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complex-associated protein,Mammalian target of rapamycin,mTOR,Mechanistic target of rapamycin,Rapamycin and FKBP12 target 1,Rapamycin target protein 1 ; 2 'TORC subunit LST8,G protein beta subunit-like,Protein GbetaL,Mammalian lethal with SEC13 protein 8,mLST8' 3 'AVO3 homolog,hAVO3' 4 ;TORC2 subunit MAPKAP1,Mitogen-activated protein kinase 2-associated protein 1,Stress-activated map kinase-interacting protein 1,mSIN1 ; 5 'DEP domain-containing protein 6' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MLGTGPAAATTAATTSSNVSVLQQFASGLKSRNEETRAKAAKELQHYVTMELREMSQEESTRFYDQLNHHIFELVSSSDA NERKGGILAIASLIGVEGGNATRIGRFANYLRNLLPSNDPVVMEMASKAIGRLAMAGDTFTAEYVEFEVKRALEWLGADR NEGRRHAAVLVLRELAISVPTFFFQQVQPFFDNIFVAVWDPKQAIREGAVAALRACLILTTQREPKEMQKPQWYRHTFEE 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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP MTOR_HUMAN P42345 ? 1 ;MLGTGPAAATTAATTSSNVSVLQQFASGLKSRNEETRAKAAKELQHYVTMELREMSQEESTRFYDQLNHHIFELVSSSDA NERKGGILAIASLIGVEGGNATRIGRFANYLRNLLPSNDPVVMEMASKAIGRLAMAGDTFTAEYVEFEVKRALEWLGADR NEGRRHAAVLVLRELAISVPTFFFQQVQPFFDNIFVAVWDPKQAIREGAVAALRACLILTTQREPKEMQKPQWYRHTFEE AEKGFDETLAKEKGMNRDDRIHGALLILNELVRISSMEGERLREEMEEITQQQLVHDKYCKDLMGFGTKPRHITPFTSFQ AVQPQQSNALVGLLGYSSHQGLMGFGTSPSPAKSTLVESRCCRDLMEEKFDQVCQWVLKCRNSKNSLIQMTILNLLPRLA AFRPSAFTDTQYLQDTMNHVLSCVKKEKERTAAFQALGLLSVAVRSEFKVYLPRVLDIIRAALPPKDFAHKRQKAMQVDA TVFTCISMLARAMGPGIQQDIKELLEPMLAVGLSPALTAVLYDLSRQIPQLKKDIQDGLLKMLSLVLMHKPLRHPGMPKG LAHQLASPGLTTLPEASDVGSITLALRTLGSFEFEGHSLTQFVRHCADHFLNSEHKEIRMEAARTCSRLLTPSIHLISGH AHVVSQTAVQVVADVLSKLLVVGITDPDPDIRYCVLASLDERFDAHLAQAENLQALFVALNDQVFEIRELAICTVGRLSS MNPAFVMPFLRKMLIQILTELEHSGIGRIKEQSARMLGHLVSNAPRLIRPYMEPILKALILKLKDPDPDPNPGVINNVLA TIGELAQVSGLEMRKWVDELFIIIMDMLQDSSLLAKRQVALWTLGQLVASTGYVVEPYRKYPTLLEVLLNFLKTEQNQGT RREAIRVLGLLGALDPYKHKVNIGMIDQSRDASAVSLSESKSSQDSSDYSTSEMLVNMGNLPLDEFYPAVSMVALMRIFR DQSLSHHHTMVVQAITFIFKSLGLKCVQFLPQVMPTFLNVIRVCDGAIREFLFQQLGMLVSFVKSHIRPYMDEIVTLMRE FWVMNTSIQSTIILLIEQIVVALGGEFKLYLPQLIPHMLRVFMHDNSPGRIVSIKLLAAIQLFGANLDDYLHLLLPPIVK LFDAPEAPLPSRKAALETVDRLTESLDFTDYASRIIHPIVRTLDQSPELRSTAMDTLSSLVFQLGKKYQIFIPMVNKVLV RHRINHQRYDVLICRIVKGYTLADEEEDPLIYQHRMLRSGQGDALASGPVETGPMKKLHVSTINLQKAWGAARRVSKDDW LEWLRRLSLELLKDSSSPSLRSCWALAQAYNPMARDLFNAAFVSCWSELNEDQQDELIRSIELALTSQDIAEVTQTLLNL AEFMEHSDKGPLPLRDDNGIVLLGERAAKCRAYAKALHYKELEFQKGPTPAILESLISINNKLQQPEAAAGVLEYAMKHF GELEIQATWYEKLHEWEDALVAYDKKMDTNKDDPELMLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEKWTLVNDETQAKMARMAAAAA WGLGQWDSMEEYTCMIPRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLAQQCIDKARDLLDAELTAMAGESYSRAYGAMVSCHMLSELE