data_7PNE # _entry.id 7PNE # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.394 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7PNE pdb_00007pne 10.2210/pdb7pne/pdb WWPDB D_1292118011 ? ? BMRB 34664 ? 10.13018/BMR34664 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2021-12-29 2 'Structure model' 1 1 2022-01-19 3 'Structure model' 1 2 2022-02-09 4 'Structure model' 1 3 2022-02-16 5 'Structure model' 1 4 2024-06-19 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 4 'Structure model' 'Database references' 4 5 'Structure model' 'Data collection' 5 5 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' citation 4 3 'Structure model' citation_author 5 4 'Structure model' citation 6 4 'Structure model' citation_author 7 5 'Structure model' chem_comp_atom 8 5 'Structure model' chem_comp_bond 9 5 'Structure model' database_2 # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.page_first' 2 2 'Structure model' '_citation.page_last' 3 2 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 4 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 5 3 'Structure model' '_citation.page_first' 6 3 'Structure model' '_citation.page_last' 7 3 'Structure model' '_citation.year' 8 3 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 9 4 'Structure model' '_citation.page_first' 10 4 'Structure model' '_citation.page_last' 11 4 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 12 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.entry_id 7PNE _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-09-06 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details ;Parallel Q-D hybrid with 3' duplex stem-loop as a lateral snapback loop ; _pdbx_database_related.db_id 34664 _pdbx_database_related.content_type unspecified # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Vianney, Y.M.' 1 ? 'Weisz, K.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country GE _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Chemistry _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 0947-6539 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 28 _citation.language ? _citation.page_first e202103718 _citation.page_last e202103718 _citation.title 'Indoloquinoline Ligands Favor Intercalation at Quadruplex-Duplex Interfaces.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1002/chem.202103718 _citation.pdbx_database_id_PubMed 34905232 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Vianney, Y.M.' 1 0000-0002-4576-9935 primary 'Weisz, K.' 2 0000-0002-2736-6606 # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method man _entity.pdbx_description TTAMycdup-3sbl _entity.formula_weight 11210.249 _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer yes _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;(THM)(DT)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DC) (DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can XTAGGTGGGTAGGGTGGGCTAGTCATTTTGACTAGG _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 THM n 1 2 DT n 1 3 DA n 1 4 DG n 1 5 DG n 1 6 DT n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DG n 1 10 DT n 1 11 DA n 1 12 DG n 1 13 DG n 1 14 DG n 1 15 DT n 1 16 DG n 1 17 DG n 1 18 DG n 1 19 DC n 1 20 DT n 1 21 DA n 1 22 DG n 1 23 DT n 1 24 DC n 1 25 DA n 1 26 DT n 1 27 DT n 1 28 DT n 1 29 DT n 1 30 DG n 1 31 DA n 1 32 DC n 1 33 DT n 1 34 DA n 1 35 DG n 1 36 DG n # _entity_src_gen.entity_id 1 _entity_src_gen.pdbx_src_id 1 _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag sample _entity_src_gen.pdbx_seq_type 'Biological sequence' _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num 1 _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num 36 _entity_src_gen.gene_src_common_name ? _entity_src_gen.gene_src_genus ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene ? _entity_src_gen.gene_src_species ? _entity_src_gen.gene_src_strain ? _entity_src_gen.gene_src_tissue ? _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction ? _entity_src_gen.gene_src_details ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name 'synthetic construct' _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id 32630 _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location ? _entity_src_gen.host_org_common_name ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name 'synthetic construct' _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id 32630 _entity_src_gen.host_org_genus ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ ? _entity_src_gen.host_org_species ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector ? _entity_src_gen.host_org_details ? _entity_src_gen.expression_system_id ? _entity_src_gen.plasmid_name ? _entity_src_gen.plasmid_details ? _entity_src_gen.pdbx_description ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 THM 'DNA OH 5 prime terminus' . THYMIDINE ;DEOXYTHYMIDINE; 2'-DEOXYTHYMIDINE ; 'C10 H14 N2 O5' 242.229 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 THM 1 1 1 THM DT5 A . n A 1 2 DT 2 2 2 DT DT A . n A 1 3 DA 3 3 3 DA DA A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DG 5 5 5 DG DG A . n A 1 6 DT 6 6 6 DT DT A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DG 9 9 9 DG DG A . n A 1 10 DT 10 10 10 DT DT A . n A 1 11 DA 11 11 11 DA DA A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DG 13 13 13 DG DG A . n A 1 14 DG 14 14 14 DG DG A . n A 1 15 DT 15 15 15 DT DT A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DG 17 17 17 DG DG A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DC 19 19 19 DC DC A . n A 1 20 DT 20 20 20 DT DT A . n A 1 21 DA 21 21 21 DA DA A . n A 1 22 DG 22 22 22 DG DG A . n A 1 23 DT 23 23 23 DT DT A . n A 1 24 DC 24 24 24 DC DC A . n A 1 25 DA 25 25 25 DA DA A . n A 1 26 DT 26 26 26 DT DT A . n A 1 27 DT 27 27 27 DT DT A . n A 1 28 DT 28 28 28 DT DT A . n A 1 29 DT 29 29 29 DT DT A . n A 1 30 DG 30 30 30 DG DG A . n A 1 31 DA 31 31 31 DA DA A . n A 1 32 DC 32 32 32 DC DC A . n A 1 33 DT 33 33 33 DT DT A . n A 1 34 DA 34 34 34 DA DA A . n A 1 35 DG 35 35 35 DG DG A . n A 1 36 DG 36 36 36 DG DG3 A . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7PNE _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7PNE _struct.title ;Parallel Q-D hybrid with 3' duplex stem-loop as a lateral snapback loop ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7PNE _struct_keywords.text 'G-quadruplex, duplex, Quadruplex-duplex junction, DNA' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 7PNE _struct_ref.pdbx_db_accession 7PNE _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 7PNE _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 36 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 7PNE _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 36 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 36 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 340 ? 1 MORE 1 ? 1 'SSA (A^2)' 6360 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale one ? A THM 1 "O3'" ? ? ? 1_555 A DT 2 P ? ? A THM 1 A DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.610 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DG 7 O6 ? ? A DG 4 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 A DG 7 N7 ? ? A DG 4 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 4 N7 ? ? ? 1_555 A DG 16 N2 ? ? A DG 4 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DG 16 N1 ? ? A DG 4 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 5 N1 ? ? ? 1_555 A DG 8 O6 ? ? A DG 5 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 5 N2 ? ? ? 1_555 A DG 8 N7 ? ? A DG 5 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 5 N7 ? ? ? 1_555 A DG 17 N2 ? ? A DG 5 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 5 O6 ? ? ? 1_555 A DG 17 N1 ? ? A DG 5 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 A DG 12 O6 ? ? A DG 7 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 A DG 12 N7 ? ? A DG 7 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 A DG 13 O6 ? ? A DG 8 A DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DG 13 N7 ? ? A DG 8 A DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 9 N3 ? ? ? 1_555 A DA 11 N6 ? ? A DG 9 A DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 9 N1 ? ? ? 1_555 A DG 14 O6 ? ? A DG 9 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 9 N2 ? ? ? 1_555 A DG 14 N7 ? ? A DG 9 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 9 N7 ? ? ? 1_555 A DG 36 N2 ? ? A DG 9 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 9 O6 ? ? ? 1_555 A DG 36 N1 ? ? A DG 9 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 12 N1 ? ? ? 1_555 A DG 16 O6 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 12 N2 ? ? ? 1_555 A DG 16 N7 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 13 N1 ? ? ? 1_555 A DG 17 O6 ? ? A DG 13 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 13 N2 ? ? ? 1_555 A DG 17 N7 ? ? A DG 13 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 14 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 14 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 18 N1 ? ? ? 1_555 A DG 36 O6 ? ? A DG 18 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 18 N2 ? ? ? 1_555 A DG 36 N7 ? ? A DG 18 A DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DC 19 N3 ? ? ? 1_555 A DG 35 N1 ? ? A DC 19 A DG 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DC 19 N4 ? ? ? 1_555 A DG 35 O6 ? ? A DC 19 A DG 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DC 19 O2 ? ? ? 1_555 A DG 35 N2 ? ? A DC 19 A DG 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DT 20 N3 ? ? ? 1_555 A DA 34 N1 ? ? A DT 20 A DA 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DT 20 O4 ? ? ? 1_555 A DA 34 N6 ? ? A DT 20 A DA 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DA 21 N1 ? ? ? 1_555 A DT 33 N3 ? ? A DA 21 A DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DA 21 N6 ? ? ? 1_555 A DT 33 O4 ? ? A DA 21 A DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A DG 22 N1 ? ? ? 1_555 A DC 32 N3 ? ? A DG 22 A DC 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A DG 22 N2 ? ? ? 1_555 A DC 32 O2 ? ? A DG 22 A DC 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A DG 22 O6 ? ? ? 1_555 A DC 32 N4 ? ? A DG 22 A DC 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DT 23 N3 ? ? ? 1_555 A DA 31 N1 ? ? A DT 23 A DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DT 23 O4 ? ? ? 1_555 A DA 31 N6 ? ? A DT 23 A DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DC 24 N3 ? ? ? 1_555 A DG 30 N1 ? ? A DC 24 A DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DC 24 N4 ? ? ? 1_555 A DG 30 O6 ? ? A DC 24 A DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DC 24 O2 ? ? ? 1_555 A DG 30 N2 ? ? A DC 24 A DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A DA 25 N1 ? ? ? 1_555 A DT 29 N3 ? ? A DA 25 A DT 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DA 25 N6 ? ? ? 1_555 A DT 29 O4 ? ? A DA 25 A DT 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 2 1 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 3 1 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 4 1 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 5 1 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 6 1 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.24 118.60 -5.36 0.60 N 7 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 8 1 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 9 1 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 112.36 108.30 4.06 0.30 N 10 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 11 1 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.21 108.30 4.91 0.30 N 12 1 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 13 1 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 112.36 108.30 4.06 0.30 N 14 1 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.04 122.90 -3.86 0.60 N 15 1 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 112.72 108.30 4.42 0.30 N 16 1 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 17 1 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 114.22 118.60 -4.38 0.60 N 18 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 19 1 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.78 108.30 3.48 0.30 N 20 1 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 21 1 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.71 108.30 2.41 0.30 N 22 1 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.12 122.90 -3.78 0.60 N 23 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 24 1 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.69 118.90 3.79 0.60 N 25 1 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.37 121.90 -5.53 0.70 N 26 1 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 112.94 108.30 4.64 0.30 N 27 1 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.54 117.00 -3.46 0.50 N 28 1 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.10 117.70 3.40 0.50 N 29 1 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.64 118.60 -4.96 0.60 N 30 1 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 31 1 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 32 1 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.73 108.30 4.43 0.30 N 33 1 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.53 118.90 3.63 0.60 N 34 1 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.35 121.90 -5.55 0.70 N 35 1 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 112.26 108.30 3.96 0.30 N 36 1 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 37 1 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 38 1 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.44 118.60 -5.16 0.60 N 39 1 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 40 1 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 110.10 108.30 1.80 0.30 N 41 1 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 118.61 122.90 -4.29 0.60 N 42 1 "C3'" A DT 27 ? ? "O3'" A DT 27 ? ? P A DT 28 ? ? 127.05 119.70 7.35 1.20 Y 43 1 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 111.06 108.30 2.76 0.30 N 44 1 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 45 1 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 112.94 108.30 4.64 0.30 N 46 1 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.08 122.90 -3.82 0.60 N 47 1 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 48 1 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 49 1 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 50 1 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 51 1 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.58 121.90 -5.32 0.70 N 52 1 "O4'" A DA 34 ? ? "C1'" A DA 34 ? ? N9 A DA 34 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 53 1 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 54 1 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.01 117.70 3.31 0.50 N 55 1 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 56 1 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.86 108.30 5.56 0.30 N 57 2 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 112.22 108.30 3.92 0.30 N 58 2 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 113.16 108.30 4.86 0.30 N 59 2 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.91 117.00 -3.09 0.50 N 60 2 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 61 2 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.17 118.60 -5.43 0.60 N 62 2 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 63 2 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 64 2 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 113.00 108.30 4.70 0.30 N 65 2 N3 A DT 6 ? ? C2 A DT 6 ? ? O2 A DT 6 ? ? 118.58 122.30 -3.72 0.60 N 66 2 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.51 108.30 3.21 0.30 N 67 2 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 68 2 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 69 2 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 70 2 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 71 2 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.13 118.60 -5.47 0.60 N 72 2 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 73 2 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 74 2 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 75 2 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 76 2 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 77 2 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 78 2 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 79 2 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 80 2 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 81 2 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 82 2 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.91 118.60 -4.69 0.60 N 83 2 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 84 2 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.49 108.30 4.19 0.30 N 85 2 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.53 121.90 -5.37 0.70 N 86 2 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 87 2 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 88 2 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 89 2 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 90 2 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.60 108.30 3.30 0.30 N 91 2 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 92 2 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 93 2 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 94 2 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 95 2 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 96 2 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 97 2 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.92 117.00 -3.08 0.50 N 98 2 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 99 2 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.38 118.60 -5.22 0.60 N 100 2 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 101 2 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 102 2 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 103 2 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.38 118.60 -5.22 0.60 N 104 2 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.27 108.30 4.97 0.30 N 105 3 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.65 108.30 2.35 0.30 N 106 3 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 107 3 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 108 3 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 109 3 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.18 118.60 -5.42 0.60 N 110 3 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 111 3 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 114.17 108.30 5.87 0.30 N 112 3 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.00 122.90 -3.90 0.60 N 113 3 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N 114 3 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 115 3 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 116 3 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.70 122.30 -3.60 0.60 N 117 3 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.09 122.90 -3.81 0.60 N 118 3 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.33 108.30 3.03 0.30 N 119 3 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.96 117.00 -3.04 0.50 N 120 3 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 121 3 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.95 118.60 -4.65 0.60 N 122 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 123 3 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 124 3 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 125 3 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 126 3 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 127 3 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.67 121.90 -5.23 0.70 N 128 3 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 129 3 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 113.45 108.30 5.15 0.30 N 130 3 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 131 3 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 132 3 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.75 118.60 -4.85 0.60 N 133 3 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 134 3 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 135 3 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 111.70 108.30 3.40 0.30 N 136 3 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.55 118.90 3.65 0.60 N 137 3 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.46 121.90 -5.44 0.70 N 138 3 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 139 3 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 140 3 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.50 118.60 -5.10 0.60 N 141 3 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 142 3 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.09 122.90 -3.81 0.60 N 143 3 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 110.65 108.30 2.35 0.30 N 144 3 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 145 3 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 146 3 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 147 3 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.91 117.00 -3.09 0.50 N 148 3 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 149 3 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.53 118.60 -5.07 0.60 N 150 3 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.54 118.90 3.64 0.60 N 151 3 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.48 121.90 -5.42 0.70 N 152 3 "O4'" A DT 33 ? ? "C1'" A DT 33 ? ? N1 A DT 33 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 153 3 C6 A DT 33 ? ? C5 A DT 33 ? ? C7 A DT 33 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 154 3 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 155 3 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 156 3 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.66 118.60 -4.94 0.60 N 157 3 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.32 108.30 5.02 0.30 N 158 4 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 159 4 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 160 4 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 161 4 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 162 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 163 4 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 164 4 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 165 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 166 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 167 4 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? "C2'" A DT 10 ? ? 