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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Sente, A.' 1 ? primary 'Desai, R.' 2 ? primary 'Naydenova, K.' 3 ? primary 'Malinauskas, T.' 4 ? primary 'Jounaidi, Y.' 5 ? primary 'Miehling, J.' 6 ? primary 'Zhou, X.' 7 ? primary 'Masiulis, S.' 8 ? primary 'Hardwick, S.W.' 9 ? primary 'Chirgadze, D.Y.' 10 ? primary 'Miller, K.W.' 11 ? primary 'Aricescu, A.R.' 12 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7QND _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? 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;QVQLVESGGGLVQGSLRLSCAASGHTFNYPIMGWFRQAPGKEREFVGAISWSGGSTSYADSVKDRFTISRDNAKNTVYLE MNNLKPEDTAVYYCAAKGRYSGGLYYPTNYDYWGQGTQVTV ; K,L,M ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 TRP n 1 3 GLY n 1 4 LEU n 1 5 ALA n 1 6 GLY n 1 7 GLY n 1 8 ARG n 1 9 LEU n 1 10 PHE n 1 11 GLY n 1 12 ILE n 1 13 PHE n 1 14 SER n 1 15 ALA n 1 16 PRO n 1 17 VAL n 1 18 LEU n 1 19 VAL n 1 20 ALA n 1 21 VAL n 1 22 VAL n 1 23 CYS n 1 24 CYS n 1 25 ALA n 1 26 GLN n 1 27 SER n 1 28 VAL n 1 29 ASN n 1 30 ASP n 1 31 PRO n 1 32 GLY n 1 33 ASN n 1 34 MET n 1 35 SER n 1 36 PHE n 1 37 VAL n 1 38 LYS n 1 39 GLU n 1 40 THR n 1 41 VAL n 1 42 ASP n 1 43 LYS n 1 44 LEU n 1 45 LEU n 1 46 LYS n 1 47 GLY n 1 48 TYR n 1 49 ASP n 1 50 ILE n 1 51 ARG n 1 52 LEU n 1 53 ARG n 1 54 PRO n 1 55 ASP n 1 56 PHE n 1 57 GLY n 1 58 GLY n 1 59 PRO n 1 60 PRO n 1 61 VAL n 1 62 CYS n 1 63 VAL n 1 64 GLY n 1 65 MET n 1 66 ASN n 1 67 ILE n 1 68 ASP n 1 69 ILE n 1 70 ALA n 1 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GBRB3_HUMAN P28472 ? 1 ;MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNM DYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAA CMMDLRRYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLK RNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLA LLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGI QYRKQSMPREGHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN ; 1 2 UNP GBRD_HUMAN O14764 ? 2 ;MDAPARLLAPLLLLCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAGYARNFRPGIGGPPVNVALALEVASIDHISE ANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLDSRFVDKLWLPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITS TVACDMDLAKYPMDEQECMLDLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPRLSLH FHLRRNRGVYIIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVSARSSLPRASAIKALDVYFWICYVF VFAALVEYAFAHFNADYRKKQKAKVKVSRPRAEMDVRNAIVLFSLSAAGVTQELAISRRQRRVPGNLMGSYRSVGVETGE TKKEGAARSGGQGGIRARLRPIDADTIDIYARAVFPAAFAAVNVIYWAAYAM ; 1 3 PDB 7QND 7QND ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7QND A 1 ? 473 ? 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'expression tag' 456 4 5 7QND GLY E 457 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 457 5 5 7QND SER E 458 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 458 6 5 7QND GLY E 459 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 459 7 5 7QND GLY E 460 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 460 8 5 7QND SER E 461 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 461 9 5 7QND GLY E 462 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 462 10 5 7QND LYS E 463 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 463 11 5 7QND THR E 464 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 464 12 5 7QND GLU E 465 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 