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Sf21 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 4 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 25 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Homo sapiens' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 9606 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SKIV2_HUMAN Q15477 ? 1 ;MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARK WQRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTQYPFWPGGMD EPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCMLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRGD TVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAIL HLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVIST VTRPVPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLAS LRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLNRGLGVHHSGIL PILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCK GRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPD MTGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKP LSQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAA VTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMERL RFLLSDQSLLLLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSP GDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCI QRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ ; 1 2 UNP TTC37_HUMAN Q6PGP7 ? 2 ;MSSKEVKTALKSARDAIRNKEYKEALKHCKTVLKQEKNNYNAWVFIGVAAAELEQPDQAQSAYKKAAELEPDQLLAWQGL ANLYEKYNHINAKDDLPGVYQKLLDLYESVDKQKWCDVCKKLVDLYYQEKKHLEVARTWHKLIKTRQEQGAENEELHQLW RKLTQFLAESTEDQNNETQQLLFTAFENALGLSDKIPSEDHQVLYRHFIQSLSKFPHESARLKKACEGMINIYPTVQYPL EVLCLHLIESGNLTDEGQQYCCRLVEMDSKSGPGLIGLGIKALQDKKYEDAVRNLTEGLKESPVCTSGWYHLAEAQVKMH RPKEAVLSCSQALKIVDNLGASGNSLYQRNLCLHLKAEALIKLSDYDSSEEAIRTLDQISDADNIPGLLVLKSLAYRNKG SFDEAAKIMEDLLSSYPDLAEVHALEALIHFTKKDYLQAEKCFQRALEKDTEVAEYHYQLGLTYWFMGEETRKDKTKALT HFLKAARLDTYMGKVFCYLGHYYRDVVGDKNRARGCYRKAFELDDTDAESGAAAVDLSVELEDMEMALAILTTVTQKASA GTAKWAWLRRGLYYLKAGQHSQAVADLQAALRADPKDFNCWESLGEAYLSRGGYTTALKSFTKASELNPESIYSVFKVAA IQQILGKYKEAVAQYQMIIKKKEDYVPALKGLGECHLMMAKAALVDYLDGKAVDYIEKALEYFTCALQHRADVSCLWKLA GDACTCLYAVAPSKVNVHVLGVLLGQKEGKQVLKKNELLHLGGRCYGRALKLMSTSNTWCDLGINYYRQAQHLAETGSNM NDLKELLEKSLHCLKKAVRLDSNNHLYWNALGVVACYSGIGNYALAQHCFIKSIQSEQINAVAWTNLGVLYLTNENIEQA HEAFKMAQSLDPSYLMCWIGQALIAEAVGSYDTMDLFRHTTELNMHTEGALGYAYWVCTTLQDKSNRETELYQYNILQMN AIPAAQVILNKYVERIQNYAPAFTMLGYLNEHLQLKKEAANAYQRAILLLQTAEDQDTYNVAIRNYGRLLCSTGEYDKAI QAFKSTPLEVLEDIIGFALALFMKGLYKESSKAYERALSIVESEQDKAHILTALAITEYKQGKTDVAKTLLFKCSILKEP TTESLQALCALGLAMQDATLSKAALNELLKHIKHKDSNYQRCLLTSAIYALQGRSVAVQKQISKAVHSNPGDPALWSLLS RVVAQYAQRNAKGGVVAGNVAHILDSNHGKKALLYTAVNQLAMGSSSAEDEKNTALKTIQKAALLSPGDPAIWAGLMAAC HADDKLALVNNTQPKRIDLYLALLSAVSASIKDEKFFENYNQSLEKWSLSQAVTGLIDTGRISEAETLCTKNLKSNPDQP AVILLLRQVQCKPLLESQKPLPDAVLEELQKTVMSNSTSVPAWQWLAHVYQSQGMMRAAEMCYRKSLQLASQRGSWSGKL SSLLRLALLALKVCMANISNDHWPSLVQEATTEALKLCFCPLAVLLQALLQFKRKMGARETRRLLERVVYQPGYPKSIAS TARWYLLRHLYAKDDYELIDVLVNNAKTHGDTRALELNQRLSSQ ; 1 3 UNP WDR61_HUMAN Q9GZS3 ? 3 ;MTNQYGILFKQEQAHDDAIWSVAWGTNKKENSETVVTGSLDDLVKVWKWRDERLDLQWSLEGHQLGVVSVDISHTLPIAA SSSLDAHIRLWDLENGKQIKSIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGKVNIFGVESGKKEYSLDTRGKFILSIAYSPDG KYLASGAIDGIINIFDIATGKLLHTLEGHAMPIRSLTFSPDSQLLVTASDDGYIKIYDVQHANLAGTLSGHASWVLNVAF CPDDTHFVSSSSDKSVKVWDVGTRTCVHTFFDHQDQVWGVKYNGNGSKIVSVGDDQEIHIYDCPI ; 1 4 PDB 7QDY 7QDY ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7QDY A 1 ? 1246 ? Q15477 1 ? 1246 ? 1 1246 2 2 7QDY B 26 ? 1589 ? Q6PGP7 1 ? 1564 ? 1 1564 3 3 7QDY C 1 ? 305 ? Q9GZS3 1 ? 305 ? 1 305 4 3 7QDY D 1 ? 305 ? Q9GZS3 1 ? 305 ? 1 305 5 4 7QDY E 1 ? 25 ? 7QDY -18 ? 6 ? -18 6 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 7QDY MET B 1 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'initiating methionine' -24 1 2 7QDY LYS B 2 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -23 2 2 7QDY HIS B 3 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -22 3 2 7QDY HIS B 4 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -21 4 2 7QDY HIS B 5 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -20 5 2 7QDY HIS B 6 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -19 6 2 7QDY HIS B 7 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -18 7 2 7QDY HIS B 8 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -17 8 2 7QDY HIS B 9 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -16 9 2 7QDY HIS B 10 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -15 10 2 7QDY HIS B 11 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -14 11 2 7QDY HIS B 12 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -13 12 2 7QDY SER B 13 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -12 13 2 7QDY ALA B 14 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -11 14 2 7QDY GLY B 15 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -10 15 2 7QDY LEU B 16 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -9 16 2 7QDY GLU B 17 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -8 17 2 7QDY VAL B 18 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -7 18 2 7QDY LEU B 19 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -6 19 2 7QDY PHE B 20 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -5 20 2 7QDY GLN B 21 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -4 21 2 7QDY GLY B 22 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -3 22 2 7QDY PRO B 23 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -2 23 2 7QDY ASP B 24 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' -1 24 2 7QDY SER B 25 ? UNP Q6PGP7 ? ? 'expression tag' 0 25 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7QDY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7QDY _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 ? 23395 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.100 ? 31789 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.769 ? 3268 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.062 ? 3657 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 4076 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7QDY _struct.title 'RNA-bound human SKI complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7QDY _struct_keywords.text 'multiprotein complex, RNA helicase, DExH-box helicase, ATPase, RNA binding, RNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 53 ? SER A 64 ? ASP A 53 SER A 64 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 LEU A 69 ? GLY A 73 ? LEU A 69 GLY A 73 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 86 ? LEU A 91 ? ASP A 86 LEU A 91 5 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 ALA A 252 ? LYS A 263 ? ALA A 252 LYS A 263 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 312 ? GLU A 323 ? ASP A 312 GLU A 323 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 THR A 334 ? MET A 353 ? 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