100.89 105.90 -5.01 0.80 N 168 4 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 169 4 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 117.70 122.30 -4.60 0.60 N 170 4 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 171 4 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.40 117.00 -3.60 0.50 N 172 4 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 173 4 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.14 118.60 -5.46 0.60 N 174 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 175 4 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 176 4 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.38 108.30 4.08 0.30 N 177 4 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 178 4 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 179 4 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 180 4 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 181 4 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 112.55 108.30 4.25 0.30 N 182 4 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 183 4 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 184 4 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.57 118.60 -5.03 0.60 N 185 4 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 186 4 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 111.96 108.30 3.66 0.30 N 187 4 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 188 4 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 189 4 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 190 4 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.82 118.60 -4.78 0.60 N 191 4 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 192 4 N3 A DT 26 ? ? C2 A DT 26 ? ? O2 A DT 26 ? ? 118.67 122.30 -3.63 0.60 N 193 4 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 118.94 122.90 -3.96 0.60 N 194 4 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 195 4 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 196 4 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 197 4 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.30 122.90 -3.60 0.60 N 198 4 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 199 4 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 200 4 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.93 108.30 3.63 0.30 N 201 4 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 202 4 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 203 4 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.41 118.60 -5.19 0.60 N 204 4 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.61 118.90 3.71 0.60 N 205 4 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 206 4 "O4'" A DT 33 ? ? "C1'" A DT 33 ? ? N1 A DT 33 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 207 4 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 208 4 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 209 4 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 210 4 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 211 5 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 212 5 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 213 5 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 214 5 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 215 5 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 216 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 217 5 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.97 108.30 3.67 0.30 N 218 5 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 219 5 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 220 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 221 5 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 222 5 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 223 5 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 112.78 108.30 4.48 0.30 N 224 5 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 225 5 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 226 5 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 227 5 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.96 117.00 -3.04 0.50 N 228 5 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 229 5 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 114.04 118.60 -4.56 0.60 N 230 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 231 5 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 232 5 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 233 5 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 118.15 122.90 -4.75 0.60 N 234 5 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 235 5 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 236 5 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 237 5 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 238 5 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 112.66 108.30 4.36 0.30 N 239 5 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 240 5 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 241 5 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 242 5 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 243 5 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 244 5 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 245 5 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.50 121.90 -5.40 0.70 N 246 5 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.64 117.00 -3.36 0.50 N 247 5 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 248 5 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.39 118.60 -5.21 0.60 N 249 5 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 250 5 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N 251 5 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 252 5 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 253 5 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 111.81 108.30 3.51 0.30 N 254 5 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 118.63 122.90 -4.27 0.60 N 255 5 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 256 5 N3 A DT 29 ? ? C2 A DT 29 ? ? O2 A DT 29 ? ? 