465 13 5 7QND THR E 466 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 466 14 5 7QND SER E 467 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 467 15 5 7QND GLN E 468 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 468 16 5 7QND VAL E 469 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 469 17 5 7QND ALA E 470 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 470 18 5 7QND PRO E 471 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 471 19 5 7QND ALA E 472 ? UNP O14764 ? ? 'expression tag' 472 20 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 EI7 non-polymer . '4,5,6,7-tetrahydro-[1,2]oxazolo[5,4-c]pyridin-3-one' gaboxadol 'C6 H8 N2 O2' 140.140 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HSM non-polymer . HISTAMINE ? 'C5 H9 N3' 111.145 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7QND _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7QND _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 17292 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.371 ? 23579 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.669 ? 6295 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.038 ? 2691 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 2923 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7QND _struct.title ;Cryo-EM structure of human full-length extrasynaptic beta3delta GABA(A)R in complex with THIP (gaboxadol), histamine and nanobody Nb25 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7QND _struct_keywords.text 'pentameric ligand-gated ion channel, neurotransmitter receptor, GABA receptor, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 4 ? L N N 5 ? M N N 4 ? N N N 5 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 6 ? R N N 6 ? S N N 6 ? T N N 7 ? U N N 8 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 32 ? LYS A 46 ? GLY A 7 LYS A 21 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 95 ? ALA A 98 ? LYS A 70 ALA A 73 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 109 ? LEU A 116 ? ASP A 84 LEU A 91 5 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 195 ? LYS A 198 ? GLY A 170 LYS A 173 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 202 ? ILE A 206 ? GLY A 177 ILE A 181 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE A 243 ? THR A 250 ? ILE A 218 THR A 225 1 ? 8 HELX_P HELX_P7 AA7 THR A 250 ? ILE A 267 ? THR A 225 ILE A 242 1 ? 18 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA A 271 ? THR A 296 ? ALA A 246 THR A 271 1 ? 26 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS A 304 ? PHE A 332 ? LYS A 279 PHE A 307 1 ? 29 HELX_P HELX_P10 AB1 ILE A 448 ? VAL A 472 ? ILE A 423 VAL A 447 1 ? 25 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN B 33 ? LYS B 46 ? ASN B 8 LYS B 21 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 AB3 LYS B 95 ? ALA B 98 ? LYS B 70 ALA B 73 5 ? 4 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP B 109 ? LEU B 116 ? ASP B 84 LEU B 91 5 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY B 195 ? LYS B 198 ? GLY B 170 LYS B 173 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY B 202 ? ILE B 206 ? GLY B 177 ILE B 181 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 ILE B 243 ? THR B 250 ? ILE B 218 THR B 225 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 250 ? ILE B 267 ? THR B 225 ILE B 242 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA B 271 ? THR B 296 ? ALA B 246 THR B 271 1 ? 