EVIQYKLVPERREIIRQIWWERLQGCQRIVEDWQKILMVRSLVVSPHEDMRTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVD PSRQLDHPLPTVHPQVTYAYMKNMWKSARKIDAFQHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHKQELHKLMARCFLKLGEWQLN LQGINESTIPKVLQYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEAVLHYKHQNQARDEKKKLRHASGANITNATTAATTAATATT TASTEGSNSESEAESTENSPTPSPLQKKVTEDLSKTLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVN EALVEGVKAIQIDTWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVASKSTTTARHNAANKILKNMCE HSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLME AQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRISKQLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDPNQPIIRIQSIAPSL QVITSKQRPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNLSIQRYAVIPLSTNSGLIGWV PHCDTLHALIRDYREKKKILLNIEHRIMLRMAPDYDHLTLMQKVEVFEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNY TRSLAVMSMVGYILGLGDRHPSNLMLDRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITC HTVMEVLREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDGVELGEPAHKKTGTTVPESIH SFIGDGLVKPEALNKKAIQIINRVRDKLTGRDFSHDDTLDVPTQVELLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW ; 1 2 UNP LST8_HUMAN Q9BVC4 ? 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4 ;MAFLDNPTIILAHIRQSHVTSDDTGMCEMVLIDHDVDLEKIHPPSMPGDSGSEIQGSNGETQGYVYAQSVDITSSWDFGI RRRSNTAQRLERLRKERQNQIKCKNIQWKERNSKQSAQELKSLFEKKSLKEKPPISGKQSILSVRLEQCPLQLNNPFNEY SKFDGKGHVGTTATKKIDVYLPLHSSQDRLLPMTVVTMASARVQDLIGLICWQYTSEGREPKLNDNVSAYCLHIAEDDGE VDTDFPPLDSNEPIHKFGFSTLALVEKYSSPGLTSKESLFVRINAAHGFSLIQVDNTKVTMKEILLKAVKRRKGSQKVSG PQYRLEKQSEPNVAVDLDSTLESQSAWEFCLVRENSSRADGVFEEDSQIDIATVQDMLSSHHYKSFKVSMIHRLRFTTDV QLGISGDKVEIDPVTNQKASTKFWIKQKPISIDSDLLCACDLAEEKSPSHAIFKLTYLSNHDYKHLYFESDAATVNEIVL KVNYILESRASTARADYFAQKQRKLNRRTSFSFQKEKKSGQQ ; 1 5 UNP DPTOR_HUMAN Q8TB45 ? 5 ;MEEGGSTGSAGSDSSTSGSGGAQQRELERMAEVLVTGEQLRLRLHEEKVIKDRRHHLKTYPNCFVAKELIDWLIEHKEAS DRETAIKLMQKLADRGIIHHVCDEHKEFKDVKLFYRFRKDDGTFPLDNEVKAFMRGQRLYEKLMSPENTLLQPREEEGVK YERTFMASEFLDWLVQEGEATTRKEAEQLCHRLMEHGIIQHVSNKHPFVDSNLLYQFRMNFRRRRRLMELLNEKSPSSQE THDSPFCLRKQSHDNRKSTSFMSVSPSKEIKIVSAVRRSSMSSCGSSGYFSSSPTLSSSPPVLCNPKSVLKRPVTSEELL TPGAPYARKTFTIVGDAVGWGFVVRGSKPCHIQAVDPSGPAAAAGMKVCQFVVSVNGLNVLHVDYRTVSNLILTGPRTIV MEVMEELEC ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7PE7 B 1 ? 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Q8TB45 1 ? 409 ? 