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AC4 ? 3 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 7 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 7 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 5 ? AE4 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC3 6 7 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD2 5 6 ? anti-parallel AD2 6 7 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE1 5 6 ? anti-parallel AE1 6 7 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 21 ? PHE A 23 ? ARG A 55 PHE A 57 AA1 2 ASN A 83 ? LEU A 87 ? ASN A 117 LEU A 121 AA1 3 THR A 70 ? ASP A 72 ? THR A 104 ASP A 106 AA1 4 LEU A 40 ? GLY A 43 ? LEU A 74 GLY A 77 AA1 5 SER A 52 ? ASP A 54 ? SER A 86 ASP A 88 AA2 1 ILE A 91 ? LEU A 97 ? ILE A 125 LEU A 131 AA2 2 LEU A 117 ? TYR A 123 ? LEU A 151 TYR A 157 AA2 3 VAL A 170 ? ILE A 172 ? VAL A 204 ILE A 206 AA3 1 ALA A 108 ? SER A 110 ? ALA A 142 SER A 144 AA3 2 GLU A 199 ? SER A 206 ? GLU A 233 SER A 240 AA3 3 GLY A 180 ? GLY A 188 ? GLY A 214 GLY A 222 AA3 4 VAL A 131 ? GLU A 136 ? VAL A 165 GLU A 170 AA4 1 GLY A 212 ? LEU A 215 ? GLY A 246 LEU A 249 AA4 2 ASP A 225 ? THR A 231 ? ASP A 259 THR A 265 AA4 3 SER A 305 ? GLU A 311 ? SER A 339 GLU A 345 AA5 1 SER A 219 ? THR A 221 ? SER A 253 THR A 255 AA5 2 ASN A 341 ? GLU A 348 ? ASN A 375 GLU A 382 AA5 3 GLU A 319 ? TYR A 325 ? GLU A 353 TYR A 359 AA5 4 HIS A 239 ? ASP A 244 ? HIS A 273 ASP A 278 AA5 5 ILE A 294 ? VAL A 299 ? ILE A 328 VAL A 333 AA5 6 THR A 267 ? ALA A 273 ? THR A 301 ALA A 307 AA5 7 THR A 278 ? THR A 280 ? THR A 312 THR A 314 AA6 1 THR A 352 ? LEU A 354 ? THR A 386 LEU A 388 AA6 2 ASN A 370 ? ALA A 373 ? ASN A 404 ALA A 407 AA6 3 THR A 407 ? GLU A 409 ? THR A 441 GLU A 443 AA7 1 GLY A 359 ? VAL A 362 ? GLY A 393 VAL A 396 AA7 2 SER A 464 ? THR A 472 ? SER A 498 THR A 506 AA7 3 GLY A 430 ? ASP A 438 ? GLY A 464 ASP A 472 AA7 4 VAL A 379 ? ARG A 384 ? VAL A 413 ARG A 418 AA7 5 TRP A 389 ? LEU A 392 ? TRP A 423 LEU A 426 AA8 1 GLU A 366 ? VAL A 367 ? GLU A 400 VAL A 401 AA8 2 ILE A 413 ? ALA A 414 ? ILE A 447 ALA A 448 AA9 1 ARG B 21 ? PHE B 23 ? ARG B 55 PHE B 57 AA9 2 ASN B 83 ? LEU B 87 ? ASN B 117 LEU B 121 AA9 3 THR B 70 ? ASP B 72 ? THR B 104 ASP B 106 AA9 4 LEU B 40 ? GLY B 43 ? LEU B 74 GLY B 77 AA9 5 SER B 52 ? ASP B 54 ? SER B 86 ASP B 88 AB1 1 ILE B 91 ? LEU B 97 ? ILE B 125 LEU B 131 AB1 2 LEU B 117 ? TYR B 123 ? LEU B 151 TYR B 157 AB1 3 VAL B 170 ? ILE B 172 ? VAL B 204 ILE B 206 AB2 1 ALA B 108 ? SER B 110 ? ALA B 142 SER B 144 AB2 2 GLU B 199 ? SER B 206 ? GLU B 233 SER B 240 AB2 3 GLY B 180 ? GLY B 188 ? GLY B 214 GLY B 222 AB2 4 VAL B 131 ? GLU B 136 ? VAL B 165 GLU B 170 AB3 1 GLY B 212 ? LEU B 215 ? GLY B 246 LEU B 249 AB3 2 ASP B 225 ? THR B 231 ? ASP B 259 THR B 265 AB3 3 SER B 305 ? GLU B 311 ? SER B 339 GLU B 345 AB4 1 SER B 219 ? THR B 221 ? SER B 253 THR B 255 AB4 2 ASN B 341 ? GLU B 348 ? ASN B 375 GLU B 382 AB4 3 GLU B 319 ? TYR B 325 ? GLU B 353 TYR B 359 AB4 4 HIS B 239 ? ASP B 244 ? HIS B 273 ASP B 278 AB4 5 ILE B 294 ? VAL B 299 ? ILE B 328 VAL B 333 AB4 6 THR B 267 ? ALA B 273 ? THR B 301 ALA B 307 AB4 7 THR B 278 ? THR B 280 ? THR B 312 THR B 314 AB5 1 THR B 352 ? LEU B 354 ? THR B 386 LEU B 388 AB5 2 ASN B 370 ? ALA B 373 ? ASN B 404 ALA B 407 AB5 3 THR B 407 ? GLU B 409 ? THR B 441 GLU B 443 AB6 1 GLY B 359 ? VAL B 362 ? GLY B 393 VAL B 396 AB6 2 SER B 464 ? THR B 472 ? SER B 498 THR B 506 AB6 3 GLY B 430 ? ASP B 438 ? GLY B 464 ASP B 472 AB6 4 VAL B 379 ? ARG B 384 ? VAL B 413 ARG B 418 AB6 5 TRP B 389 ? LEU B 392 ? TRP B 423 LEU B 426 AB7 1 GLU B 366 ? VAL B 367 ? GLU B 400 VAL B 401 AB7 2 ILE B 413 ? ALA B 414 ? ILE B 447 ALA B 448 AB8 1 ARG C 21 ? PHE C 23 ? ARG C 55 PHE C 57 AB8 2 ASN C 83 ? LEU C 87 ? ASN C 117 LEU C 121 AB8 3 THR C 70 ? ASP C 72 ? THR C 104 ASP C 106 AB8 4 LEU C 40 ? GLY C 43 ? LEU C 74 GLY C 77 AB8 5 SER C 52 ? ASP C 54 ? SER C 86 ASP C 88 AB9 1 ILE C 91 ? LEU C 97 ? ILE C 125 LEU C 131 AB9 2 LEU C 117 ? TYR C 123 ? LEU C 151 TYR C 157 AB9 3 VAL C 170 ? ILE C 172 ? VAL C 204 ILE C 206 AC1 1 ALA C 108 ? SER C 110 ? ALA C 142 SER C 144 AC1 2 GLU C 199 ? SER C 206 ? GLU C 233 SER C 240 AC1 3 GLY C 180 ? GLY C 188 ? GLY C 214 GLY C 222 AC1 4 VAL C 131 ? GLU C 136 ? VAL C 165 GLU C 170 AC2 1 GLY C 212 ? LEU C 215 ? GLY C 246 LEU C 249 AC2 2 ASP C 225 ? THR C 231 ? ASP C 259 THR C 265 AC2 3 SER C 305 ? GLU C 311 ? SER C 339 GLU C 345 AC3 1 SER C 219 ? THR C 221 ? SER C 253 THR C 255 AC3 2 ASN C 341 ? GLU C 348 ? ASN C 375 GLU C 382 AC3 3 GLU C 319 ? TYR C 325 ? GLU C 353 TYR C 359 AC3 4 HIS C 239 ? ASP C 244 ? HIS C 273 ASP C 278 AC3 5 ILE C 294 ? VAL C 299 ? ILE C 328 VAL C 333 AC3 6 THR C 267 ? ALA C 273 ? THR C 301 ALA C 307 AC3 7 THR C 278 ? THR C 280 ? THR C 312 THR C 314 AC4 1 THR C 352 ? LEU C 354 ? THR C 386 LEU C 388 AC4 2 ASN C 370 ? ALA C 373 ? ASN C 404 ALA C 407 AC4 3 THR C 407 ? GLU C 409 ? THR C 441 GLU C 443 AC5 1 GLY C 359 ? VAL C 362 ? GLY C 393 VAL C 396 AC5 2 SER C 464 ? THR C 472 ? SER C 498 THR C 506 AC5 3 GLY C 430 ? ASP C 438 ? GLY C 464 ASP C 472 AC5 4 VAL C 379 ? ARG C 384 ? VAL C 413 ARG C 418 AC5 5 TRP C 389 ? LEU C 392 ? TRP C 423 LEU C 426 AC6 1 GLU C 366 ? VAL C 367 ? GLU C 400 VAL C 401 AC6 2 ILE C 413 ? ALA C 414 ? ILE C 447 ALA C 448 AC7 1 ARG D 21 ? PHE D 23 ? ARG D 55 PHE D 57 AC7 2 ASN D 83 ? LEU D 87 ? ASN D 117 LEU D 121 AC7 3 THR D 70 ? ASP D 72 ? THR D 104 ASP D 106 AC7 4 LEU D 40 ? GLY D 43 ? LEU D 74 GLY D 77 AC7 5 SER D 52 ? ASP D 54 ? 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E . n E 1 631 ASP 631 665 ? ? ? E . n E 1 632 ALA 632 666 ? ? ? E . n E 1 633 ALA 633 667 ? ? ? E . n E 1 634 GLU 634 668 ? ? ? E . n E 1 635 ALA 635 669 ? ? ? E . n E 1 636 ALA 636 670 ? ? ? E . n E 1 637 GLY 637 671 ? ? ? E . n E 1 638 ILE 638 672 ? ? ? E . n E 1 639 ASN 639 673 ? ? ? E . n E 1 640 PRO 640 674 ? ? ? E . n E 1 641 VAL 641 675 ? ? ? E . n E 1 642 ALA 642 676 ? ? ? E . n E 1 643 THR 643 677 ? ? ? E . n E 1 644 GLY 644 678 ? ? ? E . n E 1 645 GLU 645 679 ? ? ? E . n E 1 646 THR 646 680 ? ? ? E . n E 1 647 MET 647 681 ? ? ? E . n E 1 648 VAL 648 682 ? ? ? E . n E 1 649 ILE 649 683 ? ? ? E . n E 1 650 ALA 650 684 ? ? ? E . n E 1 651 GLY 651 685 ? ? ? E . n E 1 652 SER 652 686 ? ? ? E . n E 1 653 THR 653 687 ? ? ? E . n E 1 654 ASN 654 688 ? ? ? E . n E 1 655 LEU 655 689 ? ? ? E . n E 1 656 LYS 656 690 ? ? ? E . n E 1 657 PRO 657 691 ? ? ? E . n E 1 658 ASP 658 692 ? ? ? E . n E 1 659 ASP 659 693 ? ? ? E . n E 1 660 ASN 660 694 ? ? ? E . n E 1 661 THR 661 695 ? ? ? E . n E 1 662 ILE 662 696 ? ? ? E . n E 1 663 SER 663 697 ? ? ? E . n E 1 664 ILE 664 698 ? ? ? E . n E 1 665 GLU 665 699 ? ? ? E . n E 1 666 VAL 666 700 ? ? ? E . n E 1 667 THR 667 701 ? ? ? E . n E 1 668 ASN 668 702 ? ? ? E . n E 1 669 GLU 669 703 ? ? ? E . n E 1 670 ASP 670 704 ? ? ? E . n E 1 671 GLY 671 705 ? ? ? E . n E 1 672 THR 672 706 ? ? ? E . n E 1 673 SER 673 707 ? ? ? E . n E 1 674 VAL 674 708 ? ? ? E . n E 1 675 ALA 675 709 ? ? ? E . n E 1 676 LEU 676 710 ? ? ? E . n E 1 677 GLU 677 711 ? ? ? E . n E 1 678 ASP 678 712 ? ? ? E . n E 1 679 THR 679 713 ? ? ? E . n E 1 680 ASP 680 714 ? ? ? E . n E 1 681 GLU 681 715 ? ? ? E . n E 1 682 TRP 682 716 ? ? ? E . n E 1 683 ASN 683 717 ? ? ? E . n E 1 684 ASN 684 718 ? ? ? E . n E 1 685 ASP 685 719 ? ? ? E . n E 1 686 GLY 686 720 ? ? ? E . n E 1 687 GLN 687 721 ? ? ? E . n E 1 688 TRP 688 722 ? ? ? E . n E 1 689 MET 689 723 ? ? ? E . n E 1 690 VAL 690 724 ? ? ? E . n E 1 691 GLU 691 725 ? ? ? E . n E 1 692 ILE 692 726 ? ? ? E . n E 1 693 ASP 693 727 ? ? ? E . n E 1 694 THR 694 728 ? ? ? E . n E 1 695 THR 695 729 ? ? ? E . n E 1 696 ASP 696 730 ? ? ? E . n E 1 697 PHE 697 731 ? ? ? E . n E 1 698 GLU 698 732 ? ? ? E . n E 1 699 THR 699 733 ? ? ? E . n E 1 700 GLY 700 734 ? ? ? E . n E 1 701 THR 701 735 ? ? ? E . n E 1 702 PHE 702 736 ? ? ? E . n E 1 703 THR 703 737 ? ? ? E . n E 1 704 VAL 704 738 ? ? ? E . n E 1 705 GLU 705 739 ? ? ? E . n E 1 706 ALA 706 740 ? ? ? E . n E 1 707 ASP 707 741 ? ? ? E . n E 1 708 ASP 708 742 ? ? ? E . n E 1 709 GLY 709 743 ? ? ? E . n E 1 710 ASP 710 744 ? ? ? E . n E 1 711 ASN 711 745 ? ? ? E . n E 1 712 THR 712 746 ? ? ? E . n E 1 713 ASP 713 747 ? ? ? E . n E 1 714 THR 714 748 ? ? ? E . n E 1 715 VAL 715 749 ? ? ? E . n E 1 716 ASN 716 750 ? ? ? E . n E 1 717 VAL 717 751 ? ? ? E . n E 1 718 GLU 718 752 ? ? ? E . n E 1 719 VAL 719 753 ? ? ? E . n E 1 720 VAL 720 754 ? ? ? E . n E 1 721 SER 721 755 ? ? ? E . n E 1 722 GLU 722 756 ? ? ? E . n E 1 723 ARG 723 757 ? ? ? E . n E 1 724 GLU 724 758 ? ? ? E . n E 1 725 ASP 725 759 ? ? ? E . n E 1 726 THR 726 760 ? ? ? E . n E 1 727 THR 727 761 ? ? ? E . n E 1 728 THR 728 762 ? ? ? E . n E 1 729 SER 729 763 ? ? ? E . n E 1 730 SER 730 764 ? ? ? E . n E 1 731 ASP 731 765 ? ? ? E . n E 1 732 ASN 732 766 ? ? ? E . n E 1 733 ALA 733 767 ? ? ? E . n E 1 734 THR 734 768 ? ? ? E . n E 1 735 ASP 735 769 ? ? ? E . n E 1 736 THR 736 770 ? ? ? E . n E 1 737 THR 737 771 ? ? ? E . n E 1 738 THR 738 772 ? ? ? E . n E 1 739 THR 739 773 ? ? ? E . n E 1 740 THR 740 774 ? ? ? E . n E 1 741 ASP 741 775 ? ? ? E . n E 1 742 GLY 742 776 ? ? ? E . n E 1 743 PRO 743 777 ? ? ? E . n E 1 744 THR 744 778 ? ? ? E . n E 1 745 GLU 745 779 ? ? ? E . n E 1 746 THR 746 780 ? ? ? E . n E 1 747 THR 747 781 ? ? ? E . n E 1 748 THR 748 782 ? ? ? E . n E 1 749 THR 749 783 ? ? ? E . n E 1 750 ALA 750 784 ? ? ? E . n E 1 751 GLU 751 785 ? ? ? E . n E 1 752 PRO 752 786 ? ? ? E . n E 1 753 THR 753 787 ? ? ? E . n E 1 754 GLU 754 788 ? ? ? E . n E 1 755 THR 755 789 ? ? ? E . n E 1 756 THR 756 790 ? ? ? E . n E 1 757 GLU 757 791 ? ? ? E . n E 1 758 GLU 758 792 ? ? ? E . n E 1 759 PRO 759 793 ? ? ? E . n E 1 760 THR 760 794 ? ? ? E . n E 1 761 GLU 761 795 ? ? ? E . n E 1 762 GLU 762 796 ? ? ? E . n E 1 763 THR 763 797 ? ? ? E . n E 1 764 THR 764 798 ? ? ? E . n E 1 765 THR 765 799 ? ? ? E . n E 1 766 SER 766 800 ? ? ? E . n E 1 767 SER 767 801 ? ? ? E . n E 1 768 ASN 768 802 ? ? ? E . n E 1 769 THR 769 803 ? ? ? E . n E 1 770 PRO 770 804 ? ? ? E . n E 1 771 GLY 771 805 ? ? ? E . n E 1 772 PHE 772 806 ? ? ? E . n E 1 773 GLY 773 807 ? ? ? E . n E 1 774 ILE 774 808 ? ? ? E . n E 1 775 ALA 775 809 ? ? ? E . n E 1 776 VAL 776 810 ? ? ? E . n E 1 777 ALA 777 811 ? ? ? E . n E 1 778 LEU 778 812 ? ? ? E . n E 1 779 VAL 779 813 ? ? ? E . n E 1 780 ALA 780 814 ? ? ? E . n E 1 781 LEU 781 815 ? ? ? E . n E 1 782 VAL 782 816 ? ? ? E . n E 1 783 GLY 783 817 ? ? ? E . n E 1 784 ALA 784 818 ? ? ? E . n E 1 785 ALA 785 819 ? ? ? E . n E 1 786 LEU 786 820 ? ? ? E . n E 1 787 LEU 787 821 ? ? ? E . n E 1 788 ALA 788 822 ? ? ? E . n E 1 789 LEU 789 823 ? ? ? E . n E 1 790 ARG 790 824 ? ? ? E . n E 1 791 ARG 791 825 ? ? ? E . n E 1 792 GLU 792 826 ? ? ? E . n E 1 793 ASN 793 827 ? ? ? E . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 2 BGC 1 1001 1001 BGC BGC A . G 2 BGC 1 1001 1001 BGC BGC B . H 2 BGC 1 1001 1001 BGC BGC C . I 2 BGC 1 1001 1001 BGC BGC D . J 2 BGC 1 1001 1001 BGC BGC E . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 9210 ? 1 MORE -6 ? 1 'SSA (A^2)' 102930 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2021-12-15 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _software.citation_id ? _software.classification refinement _software.compiler_name ? _software.compiler_version ? _software.contact_author ? _software.contact_author_email ? _software.date ? _software.description ? _software.dependencies ? _software.hardware ? _software.language ? _software.location ? _software.mods ? _software.name PHENIX _software.os ? _software.os_version ? _software.type ? _software.version 1.19_4092: _software.pdbx_ordinal 1 # _pdbx_entry_details.entry_id 7PTU _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # _em_3d_fitting.entry_id 7PTU _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;The initial manual build of D1-D2 was performed independently using the csg pentameric cryo-EM map, which served as an additional validation of the manual building performed in the csg hexamer in the related deposition. The manual building exercise yielded a nearly identical result to the hexamer; thus, the final refined hexameric structures of D1-D2, along with D3-D4 were taken and fitted into the pentameric map (~3.87 angstrom resolution in D1-D3, lower in D4 which is partially resolved). Five copies of these D1-D4 were used for refinement and model building as for the hexamer, except D3 and D4 was restrained in position, due to steadily deteriorating resolution in this part of the map. D5-D6 were not resolved in the pentameric structure and were thus not included in the refinements. Model validation was performed in PHENIX and CCP-EM. ; _em_3d_fitting.overall_b_value 179.68 _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria 'Best Fit' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7PTU _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.details ;The final map (RELION3.1) was obtained from 382,105 particles and post-processed using a soft mask focused on the entire pentameric map yielding a global resolution of 3.87 angstrom with resolution anisotropy from 3.49-8.11 angstrom from the central C5 axis near domains D1-D3 (well resolved) to the more flexible domains D4 (partially resolved) and D5-D6 (not resolved). ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 3 _em_3d_reconstruction.num_particles 382105 _em_3d_reconstruction.resolution 3.87 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ;Buffer solutions were prepared fresh from sterile filtered concentrated stocksolutions. Solutions were filtered through a 0.22 um filter to avoid microbial contamination and degassed using a vacuum fold pump. The pH of the HEPES stock solution was adjusted with sodium hydroxide at 4 deg C. 1.75 mM holmium chloride was added 2 hours before vitrification. ; _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'Structure of pentameric S-layer protein csg' _em_entity_assembly.name 'Structure of pentameric S-layer protein csg' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 7PTU _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 4092 _em_image_scans.dimension_width 5760 _em_image_scans.frames_per_image ? _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7PTU _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'ZEMLIN TABLEAU' _em_imaging.c2_aperture_diameter 50 _em_imaging.calibrated_defocus_max 4000 _em_imaging.calibrated_defocus_min 1000 _em_imaging.calibrated_magnification 81000 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details 'EPU software with faster acquisition mode AFIS (Aberration Free Image Shift).' _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_magnification 81000 _em_imaging.recording_temperature_maximum 70 _em_imaging.recording_temperature_minimum 70 _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '20 seconds, 15 mA' _em_sample_support.grid_material COPPER/RHODIUM _em_sample_support.grid_mesh_size 200 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/2' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 283.15 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Vitrobot options: Blot time 5 seconds, Blot force -10,1, Wait time 10 seconds, Drain time 0.5 seconds ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7PTU _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7PTU _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7PTU _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C5 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OG1 C THR 406 ? ? O C ASP 440 ? ? 2.17 2 1 OG1 D THR 406 ? ? O D ASP 440 ? ? 2.17 3 1 OG1 E THR 406 ? ? O E ASP 440 ? ? 2.17 4 1 OG1 B THR 406 ? ? O B ASP 440 ? ? 2.17 5 1 OG1 A THR 406 ? ? O A ASP 440 ? ? 2.17 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CB A ASP 420 ? ? CG A ASP 420 ? ? OD1 A ASP 420 ? ? 124.69 118.30 6.39 0.90 N 2 1 CB B ASP 420 ? ? CG B ASP 420 ? ? OD1 B ASP 420 ? ? 124.63 118.30 6.33 0.90 N 3 1 CB C ASP 420 ? ? CG C ASP 420 ? ? OD1 C ASP 420 ? ? 124.64 118.30 6.34 0.90 N 4 1 CB D ASP 420 ? ? CG D ASP 420 ? ? OD1 D ASP 420 ? ? 124.69 118.30 6.39 0.90 N 5 1 CB E ASP 420 ? ? CG E ASP 420 ? ? OD1 E ASP 420 ? ? 124.67 118.30 6.37 0.90 N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER A 43 ? ? 