26 HELX_P HELX_P19 AC1 LYS B 304 ? PHE B 332 ? LYS B 279 PHE B 307 1 ? 29 HELX_P HELX_P20 AC2 ILE B 448 ? VAL B 472 ? ILE B 423 VAL B 447 1 ? 25 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN C 33 ? LYS C 46 ? ASN C 8 LYS C 21 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS C 95 ? ALA C 98 ? LYS C 70 ALA C 73 5 ? 4 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP C 109 ? LEU C 116 ? ASP C 84 LEU C 91 5 ? 8 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY C 195 ? LYS C 198 ? GLY C 170 LYS C 173 5 ? 4 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY C 202 ? ILE C 206 ? GLY C 177 ILE C 181 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE C 243 ? THR C 250 ? ILE C 218 THR C 225 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 THR C 250 ? ILE C 267 ? THR C 225 ILE C 242 1 ? 18 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA C 271 ? THR C 296 ? ALA C 246 THR C 271 1 ? 26 HELX_P HELX_P29 AD2 LYS C 304 ? PHE C 332 ? LYS C 279 PHE C 307 1 ? 29 HELX_P HELX_P30 AD3 ILE C 448 ? VAL C 472 ? ILE C 423 VAL C 447 1 ? 25 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN D 33 ? LYS D 46 ? ASN D 8 LYS D 21 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 AD5 LYS D 95 ? ALA D 98 ? LYS D 70 ALA D 73 5 ? 4 HELX_P HELX_P33 AD6 ASP D 109 ? LEU D 116 ? ASP D 84 LEU D 91 5 ? 8 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY D 195 ? LYS D 198 ? GLY D 170 LYS D 173 5 ? 4 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY D 202 ? ILE D 206 ? GLY D 177 ILE D 181 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 ILE D 243 ? THR D 250 ? ILE D 218 THR D 225 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 AE1 THR D 250 ? ILE D 267 ? THR D 225 ILE D 242 1 ? 18 HELX_P HELX_P38 AE2 ALA D 271 ? THR D 296 ? ALA D 246 THR D 271 1 ? 26 HELX_P HELX_P39 AE3 LYS D 304 ? PHE D 332 ? LYS D 279 PHE D 307 1 ? 29 HELX_P HELX_P40 AE4 ILE D 448 ? VAL D 472 ? ILE D 423 VAL D 447 1 ? 25 HELX_P HELX_P41 AE5 PRO E 42 ? GLY E 50 ? PRO E 42 GLY E 50 1 ? 9 HELX_P HELX_P42 AE6 SER E 98 ? SER E 101 ? SER E 98 SER E 101 5 ? 4 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP E 112 ? LEU E 119 ? ASP E 112 LEU E 119 5 ? 8 HELX_P HELX_P44 AE8 SER E 199 ? HIS E 204 ? SER E 199 HIS E 204 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY E 248 ? ILE E 271 ? GLY E 248 ILE E 271 1 ? 24 HELX_P HELX_P46 AF1 ALA E 275 ? SER E 300 ? ALA E 275 SER E 300 1 ? 26 HELX_P HELX_P47 AF2 LYS E 308 ? ASP E 336 ? LYS E 308 ASP E 336 1 ? 29 HELX_P HELX_P48 AF3 ASP E 425 ? ALA E 451 ? ASP E 425 ALA E 451 1 ? 27 HELX_P HELX_P49 AF4 TYR F 106 ? THR F 108 ? TYR K 495 THR K 497 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 AF5 TYR G 106 ? THR G 108 ? TYR L 495 THR L 497 5 ? 3 HELX_P HELX_P51 AF6 TYR H 106 ? THR H 108 ? TYR M 495 THR M 497 5 ? 3 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 161 SG ? ? ? 1_555 A CYS 175 SG ? ? A CYS 136 A CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 161 SG ? ? ? 1_555 B CYS 175 SG ? ? B CYS 136 B CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 161 SG ? ? ? 1_555 C CYS 175 SG ? ? C CYS 136 C CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 161 SG ? ? ? 1_555 D CYS 175 SG ? ? D CYS 136 D CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 164 SG ? ? ? 