1 409 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7PE7 GLY B 259 M UNP P42345 ? ? insertion 246 1 1 7PE7 SER B 260 N UNP P42345 ? ? insertion 246 2 1 7PE7 THR B 261 O UNP P42345 ? ? insertion 246 3 1 7PE7 SER B 262 P UNP P42345 ? ? insertion 246 4 1 7PE7 GLY B 263 Q UNP P42345 ? ? insertion 246 5 1 7PE7 SER B 264 R UNP P42345 ? ? insertion 246 6 1 7PE7 GLY B 265 S UNP P42345 ? ? insertion 246 7 1 7PE7 ASP B 266 T UNP P42345 ? ? insertion 246 8 1 7PE7 TYR B 267 U UNP P42345 ? ? insertion 246 9 1 7PE7 LYS B 268 V UNP P42345 ? ? insertion 246 10 1 7PE7 ASP B 269 W UNP P42345 ? ? insertion 246 11 1 7PE7 ASP B 270 X UNP P42345 ? ? insertion 246 12 1 7PE7 ASP B 271 Y UNP P42345 ? ? insertion 246 13 1 7PE7 ASP B 272 Z UNP P42345 ? ? insertion 246 14 1 7PE7 LYS B 273 A UNP P42345 ? ? insertion 247 15 1 7PE7 GLY B 274 B UNP P42345 ? ? insertion 247 16 1 7PE7 SER B 275 C UNP P42345 ? ? insertion 247 17 1 7PE7 THR B 276 D UNP P42345 ? ? insertion 247 18 1 7PE7 SER B 277 E UNP P42345 ? ? insertion 247 19 1 7PE7 GLY B 278 F UNP P42345 ? ? insertion 247 20 1 7PE7 SER B 279 G UNP P42345 ? ? insertion 247 21 1 7PE7 GLY B 280 H UNP P42345 ? ? insertion 247 22 5 7PE7 GLY A 259 M UNP P42345 ? ? insertion 246 23 5 7PE7 SER A 260 N UNP P42345 ? ? insertion 246 24 5 7PE7 THR A 261 O UNP P42345 ? ? insertion 246 25 5 7PE7 SER A 262 P UNP P42345 ? ? insertion 246 26 5 7PE7 GLY A 263 Q UNP P42345 ? ? insertion 246 27 5 7PE7 SER A 264 R UNP P42345 ? ? insertion 246 28 5 7PE7 GLY A 265 S UNP P42345 ? ? insertion 246 29 5 7PE7 ASP A 266 T UNP P42345 ? ? insertion 246 30 5 7PE7 TYR A 267 U UNP P42345 ? ? insertion 246 31 5 7PE7 LYS A 268 V UNP P42345 ? ? insertion 246 32 5 7PE7 ASP A 269 W UNP P42345 ? ? insertion 246 33 5 7PE7 ASP A 270 X UNP P42345 ? ? insertion 246 34 5 7PE7 ASP A 271 Y UNP P42345 ? ? insertion 246 35 5 7PE7 ASP A 272 Z UNP P42345 ? ? insertion 246 36 5 7PE7 LYS A 273 A UNP P42345 ? ? insertion 247 37 5 7PE7 GLY A 274 B UNP P42345 ? ? insertion 247 38 5 7PE7 SER A 275 C UNP P42345 ? ? insertion 247 39 5 7PE7 THR A 276 D UNP P42345 ? ? insertion 247 40 5 7PE7 SER A 277 E UNP P42345 ? ? insertion 247 41 5 7PE7 GLY A 278 F UNP P42345 ? ? insertion 247 42 5 7PE7 SER A 279 G UNP P42345 ? ? insertion 247 43 5 7PE7 GLY A 280 H UNP P42345 ? ? insertion 247 44 9 7PE7 SER I 204 ? UNP Q8TB45 ASN 204 variant 204 45 9 7PE7 ASN I 389 ? UNP Q8TB45 SER 389 variant 389 46 10 7PE7 SER J 204 ? UNP Q8TB45 ASN 204 variant 204 47 10 7PE7 ASN J 389 ? UNP Q8TB45 SER 389 variant 389 48 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ACE non-polymer . 'ACETYL GROUP' ? 'C2 H4 O' 44.053 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 IHP non-polymer . 'INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE' 'MYO-INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE; INOSITOL 1,2,3,4,5,6-HEXAKISPHOSPHATE' 'C6 H18 O24 P6' 660.035 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7PE7 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7PE7 _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 3.41 _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 59668 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.397 ? 81006 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.014 ? 21428 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.037 ? 9390 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 10392 ? f_plane_restr ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 0.000709307199212 ? ? 1 'NCS constraints' ? B ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 0.000717475095982 ? ? 2 'NCS constraints' ? 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P CYS 106 ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? ens_3 ? ens_4 ? ens_5 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_2 d_2 d_1 2 ens_3 d_2 d_1 3 ens_4 d_2 d_1 4 ens_5 d_2 d_1 5 # _struct.entry_id 7PE7 _struct.title 'cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7PE7 _struct_keywords.text 'DEPTOR, mTOR, regulator, inhibitor, mTORC2, DEP-domain, PDZ-domain, SIGNALING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? 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G CYS 1520 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? E CYS 1520 E ZN 4801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc7 metalc ? ? G CYS 1523 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? E CYS 1523 E ZN 4801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc8 metalc ? ? G CYS 1651 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? E CYS 1651 E ZN 4801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 5 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 2142 ? GLU A 2144 ? SER B 2120 GLU B 2122 AA1 2 SER A 2181 ? VAL A 2184 ? SER B 2159 VAL B 2162 AA1 3 ARG A 2192 ? LYS A 2193 ? ARG B 2170 LYS B 2171 AA2 1 ILE A 2175 ? ILE A 2178 ? ILE B 2153 ILE B 2156 AA2 2 THR A 2195 ? GLY A 2198 ? THR B 2173 GLY B 2176 AA2 3 GLU A 2203 ? GLY A 2210 ? GLU B 2181 GLY B 2188 AA2 4 SER A 2256 ? GLY A 2260 ? SER B 2234 GLY B 2238 AA3 1 CYS A 2265 ? THR A 2267 ? CYS B 2243 THR B 2245 AA3 2 LEU A 2366 ? ASP A 2369 ? LEU B 2344 ASP B 2347 AA3 3 ILE A 2375 ? HIS A 2377 ? ILE B 2353 HIS B 2355 AA4 1 ARG B 36 ? GLN B 39 ? ARG D 36 GLN D 39 AA4 2 THR B 23 ? TRP B 27 ? THR D 23 TRP D 27 AA4 3 ILE B 14 ? GLY B 19 ? ILE D 14 GLY D 19 AA4 4 VAL B 315 ? ASN B 321 ? VAL D 315 ASN D 321 AA5 1 ALA B 47 ? VAL B 50 ? ALA D 47 VAL D 50 AA5 2 MET B 56 ? ALA B 60 ? MET D 56 ALA D 60 AA5 3 ILE B 65 ? ASP B 69 ? ILE D 65 ASP D 69 AA5 4 ILE B 79 ? TYR B 81 ? ILE D 79 TYR D 81 AA5 5 LYS D 104 ? ILE D 106 ? LYS H 104 ILE H 106 AA6 1 ILE B 88 ? PHE B 93 ? ILE D 88 PHE D 93 AA6 2 TRP B 99 ? GLY B 104 ? TRP D 99 GLY D 104 AA6 3 THR B 108 ? ASP B 113 ? THR D 108 ASP D 113 AA6 4 ILE B 124 ? GLN B 126 ? ILE D 124 GLN D 126 AA7 1 ILE B 131 ? LEU B 136 ? ILE D 131 LEU D 136 AA7 2 GLU B 142 ? ASP B 147 ? GLU D 142 ASP D 147 AA7 3 ILE B 152 ? ASP B 156 ? ILE D 152 ASP D 156 AA7 4 ASN B 162 ? LEU B 165 ? ASN D 162 LEU D 165 AA8 1 ILE B 173 ? ILE B 178 ? ILE D 173 ILE D 178 AA8 2 MET B 185 ? ASN B 189 ? MET D 185 ASN D 189 AA8 3 CYS B 194 ? ASN B 198 ? CYS D 194 ASN D 198 AA8 4 ILE B 211 ? ILE B 216 ? ILE D 211 ILE D 216 AA9 1 CYS B 226 ? PHE B 228 ? CYS D 226 PHE D 228 AA9 2 LEU B 234 ? THR B 237 ? LEU D 234 THR D 237 AA9 3 THR B 243 ? ARG B 248 ? THR D 243 ARG D 248 AA9 4 LEU B 254 ? SER B 259 ? LEU D 254 SER D 259 AB1 1 MET B 273 ? PHE B 278 ? MET D 273 PHE D 278 AB1 2 TYR B 284 ? SER B 289 ? TYR D 284 SER D 289 AB1 3 ALA B 294 ? CYS B 298 ? ALA D 294 CYS D 298 AB1 4 ARG B 306 ? TYR B 308 ? ARG D 306 TYR D 308 AB2 1 TRP C 990 ? ALA C 992 ? TRP F 990 ALA F 992 AB2 2 ALA C 1428 ? PRO C 1430 ? ALA F 1428 PRO F 1430 AB3 1 SER E 2142 ? GLU E 2144 ? SER A 2120 GLU A 2122 AB3 2 SER E 2181 ? VAL E 2184 ? SER A 2159 VAL A 2162 AB3 3 ARG E 2192 ? LYS E 2193 ? ARG A 2170 LYS A 2171 AB4 1 ILE E 2175 ? ILE E 2178 ? ILE A 2153 ILE A 2156 AB4 2 THR E 2195 ? GLY E 2198 ? THR A 2173 GLY A 2176 AB4 3 GLU E 2203 ? GLY E 2210 ? GLU A 2181 GLY A 2188 AB4 4 SER E 2256 ? GLY E 2260 ? SER A 2234 GLY A 2238 AB5 1 CYS E 2265 ? THR E 2267 ? CYS A 2243 THR A 2245 AB5 2 LEU E 2366 ? ASP E 2369 ? LEU A 2344 ASP A 2347 AB5 3 ILE E 2375 ? HIS E 2377 ? ILE A 2353 HIS A 2355 AB6 1 ARG F 36 ? GLN F 39 ? ARG C 36 GLN C 39 AB6 2 THR F 23 ? TRP F 27 ? THR C 23 TRP C 27 AB6 3 ILE F 14 ? GLY F 19 ? ILE C 14 GLY C 19 AB6 4 VAL F 315 ? ASN F 321 ? VAL C 315 ASN C 321 AB7 1 ALA F 47 ? VAL F 50 ? ALA C 47 VAL C 50 AB7 2 MET F 56 ? ALA F 60 ? MET C 56 ALA C 60 AB7 3 ILE F 65 ? ASP F 69 ? ILE C 65 ASP C 69 AB7 4 ILE F 79 ? TYR F 81 ? ILE C 79 TYR C 81 AB7 5 LYS H 104 ? ILE H 106 ? LYS G 104 ILE G 106 AB8 1 ILE F 88 ? PHE F 93 ? ILE C 88 PHE C 93 AB8 2 TRP F 99 ? GLY F 104 ? TRP C 99 GLY C 104 AB8 3 THR F 108 ? ASP F 113 ? THR C 108 ASP C 113 AB8 4 ILE F 124 ? GLN F 126 ? ILE C 124 GLN C 126 AB9 1 ILE F 131 ? LEU F 136 ? ILE C 131 LEU C 136 AB9 2 GLU F 142 ? ASP F 147 ? GLU C 142 ASP C 147 AB9 3 ILE F 152 ? ASP F 156 ? ILE C 152 ASP C 156 AB9 4 ASN F 162 ? LEU F 165 ? ASN C 162 LEU C 165 AC1 1 ILE F 173 ? ILE F 178 ? ILE C 173 ILE C 178 AC1 2 MET F 185 ? ASN F 189 ? MET C 185 ASN C 189 AC1 3 CYS F 194 ? ASN F 198 ? CYS C 194 ASN C 198 AC1 4 ILE F 211 ? ILE F 216 ? ILE C 211 ILE C 216 AC2 1 CYS F 226 ? PHE F 228 ? CYS C 226 PHE C 228 AC2 2 LEU F 234 ? THR F 237 ? LEU C 234 THR C 237 AC2 3 THR F 243 ? ARG F 248 ? THR C 243 ARG C 248 AC2 4 LEU F 254 ? SER F 259 ? LEU C 254 SER C 259 AC3 1 MET F 273 ? PHE F 278 ? MET C 273 PHE C 278 AC3 2 TYR F 284 ? SER F 289 ? TYR C 284 SER C 289 AC3 3 ALA F 294 ? CYS F 298 ? ALA C 294 CYS C 298 AC3 4 ARG F 306 ? TYR F 308 ? ARG C 306 TYR C 308 AC4 1 TRP G 990 ? ALA G 992 ? TRP E 990 ALA E 992 AC4 2 ALA G 1428 ? PRO G 1430 ? ALA E 1428 PRO E 1430 AC5 1 LYS I 329 ? ILE I 333 ? LYS I 329 ILE I 333 AC5 2 ILE I 399 ? VAL I 403 ? ILE I 399 VAL I 403 AC5 3 VAL I 372 ? VAL I 375 ? VAL I 372 VAL I 375 AC5 4 LEU I 378 ? ASN I 379 ? LEU I 378 ASN I 379 AC6 1 PHE I 342 ? VAL I 344 ? PHE I 342 VAL I 344 AC6 2 ILE I 352 ? VAL I 355 ? ILE I 352 VAL I 355 AC7 1 LYS J 329 ? ILE J 333 ? LYS J 329 ILE J 333 AC7 2 ILE J 399 ? VAL J 403 ? ILE J 399 VAL J 403 AC7 3 VAL J 372 ? VAL J 375 ? VAL J 372 VAL J 375 AC7 4 LEU J 378 ? ASN J 379 ? LEU J 378 ASN J 379 AC8 1 PHE J 342 ? VAL J 344 ? PHE J 342 VAL J 344 AC8 2 ILE J 352 ? VAL J 355 ? ILE J 352 VAL J 355 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LEU A 2143 ? N LEU B 2121 O LEU A 2182 ? O LEU B 2160 AA1 2 3 N GLN A 2183 ? N GLN B 2161 O LYS A 2193 ? O LYS B 2171 AA2 1 2 N GLN A 2176 ? N GLN B 2154 O MET A 2197 ? O MET B 2175 AA2 2 3 N LEU A 2196 ? N LEU B 2174 O PHE A 2204 ? O PHE B 2182 AA2 3 4 N LEU A 2207 ? N LEU B 2185 O ILE A 2259 ? O ILE B 2237 AA3 1 2 N ASP A 2266 ? N ASP B 2244 O LEU A 2368 ? O LEU B 2346 AA3 2 3 N MET A 2367 ? N MET B 2345 O LEU A 2376 ? O LEU B 2354 AA4 1 2 O VAL B 38 ? O VAL D 38 N VAL B 24 ? N VAL D 24 AA4 2 3 O TRP B 27 ? O TRP D 27 N LEU B 15 ? N LEU D 15 AA4 3 4 N ALA B 16 ? N ALA D 16 O ALA B 319 ? O ALA D 319 AA5 1 2 N GLU B 49 ? N GLU D 49 O ALA B 58 ? O ALA D 58 AA5 2 3 N ALA B 59 ? N ALA D 59 O ARG B 66 ? O ARG D 66 AA5 3 4 N MET B 67 ? N MET D 67 O ILE B 79 ? O ILE D 79 AA5 4 5 N SER B 80 ? N SER D 80 O LYS D 104 ? O LYS H 104 AA6 1 2 N ALA B 89 ? N ALA D 89 O GLY B 103 ? O GLY D 103 AA6 2 3 N MET B 100 ? N MET D 100 O TRP B 112 ? O TRP D 112 AA6 3 4 N ALA B 109 ? N ALA D 109 O PHE B 125 ? 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