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ZN ? ? 6 CYS 333 6 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? ? metalc29 metalc ? ? E CYS 338 SG ? ? ? 1_555 Y ZN . ZN ? ? 6 CYS 338 6 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc30 metalc ? ? F CYS 262 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 262 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? ? metalc31 metalc ? ? F CYS 265 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 265 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? ? metalc32 metalc ? ? F CYS 284 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 284 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? ? metalc33 metalc ? ? F CYS 289 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 289 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc34 metalc ? ? F SER 467 OG ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 7 SER 467 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.100 ? ? metalc35 metalc ? ? F GLU 542 OE1 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? 7 GLU 542 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.740 ? ? metalc36 metalc ? ? AA ADP . O3B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 7 ADP 902 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? metalc37 metalc ? ? AA ADP . O2A ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 7 ADP 902 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? ? metalc38 metalc ? ? G CYS 341 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 341 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? ? metalc39 metalc ? ? G CYS 344 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 344 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? ? metalc40 metalc ? ? G CYS 364 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 364 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? ? metalc41 metalc ? ? G CYS 367 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 367 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc42 metalc ? ? G SER 550 OG ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A SER 550 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc43 metalc ? ? DA ATP . O1G ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A ATP 901 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? ? metalc44 metalc ? ? DA ATP . O1B ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A ATP 901 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? ? metalc45 metalc ? ? DA ATP . O2A ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A ATP 901 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? ? metalc46 metalc ? ? H SER 451 OG ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? B SER 416 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? metalc47 metalc ? ? GA ADP . O2B ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? B ADP 1001 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? ? metalc48 metalc ? ? I CYS 349 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? C CYS 349 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc49 metalc ? ? I CYS 352 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? C CYS 352 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? ? metalc50 metalc ? ? I CYS 371 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? C CYS 371 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc51 metalc ? ? I CYS 376 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? C CYS 376 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? ? metalc52 metalc ? ? I SER 575 OG ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? C SER 575 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? ? metalc53 metalc ? ? IA ADP . O1B ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc54 metalc ? ? IA ADP . O2B ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? ? metalc55 metalc ? ? IA ADP . O1A ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc56 metalc ? ? IA ADP . O3A ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? ? metalc57 metalc ? ? J CYS 183 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? D CYS 183 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? ? metalc58 metalc ? ? J CYS 186 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? D CYS 186 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? ? metalc59 metalc ? ? J CYS 211 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? D CYS 211 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? ? metalc60 metalc ? ? J CYS 236 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? D CYS 236 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? ? metalc61 metalc ? ? J SER 423 OG ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? D SER 423 D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? metalc62 metalc ? ? KA ADP . O2B ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? D ADP 801 D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? ? metalc63 metalc ? ? K CYS 311 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? E CYS 311 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc64 metalc ? ? K CYS 314 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? E CYS 314 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc65 metalc ? ? K CYS 333 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? E CYS 333 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? ? metalc66 metalc ? ? K CYS 338 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? E CYS 338 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc67 metalc ? ? L CYS 262 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? F CYS 262 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? ? metalc68 metalc ? ? L CYS 265 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? F CYS 265 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? ? metalc69 metalc ? ? L CYS 284 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? F CYS 284 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? ? metalc70 metalc ? ? L CYS 289 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? F CYS 289 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? ? metalc71 metalc ? ? L SER 467 OG ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? F SER 467 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.100 ? ? metalc72 metalc ? ? L GLU 542 OE1 ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? F GLU 542 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? ? metalc73 metalc ? ? PA ADP . O3B ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? F ADP 902 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? metalc74 metalc ? ? PA ADP . O2A ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? F ADP 902 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? ? hydrog1 hydrog ? ? M DG 1 N1 ? ? ? 1_555 N DC 53 N3 ? ? X DG 1 Y DC -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? M DG 1 N2 ? ? ? 1_555 N DC 53 O2 ? ? X DG 1 Y DC -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? M DG 1 O6 ? ? ? 1_555 N DC 53 N4 ? ? X DG 1 Y DC -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? M DC 2 N3 ? ? ? 1_555 N DG 52 N1 ? ? X DC 2 Y DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? M DC 2 N4 ? ? ? 1_555 N DG 52 O6 ? ? X DC 2 Y DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? M DC 2 O2 ? ? ? 1_555 N DG 52 N2 ? ? X DC 2 Y DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? M DA 3 N1 ? ? ? 1_555 N DT 51 N3 ? ? X DA 3 Y DT -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? M DA 3 N6 ? ? ? 1_555 N DT 51 O4 ? ? X DA 3 Y DT -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? M DT 4 N3 ? ? ? 1_555 N DA 50 N1 ? ? X DT 4 Y DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? M DT 4 O4 ? ? ? 1_555 N DA 50 N6 ? ? X DT 4 Y DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? M DG 5 N1 ? ? ? 1_555 N DC 49 N3 ? ? X DG 5 Y DC -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? M DG 5 N2 ? ? ? 1_555 N DC 49 O2 ? ? X DG 5 Y DC -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? M DG 5 O6 ? ? ? 1_555 N DC 49 N4 ? ? X DG 5 Y DC -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? M DC 6 N3 ? ? ? 1_555 N DG 48 N1 ? ? X DC 6 Y DG -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? M DC 6 N4 ? ? ? 1_555 N DG 48 O6 ? ? X DC 6 Y DG -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? M DC 6 O2 ? ? ? 1_555 N DG 48 N2 ? ? X DC 6 Y DG -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? M DA 7 N1 ? ? ? 1_555 N DT 47 N3 ? ? X DA 7 Y DT -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? M DA 7 N6 ? ? ? 1_555 N DT 47 O4 ? ? X DA 7 Y DT -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? M DT 8 N3 ? ? ? 1_555 N DA 46 N1 ? ? X DT 8 Y DA -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? M DT 8 O4 ? ? ? 1_555 N DA 46 N6 ? ? X DT 8 Y DA -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? M DG 9 N1 ? ? ? 1_555 N DC 45 N3 ? ? X DG 9 Y DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? M DG 9 N2 ? ? ? 1_555 N DC 45 O2 ? ? X DG 9 Y DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? M DG 9 O6 ? ? ? 1_555 N DC 45 N4 ? ? X DG 9 Y DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? M DC 10 N3 ? ? ? 1_555 N DG 44 N1 ? ? X DC 10 Y DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? M DC 10 N4 ? ? ? 1_555 N DG 44 O6 ? ? X DC 10 Y DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? M DC 10 O2 ? ? ? 1_555 N DG 44 N2 ? ? X DC 10 Y DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? M DG 11 N1 ? ? ? 1_555 N DC 43 N3 ? ? X DG 11 Y DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? M DG 11 N2 ? ? ? 1_555 N DC 43 O2 ? ? X DG 11 Y DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? M DG 11 O6 ? ? ? 1_555 N DC 43 N4 ? ? X DG 11 Y DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? M DC 12 N3 ? ? ? 1_555 N DG 42 N1 ? ? X DC 12 Y DG -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? M DC 12 N4 ? ? ? 1_555 N DG 42 O6 ? ? X DC 12 Y DG -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? M DC 12 O2 ? ? ? 1_555 N DG 42 N2 ? ? X DC 12 Y DG -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? M DA 13 N1 ? ? ? 1_555 N DT 41 N3 ? ? X DA 13 Y DT -13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? M DA 13 N6 ? ? ? 1_555 N DT 41 O4 ? ? X DA 13 Y DT -13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? M DT 14 N3 ? ? ? 1_555 N DA 40 N1 ? ? X DT 14 Y DA -14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? M DT 14 O4 ? ? ? 1_555 N DA 40 N6 ? ? X DT 14 Y DA -14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? M DG 15 N1 ? ? ? 1_555 N DC 39 N3 ? ? X DG 15 Y DC -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? M DG 15 N2 ? ? ? 1_555 N DC 39 O2 ? ? X DG 15 Y DC -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? M DG 15 O6 ? ? ? 1_555 N DC 39 N4 ? ? X DG 15 Y DC -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? M DC 16 N3 ? ? ? 1_555 N DG 38 N1 ? ? X DC 16 Y DG -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? M DC 16 N4 ? ? ? 1_555 N DG 38 O6 ? ? X DC 16 Y DG -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? M DC 16 O2 ? ? ? 1_555 N DG 38 N2 ? ? X DC 16 Y DG -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? M DA 17 N1 ? ? ? 1_555 N DT 37 N3 ? ? X DA 17 Y DT -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? M DA 17 N6 ? ? ? 1_555 N DT 37 O4 ? ? X DA 17 Y DT -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? M DT 18 N3 ? ? ? 1_555 N DA 36 N1 ? ? X DT 18 Y DA -18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? M DT 18 O4 ? ? ? 1_555 N DA 36 N6 ? ? X DT 18 Y DA -18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? M DG 19 N1 ? ? ? 1_555 N DC 35 N3 ? ? X DG 19 Y DC -19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? M DG 19 N2 ? ? ? 1_555 N DC 35 O2 ? ? X DG 19 Y DC -19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? M DG 19 O6 ? ? ? 1_555 N DC 35 N4 ? ? X DG 19 Y DC -19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? M DC 20 N3 ? ? ? 1_555 N DG 34 N1 ? ? X DC 20 Y DG -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? M DC 20 N4 ? ? ? 1_555 N DG 34 O6 ? ? X DC 20 Y DG -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? M DC 20 O2 ? ? ? 1_555 N DG 34 N2 ? ? 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RELION 3.1 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ResolveCryoEM PHENIX ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details 'The entire MCM loading and phosphorylation reaction was applied to the EM grid.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7P30 'double helix' 7P30 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 M DG 1 1_555 N DC 53 1_555 -0.198 -0.140 0.051 0.179 0.525 1.126 1 X_DG1:DC-1_Y X 1 ? 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