1_555 E CYS 178 SG ? ? E CYS 164 E CYS 178 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? F CYS 20 SG ? ? ? 1_555 F CYS 94 SG ? ? K CYS 409 K CYS 483 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf7 disulf ? ? G CYS 20 SG ? ? ? 1_555 G CYS 94 SG ? ? L CYS 409 L CYS 483 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf8 disulf ? ? H CYS 20 SG ? ? ? 1_555 H CYS 94 SG ? ? M CYS 409 M CYS 483 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale one ? A ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 80 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 149 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? B ASN 80 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 149 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? C ASN 80 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? C ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? C ASN 149 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? D ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? D ASN 80 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? D ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? D ASN 149 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? E ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? E ASN 103 E NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale10 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale11 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale12 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J BMA . C1 ? ? F NAG 2 F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale13 covale both ? J BMA . O3 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? F BMA 3 F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale14 covale both ? J BMA . O6 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? F BMA 3 F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale15 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale16 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale17 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale18 covale both ? L BMA . O3 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale19 covale both ? L BMA . O6 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale20 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale21 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale22 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? H NAG 2 H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale23 covale both ? N BMA . O3 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? H BMA 3 H MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale24 covale both ? N BMA . O6 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? H BMA 3 H MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale25 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale26 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale27 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale28 covale both ? P BMA . O3 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale29 covale both ? P BMA . O6 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 VAL 134 A . ? VAL 109 A THR 135 A ? THR 110 A 1 0.20 2 TYR 168 A . ? TYR 143 A PRO 169 A ? PRO 144 A 1 1.61 3 VAL 134 B . ? VAL 109 B THR 135 B ? THR 110 B 1 0.15 4 TYR 168 B . ? TYR 143 B PRO 169 B ? PRO 144 B 1 1.53 5 VAL 