118.64 122.30 -3.66 0.60 N 257 5 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 258 5 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 259 5 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 260 5 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 261 5 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.16 118.60 -5.44 0.60 N 262 5 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.48 121.90 -5.42 0.70 N 263 5 "O4'" A DA 34 ? ? "C1'" A DA 34 ? ? N9 A DA 34 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 264 5 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 265 5 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 266 5 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.83 118.60 -4.77 0.60 N 267 5 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 114.67 108.30 6.37 0.30 N 268 6 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 269 6 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.25 108.30 2.95 0.30 N 270 6 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 271 6 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 272 6 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.35 118.60 -5.25 0.60 N 273 6 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 274 6 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 275 6 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 276 6 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.10 122.90 -3.80 0.60 N 277 6 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 278 6 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.02 108.30 3.72 0.30 N 279 6 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 280 6 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.62 122.30 -3.68 0.60 N 281 6 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 282 6 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.23 117.00 -3.77 0.50 N 283 6 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.55 117.70 3.85 0.50 N 284 6 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.68 118.60 -5.92 0.60 N 285 6 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N 286 6 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 287 6 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 288 6 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 289 6 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.48 121.90 -5.42 0.70 N 290 6 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 111.86 108.30 3.56 0.30 N 291 6 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 292 6 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 293 6 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.56 118.60 -5.04 0.60 N 294 6 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 295 6 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 118.41 122.90 -4.49 0.60 N 296 6 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.72 108.30 4.42 0.30 N 297 6 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.54 121.90 -5.36 0.70 N 298 6 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 299 6 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.63 118.60 -4.97 0.60 N 300 6 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.53 108.30 3.23 0.30 N 301 6 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 302 6 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 303 6 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 304 6 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 305 6 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 306 6 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 307 6 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 308 6 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.50 118.60 -5.10 0.60 N 309 6 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 310 6 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.41 121.90 -5.49 0.70 N 311 6 "O4'" A DA 34 ? ? "C1'" A DA 34 ? ? N9 A DA 34 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 312 6 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.58 117.00 -3.42 0.50 N 313 6 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 314 6 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.72 118.60 -4.88 0.60 N 315 6 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.17 108.30 4.87 0.30 N 316 7 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 317 7 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.09 108.30 3.79 0.30 N 318 7 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 319 7 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 320 7 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.23 118.60 -5.37 0.60 N 321 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 322 7 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 111.59 108.30 3.29 0.30 N 323 7 N3 A DG 5 ? ? C2 A DG 5 ? ? N2 A DG 5 ? ? 115.46 119.90 -4.44 0.70 N 324 7 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 325 7 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 326 7 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.49 108.30 4.19 0.30 N 327 7 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 328 7 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 329 7 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 112.08 108.30 3.78 0.30 N 330 7 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.30 117.00 -3.70 0.50 N 331 7 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 332 7 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.78 118.60 -5.82 0.60 N 333 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 334 7 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 335 7 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 336 7 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 337 7 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 338 7 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.93 108.30 3.63 0.30 N 339 7 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 340 7 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 341 7 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 111.46 108.30 3.16 0.30 N 342 7 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 343 7 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 344 7 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 345 7 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 346 7 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 347 7 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.58 108.30 4.28 0.30 N 348 7 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.49 121.90 -5.41 0.70 N 349 7 "O4'" A DA 25 ? ? "C1'" A DA 25 ? ? N9 A DA 25 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 350 7 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.99 117.00 -3.01 0.50 N 351 7 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 352 7 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 353 7 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N 354 7 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.00 122.90 -3.90 0.60 N 355 7 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 356 7 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 357 7 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 358 7 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 359 7 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 360 7 "O4'" A DA 31 ? ? "C1'" A DA 31 ? ? N9 A DA 31 ? ? 110.70 108.30 2.40 0.30 N 361 7 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 362 7 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 363 7 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.44 118.60 -5.16 0.60 N 364 7 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 365 7 C6 A DT 33 ? ? C5 A DT 33 ? ? C7 A DT 33 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 366 7 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 367 7 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 368 7 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.66 118.60 -4.94 0.60 N 369 7 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.97 108.30 5.67 0.30 N 370 8 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.38 108.30 3.08 0.30 N 371 8 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 372 8 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 373 8 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.30 118.60 -5.30 0.60 N 374 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 375 8 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 112.76 108.30 4.46 0.30 N 376 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.25 108.30 2.95 0.30 N 377 8 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 378 8 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.54 108.30 4.24 0.30 N 379 8 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N 380 8 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 381 8 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.82 108.30 3.52 0.30 N 382 8 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 383 8 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 384 8 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.95 118.60 -5.65 0.60 N 385 8 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 386 8 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.59 108.30 2.29 0.30 N 387 8 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 388 8 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 389 8 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 390 8 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 391 8 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 392 8 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.58 121.90 -5.32 0.70 N 393 8 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 394 8 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 395 8 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.60 117.00 -3.40 0.50 N 396 8 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.08 117.70 3.38 0.50 N 397 8 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.52 118.60 -5.08 0.60 N 398 8 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.28 108.30 3.98 0.30 N 399 8 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.89 108.30 4.59 0.30 N 400 8 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.68 118.90 3.78 0.60 N 401 8 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.37 121.90 -5.53 0.70 N 402 8 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 403 8 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 404 8 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.15 118.60 -5.45 0.60 N 405 8 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 406 8 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 113.44 108.30 5.14 0.30 N 407 8 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 118.81 122.90 -4.09 0.60 N 408 8 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 409 8 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 410 8 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 411 8 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 412 8 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 413 8 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.51 118.60 -5.09 0.60 N 414 8 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.69 118.90 3.79 0.60 N 415 8 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 416 8 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 417 8 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 418 8 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.68 118.60 -4.92 0.60 N 419 8 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.58 108.30 5.28 0.30 N 420 9 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 421 9 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 422 9 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 423 9 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 424 9 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 425 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 426 9 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 427 9 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 110.84 108.30 2.54 0.30 N 428 9 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 429 9 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 430 9 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 113.02 108.30 4.72 0.30 N 431 9 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 432 9 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 433 9 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 434 9 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 435 9 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.89 118.60 -5.71 0.60 N 436 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 437 9 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 112.82 108.30 4.52 0.30 N 438 9 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.34 108.30 4.04 0.30 N 439 9 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 440 9 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 441 9 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 112.28 108.30 3.98 0.30 N 442 9 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 443 9 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 112.54 108.30 4.24 0.30 N 444 9 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 445 9 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 446 9 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.59 118.60 -5.01 0.60 N 447 9 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 448 9 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 449 9 N1 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 122.59 118.90 3.69 0.60 N 450 9 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.37 121.90 -5.53 0.70 N 451 9 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 452 9 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 453 9 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.38 118.60 -5.22 0.60 N 454 9 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 455 9 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 456 9 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 457 9 "O4'" A DT 28 ? ? "C1'" A DT 28 ? ? N1 A DT 28 ? ? 111.06 108.30 2.76 0.30 N 458 9 C6 A DT 28 ? ? C5 A DT 28 ? ? C7 A DT 28 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 459 9 N3 A DT 29 ? ? C2 A DT 29 ? ? O2 A DT 29 ? ? 118.66 122.30 -3.64 0.60 N 460 9 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 461 9 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 111.76 108.30 3.46 0.30 N 462 9 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 463 9 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 464 9 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.26 118.60 -5.34 0.60 N 465 9 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 466 9 "O4'" A DA 34 ? ? "C1'" A DA 34 ? ? N9 A DA 34 ? ? 