE2 TYR F 519 ? MET F 526 ? TYR F 519 MET F 526 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN F 540 ? MET F 550 ? ASN F 540 MET F 550 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 PRO F 553 ? LEU F 561 ? PRO F 553 LEU F 561 1 ? 9 HELX_P HELX_P41 AE5 LYS F 586 ? GLY F 596 ? LYS F 586 GLY F 596 1 ? 11 HELX_P HELX_P42 AE6 LYS F 603 ? TYR F 608 ? LYS F 603 TYR F 608 1 ? 6 HELX_P HELX_P43 AE7 SER F 627 ? TYR F 634 ? SER F 627 TYR F 634 1 ? 8 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP F 636 ? PHE F 641 ? ASP F 636 PHE F 641 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 THR F 691 ? SER F 701 ? THR F 691 SER F 701 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 AF1 PRO G 36 ? GLU G 39 ? PRO G 36 GLU G 39 5 ? 4 HELX_P HELX_P47 AF2 TYR G 40 ? GLN G 49 ? TYR G 40 GLN G 49 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 AF3 GLY G 86 ? ILE G 94 ? GLY G 86 ILE G 94 1 ? 9 HELX_P HELX_P49 AF4 PRO G 95 ? ASN G 105 ? PRO G 95 ASN G 105 1 ? 11 HELX_P HELX_P50 AF5 PRO G 119 ? GLY G 130 ? PRO G 119 GLY G 130 1 ? 12 HELX_P HELX_P51 AF6 ASN G 156 ? LEU G 158 ? ASN G 156 LEU G 158 5 ? 3 HELX_P HELX_P52 AF7 SER G 211 ? GLY G 215 ? SER G 211 GLY G 215 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 ASN G 246 ? PHE G 258 ? ASN G 246 PHE G 258 1 ? 13 HELX_P HELX_P54 AF9 ALA G 379 ? TYR G 383 ? ALA G 379 TYR G 383 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 TRP G 393 ? VAL G 414 ? TRP G 393 VAL G 414 1 ? 22 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP H 119 ? SER H 129 ? ASP H 119 SER H 129 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 AG3 ALA H 192 ? ASN H 216 ? ALA H 192 ASN H 216 1 ? 25 HELX_P HELX_P58 AG4 THR H 227 ? TYR H 252 ? THR H 227 TYR H 252 1 ? 26 HELX_P HELX_P59 AG5 SER H 256 ? PHE H 282 ? SER H 256 PHE H 282 1 ? 27 HELX_P HELX_P60 AG6 UNK I 2 ? UNK I 21 ? UNK I 2 UNK I 21 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale one ? A ASN 336 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 336 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 400 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 400 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? F ASN 539 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? F ASN 539 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? G ASN 60 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? G ASN 60 G NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? G ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? G ASN 332 G NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale6 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale7 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale8 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale9 covale both ? K BMA . O3 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale10 covale both ? K BMA . O6 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale11 covale both ? K MAN . O2 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J MAN 4 J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale12 covale both ? K MAN . O2 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J MAN 5 J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? metalc1 metalc ? ? F ASP 47 OD2 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? F ASP 47 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? ? metalc2 metalc ? ? S MG . MG ? ? ? 1_555 U V8K . O59 ? ? F MG 901 F V8K 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 8 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 7 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB3 6 7 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 78 ? 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HIS A 416 TYR A 423 AA4 8 ASN A 400 ? GLN A 406 ? ASN A 400 GLN A 406 AA5 1 LEU A 291 ? MET A 293 ? LEU A 291 MET A 293 AA5 2 HIS A 320 ? ILE A 323 ? HIS A 320 ILE A 323 AA5 3 SER A 314 ? GLU A 317 ? SER A 314 GLU A 317 AA6 1 LEU A 349 ? VAL A 351 ? LEU A 349 VAL A 351 AA6 2 LYS A 358 ? PRO A 364 ? LYS A 358 PRO A 364 AA6 3 GLN A 434 ? ASP A 440 ? GLN A 434 ASP A 440 AA6 4 GLU A 388 ? ASP A 393 ? GLU A 388 ASP A 393 AA7 1 VAL A 373 ? TYR A 374 ? VAL A 373 TYR A 374 AA7 2 LEU A 426 ? ILE A 427 ? LEU A 426 ILE A 427 AA8 1 ALA C 246 ? ARG C 247 ? ALA C 246 ARG C 247 AA8 2 ILE C 253 ? MET C 254 ? ILE C 253 MET C 254 AA9 1 PHE F 70 ? ASP F 71 ? PHE F 70 ASP F 71 AA9 2 ARG F 80 ? VAL F 81 ? ARG F 80 VAL F 81 AB1 1 THR F 530 ? THR F 531 ? THR F 530 THR F 531 AB1 2 LYS F 512 ? ALA F 514 ? LYS F 512 ALA F 514 AB1 3 TYR F 568 ? ILE F 572 ? TYR F 568 ILE F 572 AB1 4 VAL F 677 ? LEU F 682 ? VAL F 677 LEU F 682 AB1 5 PHE F 666 ? THR F 671 ? PHE F 666 THR F 671 AB2 1 ALA F 646 ? THR F 647 ? ALA F 646 THR F 647 AB2 2 MET F 654 ? ILE F 655 ? MET F 654 ILE F 655 AB3 1 GLU G 55 ? LEU G 57 ? GLU G 55 LEU G 57 AB3 2 LEU G 27 ? LEU G 29 ? LEU G 27 LEU G 29 AB3 3 ASN G 78 ? VAL G 81 ? ASN G 78 VAL G 81 AB3 4 ASN G 108 ? MET G 112 ? ASN G 108 MET G 112 AB3 5 ARG G 228 ? ILE G 232 ? ARG G 228 ILE G 232 AB3 6 VAL G 218 ? GLN G 222 ? VAL G 218 GLN G 222 AB3 7 ILE G 188 ? PRO G 190 ? ILE G 188 PRO G 190 AB4 1 ILE G 131 ? TYR G 132 ? ILE G 131 TYR G 132 AB4 2 LEU G 181 ? LEU G 182 ? LEU G 181 LEU G 182 AB5 1 VAL G 139 ? ARG G 141 ? VAL G 139 ARG G 141 AB5 2 PHE G 199 ? GLU G 201 ? PHE G 199 GLU G 201 AB6 1 LEU G 151 ? SER G 154 ? LEU G 151 SER G 154 AB6 2 ASP G 171 ? PHE G 174 ? ASP G 171 PHE G 174 AB7 1 VAL G 263 ? HIS G 273 ? VAL G 263 HIS G 273 AB7 2 LYS G 289 ? TRP G 299 ? LYS G 289 TRP G 299 AB7 3 GLN G 337 ? THR G 340 ? GLN G 337 THR G 340 AB7 4 SER G 328 ? ASN G 332 ? SER G 328 ASN G 332 AB8 1 TRP G 304 ? PRO G 306 ? TRP G 304 PRO G 306 AB8 2 LYS G 289 ? TRP G 299 ? LYS G 289 TRP G 299 AB8 3 PHE G 344 ? ILE G 345 ? PHE G 344 ILE G 345 AB9 1 PRO G 321 ? THR G 326 ? PRO G 321 THR G 326 AB9 2 GLN G 313 ? ARG G 317 ? GLN G 313 ARG G 317 AB9 3 GLY G 351 ? LEU G 356 ? GLY G 351 LEU G 356 AB9 4 ASP G 371 ? ILE G 375 ? ASP G 371 ILE G 375 AC1 1 ASP G 358 ? TYR G 359 ? ASP G 358 TYR G 359 AC1 2 THR G 367 ? THR G 368 ? THR G 367 THR G 368 AC2 1 VAL H 59 ? GLU H 60 ? VAL H 59 GLU H 60 AC2 2 GLN H 67 ? PHE H 70 ? GLN H 67 PHE H 70 AC2 3 VAL H 27 ? GLY H 34 ? VAL H 26 GLY H 33 AC2 4 LEU H 106 ? ILE H 113 ? LEU H 106 ILE H 113 AC2 5 GLU H 99 ? ASN H 103 ? GLU H 99 ASN H 103 AC3 1 LEU H 92 ? PHE H 96 ? LEU H 92 PHE H 96 AC3 2 THR H 82 ? LEU H 87 ? THR H 82 LEU H 87 AC3 3 ILE H 133 ? ILE H 138 ? ILE H 133 ILE H 138 AC3 4 PHE H 151 ? LEU H 157 ? 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PHENIX ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 5 _em_specimen.details 'This sample was monodisperse' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Swiss National Science Foundation' _pdbx_audit_support.country Switzerland _pdbx_audit_support.grant_number CRSII5_173709 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero J 10 NAG 1 K NAG 1 A NAG 506 n J 10 NAG 2 K NAG 2 A NAG 507 n K 11 NAG 1 J NAG 1 F NAG 1802 n K 11 NAG 2 J NAG 2 F NAG 1803 n K 11 BMA 3 J BMA 3 F BMA 1804 n K 11 MAN 4 J MAN 4 F MAN 1806 n K 11 MAN 5 J MAN 5 F MAN 1807 n K 11 MAN 6 J MAN 6 F MAN 1808 n K 11 MAN 7 J MAN 7 F MAN 1805 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 10 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 10 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 10 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 11 'DManpa1-2DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 11 'WURCS=2.0/3,7,6/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-g1_d2-e1_e2-f1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 11 ;[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 11 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 11 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 11 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 11 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 6 11 6 MAN C1 O1 5 MAN O2 HO2 sing ? 7 11 7 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 11 NAG 1 n 11 NAG 2 n 11 BMA 3 n 11 MAN 4 n 11 MAN 5 n 11 MAN 6 n 11 MAN 7 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 12 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine PEE 13 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 14 Digitonin AJP 15 'MAGNESIUM ION' MG 16 Dolichylphosphate V8K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #