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N1 B DT 18 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 129 4 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 117.90 122.90 -5.00 0.60 N 130 4 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 131 4 "O4'" B DG 20 ? ? "C1'" B DG 20 ? ? N9 B DG 20 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 132 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 133 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 134 5 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.06 121.90 -4.84 0.70 N 135 5 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 136 5 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 137 5 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 114.00 118.60 -4.60 0.60 N 138 5 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 139 5 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 140 5 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 141 5 N1 A DA 6 ? ? 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N1 A DC 1 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 166 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.82 121.90 -5.08 0.70 N 167 6 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.70 N 168 6 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 169 6 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 170 6 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 114.01 118.60 -4.59 0.60 N 171 6 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 172 6 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 173 6 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 174 6 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.79 118.60 -4.81 0.60 N 175 6 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 117.77 122.90 -5.13 0.60 N 176 6 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 177 6 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 178 6 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 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N1 A DA 3 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 203 7 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.96 118.60 -4.64 0.60 N 204 7 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 205 7 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 206 7 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 207 7 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 208 7 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 117.75 122.90 -5.15 0.60 N 209 7 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 210 7 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.03 117.70 3.33 0.50 N 211 7 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.98 118.60 -4.62 0.60 N 212 7 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.09 121.90 -4.81 0.70 N 213 7 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 214 7 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 117.21 121.90 -4.69 0.70 N 215 7 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? 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N1 B DT 18 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N 228 7 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 117.91 122.90 -4.99 0.60 N 229 7 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 230 7 "O4'" B DG 20 ? ? "C1'" B DG 20 ? ? N9 B DG 20 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 231 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 232 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.84 121.90 -5.06 0.70 N 233 8 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.05 121.90 -4.85 0.70 N 234 8 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 235 8 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 236 8 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 114.05 118.60 -4.55 0.60 N 237 8 C6 A DT 4 ? ? C5 A DT 4 ? ? C7 A DT 4 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 238 8 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 239 8 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 240 8 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 241 8 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 242 8 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 117.79 122.90 -5.11 0.60 N 243 8 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 244 8 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.00 117.70 3.30 0.50 N 245 8 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.93 118.60 -4.67 0.60 N 246 8 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.70 N 247 8 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 248 8 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 117.21 121.90 -4.69 0.70 N 249 8 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 117.39 122.90 -5.51 0.60 N 250 8 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 251 8 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 252 8 N1 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N6 B DA 14 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 253 8 C6 B DT 15 ? ? C5 B DT 15 ? ? C7 B DT 15 ? ? 117.66 122.90 -5.24 0.60 N 254 8 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 255 8 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 256 8 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 257 8 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 114.27 118.60 -4.33 0.60 N 258 8 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 259 8 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 260 8 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.80 118.60 -4.80 0.60 N 261 8 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 262 8 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 117.86 122.90 -5.04 0.60 N 263 8 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 264 8 "O4'" B DG 20 ? ? "C1'" B DG 20 ? ? N9 B DG 20 ? ? 111.51 108.30 3.21 0.30 N 265 9 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? 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N1 A DA 8 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 279 9 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N 280 9 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.70 N 281 9 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 282 9 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 117.28 121.90 -4.62 0.70 N 283 9 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 117.37 122.90 -5.53 0.60 N 284 9 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 285 9 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 286 9 N1 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N6 B DA 14 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 287 9 C6 B DT 15 ? ? C5 B DT 15 ? ? C7 B DT 15 ? ? 117.73 122.90 -5.17 0.60 N 288 9 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 289 9 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 290 9 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 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"C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 316 10 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 117.24 121.90 -4.66 0.70 N 317 10 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 117.36 122.90 -5.54 0.60 N 318 10 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 319 10 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 320 10 N1 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N6 B DA 14 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 321 10 C6 B DT 15 ? ? C5 B DT 15 ? ? C7 B DT 15 ? ? 117.74 122.90 -5.16 0.60 N 322 10 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 323 10 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 324 10 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 325 10 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 114.26 118.60 -4.34 0.60 N 326 10 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 327 10 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 328 10 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.76 118.60 -4.84 0.60 N 329 10 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 330 10 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 117.87 122.90 -5.03 0.60 N 331 10 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 332 10 "O4'" B DG 20 ? ? "C1'" B DG 20 ? ? N9 B DG 20 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 7QA9 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 50 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 7QA9 _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 ;0.4 mM no DNA (5'-D(*CP*CP*AP*TP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3'), 0.4 mM no DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*AP*TP*GP*G)-3'), 10 mM no sodium phosphate, 100% D2O ; '100% D2O' no solution ? 2 ;0.4 mM no DNA (5'-D(*CP*CP*AP*TP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3'), 0.4 mM no DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*AP*TP*GP*G)-3'), 10 mM no sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' no solution ? # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*AP*TP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3') ; 0.4 ? mM no 1 ;DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*AP*TP*GP*G)-3') ; 0.4 ? mM no 1 'sodium phosphate' 10 ? mM no 2 ;DNA (5'-D(*CP*CP*AP*TP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3') ; 0.4 ? mM no 2 ;DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*AP*TP*GP*G)-3') ; 0.4 ? mM no 2 'sodium phosphate' 10 ? mM no # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 278 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 10 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label conditions_1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D NOESY' 1 isotropic 2 1 2 '2D NOESY' 1 isotropic 3 1 1 '2D DQF-COSY' 1 isotropic 4 1 1 '2D 1H-1H TOCSY' 1 isotropic # _pdbx_nmr_refine.entry_id 7QA9 _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 5 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 collection TopSpin ? 'Bruker Biospin' 2 'chemical shift assignment' TopSpin ? 'Bruker Biospin' 3 'chemical shift assignment' NMRFAM-SPARKY ? 'Lee W, Tonelli M, Markley JL' 4 'peak picking' NMRFAM-SPARKY ? 'Lee W, Tonelli M, Markley JL' 5 'structure calculation' Amber ? 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 # 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