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'Legionella pneumophila' 446 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q5ZYC6_LEGPH Q5ZYC6 ? 1 ;MMRGIDSRHELDPTLLLRDTRTFTQRLADFFADPTNISIVLISLAAVSYYFSEAATFLLIMGGIFFLYSYTRKQKLPFRL PQISRAKDYNDLKPGINKPNIARGITFFGNDRKTGEELWFANDDMRTHALIFGSTGSGKTETLVSLSYNALVQGSGFIYV DGKGDNSLYAKVFSMVRSMGREDDLLLINFMTGARDIVGPQEKRLSNTLNPFCQGSSSMLTQLVVSLMGSSGQSSDGDMW KGRAIAFVEALMRLLVYMRDEGAILLDANTIRNYFDLQRLESIVIDKVFPRDDQESVNIETIPKLVTDPLRNYLNTLPGY NKEKKGKQVSQVLEQHGFITMQLVRSFSSLADTYGHIIRTNLAEVDFKDVVLNRRILVVLLPALEKSPDELSNLGKIIVS SLKAMMAAGLGEEVEGDYRDVILRKPTNAPTPYMCILDEYGYYAVQGFAVVPAQARSLGFSAIFAGQDLPAFQKASKEEA ASIGANTNIKICMKLEDPTETWDFFTKTAGEAYVTKVDSFQTKETSIANSYMDTKSSSFEKRARVDLLDLKEQTEGEAHI FFKSKIVRARMFYANPKPVKQLKINQFLKVEPPPDDYLMKLQKQLASFQSILESGDLSINKAVENEEITLISKALKESTI VEPIERGVAALIAFHGQNEPEPVEDIVEEEVEGALTIFSKLRIDPNAPPILVADKEVFSEPLLPINETRNQMITIERLAG AKDKYAGTVANELIKDFQIATSYPPEERDVIDVQELTGIIRDLSAKISAEREKANKKAAEELT ; 1 2 UNP Q5ZYC7_LEGPH Q5ZYC7 ? 2 ;MYIEMAQQQQQSGSDNSMAPVWIVILLFITAYFVWALAHQYIVSFVFTINIWQARLVNLFLNNQLLANQIYLMQTLDPNT VNWDQMVTVMRAVGDYMRYPVICILVVLAFVLYNSNVTLKYRKTYDMKSLRAQEQFNWPAIMPIVKEDLVSQDVNKGPWA MALTPMEFARKYNLLRKDDALLDNPVPGEEMTAGIRRGDAKRVFTMQLGPYWDGFERCSPQAYALSAVFMARMNRDRDAA NNILKVLDKTFVDGKPDFSVARPVMKKYQNSELVQEVVAKHAYVLTVIASLLEAAREDGVVPSSEFLWLKPVDRRLWYML NCVGRQTPYSEVAGPFAHWKAEKEMGRRSLVPMIDEAIRALEIAVKEVRLTPRQMEELEP ; 1 3 UNP Q5ZYB7_LEGPH Q5ZYB7 ? 3 ;MADNQQRCELKLIASPGSWRLYSARKIDERFKSYEQKIFQRDRYTCQFCGFQARLYQDIVNLDGDYTNNRLSNLVTACCF CAQCFFVESVGVGGYGGGTLIYLPELTQAELNSLCHVLFCAITNDTGYKSSAQNIYRSFKFRSQIVEEKFGEGTSDPAIF GQLMIDSGVNSEEIREKLFKNIRLLPSRAKFRKQIEKWAASALEEIAD ; 7 4 UNP Q5ZV91_LEGPH Q5ZV91 ? 4 ;MDEIKKDDELSQWLSTYGTITAERILGRYNISLPQDEILEAINIPSSFYRHLLQIPLKNVLNGIVIQQASDYHVYAQKLL IDYLLSGESSKEPDSQGAGTRESLEDERQRLVQLGDEFHKLELEQDNLIASSQASLMKISIDWNTKLETTLSKLNSLYKN TNSKIKKNAIRKALIKAFIHCDLVKDQSQKNKYQLIDKLNQTLAVSVGAELKESILTNLSELFQILEALNTKLDEFTDRT NHLSQQAKSFRTQFYEVILRIIELIKLLPEYKIDPAQDAINREPLYFDRTIGER ; 1 5 UNP Q5ZYR7_LEGPH Q5ZYR7 ? 5 ;MPKYTLPTRDALLKAMQVGETSIEAAEYMATRFEQILTKAKLLPECNDMLEKIKEYAQFVKFKLLSSAQVWSGQERPTSD YQNTQENKAEFLASHLEGLPSGLKLEVAIGDDAKILRGFSSNGKMVEGDQLKTMDGLLEGWLAKNSLAISGGAVVKIDNT GNQTKVDPQEIRQLINDSEKGVAKYFADKGVGMEVAQRTYQEPKALETKREEIRQEIESGAEAPTTQSIR ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7OVB A 1 ? 783 ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7OVB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7OVB _struct.title 'L. pneumophila Type IV Coupling Complex (T4CC) with density for DotY N-terminal and middle domains' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7OVB _struct_keywords.text ;Type IV Coupling Complex, T4CC, Type IV Secretion System, T4SS, Membrane protein complex, Membrane