58.46 19.50 2 1 LEU A 68 ? ? -85.83 46.22 3 1 ASN A 72 ? ? -164.73 80.13 4 1 THR A 96 ? ? 76.17 -10.40 5 1 ASN A 99 ? ? 73.69 -8.93 6 1 ASP A 230 ? ? 65.25 -7.03 7 1 ASN A 266 ? ? 60.19 60.87 8 1 ASP A 431 ? ? 65.60 -0.02 9 1 GLU A 445 ? ? -69.86 -179.90 10 1 SER B 43 ? ? 58.44 19.49 11 1 LEU B 68 ? ? -85.83 46.13 12 1 ASN B 72 ? ? -164.76 80.17 13 1 THR B 96 ? ? 76.20 -10.40 14 1 ASN B 99 ? ? 73.69 -8.87 15 1 ASP B 230 ? ? 65.23 -6.94 16 1 ASN B 266 ? ? 60.23 60.86 17 1 GLU B 445 ? ? -69.91 -179.94 18 1 SER C 43 ? ? 58.54 19.46 19 1 LEU C 68 ? ? -85.86 46.14 20 1 ASN C 72 ? ? -164.81 80.11 21 1 THR C 96 ? ? 76.17 -10.43 22 1 ASN C 99 ? ? 73.64 -8.81 23 1 ASP C 230 ? ? 65.28 -6.98 24 1 ASN C 266 ? ? 60.22 60.85 25 1 GLU C 445 ? ? -69.88 -179.98 26 1 SER D 43 ? ? 58.50 19.55 27 1 LEU D 68 ? ? -85.95 46.24 28 1 ASN D 72 ? ? -164.78 80.11 29 1 THR D 96 ? ? 76.27 -10.50 30 1 ASN D 99 ? ? 73.68 -8.86 31 1 ASP D 230 ? ? 65.27 -6.98 32 1 ASN D 266 ? ? 60.22 60.85 33 1 ASP D 431 ? ? 65.55 0.00 34 1 GLU D 445 ? ? -69.85 -179.91 35 1 SER E 43 ? ? 58.51 19.53 36 1 LEU E 68 ? ? -85.87 46.11 37 1 ASN E 72 ? ? -164.75 80.14 38 1 THR E 96 ? ? 76.18 -10.41 39 1 ASN E 99 ? ? 73.70 -8.88 40 1 ASP E 230 ? ? 65.27 -6.96 41 1 ASN E 266 ? ? 60.25 60.81 42 1 GLU E 445 ? ? -69.88 -179.92 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A ALA 509 ? A ALA 475 2 1 Y 1 A LEU 510 ? A LEU 476 3 1 Y 1 A THR 511 ? A THR 477 4 1 Y 1 A GLY 512 ? A GLY 478 5 1 Y 1 A GLN 513 ? A GLN 479 6 1 Y 1 A PHE 514 ? A PHE 480 7 1 Y 1 A THR 515 ? A THR 481 8 1 Y 1 A THR 516 ? A THR 482 9 1 Y 1 A ILE 517 ? A ILE 483 10 1 Y 1 A ASN 518 ? A ASN 484 11 1 Y 1 A GLY 519 ? A GLY 485 12 1 Y 1 A GLN 520 ? A GLN 486 13 1 Y 1 A VAL 521 ? A VAL 487 14 1 Y 1 A ALA 522 ? A ALA 488 15 1 Y 1 A PRO 523 ? A PRO 489 16 1 Y 1 A VAL 524 ? A VAL 490 17 1 Y 1 A GLU 525 ? A GLU 491 18 1 Y 1 A THR 526 ? A THR 492 19 1 Y 1 A GLY 527 ? A GLY 493 20 1 Y 1 A THR 528 ? A THR 494 21 1 Y 1 A VAL 529 ? A VAL 495 22 1 Y 1 A ASP 530 ? A ASP 496 23 1 Y 1 A ILE 531 ? A ILE 497 24 1 Y 1 A ASN 532 ? A ASN 498 25 1 Y 1 A GLY 533 ? A GLY 499 26 1 Y 1 A THR 534 ? A THR 500 27 1 Y 1 A ALA 535 ? A ALA 501 28 1 Y 1 A SER 536 ? A SER 502 29 1 Y 1 A GLY 537 ? A GLY 503 30 1 Y 1 A ALA 538 ? A ALA 504 31 1 Y 1 A ASN 539 ? A ASN 505 32 1 Y 1 A SER 540 ? A SER 506 33 1 Y 1 A VAL 541 ? A VAL 507 34 1 Y 1 A LEU 542 ? A LEU 508 35 1 Y 1 A VAL 543 ? A VAL 509 36 1 Y 1 A ILE 544 ? A ILE 510 37 1 Y 1 A PHE 545 ? A PHE 511 38 1 Y 1 A VAL 546 ? A VAL 512 39 1 Y 1 A ASP 547 ? A ASP 513 40 1 Y 1 A GLU 548 ? A GLU 514 41 1 Y 1 A ARG 549 ? A ARG 515 42 1 Y 1 A GLY 550 ? A GLY 516 43 1 Y 1 A ASN 551 ? A ASN 517 44 1 Y 1 A VAL 552 ? A VAL 518 45 1 Y 1 A ASN 553 ? A ASN 519 46 1 Y 1 A TYR 554 ? A TYR 520 47 1 Y 1 A GLN 555 ? A GLN 521 48 1 Y 1 A GLU 556 ? A GLU 522 49 1 Y 1 A VAL 557 ? A VAL 523 50 1 Y 1 A SER 558 ? A SER 524 51 1 Y 1 A VAL 559 ? A VAL 525 52 1 Y 1 A ASP 560 ? A ASP 526 53 1 Y 1 A SER 561 ? A SER 527 54 1 Y 1 A ASP 562 ? A ASP 528 55 1 Y 1 A GLY 563 ? A GLY 529 56 1 Y 1 A THR 564 ? A THR 530 57 1 Y 1 A TYR 565 ? A TYR 531 58 1 Y 1 A ASP 566 ? A ASP 532 59 1 Y 1 A GLU 567 ? A GLU 533 60 1 Y 1 A ASP 568 ? A ASP 534 61 1 Y 1 A ASP 569 ? A ASP 535 62 1 Y 1 A ILE 570 ? A ILE 536 63 1 Y 1 A THR 571 ? A THR 537 64 1 Y 1 A VAL 572 ? A VAL 538 65 1 Y 1 A GLY 573 ? A GLY 539 66 1 Y 1 A LEU 574 ? A LEU 540 67 1 Y 1 A THR 575 ? A THR 541 68 1 Y 1 A GLN 576 ? A GLN 542 69 1 Y 1 A GLY 577 ? A GLY 543 70 1 Y 1 A ARG 578 ? A ARG 544 71 1 Y 1 A VAL 579 ? A VAL 545 72 1 Y 1 A THR 580 ? A THR 546 73 1 Y 1 A ALA 581 ? A ALA 547 74 1 Y 1 A HIS 582 ? A HIS 548 75 1 Y 1 A ILE 583 ? A ILE 549 76 1 Y 1 A LEU 584 ? A LEU 550 77 1 Y 1 A SER 585 ? A SER 551 78 1 Y 1 A VAL 586 ? A VAL 552 79 1 Y 1 A GLY 587 ? A GLY 553 80 1 Y 1 A ARG 588 ? A ARG 554 81 1 Y 1 A ASP 589 ? A ASP 555 82 1 Y 1 A SER 590 ? A SER 556 83 1 Y 1 A ALA 591 ? A ALA 557 84 1 Y 1 A ILE 592 ? A ILE 558 85 1 Y 1 A GLY 593 ? A GLY 559 86 1 Y 1 A ASP 594 ? A ASP 560 87 1 Y 1 A GLY 595 ? A GLY 561 88 1 Y 1 A SER 596 ? A SER 562 89 1 Y 1 A LEU 597 ? A LEU 563 90 1 Y 1 A PRO 598 ? A PRO 564 91 1 Y 1 A SER 599 ? A SER 565 92 1 Y 1 A GLY 600 ? A GLY 566 93 1 Y 1 A PRO 601 ? A PRO 567 94 1 Y 1 A SER 602 ? A SER 568 95 1 Y 1 A ASN 603 ? A ASN 569 96 1 Y 1 A GLY 604 ? A GLY 570 97 1 Y 1 A ALA 605 ? 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E THR 734 1537 1 Y 1 E ASP 769 ? E ASP 735 1538 1 Y 1 E THR 770 ? E THR 736 1539 1 Y 1 E THR 771 ? E THR 737 1540 1 Y 1 E THR 772 ? E THR 738 1541 1 Y 1 E THR 773 ? E THR 739 1542 1 Y 1 E THR 774 ? E THR 740 1543 1 Y 1 E ASP 775 ? E ASP 741 1544 1 Y 1 E GLY 776 ? E GLY 742 1545 1 Y 1 E PRO 777 ? E PRO 743 1546 1 Y 1 E THR 778 ? E THR 744 1547 1 Y 1 E GLU 779 ? E GLU 745 1548 1 Y 1 E THR 780 ? E THR 746 1549 1 Y 1 E THR 781 ? E THR 747 1550 1 Y 1 E THR 782 ? E THR 748 1551 1 Y 1 E THR 783 ? E THR 749 1552 1 Y 1 E ALA 784 ? E ALA 750 1553 1 Y 1 E GLU 785 ? E GLU 751 1554 1 Y 1 E PRO 786 ? E PRO 752 1555 1 Y 1 E THR 787 ? E THR 753 1556 1 Y 1 E GLU 788 ? E GLU 754 1557 1 Y 1 E THR 789 ? E THR 755 1558 1 Y 1 E THR 790 ? E THR 756 1559 1 Y 1 E GLU 791 ? E GLU 757 1560 1 Y 1 E GLU 792 ? E GLU 758 1561 1 Y 1 E PRO 793 ? E PRO 759 1562 1 Y 1 E THR 794 ? E THR 760 1563 1 Y 1 E GLU 795 ? E GLU 761 1564 1 Y 1 E GLU 796 ? E GLU 762 1565 1 Y 1 E THR 797 ? E THR 763 1566 1 Y 1 E THR 798 ? E THR 764 1567 1 Y 1 E THR 799 ? E THR 765 1568 1 Y 1 E SER 800 ? E SER 766 1569 1 Y 1 E SER 801 ? E SER 767 1570 1 Y 1 E ASN 802 ? E ASN 768 1571 1 Y 1 E THR 803 ? E THR 769 1572 1 Y 1 E PRO 804 ? E PRO 770 1573 1 Y 1 E GLY 805 ? E GLY 771 1574 1 Y 1 E PHE 806 ? E PHE 772 1575 1 Y 1 E GLY 807 ? E GLY 773 1576 1 Y 1 E ILE 808 ? E ILE 774 1577 1 Y 1 E ALA 809 ? E ALA 775 1578 1 Y 1 E VAL 810 ? E VAL 776 1579 1 Y 1 E ALA 811 ? E ALA 777 1580 1 Y 1 E LEU 812 ? E LEU 778 1581 1 Y 1 E VAL 813 ? E VAL 779 1582 1 Y 1 E ALA 814 ? E ALA 780 1583 1 Y 1 E LEU 815 ? E LEU 781 1584 1 Y 1 E VAL 816 ? E VAL 782 1585 1 Y 1 E GLY 817 ? E GLY 783 1586 1 Y 1 E ALA 818 ? E ALA 784 1587 1 Y 1 E ALA 819 ? E ALA 785 1588 1 Y 1 E LEU 820 ? E LEU 786 1589 1 Y 1 E LEU 821 ? E LEU 787 1590 1 Y 1 E ALA 822 ? E ALA 788 1591 1 Y 1 E LEU 823 ? E LEU 789 1592 1 Y 1 E ARG 824 ? E ARG 790 1593 1 Y 1 E ARG 825 ? E ARG 791 1594 1 Y 1 E GLU 826 ? E GLU 792 1595 1 Y 1 E ASN 827 ? E ASN 793 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C8H18N2O4S HEPES 1 2 150 mM MgCl2 'magnesium chloride' 1 3 1.75 mM HoCl3 'holmium chloride' 1 4 0.65 '% (w/v)' C32H58N2O7S 'CHAPS detergent' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details 'RELION refinement with in-built CTF correction. The function is similar to a Wiener filter, so amplitude correction included.' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location 'Cell surface' _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 309800 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Haloferax volcanii DS2' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ;Imported movies were motion-corrected, dose weighted, and Fourier cropped (2x) with MotionCor2 (Zheng et al., 2017) implemented in RELION3.1 (Zivanov et al., 2018). Contrast transfer functions (CTFs) of the resulting motion-corrected micrographs were estimated using CTFFIND4 (Rohou and Grigorieff, 2015). ; # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 53.9 _em_image_recording.average_exposure_time 3.6 _em_image_recording.details ;Images were collected in two sessions in movie-mode and subjected to 3.6 seconds of exposure where a total dose of 53.45 or 53.9 e-/A2 was applied, and 40 frames were recorded per movie. A total of 11871 movies were collected in two sessions with the same microscope and settings. ; _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 11871 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Quantum LS' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.details ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;Particles were initially picking using the Laplacian-of gaussian algorithm implemented in RELION3.0 (Zivanov et al., 2018). Particles were extracted in 8x down-sampled in 50x50 pixel boxes and classified using reference-free 2D classification inside RELION3.0. ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1773652 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'PARTICLE SELECTION' AutoPicking RELION 3.0 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' 'CTFFIND4 was used as implemented in RELION 3.1' CTFFIND 4.1.13 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? Coot 0.9.2-pre ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.1 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION 3.1 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION 3.1 1 ? ? 14 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.19-4092 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 2.5 _em_specimen.details 'Purified csg protein mixed with 1.75 mM HoCl3 after 2 hour incubation.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' 202231/Z/16/Z 1 'Leverhulme Trust' 'United Kingdom' 'Philip Leverhulme Prize' 2 'Other private' 'United Kingdom' 'Vallee Scholarship' 3 # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BGC 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpb BGC 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-glucopyranose BGC 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Glcp BGC 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Glc # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id BGC _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id BGC _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id BGC # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #