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E G 33 N2 ? ? ? 1_555 E U 37 O4 ? ? 2 G 33 2 U 37 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? E A 48 N1 ? ? ? 1_555 E U 65 N3 ? ? 2 A 48 2 U 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? E A 48 N6 ? ? ? 1_555 E U 65 O4 ? ? 2 A 48 2 U 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? E U 49 N3 ? ? ? 1_555 E A 64 N1 ? ? 2 U 49 2 A 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? E U 49 O4 ? ? ? 1_555 E A 64 N6 ? ? 2 U 49 2 A 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? E C 50 N3 ? ? ? 1_555 E G 63 N1 ? ? 2 C 50 2 G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? E C 50 N4 ? ? ? 1_555 E G 63 O6 ? ? 2 C 50 2 G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? E C 50 O2 ? ? ? 1_555 E G 63 N2 ? ? 2 C 50 2 G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? E A 51 N1 ? ? ? 1_555 E U 62 N3 ? ? 2 A 51 2 U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? E A 51 N6 ? ? ? 1_555 E U 62 O4 ? ? 2 A 51 2 U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? E G 52 N1 ? ? ? 1_555 E C 61 N3 ? ? 2 G 52 2 C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? E G 52 N2 ? ? ? 1_555 E C 61 O2 ? ? 2 G 52 2 C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? E G 52 O6 ? ? ? 1_555 E C 61 N4 ? ? 2 G 52 2 C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? E U 53 N3 ? ? ? 1_555 E U 60 O4 ? ? 2 U 53 2 U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? E U 54 O2 ? ? ? 1_555 E A 59 N6 ? ? 2 U 54 2 A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 405 B . ? SER 405 C PRO 406 B ? PRO 406 C 1 -16.41 2 ASN 916 B . ? ASN 916 C PRO 917 B ? PRO 917 C 1 -7.17 3 THR 717 H . ? THR 717 A PRO 718 H ? PRO 718 A 1 -7.32 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL B 1101 ? 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LEU C 158 GLU C 159 AA6 1 THR B 165 ? VAL B 173 ? THR C 165 VAL C 173 AA6 2 MET B 181 ? ASP B 188 ? MET C 181 ASP C 188 AA6 3 THR B 207 ? ASP B 214 ? THR C 207 ASP C 214 AA6 4 HIS B 219 ? PRO B 227 ? HIS C 219 PRO C 227 AA7 1 GLY B 232 ? THR B 237 ? GLY C 232 THR C 237 AA7 2 VAL B 248 ? SER B 252 ? VAL C 248 SER C 252 AA7 3 TYR B 255 ? LYS B 259 ? TYR C 255 LYS C 259 AA7 4 ILE B 267 ? PRO B 270 ? ILE C 267 PRO C 270 AA8 1 ARG B 273 ? ARG B 274 ? ARG C 273 ARG C 274 AA8 2 PHE B 386 ? PHE B 387 ? PHE C 386 PHE C 387 AA9 1 PHE B 287 ? THR B 295 ? PHE C 287 THR C 295 AA9 2 MET B 298 ? THR B 305 ? MET C 298 THR C 305 AA9 3 ASP B 309 ? ASP B 318 ? ASP C 309 ASP C 318 AA9 4 MET B 321 ? THR B 332 ? MET C 321 THR C 332 AA9 5 GLU B 372 ? SER B 374 ? GLU C 372 SER C 374 AB1 1 ALA B 336 ? LEU B 342 ? ALA C 336 LEU C 342 AB1 2 PHE B 346 ? SER B 351 ? PHE C 346 SER C 351 AB1 3 HIS B 356 ? ILE B 361 ? HIS C 356 ILE C 361 AB1 4 LEU B 395 ? LEU B 401 ? LEU C 395 LEU C 401 AB2 1 ILE B 407 ? ALA B 413 ? ILE C 407 ALA C 413 AB2 2 GLN B 422 ? CYS B 427 ? GLN C 422 CYS C 427 AB2 3 SER B 434 ? HIS B 440 ? SER C 434 HIS C 440 AB2 4 PHE B 774 ? PRO B 780 ? PHE C 774 PRO C 780 AB3 1 SER B 445 ? SER B 450 ? SER C 445 SER C 450 AB3 2 THR B 761 ? ALA B 766 ? THR C 761 ALA C 766 AB3 3 GLY B 753 ? SER B 758 ? GLY C 753 SER C 758 AB3 4 PHE B 741 ? PHE B 745 ? PHE C 741 PHE C 745 AB4 1 ALA B 458 ? VAL B 462 ? ALA C 458 VAL C 462 AB4 2 TYR B 473 ? SER B 477 ? TYR C 473 SER C 477 AB4 3 THR B 482 ? SER B 486 ? THR C 482 SER C 486 AB4 4 GLU B 492 ? VAL B 494 ? GLU C 492 VAL C 494 AB5 1 SER B 507 ? LEU B 510 ? SER C 507 LEU C 510 AB5 2 LEU B 516 ? TYR B 520 ? LEU C 516 TYR C 520 AB5 3 GLY B 523 ? ILE B 527 ? GLY C 523 ILE C 527 AB5 4 ASN B 534 ? LYS B 537 ? ASN C 534 LYS C 537 AB6 1 ILE B 544 ? VAL B 549 ? ILE C 544 VAL C 549 AB6 2 GLN B 553 ? LEU B 558 ? GLN C 553 LEU C 558 AB6 3 GLU B 562 ? MET B 568 ? GLU C 562 MET C 568 AB6 4 LEU B 574 ? GLU B 576 ? LEU C 574 GLU C 576 AB7 1 ILE B 544 ? VAL B 549 ? 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RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.3 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7Q3L 'double helix' 7Q3L 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 E G 25 1_555 E C 45 1_555 -1.436 0.868 0.490 -8.265 0.524 13.647 1 2_G25:C45_2 2 25 ? 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