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'ATCC 29342 / M129' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RL34_MYCPN P78006 ? 1 MKRTYQPSKLKRAKTHGFLARMATASGRKVLKLRRKKQRAQLTVSSER 1 2 UNP RL35_MYCPN P75447 ? 2 MKVKSAAKKRFKLTKSGQIKRKHAYTSHLAPHKTTKQKRHLRKQGTVSASDFKRIGNLI 1 3 UNP RL36_MYCPN P52864 ? 3 MKVRASVKPICKDCKIIKRHQIVRVICKTQKHKQRQG 1 4 UNP RRF_MYCPN P75161 ? 4 ;MSPEKYLNFFKETADKKFQWLKEELSKIRTGRPNPKLFDNLLVESYGDRMPMVALAQIAVNPPREIVIKPFDVKNNINAI YSEIQRANLGVQPVIDGDKIRINFPPMTQESRLESIKQAKKVVEQIHQELRSVRRDTLQMIKKDDHKDEDFEEFLKEEVE KVNKQYIAQLETIQKQKEKELLVV ; 1 5 UNP RL2_MYCPN P75577 ? 5 ;MPIKKIISRSNSGIHHSTVIDYKKLLTTNKNKPEKSLLVTLKKHGGRNNQGKITVRHQGGRNKRKYRIIDFKRTHYDNIE ATVKSIEYDPNRSCFVSLITYANGAKSYIISPDGIKVGDKILASEHPIDIKPGFSMPLAFIPEGTQVHNIELHPKGGGQI ARSAGSYARILGQDETGKYVILQLLSGETRKFLKECRATVGVVSNLDHNLVVIGKAGRNRHRGIRPTVRGSAMNPNDHPH GGGEGRSPVGRDAPRTPWGKRHMGVKTRNMKKASTNLIIRNRKGEQY ; 1 6 UNP RL3_MYCPN P75580 ? 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10 ;MKVILKQDVSNLGKRFDVVDVKDGYAIHFLFPKKLAAPLTKKSLQDRDLFLKKQQEHYEINKALSHKLKEVIEQTELHFS LKEHNGRPYGSIITKQIINQAHTKGMALQKFMFKDNVRLGFGDHEITLHIFEDTTAVLKVKVTPDNGVK ; 1 11 UNP RL10_MYCPN P75240 ? 11 ;MEAKKDKAQQVADVSHLLSTSAGFVIFDYTSMSAIEATSIRKKLFKNGSKIKVIKNNILRRALKAGKFEGIDETAIKGKL AVAVGVNEIVETLKAVDGVVKAKEAMNFVCGYFDNRAFNSADLEKIAKLPGRNELYGMFLSVLQAPLRKFLYALEAVKAA K ; 1 12 UNP RL11_MYCPN P75550 ? 12 ;MAKKTITRIAKINLLGGQAKPGPALASVGINMGEFTKQFNEKTKDKQGEMIPCVITAYNDKSFDFILKTTPVSILLKQAA KLEKGAKNAKTIVGKITMAKAKEIAQYKLVDLNANTVEAALKMVLGTAKQMGIEVIE ; 1 13 UNP RL13_MYCPN P75178 ? 13 ;MQKTSMLTKEQANKRRQWYIVDAAGLVLGKLAVKAADLIRGKNKVDFTPNQDCGDYLIIINSDQVVLTGNKKENEFWYHH SQYIGGIKKVSGRDMLKKQSDKLVYNAVKGMLPDNRLSRRWITKVHVFKGDKHNMEAQKPTTLNWS ; 1 14 UNP RL14_MYCPN Q50308 ? 14 ;MVSFMTRLNVADNTGAKQVGIIKVLGSTRKRYAFLGDVVVVSVKDAIPSGMVKKGQVLRAVIVRTKKGQQRKDGTHLKFD DNACVLIKEDKSPRGTRIFGPVARELRERGYNKILSLAVEVV ; 1 15 UNP RL15_MYCPN Q50300 ? 15 ;MELNQLKSVPKARNHKTKTLGRGHGSGLGKTSGRGQKGQKARKSGLTRPGFEGGQTPLYRRLPKFGNARKGFLKQEWVVL NLNKIAKLKLDKINRASLIEKQVISAKSQLPIKLIGHTKLEKPLHFEVHKVSKQALKAVENANGSVKLLEK ; 1 16 UNP RL16_MYCPN P41204 ? 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'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7PAU _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7PAU _struct.title 'free 50S in complex with ribosome recycling factor in untreated Mycoplasma pneumoniae cells' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7PAU _struct_keywords.text 'In-cell cryo-electron tomography, sub-tomogram analysis, ribosome, translation intermediate state, translation termination' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? 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ALA N 46 ? VAL j 38 ALA j 46 AC9 4 VAL N 57 ? ILE N 62 ? VAL j 57 ILE j 62 AC9 5 ALA N 83 ? ILE N 87 ? ALA j 83 ILE j 87 AC9 6 ARG N 7 ? VAL N 10 ? ARG j 7 VAL j 10 AD1 1 GLN N 69 ? GLN N 70 ? GLN j 69 GLN j 70 AD1 2 HIS N 76 ? LYS N 78 ? HIS j 76 LYS j 78 AD1 3 ILE S 73 ? GLN S 80 ? ILE o 73 GLN o 80 AD1 4 THR S 63 ? THR S 70 ? THR o 63 THR o 70 AD1 5 VAL S 43 ? ARG S 56 ? VAL o 43 ARG o 56 AD1 6 GLU S 30 ? LYS S 38 ? GLU o 30 LYS o 38 AD1 7 ILE S 86 ? ARG S 92 ? ILE o 86 ARG o 92 AD2 1 VAL N 102 ? ALA N 103 ? VAL j 102 ALA j 103 AD2 2 VAL N 121 ? VAL N 122 ? VAL j 121 VAL j 122 AD3 1 VAL O 78 ? ASN O 81 ? VAL k 78 ASN k 81 AD3 2 ILE O 112 ? ILE O 115 ? ILE k 112 ILE k 115 AD3 3 LYS O 130 ? VAL O 131 ? LYS k 130 VAL k 131 AD4 1 HIS O 125 ? VAL O 128 ? HIS k 125 VAL k 128 AD4 2 SER O 145 ? LEU O 148 ? SER k 145 LEU k 148 AD5 1 LYS P 63 ? ILE P 66 ? LYS l 63 ILE l 66 AD5 2 THR P 101 ? ALA P 107 ? THR l 101 ALA l 107 AD5 3 TYR P 32 ? ALA P 36 ? TYR l 32 ALA l 36 AD5 4 ILE P 131 ? 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LEU z 34 CYS z 38 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LYS B 12 ? 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