134 C . ? VAL 109 C THR 135 C ? THR 110 C 1 0.16 6 TYR 168 C . ? TYR 143 C PRO 169 C ? PRO 144 C 1 1.57 7 VAL 134 D . ? VAL 109 D THR 135 D ? THR 110 D 1 0.20 8 TYR 168 D . ? TYR 143 D PRO 169 D ? PRO 144 D 1 1.52 9 VAL 137 E . ? VAL 137 E THR 138 E ? THR 138 E 1 0.46 10 TYR 171 E . ? TYR 171 E PRO 172 E ? PRO 172 E 1 1.72 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 107 ? LEU A 108 ? THR A 82 LEU A 83 AA1 2 ARG A 139 ? LEU A 143 ? ARG A 114 LEU A 118 AA1 3 THR A 148 ? ALA A 160 ? THR A 123 ALA A 135 AA1 4 ASP A 81 ? ARG A 93 ? ASP A 56 ARG A 68 AA1 5 VAL A 61 ? SER A 76 ? VAL A 36 SER A 51 AA1 6 ILE A 189 ? TRP A 193 ? ILE A 164 TRP A 168 AA2 1 ASP A 126 ? VAL A 131 ? ASP A 101 VAL A 106 AA2 2 THR A 148 ? ALA A 160 ? THR A 123 ALA A 135 AA2 3 ASP A 81 ? ARG A 93 ? ASP A 56 ARG A 68 AA2 4 VAL A 61 ? SER A 76 ? VAL A 36 SER A 51 AA2 5 VAL A 200 ? THR A 201 ? VAL A 175 THR A 176 AA3 1 THR A 121 ? PHE A 123 ? THR A 96 PHE A 98 AA3 2 GLU A 172 ? SER A 181 ? GLU A 147 SER A 156 AA3 3 ALA A 229 ? ARG A 241 ? ALA A 204 ARG A 216 AA3 4 PHE A 211 ? VAL A 224 ? PHE A 186 VAL A 199 AA4 1 THR B 107 ? LEU B 108 ? THR B 82 LEU B 83 AA4 2 ARG B 139 ? LEU B 143 ? ARG B 114 LEU B 118 AA4 3 THR B 148 ? ALA B 160 ? THR B 123 ALA B 135 AA4 4 ASP B 81 ? ARG B 93 ? ASP B 56 ARG B 68 AA4 5 VAL B 61 ? SER B 76 ? VAL B 36 SER B 51 AA4 6 ILE B 189 ? TRP B 193 ? ILE B 164 TRP B 168 AA5 1 ASP B 126 ? VAL B 131 ? ASP B 101 VAL B 106 AA5 2 THR B 148 ? ALA B 160 ? THR B 123 ALA B 135 AA5 3 ASP B 81 ? ARG B 93 ? ASP B 56 ARG B 68 AA5 4 VAL B 61 ? SER B 76 ? VAL B 36 SER B 51 AA5 5 VAL B 200 ? THR B 201 ? VAL B 175 THR B 176 AA6 1 THR B 121 ? PHE B 123 ? THR B 96 PHE B 98 AA6 2 GLU B 172 ? SER B 181 ? GLU B 147 SER B 156 AA6 3 ALA B 229 ? ARG B 241 ? ALA B 204 ARG B 216 AA6 4 PHE B 211 ? VAL B 224 ? PHE B 186 VAL B 199 AA7 1 THR C 107 ? LEU C 108 ? THR C 82 LEU C 83 AA7 2 ARG C 139 ? LEU C 143 ? ARG C 114 LEU C 118 AA7 3 THR C 148 ? ALA C 160 ? THR C 123 ALA C 135 AA7 4 ASP C 81 ? ARG C 93 ? ASP C 56 ARG C 68 AA7 5 VAL C 61 ? SER C 76 ? VAL C 36 SER C 51 AA7 6 ILE C 189 ? TRP C 193 ? ILE C 164 TRP C 168 AA8 1 ASP C 126 ? VAL C 131 ? ASP C 101 VAL C 106 AA8 2 THR C 148 ? ALA C 160 ? THR C 123 ALA C 135 AA8 3 ASP C 81 ? ARG C 93 ? ASP C 56 ARG C 68 AA8 4 VAL C 61 ? SER C 76 ? VAL C 36 SER C 51 AA8 5 VAL C 200 ? THR C 201 ? VAL C 175 THR C 176 AA9 1 THR C 121 ? PHE C 123 ? THR C 96 PHE C 98 AA9 2 GLU C 172 ? SER C 181 ? GLU C 147 SER C 156 AA9 3 ALA C 229 ? ARG C 241 ? ALA C 204 ARG C 216 AA9 4 PHE C 211 ? VAL C 224 ? PHE C 186 VAL C 199 AB1 1 THR D 107 ? LEU D 108 ? THR D 82 LEU D 83 AB1 2 ARG D 139 ? LEU D 143 ? ARG D 114 LEU D 118 AB1 3 THR D 148 ? ALA D 160 ? THR D 123 ALA D 135 AB1 4 ASP D 81 ? ARG D 93 ? ASP D 56 ARG D 68 AB1 5 VAL D 61 ? SER D 76 ? VAL D 36 SER D 51 AB1 6 ILE D 189 ? TRP D 193 ? ILE D 164 TRP D 168 AB2 1 ASP D 126 ? VAL D 131 ? ASP D 101 VAL D 106 AB2 2 THR D 148 ? ALA D 160 ? THR D 123 ALA D 135 AB2 3 ASP D 81 ? ARG D 93 ? ASP D 56 ARG D 68 AB2 4 VAL D 61 ? SER D 76 ? VAL D 36 SER D 51 AB2 5 VAL D 200 ? THR D 201 ? VAL D 175 THR D 176 AB3 1 THR D 121 ? PHE D 123 ? THR D 96 PHE D 98 AB3 2 GLU D 172 ? SER D 181 ? GLU D 147 SER D 156 AB3 3 ALA D 229 ? ARG D 241 ? ALA D 204 ARG D 216 AB3 4 PHE D 211 ? VAL D 224 ? PHE D 186 VAL D 199 AB4 1 LEU E 109 ? LEU E 111 ? 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D LEU 442 580 1 Y 1 D THR 418 ? D THR 443 581 1 Y 1 D ASP 419 ? D ASP 444 582 1 Y 1 D VAL 420 ? D VAL 445 583 1 Y 1 D ASN 421 ? D ASN 446 584 1 Y 1 D ASN 448 ? D ASN 473 585 1 Y 1 E MET 1 ? E MET 1 586 1 Y 1 E ASP 2 ? E ASP 2 587 1 Y 1 E ALA 3 ? E ALA 3 588 1 Y 1 E PRO 4 ? E PRO 4 589 1 Y 1 E ALA 5 ? E ALA 5 590 1 Y 1 E ARG 6 ? E ARG 6 591 1 Y 1 E LEU 7 ? E LEU 7 592 1 Y 1 E LEU 8 ? E LEU 8 593 1 Y 1 E ALA 9 ? E ALA 9 594 1 Y 1 E PRO 10 ? E PRO 10 595 1 Y 1 E LEU 11 ? E LEU 11 596 1 Y 1 E LEU 12 ? E LEU 12 597 1 Y 1 E LEU 13 ? E LEU 13 598 1 Y 1 E LEU 14 ? E LEU 14 599 1 Y 1 E CYS 15 ? E CYS 15 600 1 Y 1 E ALA 16 ? E ALA 16 601 1 Y 1 E GLN 17 ? E GLN 17 602 1 Y 1 E GLN 18 ? E GLN 18 603 1 Y 1 E LEU 19 ? E LEU 19 604 1 Y 1 E ARG 20 ? E ARG 20 605 1 Y 1 E GLY 21 ? E GLY 21 606 1 Y 1 E THR 22 ? E THR 22 607 1 Y 1 E ARG 23 ? E ARG 23 608 1 Y 1 E ALA 24 ? E ALA 24 609 1 Y 1 E MET 25 ? E MET 25 610 1 Y 1 E ASN 26 ? E ASN 26 611 1 Y 1 E ASP 27 ? E ASP 27 612 1 Y 1 E ILE 28 ? 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EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4.1.13 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? REFMAC 5 ? 1 ? 10 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.19.2 ? 1 ? 11 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.1 1 ? ? 12 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.1 1 ? ? 13 CLASSIFICATION ? RELION 3.1 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ? RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Medical Research Council (MRC, United Kingdom)' 'United Kingdom' MR/L009609/1 1 'Medical Research Council (MRC, United Kingdom)' 'United Kingdom' MC_UP_1201/15 2 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United Kingdom' 1R01-GM135550 3 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' 206171/Z/17/Z 4 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' 202905/Z/16/Z 5 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero I 4 NAG 1 a NAG 1 a NAG 1 n I 4 NAG 2 a NAG 2 a NAG 2 n J 5 NAG 1 F NAG 1 a NAG 3 n J 5 NAG 2 F NAG 2 a NAG 4 n J 5 BMA 3 F BMA 3 a BMA 5 n J 5 MAN 4 F MAN 4 a MAN 6 n J 5 MAN 5 F MAN 5 a MAN 7 n K 4 NAG 1 b NAG 1 b NAG 1 n K 4 NAG 2 b NAG 2 b NAG 2 n L 5 NAG 1 G NAG 1 b NAG 3 n L 5 NAG 2 G NAG 2 b NAG 4 n L 5 BMA 3 G BMA 3 b BMA 5 n L 5 MAN 4 G MAN 4 b MAN 6 n L 5 MAN 5 G MAN 5 b MAN 7 n M 4 NAG 1 c NAG 1 c NAG 1 n M 4 NAG 2 c NAG 2 c NAG 2 n N 5 NAG 1 H NAG 1 c NAG 3 n N 5 NAG 2 H NAG 2 c NAG 4 n N 5 BMA 3 H BMA 3 c BMA 5 n N 5 MAN 4 H MAN 4 c MAN 6 n N 5 MAN 5 H MAN 5 c MAN 7 n O 4 NAG 1 d NAG 1 d NAG 1 n O 4 NAG 2 d NAG 2 d NAG 2 n P 5 NAG 1 I NAG 1 d NAG 3 n P 5 NAG 2 I NAG 2 d NAG 4 n P 5 BMA 3 I BMA 3 d BMA 5 n P 5 MAN 4 I MAN 4 d MAN 6 n P 5 MAN 5 I MAN 5 d MAN 7 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 5 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 5 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 5 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 5 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 5 MAN 4 n 5 MAN 5 n # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 EI7 ? ? EI7 ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 HSM ? ? HSM ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 6 HISTAMINE HSM 7 '4,5,6,7-tetrahydro-[1,2]oxazolo[5,4-c]pyridin-3-one' EI7 8 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #