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EMDB EMD-13427 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details ;Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I ; _pdbx_database_related.db_id EMD-13427 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7PHR _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-08-18 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Susac, L.' 1 0000-0002-5392-5029 'Thomas, C.' 2 0000-0001-7441-1089 'Tampe, R.' 3 0000-0002-0403-2160 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 185 _citation.language ? _citation.page_first 3201 _citation.page_last 3213.e19 _citation.title 'Structure of a fully assembled tumor-specific T cell receptor ligated by pMHC.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2022.07.010 _citation.pdbx_database_id_PubMed 35985289 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Susac, L.' 1 ? primary 'Vuong, M.T.' 2 ? primary 'Thomas, C.' 3 ? primary 'von Bulow, S.' 4 ? primary ;O'Brien-Ball, C. ; 5 ? primary 'Santos, A.M.' 6 ? primary 'Fernandes, R.A.' 7 ? primary 'Hummer, G.' 8 ? primary 'Tampe, R.' 9 ? primary 'Davis, S.J.' 10 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7PHR _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7PHR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'T-cell receptor alpha chain' 27979.268 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'T-cell receptor beta chain' 32750.736 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain' 13713.741 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, green fluorescent protein' 39858.188 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain' 15316.222 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain' 35054.613 1 ? ? ? ? 7 polymer man Beta-2-microglobulin 11936.408 1 ? ? ? ? 8 polymer syn 'Tumor-associated antigentic peptide gp100' 974.107 1 ? 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AHSQTHRVDLGTLRGYYNQSEAGSHTVQRMYGCDVGSDWRFLRGYHQYAYDGKDYIALKEDLRSWTAADMAAQTTKHKWE AAHVAEQLRAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLTWQRDGEDQTQDT ELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEPSSQPEDQVDPRLIDGK ; H ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MGIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEY ACRVNHVTLSQPKIVKWDRDM ; ;MGIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEY ACRVNHVTLSQPKIVKWDRDM ; L ? 8 'polypeptide(L)' no no YLEPGPVTV YLEPGPVTV P ? 9 'polypeptide(L)' no no QSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSR QSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSR Z,z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 GLN n 1 4 GLN n 1 5 GLY n 1 6 GLU n 1 7 GLU n 1 8 ASP n 1 9 PRO n 1 10 GLN n 1 11 ALA n 1 12 LEU n 1 13 SER n 1 14 ILE n 1 15 GLN n 1 16 GLU n 1 17 GLY n 1 18 GLU n 1 19 ASN n 1 20 ALA n 1 21 THR n 1 22 MET n 1 23 ASN n 1 24 CYS n 1 25 SER n 1 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'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 8 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 9 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Homo sapiens' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name Human _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 9606 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7PHR 7PHR ? 1 ? 1 2 PDB 7PHR 7PHR ? 2 ? 1 3 UNP CD3G_HUMAN P09693 ? 3 ;QSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKDPRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYR MCQNCIELNAATISGFLFAEIVSIFVLAVGVYFIAGQDGVRQ ; 23 4 UNP CD3D_HUMAN P04234 ? 4 ;FKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYKDKESTVQVHYRMCQSCVELDP ATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGR ; 22 5 UNP GFP_AEQVI P42212 ? 4 ;MSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTFSYGVQCFSRYPDHMKQ HDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNG IKVNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITHGMDELYK ; 1 6 UNP CD3E_HUMAN P07766 ? 5 ;DGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDEDHLSLKEFSELEQSGYYVCYPRG SKPEDANFYLYLRARVCENCMEMDVMSVATIVIVDICITGGLLLLVYYWSKNRKAK ; 23 7 UNP HLAA_HUMAN P04439 ? 6 ;GSHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDQETRNVKAQSQTDRVDLGT LRGYYNQSEAGSHTIQIMYGCDVGSDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITKRKWEAAHEAEQLRAYL DGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDPPKTHMTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGT FQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWELSSQP ; 25 8 UNP B2MG_HUMAN P61769 ? 7 ;AIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYA CRVNHVTLSQPKIVKWDRDM ; 20 9 UNP PMEL_HUMAN P40967 ? 8 YLEPGPVTA 280 10 UNP CD3Z_HUMAN P20963 ? 9 QSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSR 22 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7PHR A 1 ? 251 ? 7PHR 1 ? 251 ? 1 251 2 2 7PHR B 1 ? 290 ? 7PHR 1 ? 290 ? 1 290 3 3 7PHR C 1 ? 122 ? 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UNP P40967 ALA 288 'engineered mutation' 9 56 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.768 ? 15989 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.545 ? 4261 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.050 ? 1774 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2045 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7PHR _struct.title 'Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7PHR _struct_keywords.text 'T-cell receptor, TCR, Major Histocompatibility Complex, MHC, Antigen, Adaptive Immunity, Cancer, Complex, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 5 ? K N N 9 ? L N N 10 ? M N N 10 ? N N N 10 ? O N N 10 ? P N N 10 ? Q N N 10 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 81 ? THR A 85 ? ARG A 81 THR A 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 185 ? ASN A 189 ? ASN A 185 ASN A 189 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 206 ? GLU A 211 ? ASP A 206 GLU A 211 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 LYS A 212 ? PHE A 214 ? LYS A 212 PHE A 214 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 217 ? SER A 250 ? ASP A 217 SER A 250 1 ? 34 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP B 115 ? VAL B 119 ? ASP B 115 VAL B 119 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 130 ? THR B 137 ? SER B 130 THR B 137 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA B 197 ? GLN B 201 ? ALA B 197 GLN B 201 1 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 THR B 247 ? LYS B 286 ? THR B 247 LYS B 286 1 ? 40 HELX_P HELX_P10 AB1 ALA C 56 ? ASP C 58 ? ALA C 56 ASP C 58 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN C 89 ? GLY C 116 ? ASN C 89 GLY C 116 1 ? 28 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE D 57 ? ASP D 60 ? ILE D 57 ASP D 60 5 ? 4 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP D 79 ? HIS D 107 ? ASP D 79 HIS D 107 1 ? 29 HELX_P HELX_P14 AB5 LYS E 82 ? ALA E 86 ? LYS E 82 ALA E 86 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP E 104 ? ASN E 132 ? ASP E 104 ASN E 132 1 ? 29 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY F 68 ? TYR F 97 ? GLY H 56 TYR H 85 1 ? 30 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP F 149 ? ALA F 162 ? ASP H 137 ALA H 150 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 HIS F 163 ? GLY F 174 ? HIS H 151 GLY H 162 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY F 174 ? GLY F 187 ? GLY H 162 GLY H 175 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY F 187 ? GLN F 192 ? GLY H 175 GLN H 180 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN F 265 ? GLN F 267 ? GLN H 253 GLN H 255 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 PHE I 3 ? LEU I 6 ? PHE Z 3 LEU Z 6 5 ? 