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_citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Jochheim, F.A.' 1 ? primary 'Tegunov, D.' 2 ? primary 'Hillen, H.S.' 3 ? primary 'Schmitzova, J.' 4 ? primary 'Kokic, G.' 5 ? primary 'Dienemann, C.' 6 ? primary 'Cramer, P.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (nsp12)' 107053.227 2 3.4.19.12,3.4.22.-,3.4.22.69,2.7.7.48,3.6.4.12,3.6.4.13,3.1.13.-,3.1.-.-,2.1.1.- ? ? ? 2 polymer man 'SARS-CoV-2 nsp8' 22175.309 2 3.4.19.12,3.4.22.-,3.4.22.69,2.7.7.48,3.6.4.12,3.6.4.13,3.1.13.-,3.1.-.-,2.1.1.- ? ? ? 3 polymer man 'SARS-CoV-2 nsp7' 9521.062 2 3.4.19.12,3.4.22.-,3.4.22.69,2.7.7.48,3.6.4.12,3.6.4.13,3.1.13.-,3.1.-.-,2.1.1.- ? ? ? 4 polymer syn ;RNA (5'-R(P*CP*UP*AP*CP*GP*CP*AP*GP*UP*G)-3') ; 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RIL ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 4 1 sample 1 15 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' ? 2697049 ? 5 1 sample 1 57 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' ? 2697049 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP R1AB_SARS2 P0DTD1 ? 1 ;SADAQSFLNRVCGVSAARLTPCGTGTSTDVVYRAFDIYNDKVAGFAKFLKTNCCRFQEKDEDDNLIDSYFVVKRHTFSNY QHEETIYNLLKDCPAVAKHDFFKFRIDGDMVPHISRQRLTKYTMADLVYALRHFDEGNCDTLKEILVTYNCCDDDYFNKK DWYDFVENPDILRVYANLGERVRQALLKTVQFCDAMRNAGIVGVLTLDNQDLNGNWYDFGDFIQTTPGSGVPVVDSYYSL LMPILTLTRALTAESHVDTDLTKPYIKWDLLKYDFTEERLKLFDRYFKYWDQTYHPNCVNCLDDRCILHCANFNVLFSTV FPPTSFGPLVRKIFVDGVPFVVSTGYHFRELGVVHNQDVNLHSSRLSFKELLVYAADPAMHAASGNLLLDKRTTCFSVAA LTNNVAFQTVKPGNFNKDFYDFAVSKGFFKEGSSVELKHFFFAQDGNAAISDYDYYRYNLPTMCDIRQLLFVVEVVDKYF DCYDGGCINANQVIVNNLDKSAGFPFNKWGKARLYYDSMSYEDQDALFAYTKRNVIPTITQMNLKYAISAKNRARTVAGV SICSTMTNRQFHQKLLKSIAATRGATVVIGTSKFYGGWHNMLKTVYSDVENPHLMGWDYPKCDRAMPNMLRIMASLVLAR KHTTCCSLSHRFYRLANECAQVLSEMVMCGGSLYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNICQAVTANVNALLSTDGNKIADKYV RNLQHRLYECLYRNRDVDTDFVNEFYAYLRKHFSMMILSDDAVVCFNSTYASQGLVASIKNFKSVLYYQNNVFMSEAKCW TETDLTKGPHEFCSQHTMLVKQGDDYVYLPYPDPSRILGAGCFVDDIVKTDGTLMIERFVSLAIDAYPLTKHPNQEYADV FHLYLQYIRKLHDELTGHMLDMYSVMLTNDNTSRYWEPEFYEAMYTPHTVLQ ; 4393 2 UNP R1AB_SARS2 P0DTD1 ? 2 ;AIASEFSSLPSYAAFATAQEAYEQAVANGDSEVVLKKLKKSLNVAKSEFDRDAAMQRKLEKMADQAMTQMYKQARSEDKR AKVTSAMQTMLFTMLRKLDNDALNNIINNARDGCVPLNIIPLTTAAKLMVVIPDYNTYKNTCDGTTFTYASALWEIQQVV DADSKIVQLSEISMDNSPNLAWPLIVTALRANSAVKLQ ; 3943 3 UNP R1AB_SARS2 P0DTD1 ? 3 ;SKMSDVKCTSVVLLSVLQQLRVESSSKLWAQCVQLHNDILLAKDTTEAFEKMVSLLSVLLSMQGAVDINKLCEEMLDNRA TLQ ; 3860 4 PDB 7OYG 7OYG ? 4 ? 1 5 PDB 7OYG 7OYG ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7OYG A 4 ? 935 ? 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J G 28 602 1 Y 1 H U 29 ? J U 29 603 1 Y 1 H A 30 ? J A 30 604 1 Y 1 H U 31 ? J U 31 605 1 Y 1 H U 32 ? J U 32 606 1 Y 1 H G 33 ? J G 33 607 1 Y 1 H A 34 ? J A 34 608 1 Y 1 H G 35 ? J G 35 609 1 Y 1 H A 36 ? J A 36 610 1 Y 1 H C 37 ? J C 37 611 1 Y 1 H C 38 ? J C 38 612 1 Y 1 H U 39 ? J U 39 613 1 Y 1 H U 40 ? J U 40 614 1 Y 1 H U 41 ? J U 41 615 1 Y 1 H U 42 ? J U 42 616 1 Y 1 H G 43 ? J G 43 617 1 Y 1 H G 44 ? J G 44 618 1 Y 1 H U 45 ? J U 45 619 1 Y 1 H C 46 ? J C 46 620 1 Y 1 H U 47 ? J U 47 621 1 Y 1 H C 48 ? J C 48 622 1 Y 1 H A 49 ? J A 49 623 1 Y 1 H A 50 ? J A 50 624 1 Y 1 H U 51 ? J U 51 625 1 Y 1 H A 52 ? J A 52 626 1 Y 1 H C 53 ? J C 53 627 1 Y 1 H G 54 ? J G 54 628 1 Y 1 H G 55 ? J G 55 629 1 Y 1 H U 56 ? J U 56 630 1 Y 1 H A 57 ? J A 57 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM Hepes ? 1 2 100 mM NaCl ? 1 3 1 mM MgCl2 ? 1 4 1 mM TCEP ? # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 2697049 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 60 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Quantum LS' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.details ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1767915 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? 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