112.20 108.30 3.90 0.30 N 467 9 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 468 9 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 469 9 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.33 118.60 -5.27 0.60 N 470 9 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 113.20 108.30 4.90 0.30 N 471 10 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 472 10 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.59 108.30 3.29 0.30 N 473 10 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.55 117.00 -3.45 0.50 N 474 10 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 475 10 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 476 10 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 477 10 "O4'" A DG 5 ? ? "C1'" A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 478 10 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 112.21 108.30 3.91 0.30 N 479 10 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.30 108.30 4.00 0.30 N 480 10 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 481 10 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 113.52 108.30 5.22 0.30 N 482 10 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.30 122.90 -3.60 0.60 N 483 10 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 484 10 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.99 117.00 -3.01 0.50 N 485 10 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 486 10 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 114.36 118.60 -4.24 0.60 N 487 10 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 113.48 108.30 5.18 0.30 N 488 10 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.94 108.30 3.64 0.30 N 489 10 C6 A DT 15 ? ? C5 A DT 15 ? ? C7 A DT 15 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 490 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 491 10 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 492 10 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.80 121.90 -5.10 0.70 N 493 10 "O4'" A DA 21 ? ? "C1'" A DA 21 ? ? N9 A DA 21 ? ? 113.21 108.30 4.91 0.30 N 494 10 C4 A DA 21 ? ? C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? 113.48 117.00 -3.52 0.50 N 495 10 C5 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N1 A DA 21 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 496 10 N1 A DA 21 ? ? C6 A DA 21 ? ? N6 A DA 21 ? ? 113.36 118.60 -5.24 0.60 N 497 10 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 498 10 C6 A DT 23 ? ? C5 A DT 23 ? ? C7 A DT 23 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 499 10 "O4'" A DC 24 ? ? "C1'" A DC 24 ? ? N1 A DC 24 ? ? 111.03 108.30 2.73 0.30 N 500 10 N3 A DC 24 ? ? C2 A DC 24 ? ? O2 A DC 24 ? ? 116.65 121.90 -5.25 0.70 N 501 10 C4 A DA 25 ? ? C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 502 10 C5 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N1 A DA 25 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 503 10 N1 A DA 25 ? ? C6 A DA 25 ? ? N6 A DA 25 ? ? 113.16 118.60 -5.44 0.60 N 504 10 "O4'" A DT 26 ? ? "C1'" A DT 26 ? ? N1 A DT 26 ? ? 112.72 108.30 4.42 0.30 N 505 10 C6 A DT 26 ? ? C5 A DT 26 ? ? C7 A DT 26 ? ? 119.10 122.90 -3.80 0.60 N 506 10 "O4'" A DT 27 ? ? "C1'" A DT 27 ? ? N1 A DT 27 ? ? 111.66 108.30 3.36 0.30 N 507 10 C6 A DT 27 ? ? C5 A DT 27 ? ? C7 A DT 27 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 508 10 "O4'" A DT 29 ? ? "C1'" A DT 29 ? ? N1 A DT 29 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 509 10 C6 A DT 29 ? ? C5 A DT 29 ? ? C7 A DT 29 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 510 10 "O4'" A DG 30 ? ? "C1'" A DG 30 ? ? N9 A DG 30 ? ? 112.95 108.30 4.65 0.30 N 511 10 C4 A DA 31 ? ? C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 512 10 C5 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N1 A DA 31 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 513 10 N1 A DA 31 ? ? C6 A DA 31 ? ? N6 A DA 31 ? ? 113.30 118.60 -5.30 0.60 N 514 10 N1 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 122.55 118.90 3.65 0.60 N 515 10 N3 A DC 32 ? ? C2 A DC 32 ? ? O2 A DC 32 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 516 10 C4 A DA 34 ? ? C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 517 10 C5 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N1 A DA 34 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 518 10 N1 A DA 34 ? ? C6 A DA 34 ? ? N6 A DA 34 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 519 10 "C3'" A DG 35 ? ? "O3'" A DG 35 ? ? P A DG 36 ? ? 127.31 119.70 7.61 1.20 Y 520 10 "O4'" A DG 36 ? ? "C1'" A DG 36 ? ? N9 A DG 36 ? ? 111.64 108.30 3.34 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DT A 20 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 2 1 DT A 23 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 3 1 DA A 25 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 4 1 DT A 29 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 5 1 DG A 35 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 6 2 DA A 3 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 7 2 DG A 5 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 9 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 9 2 DA A 25 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 10 2 DT A 33 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 11 2 DA A 34 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 12 3 DA A 3 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 13 3 DG A 4 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 14 3 DT A 23 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 15 4 DT A 2 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 16 4 DA A 3 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 17 4 DG A 4 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' 18 4 DG A 9 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 19 4 DA A 11 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 20 4 DT A 20 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 21 4 DA A 25 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 22 5 DA A 3 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 23 5 DT A 20 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 24 6 DA A 3 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 25 6 DT A 10 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 26 6 DA A 11 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 27 6 DT A 26 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 28 6 DT A 28 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 29 7 DA A 11 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 30 7 DT A 20 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 31 7 DT A 26 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 32 8 DA A 3 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 33 8 DG A 4 ? ? 0.049 'SIDE CHAIN' 34 8 DT A 20 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 35 8 DT A 23 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 36 9 DT A 20 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 37 9 DT A 23 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 38 10 DA A 3 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 39 10 DG A 4 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 40 10 DG A 9 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 41 10 DA A 11 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 42 10 DT A 20 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 43 10 DT A 26 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' # _pdbx_entry_details.entry_id 7PNE _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 7PNE _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 7PNE _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.contents '1 mM 0 DNA, 90% H2O/10% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '90% H2O/10% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.label 1 _pdbx_nmr_sample_details.type solution _pdbx_nmr_sample_details.details mycdup-3sbl # _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample.component DNA _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration 1 _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range ? _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 0 # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 293 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 10 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details 'mycdup-3sbl-10 mM K+, 293 K' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label 'condition 1' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-13C HSQC aromatic' 1 isotropic 2 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 3 1 1 '2D DQF-COSY' 1 isotropic # _pdbx_nmr_refine.entry_id 7PNE _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 5 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 'chemical shift assignment' 'CcpNmr Analysis' 2.4.2 CCPN 2 processing TopSpin 4.0.7 'Bruker Biospin' 3 'data analysis' 'CcpNmr Analysis' 2.4.2 CCPN 4 'structure calculation' 'X-PLOR NIH' 3.0.3 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 5 refinement Amber 16 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 THM "O5'" O N N 144 THM "C5'" C N N 145 THM "C4'" C N R 146 THM "O4'" O N N 147 THM "C3'" C N S 148 THM "O3'" O N N 149 THM "C2'" C N N 150 THM "C1'" C N R 151 THM N1 N N N 152 THM C2 C N N 153 THM O2 O N N 154 THM N3 N N N 155 THM C4 C N N 156 THM O4 O N N 157 THM C5 C N N 158 THM C5M C N N 159 THM C6 C N N 160 THM "HO5'" H N N 161 THM "H5'1" H N N 162 THM "H5'2" H N N 163 THM "H4'" H N N 164 THM "H3'" H N N 165 THM "HO3'" H N N 166 THM "H2'1" H N N 167 THM "H2'2" H N N 168 THM "H1'" H N N 169 THM HN3 H N N 170 THM HM51 H N N 171 THM HM52 H N N 172 THM HM53 H N N 173 THM H6 H N N 174 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 THM "O5'" "C5'" sing N N 150 THM "O5'" "HO5'" sing N N 151 THM "C5'" "C4'" sing N N 152 THM "C5'" "H5'1" sing N N 153 THM "C5'" "H5'2" sing N N 154 THM "C4'" "O4'" sing N N 155 THM "C4'" "C3'" sing N N 156 THM "C4'" "H4'" sing N N 157 THM "O4'" "C1'" sing N N 158 THM "C3'" "O3'" sing N N 159 THM "C3'" "C2'" sing N N 160 THM "C3'" "H3'" sing N N 161 THM "O3'" "HO3'" sing N N 162 THM "C2'" "C1'" sing N N 163 THM "C2'" "H2'1" sing N N 164 THM "C2'" "H2'2" sing N N 165 THM "C1'" N1 sing N N 166 THM "C1'" "H1'" sing N N 167 THM N1 C2 sing N N 168 THM N1 C6 sing N N 169 THM C2 O2 doub N N 170 THM C2 N3 sing N N 171 THM N3 C4 sing N N 172 THM N3 HN3 sing N N 173 THM C4 O4 doub N N 174 THM C4 C5 sing N N 175 THM C5 C5M sing N N 176 THM C5 C6 doub N N 177 THM C5M HM51 sing N N 178 THM C5M HM52 sing N N 179 THM C5M HM53 sing N N 180 THM C6 H6 sing N N 181 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7PNE 'double helix' 7PNE 'hairpin loop' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DT 29 1_555 A DA 25 1_555 -0.273 0.155 0.332 -31.990 7.296 -0.191 1 A_DT29:DA25_A A 29 ? A 25 ? 20 1 1 A DG 30 1_555 A DC 24 1_555 -0.246 -0.081 -0.246 2.350 1.485 -1.735 2 A_DG30:DC24_A A 30 ? A 24 ? 19 1 1 A DA 31 1_555 A DT 23 1_555 0.215 0.008 0.154 9.975 -15.283 1.084 3 A_DA31:DT23_A A 31 ? A 23 ? 20 1 1 A DC 32 1_555 A DG 22 1_555 0.244 -0.074 0.180 1.230 -14.934 -0.395 4 A_DC32:DG22_A A 32 ? A 22 ? 19 1 1 A DT 33 1_555 A DA 21 1_555 -0.182 -0.030 0.109 -8.084 -9.806 1.284 5 A_DT33:DA21_A A 33 ? A 21 ? 20 1 1 A DA 34 1_555 A DT 20 1_555 0.115 0.010 0.254 1.457 -5.677 7.023 6 A_DA34:DT20_A A 34 ? A 20 ? 20 1 1 A DG 35 1_555 A DC 19 1_555 -0.331 -0.118 0.148 -6.890 -24.609 -0.956 7 A_DG35:DC19_A A 35 ? A 19 ? 19 1 1 A DG 14 1_555 A DG 18 1_555 1.887 3.302 -0.086 -7.062 10.772 -89.023 8 A_DG14:DG18_A A 14 ? A 18 ? 6 3 1 A DG 5 1_555 A DG 17 1_555 -1.860 -3.343 -0.028 -3.282 0.120 88.802 9 A_DG5:DG17_A A 5 ? A 17 ? 6 3 1 A DG 16 1_555 A DG 4 1_555 1.874 3.226 -0.058 1.085 9.719 -91.667 10 A_DG16:DG4_A A 16 ? A 4 ? 6 3 1 A DG 12 1_555 A DG 7 1_555 -1.979 -3.105 0.327 2.900 -10.384 91.740 11 A_DG12:DG7_A A 12 ? A 7 ? 6 3 1 A DG 8 1_555 A DG 13 1_555 1.687 3.271 -0.716 12.581 -2.689 -93.428 12 A_DG8:DG13_A A 8 ? A 13 ? 6 3 1 A DG 9 1_555 A DG 36 1_555 -1.849 -3.204 0.287 -4.337 -7.097 93.047 13 A_DG9:DG36_A A 9 ? A 36 ? 6 3 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DT 29 1_555 A DA 25 1_555 A DG 30 1_555 A DC 24 1_555 -0.448 0.741 2.803 4.903 -6.857 30.642 2.390 1.559 2.483 -12.676 -9.063 31.754 1 AA_DT29DG30:DC24DA25_AA A 29 ? A 25 ? A 30 ? A 24 ? 1 A DG 30 1_555 A DC 24 1_555 A DA 31 1_555 A DT 23 1_555 -1.431 0.536 3.255 -3.874 -1.533 33.016 1.196 1.842 3.368 -2.683 6.783 33.270 2 AA_DG30DA31:DT23DC24_AA A 30 ? A 24 ? A 31 ? A 23 ? 1 A DA 31 1_555 A DT 23 1_555 A DC 32 1_555 A DG 22 1_555 0.235 -0.964 3.509 -1.177 -0.558 38.634 -1.383 -0.511 3.514 -0.843 1.779 38.655 3 AA_DA31DC32:DG22DT23_AA A 31 ? A 23 ? A 32 ? A 22 ? 1 A DC 32 1_555 A DG 22 1_555 A DT 33 1_555 A DA 21 1_555 0.653 -0.397 3.444 4.344 2.124 35.815 -0.958 -0.402 3.469 3.435 -7.024 36.129 4 AA_DC32DT33:DA21DG22_AA A 32 ? A 22 ? A 33 ? A 21 ? 1 A DT 33 1_555 A DA 21 1_555 A DA 34 1_555 A DT 20 1_555 0.545 -0.004 3.113 0.170 2.036 28.209 -0.457 -1.078 3.108 4.170 -0.347 28.281 5 AA_DT33DA34:DT20DA21_AA A 33 ? A 21 ? A 34 ? A 20 ? 1 A DA 34 1_555 A DT 20 1_555 A DG 35 1_555 A DC 19 1_555 -1.626 0.208 3.501 -3.678 -3.533 41.257 0.701 1.867 3.598 -4.990 5.195 41.557 6 AA_DA34DG35:DC19DT20_AA A 34 ? A 20 ? A 35 ? A 19 ? 1 A DG 35 1_555 A DC 19 1_555 A DG 14 1_555 A DG 18 1_555 4.640 -0.398 0.014 -133.293 -108.281 -45.576 0.851 1.523 3.093 55.736 -68.611 -172.378 7 AA_DG35DG14:DG18DC19_AA A 35 ? A 19 ? A 14 ? A 18 ? 1 A DG 14 1_555 A DG 18 1_555 A DG 5 1_555 A DG 17 1_555 -1.322 -1.432 -3.160 -3.937 -5.977 59.427 -1.714 1.509 -2.932 -6.006 3.956 59.818 8 AA_DG14DG5:DG17DG18_AA A 14 ? A 18 ? A 5 ? A 17 ? 1 A DG 5 1_555 A DG 17 1_555 A DG 16 1_555 A DG 4 1_555 0.386 1.130 -3.411 2.173 2.317 -26.391 -1.811 0.232 -3.515 -5.051 4.738 -26.578 9 AA_DG5DG16:DG4DG17_AA A 5 ? A 17 ? A 16 ? A 4 ? 1 A DG 16 1_555 A DG 4 1_555 A DG 12 1_555 A DG 7 1_555 1.927 3.295 -0.131 -11.127 -3.465 -178.214 -1.648 0.964 -0.127 1.733 -5.564 -178.223 10 AA_DG16DG12:DG7DG4_AA A 16 ? A 4 ? A 12 ? A 7 ? 1 A DG 12 1_555 A DG 7 1_555 A DG 8 1_555 A DG 13 1_555 0.241 -0.552 3.274 1.108 -0.592 24.651 -1.111 -0.224 3.293 -1.386 -2.593 24.683 11 AA_DG12DG8:DG13DG7_AA A 12 ? A 7 ? A 8 ? A 13 ? 1 A DG 8 1_555 A DG 13 1_555 A DG 9 1_555 A DG 36 1_555 1.105 2.544 2.923 6.581 3.124 -59.523 -2.680 1.386 2.675 -3.134 6.602 -59.927 12 AA_DG8DG9:DG36DG13_AA A 8 ? A 13 ? A 9 ? A 36 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'German Research Foundation (DFG)' _pdbx_audit_support.country Germany _pdbx_audit_support.grant_number 'WE 1933/15-1' _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.model 'AVANCE NEO' _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 600 _pdbx_nmr_spectrometer.details ? # _atom_sites.entry_id 7PNE _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_