4 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP I 7 ? PHE I 34 ? ASP Z 7 PHE Z 34 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 LYS J 82 ? ALA J 86 ? LYS e 82 ALA e 86 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP J 104 ? LYS J 134 ? ASP e 104 LYS e 134 1 ? 31 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP K 7 ? PHE K 34 ? ASP z 7 PHE z 34 1 ? 28 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 24 SG ? ? ? 1_555 A CYS 90 SG ? ? A CYS 24 A CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 133 SG ? ? ? 1_555 A CYS 183 SG ? ? A CYS 133 A CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 205 SG ? ? ? 1_555 B CYS 244 SG ? ? A CYS 205 B CYS 244 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 24 SG ? ? ? 1_555 B CYS 92 SG ? ? B CYS 24 B CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 144 SG ? ? ? 1_555 B CYS 209 SG ? ? B CYS 144 B CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 24 SG ? ? ? 1_555 C CYS 65 SG ? ? C CYS 24 C CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 82 SG ? ? ? 1_555 C CYS 85 SG ? ? C CYS 82 C CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 16 SG ? ? ? 1_555 D CYS 52 SG ? ? D CYS 16 D CYS 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf9 disulf ? ? D CYS 72 SG ? ? ? 1_555 D CYS 75 SG ? ? D CYS 72 D CYS 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf10 disulf ? ? E CYS 27 SG ? ? ? 1_555 E CYS 76 SG ? ? E CYS 27 E CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 97 SG ? ? ? 1_555 E CYS 100 SG ? ? E CYS 97 E CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 113 SG ? ? ? 1_555 F CYS 176 SG ? ? H CYS 101 H CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? F CYS 215 SG ? ? ? 1_555 F CYS 271 SG ? ? H CYS 203 H CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf14 disulf ? ? G CYS 27 SG ? ? ? 1_555 G CYS 82 SG ? ? L CYS 25 L CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf15 disulf ? ? I CYS 11 SG ? ? ? 1_555 K CYS 11 SG ? ? Z CYS 11 z CYS 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf16 disulf ? ? J CYS 27 SG ? ? ? 1_555 J CYS 76 SG ? ? e CYS 27 e CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf17 disulf ? ? J CYS 97 SG ? ? ? 1_555 J CYS 100 SG ? ? e CYS 97 e CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? covale1 covale one ? A ASN 23 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 23 A NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 143 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 143 A NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 177 A NAG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 19 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 19 B NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? D ASN 17 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? D ASN 17 D NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? D ASN 53 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? D ASN 53 D NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 96 A . ? THR 96 A PRO 97 A ? PRO 97 A 1 10.72 2 SER 8 B . ? SER 8 B PRO 9 B ? PRO 9 B 1 -6.68 3 PHE 150 B . ? PHE 150 B PRO 151 B ? PRO 151 B 1 -1.68 4 TYR 221 F . ? TYR 209 H PRO 222 F ? PRO 210 H 1 0.40 5 HIS 33 G . ? HIS 31 L PRO 34 G ? PRO 32 L 1 6.36 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 7 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 8 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB6 6 7 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 11 ? GLN A 15 ? ALA A 11 GLN A 15 AA1 2 THR A 104 ? ILE A 109 ? THR A 104 ILE A 109 AA1 3 ALA A 86 ? THR A 92 ? ALA A 86 THR A 92 AA1 4 ASN A 32 ? GLN A 38 ? ASN A 32 GLN A 38 AA1 5 LEU A 44 ? ARG A 51 ? LEU A 44 ARG A 51 AA2 1 ALA A 20 ? SER A 25 ? ALA A 20 SER A 25 AA2 2 SER A 72 ? ILE A 77 ? SER A 72 ILE A 77 AA2 3 LEU A 62 ? ASP A 67 ? LEU A 62 ASP A 67 AA2 4 GLU A 56 ? SER A 59 ? GLU A 56 SER A 59 AA3 1 ALA A 118 ? GLN A 121 ? ALA A 118 GLN A 121 AA3 2 SER A 131 ? PHE A 138 ? SER A 131 PHE A 138 AA3 3 PHE A 167 ? SER A 176 ? PHE A 167 SER A 176 AA3 4 TYR A 153 ? ILE A 154 ? TYR A 153 ILE A 154 AA4 1 ALA A 118 ? GLN A 121 ? ALA A 118 GLN A 121 AA4 2 SER A 131 ? PHE A 138 ? SER A 131 PHE A 138 AA4 3 PHE A 167 ? SER A 176 ? PHE A 167 SER A 176 AA4 4 THR A 158 ? MET A 162 ? THR A 158 MET A 162 AA5 1 ILE B 5 ? SER B 8 ? ILE B 5 SER B 8 AA5 2 VAL B 20 ? GLN B 26 ? VAL B 20 GLN B 26 AA5 3 LEU B 77 ? VAL B 79 ? LEU B 77 VAL B 79 AA5 4 TYR B 65 ? VAL B 67 ? TYR B 65 VAL B 67 AA6 1 TYR B 11 ? LYS B 15 ? TYR B 11 LYS B 15 AA6 2 THR B 108 ? THR B 113 ? THR B 108 THR B 113 AA6 3 ALA B 88 ? SER B 95 ? ALA B 88 SER B 95 AA6 4 ALA B 32 ? ASP B 39 ? ALA B 32 ASP B 39 AA6 5 GLY B 43 ? SER B 50 ? GLY B 43 SER B 50 AA6 6 GLN B 57 ? LYS B 58 ? GLN B 57 LYS B 58 AA7 1 TYR B 11 ? LYS B 15 ? TYR B 11 LYS B 15 AA7 2 THR B 108 ? THR B 113 ? THR B 108 THR B 113 AA7 3 ALA B 88 ? SER B 95 ? ALA B 88 SER B 95 AA7 4 TYR B 103 ? PHE B 104 ? TYR B 103 PHE B 104 AA8 1 GLU B 123 ? PHE B 127 ? GLU B 123 PHE B 127 AA8 2 LYS B 139 ? PHE B 149 ? LYS B 139 PHE B 149 AA8 3 TYR B 187 ? SER B 196 ? TYR B 187 SER B 196 AA8 4 VAL B 169 ? THR B 171 ? VAL B 169 THR B 171 AA9 1 LYS B 163 ? VAL B 165 ? LYS B 163 VAL B 165 AA9 2 VAL B 154 ? VAL B 160 ? VAL B 154 VAL B 160 AA9 3 HIS B 206 ? PHE B 213 ? HIS B 206 PHE B 213 AA9 4 GLN B 232 ? TRP B 239 ? GLN B 232 TRP B 239 AB1 1 VAL C 9 ? TYR C 12 ? VAL C 9 TYR C 12 AB1 2 SER C 19 ? CYS C 24 ? SER C 19 CYS C 24 AB1 3 TRP C 50 ? SER C 54 ? TRP C 50 SER C 54 AB2 1 LYS C 38 ? LEU C 43 ? LYS C 38 LEU C 43 AB2 2 ILE C 31 ? LYS C 35 ? ILE C 31 LYS C 35 AB2 3 TYR C 63 ? LYS C 66 ? TYR C 63 LYS C 66 AB3 1 LEU C 75 ? TYR C 79 ? LEU C 75 TYR C 79 AB3 2 TYR J 89 ? ARG J 93 ? TYR e 89 ARG e 93 AB3 3 GLY J 72 ? PRO J 78 ? GLY e 72 PRO e 78 AB3 4 ILE J 35 ? HIS J 39 ? ILE e 35 HIS e 39 AB3 5 ASN J 43 ? ILE J 44 ? ASN e 43 ILE e 44 AB4 1 CYS C 85 ? GLU C 87 ? CYS C 85 GLU C 87 AB4 2 CYS J 100 ? GLU J 102 ? CYS e 100 GLU e 102 AB5 1 ILE D 5 ? LEU D 8 ? ILE D 5 LEU D 8 AB5 2 ARG D 11 ? ASN D 15 ? ARG D 11 ASN D 15 AB5 3 ARG D 36 ? LYS D 41 ? ARG D 36 LYS D 41 AB5 4 THR D 29 ? LEU D 30 ? THR D 29 LEU D 30 AB6 1 THR D 21 ? GLY D 25 ? THR D 21 GLY D 25 AB6 2 GLY D 48 ? ASN D 53 ? GLY D 48 ASN D 53 AB6 3 GLU D 62 ? ARG D 70 ? GLU D 62 ARG D 70 AB6 4 TYR E 89 ? ALA E 94 ? TYR E 89 ALA E 94 AB6 5 GLY E 72 ? PRO E 78 ? GLY E 72 PRO E 78 AB6 6 ILE E 35 ? HIS E 39 ? ILE E 35 HIS E 39 AB6 7 LYS E 42 ? ILE E 44 ? LYS E 42 ILE E 44 AB7 1 CYS D 75 ? GLU D 77 ? CYS D 75 GLU D 77 AB7 2 CYS E 100 ? GLU E 102 ? CYS E 100 GLU E 102 AB8 1 LYS E 15 ? SER E 19 ? LYS E 15 SER E 19 AB8 2 THR E 22 ? THR E 26 ? THR E 22 THR E 26 AB8 3 HIS E 59 ? LEU E 62 ? HIS E 59 LEU E 62 AB8 4 ILE E 53 ? ASP E 56 ? ILE E 53 ASP E 56 AB9 1 GLU F 58 ? PRO F 59 ? GLU H 46 PRO H 47 AB9 2 THR F 43 ? ASP F 49 ? THR H 31 ASP H 37 AB9 3 ARG F 33 ? VAL F 40 ? ARG H 21 VAL H 28 AB9 4 HIS F 15 ? VAL F 24 ? HIS H 3 VAL H 12 AB9 5 THR F 106 ? VAL F 115 ? THR H 94 VAL H 103 AB9 6 PHE F 121 ? TYR F 130 ? PHE H 109 TYR H 118 AB9 7 LYS F 133 ? LEU F 138 ? LYS H 121 LEU H 126 AB9 8 TRP F 145 ? ALA F 147 ? TRP H 133 ALA H 135 AC1 1 MET F 201 ? HIS F 204 ? MET H 189 HIS H 192 AC1 2 GLU F 210 ? PHE F 220 ? GLU H 198 PHE H 208 AC1 3 PHE F 253 ? PRO F 262 ? PHE H 241 PRO H 250 AC1 4 THR F 240 ? LEU F 242 ? THR H 228 LEU H 230 AC2 1 MET F 201 ? HIS F 204 ? MET H 189 HIS H 192 AC2 2 GLU F 210 ? PHE F 220 ? GLU H 198 PHE H 208 AC2 3 PHE F 253 ? 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