complex, DotY, DotZ, DotL, DotM, DotN, IcmSW, Legionella, MEMBRANE PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 121 ? THR A 127 ? ALA A 121 THR A 127 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 139 ? ASN A 149 ? LYS A 139 ASN A 149 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 168 ? ARG A 177 ? LEU A 168 ARG A 177 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 178 ? GLY A 180 ? SER A 178 GLY A 180 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 218 ? MET A 228 ? SER A 218 MET A 228 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 AA6 TRP A 240 ? GLY A 262 ? TRP A 240 GLY A 262 1 ? 23 HELX_P HELX_P7 AA7 ILE A 271 ? ASP A 276 ? ILE A 271 ASP A 276 5 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 277 ? ILE A 285 ? LEU A 277 ILE A 285 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO A 303 ? THR A 316 ? PRO A 303 THR A 316 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 LYS A 324 ? THR A 353 ? LYS A 324 THR A 353 1 ? 30 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP A 366 ? ASN A 373 ? ASP A 366 ASN A 373 1 ? 8 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 387 ? SER A 392 ? SER A 387 SER A 392 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 GLY A 395 ? MET A 405 ? GLY A 395 MET A 405 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 GLN A 454 ? LEU A 458 ? GLN A 454 LEU A 458 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP A 468 ? SER A 476 ? ASP A 468 SER A 476 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU A 479 ? THR A 487 ? GLU A 479 THR A 487 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO A 594 ? GLY A 615 ? PRO A 594 GLY A 615 1 ? 22 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU A 627 ? SER A 638 ? GLU A 627 SER A 638 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 GLU A 642 ? ASN A 658 ? 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ALA B 333 GLY B 346 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 GLU B 356 ? ALA B 364 ? GLU B 356 ALA B 364 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 AD8 THR B 371 ? GLU B 376 ? THR B 371 GLU B 376 1 ? 6 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY C 17 ? ASP C 28 ? GLY C 17 ASP C 28 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 AE1 GLU C 29 ? ARG C 43 ? GLU C 29 ARG C 43 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 AE2 CYS C 81 ? PHE C 86 ? CYS C 81 PHE C 86 5 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 GLN C 108 ? LEU C 118 ? GLN C 108 LEU C 118 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 TYR C 128 ? PHE C 141 ? TYR C 128 PHE C 141 1 ? 14 HELX_P HELX_P41 AE5 ARG C 142 ? GLN C 144 ? ARG C 142 GLN C 144 5 ? 3 HELX_P HELX_P42 AE6 ILE C 145 ? GLY C 151 ? ILE C 145 GLY C 151 1 ? 7 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP C 156 ? ASP C 166 ? ASP C 156 ASP C 166 1 ? 11 HELX_P HELX_P44 AE8 SER C 171 ? LYS C 177 ? SER C 171 LYS C 177 1 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 SER C 187 ? LYS C 190 ? SER C 187 LYS C 190 5 ? 4 HELX_P HELX_P46 AF1 PHE C 191 ? GLU C 196 ? PHE C 191 GLU C 196 1 ? 6 HELX_P HELX_P47 AF2 GLU C 196 ? ALA C 207 ? GLU C 196 ALA C 207 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 TYR D 17 ? ASN D 30 ? TYR D 17 ASN D 30 1 ? 14 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP D 36 ? GLU D 40 ? ASP D 36 GLU D 40 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 ARG D 50 ? GLY D 87 ? ARG D 50 GLY D 87 1 ? 38 HELX_P HELX_P51 AF6 GLN D 96 ? ASN D 160 ? GLN D 96 ASN D 160 1 ? 65 HELX_P HELX_P52 AF7 LYS D 167 ? CYS D 181 ? LYS D 167 CYS D 181 1 ? 15 HELX_P HELX_P53 AF8 LYS D 190 ? LEU D 203 ? LYS D 190 LEU D 203 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 AF9 GLU D 210 ? THR D 217 ? GLU D 210 THR D 217 1 ? 8 HELX_P HELX_P55 AG1 LEU D 219 ? ILE D 265 ? LEU D 219 ILE D 265 1 ? 47 HELX_P HELX_P56 AG2 LYS D 266 ? LEU D 268 ? LYS D 266 LEU D 268 5 ? 3 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP D 274 ? ARG D 282 ? ASP D 274 ARG D 282 1 ? 9 HELX_P HELX_P58 AG4 GLU D 283 ? TYR D 286 ? GLU D 283 TYR D 286 5 ? 4 HELX_P HELX_P59 AG5 THR E 8 ? VAL E 18 ? THR E 8 VAL E 18 1 ? 11 HELX_P HELX_P60 AG6 SER E 22 ? LYS E 39 ? SER E 22 LYS E 39 1 ? 18 HELX_P HELX_P61 AG7 LEU E 43 ? LEU E 64 ? LEU E 43 LEU E 64 1 ? 22 HELX_P HELX_P62 AG8 GLN E 69 ? GLY E 73 ? GLN E 69 GLY E 73 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 AG9 SER E 79 ? LEU E 96 ? SER E 79 LEU E 96 1 ? 18 HELX_P HELX_P64 AH1 MET E 125 ? LEU E 142 ? MET E 125 LEU E 142 1 ? 18 HELX_P HELX_P65 AH2 GLU E 170 ? ALA E 183 ? GLU E 170 ALA E 183 1 ? 14 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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O LEU A 118 N GLY A 109 ? N GLY A 109 AA1 2 3 N ASN A 110 ? N ASN A 110 O ARG A 570 ? O ARG A 570 AA1 3 4 O VAL A 567 ? O VAL A 567 N ILE A 560 ? N ILE A 560 AA1 4 5 O PHE A 561 ? O PHE A 561 N LYS A 490 ? N LYS A 490 AA1 5 6 O ILE A 491 ? O ILE A 491 N LEU A 130 ? N LEU A 130 AA1 6 7 N ALA A 129 ? N ALA A 129 O ALA A 462 ? O ALA A 462 AA1 7 8 O ILE A 463 ? O ILE A 463 N CYS A 435 ? N CYS A 435 AA1 8 9 O ILE A 436 ? O ILE A 436 N ILE A 158 ? N ILE A 158 AA1 9 10 N TYR A 159 ? N TYR A 159 O VAL A 379 ? O VAL A 379 AA1 10 11 O LEU A 380 ? O LEU A 380 N ILE A 188 ? N ILE A 188 AA2 1 2 N PHE A 289 ? N PHE A 289 O VAL A 297 ? O VAL A 297 AA3 1 2 N VAL C 60 ? N VAL C 60 O VAL C 75 ? O VAL C 75 AA4 1 2 N ILE C 101 ? N ILE C 101 O ARG C 183 ? 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