data_7QO3 # _entry.id 7QO3 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.357 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7QO3 pdb_00007qo3 10.2210/pdb7qo3/pdb WWPDB D_1292116511 ? ? EMDB EMD-14082 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of the 26S proteasome-Ubp6 complex in the si state (Core Particle and Lid)' _pdbx_database_related.db_id EMD-14082 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7QO3 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-12-23 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hung, K.Y.S.' 1 ? 'Klumpe, S.' 2 ? 'Eisele, M.R.' 3 ? 'Elsasser, S.' 4 ? 'Geng, T.T.' 5 ? 'Cheng, T.C.' 6 ? 'Joshi, T.' 7 ? 'Rudack, T.' 8 0000-0003-2693-9561 'Sakata, E.' 9 0000-0002-8580-3683 'Finley, D.' 10 0000-0003-2076-5863 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 13 _citation.language ? _citation.page_first 838 _citation.page_last 838 _citation.title 'Allosteric control of Ubp6 and the proteasome via a bidirectional switch.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-022-28186-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 35149681 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hung, K.Y.S.' 1 ? primary 'Klumpe, S.' 2 0000-0002-8350-6503 primary 'Eisele, M.R.' 3 ? primary 'Elsasser, S.' 4 0000-0002-0544-9726 primary 'Tian, G.' 5 ? primary 'Sun, S.' 6 ? primary 'Moroco, J.A.' 7 ? primary 'Cheng, T.C.' 8 ? primary 'Joshi, T.' 9 ? primary 'Seibel, T.' 10 ? primary 'Van Dalen, D.' 11 ? primary 'Feng, X.H.' 12 ? primary 'Lu, Y.' 13 ? primary 'Ovaa, H.' 14 ? primary 'Engen, J.R.' 15 0000-0002-6918-9476 primary 'Lee, B.H.' 16 0000-0002-7101-0471 primary 'Rudack, T.' 17 0000-0003-2693-9561 primary 'Sakata, E.' 18 0000-0002-8580-3683 primary 'Finley, D.' 19 0000-0003-2076-5863 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7QO3 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 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'Proteasome subunit alpha type-2' 27191.828 2 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-3' 28748.230 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-4' 28478.111 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-5' 28649.086 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-6' 25634.000 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Probable proteasome subunit alpha type-7' 31575.068 2 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-1' 23573.604 2 3.4.25.1 ? ? ? 9 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-2' 28299.889 2 3.4.25.1 ? ? ? 10 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-3' 22627.842 2 ? ? ? ? 11 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-4' 22545.676 2 ? ? ? ? 12 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-5' 31670.539 2 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-6' 26905.076 2 ? ? ? ? 14 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-7' 29471.289 2 ? ? ? ? 15 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN10' 29776.098 1 ? ? ? ? 16 polymer nat 'Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11' 34442.281 1 3.4.19.12 ? ? ? 17 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN12' 31952.119 1 ? ? ? ? 18 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN13' 17919.002 1 ? ? ? ? 19 polymer nat '26S proteasome complex subunit SEM1' 10397.102 1 ? ? ? ? 20 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN1' 109601.906 1 ? ? ? ? 21 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN2' 104351.883 1 ? ? ? ? 22 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN3' 60464.605 1 ? ? ? ? 23 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN5' 51840.352 1 ? ? ? ? 24 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN6' 49839.812 1 ? ? ? ? 25 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN7' 49016.367 1 ? ? ? ? 26 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN8' 38365.508 1 ? ? ? ? 27 polymer nat '26S proteasome regulatory subunit RPN9' 45839.348 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;Macropain subunit C7-alpha,Multicatalytic endopeptidase complex C7,Proteasome component C7-alpha,Proteasome component Y8,Proteinase YSCE subunit 7,SCL1 suppressor protein ; 2 'Macropain subunit Y7,Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y7,Proteasome component Y7,Proteinase YSCE subunit 7' 3 'Macropain subunit Y13,Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y13,Proteasome component Y13,Proteinase YSCE subunit 13' 4 'Macropain subunit PRE6,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE6,Proteasome component PRE6,Proteinase YSCE subunit PRE6' 5 'Macropain subunit PUP2,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP2,Proteasome component PUP2,Proteinase YSCE subunit PUP2' 6 'Macropain subunit PRE5,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE5,Proteasome component PRE5,Proteinase YSCE subunit PRE5' 7 'Macropain subunit C1,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C1,Proteasome component C1,Proteinase YSCE subunit 1' 8 'Macropain subunit PRE3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE3,Proteasome component PRE3,Proteinase YSCE subunit PRE3' 9 'Macropain subunit PUP1,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP1,Proteasome component PUP1,Proteinase YSCE subunit PUP1' 10 'Macropain subunit PUP3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP3,Proteasome component PUP3' 11 'Macropain subunit C11,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C11,Proteasome component C11,Proteinase YSCE subunit 11' 12 'Macropain subunit PRE2,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE2,Proteasome component PRE2,Proteinase YSCE subunit PRE2' 13 'Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5,Proteasome component C5' 14 'Macropain subunit PRE4,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE4,Proteasome component PRE4,Proteinase YSCE subunit PRE4' 16 '26S proteasome regulatory subunit RPN11,Protein MPR1' 17 'Nuclear integrity protein 1' 18 'Proteasome non-ATPase subunit 13' 20 'HMG-CoA reductase degradation protein 2,Proteasome non-ATPase subunit 1' 23 'Proteasome non-ATPase subunit 5' 24 'Proteasome non-ATPase subunit 4' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; a,A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; b,B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; c,C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; d,D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; e,E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; f,F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; g,G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; h,1 ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; i,2 ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; j,3 ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; k,4 ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; l,5 ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; m,6 ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI ; ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD 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16 ;MERLQRLMMNSKVGSADTGRDDTKETVYISSIALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVNVVDVFAMPQSGTGVSV EAVDDVFQAKMMDMLKQTGRDQMVVGWYHSHPGFGCWLSSVDVNTQKSFEQLNSRAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLID TGALINNLEPRQTTSNTGLLNKANIQALIHGLNRHYYSLNIDYHKTAKETKMLMNLHKEQWQSGLKMYDYEEKEESNLAA TKSMVKIAEQYSKRIEEEKELTEEELKTRYVGRQDPKKHLSETADETLENNIVSVLTAGVNSVAIK ; 1 17 UNP RPN12_YEAST P32496 ? 17 ;MPSLAELTKSLSIAFENGDYAACEKLLPPIKIELIKNNLLIPDLSIQNDIYLNDLMITKRILEVGALASIQTFNFDSFEN YFNQLKPYYFSNNHKLSESDKKSKLISLYLLNLLSQNNTTKFHSELQYLDKHIKNLEDDSLLSYPIKLDRWLMEGSYQKA WDLLQSGSQNISEFDSFTDILKSAIRDEIAKNTELSYDFLPLSNIKALLFFNNEKETEKFALERNWPIVNSKVYFNNQSK EKADYEDEMMHEEDQKTNIIEKAMDYAISIENIV ; 1 18 UNP RPN13_YEAST O13563 ? 18 ;MSMSSTVIKFRAGVCEYNEDSRLCTPIPVQGEIEIKPNEEEELGFWDFEWRPTEKPVGRELDPISLILIPGETMWVPIKS SKSGRIFALVFSSNERYFFWLQEKNSGNLPLNELSAKDKEIYNKMIGVLNNSSESDEEESNDEKQKAQDVDVSMQD ; 1 19 UNP SEM1_YEAST O94742 ? 19 ;MSTDVAAAQAQSKIDLTKKKNEEINKKSLEEDDEFEDFPIDTWANGETIKSNAVTQTNIWEENWDDVEVDDDFTNELKAE LDRYKRENQ ; 1 20 UNP RPN1_YEAST P38764 ? 20 ;MVDESDKKQQTIDEQSQISPEKQTPNKKDKKKEEEEQLSEEDAKLKTDLELLVERLKEDDSSLYEASLNALKESIKNSTS SMTAVPKPLKFLRPTYPDLCSIYDKWTDPNLKSSLADVLSILAMTYSENGKHDSLRYRLLSDVSDFEGWGHEYIRHLALE IGEVYNDQVEKDAEDETSSDGSKSDGSAATSGFEFSKEDTLRLCLDIVPYFLKHNGEEDAVDLLLEIESIDKLPQFVDEN TFQRVCQYMVACVPLLPPPEDVAFLKTAYSIYLSQNELTDAIALAVRLGEEDMIRSVFDATSDPVMHKQLAYILAAQKTS FEYEGVQDIIGNGKLSEHFLYLAKELNLTGPKVPEDIYKSHLDNSKSVFSSAGLDSAQQNLASSFVNGFLNLGYCNDKLI VDNDNWVYKTKGDGMTSAVASIGSIYQWNLDGLQQLDKYLYVDEPEVKAGALLGIGISASGVHDGEVEPALLLLQDYVTN PDTKISSAAILGLGIAFAGSKNDEVLGLLLPIAASTDLPIETAAMASLALAHVFVGTCNGDITTSIMDNFLERTAIELKT DWVRFLALALGILYMGQGEQVDDVLETISAIEHPMTSAIEVLVGSCAYTGTGDVLLIQDLLHRLTPKNVKGEEDADEEET AEGQTNSISDFLGEQVNEPTKNEEAEIEVDEMEVDAEGEEVEVKAEITEKKNGESLEGEEIKSEEKKGKSSDKDATTDGK NDDEEEEKEAGIVDELAYAVLGIALIALGEDIGKEMSLRHFGHLMHYGNEHIRRMVPLAMGIVSVSDPQMKVFDTLTRFS HDADLEVSMNSIFAMGLCGAGTNNARLAQLLRQLASYYSREQDALFITRLAQGLLHLGKGTMTMDVFNDAHVLNKVTLAS ILTTAVGLVSPSFMLKHHQLFYMLNAGIRPKFILALNDEGEPIKVNVRVGQAVETVGQAGRPKKITGWITQSTPVLLNHG ERAELETDEYISYTSHIEGVVILKKNPDYREEE ; 1 21 UNP RPN2_YEAST P32565 ? 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Q04062 1 ? 393 ? 1 393 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7QO3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7QO3 _struct.title 'Structure of the 26S proteasome-Ubp6 complex in the si state (Core Particle and Lid)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7QO3 _struct_keywords.text 'Proteasome UBP6 Ubiquitin Allostery, MOTOR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MOTOR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? 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NZ k LYS 90 ? ? 95.74 111.70 -15.96 2.30 N 62 1 CA k LYS 109 ? ? CB k LYS 109 ? ? CG k LYS 109 ? ? 97.61 113.40 -15.79 2.20 N 63 1 CB k LYS 109 ? ? CG k LYS 109 ? ? CD k LYS 109 ? ? 128.65 111.60 17.05 2.60 N 64 1 CG k LYS 109 ? ? CD k LYS 109 ? ? CE k LYS 109 ? ? 132.45 111.90 20.55 3.00 N 65 1 CD k LYS 110 ? ? CE k LYS 110 ? ? NZ k LYS 110 ? ? 93.14 111.70 -18.56 2.30 N 66 1 CA k LEU 163 ? ? CB k LEU 163 ? ? CG k LEU 163 ? ? 129.30 115.30 14.00 2.30 N 67 1 CB k LEU 163 ? ? CG k LEU 163 ? ? CD1 k LEU 163 ? ? 124.96 111.00 13.96 1.70 N 68 1 CB k LEU 163 ? ? CG k LEU 163 ? ? CD2 k LEU 163 ? ? 98.34 111.00 -12.66 1.70 N 69 1 NE k ARG 171 ? ? CZ k ARG 171 ? ? NH1 k ARG 171 ? ? 123.86 120.30 3.56 0.50 N 70 1 CG l ARG 82 ? ? CD l ARG 82 ? ? NE l ARG 82 ? ? 124.67 111.80 12.87 2.10 N 71 1 CD l LYS 107 ? ? CE l LYS 107 ? ? NZ l LYS 107 ? ? 129.52 111.70 17.82 2.30 N 72 1 NE l ARG 148 ? ? CZ l ARG 148 ? ? NH2 l ARG 148 ? ? 116.23 120.30 -4.07 0.50 N 73 1 CD l LYS 156 ? ? CE l LYS 156 ? ? NZ l LYS 156 ? ? 130.12 111.70 18.42 2.30 N 74 1 NE l ARG 181 ? ? CZ l ARG 181 ? ? NH1 l ARG 181 ? ? 115.92 120.30 -4.38 0.50 N 75 1 NE l ARG 181 ? ? CZ l ARG 181 ? ? NH2 l ARG 181 ? ? 125.53 120.30 5.23 0.50 N 76 1 CD l LYS 182 ? ? CE l LYS 182 ? ? NZ l LYS 182 ? ? 129.60 111.70 17.90 2.30 N 77 1 NE l ARG 196 ? ? CZ l ARG 196 ? ? NH1 l ARG 196 ? ? 128.20 120.30 7.90 0.50 N 78 1 NE l ARG 196 ? ? CZ l ARG 196 ? ? NH2 l ARG 196 ? ? 112.52 120.30 -7.78 0.50 N 79 1 NE m ARG 36 ? ? CZ m ARG 36 ? ? NH1 m ARG 36 ? ? 123.72 120.30 3.42 0.50 N 80 1 N m ASP 40 ? ? CA m ASP 40 ? ? C m ASP 40 ? ? 93.10 111.00 -17.90 2.70 N 81 1 NE m ARG 46 ? ? CZ m ARG 46 ? ? NH1 m ARG 46 ? ? 127.29 120.30 6.99 0.50 N 82 1 NE m ARG 46 ? ? CZ m ARG 46 ? ? NH2 m ARG 46 ? ? 113.30 120.30 -7.00 0.50 N 83 1 NE m ARG 75 ? ? CZ m ARG 75 ? ? NH1 m ARG 75 ? ? 124.10 120.30 3.80 0.50 N 84 1 CG m LYS 127 ? ? CD m LYS 127 ? ? CE m LYS 127 ? ? 93.54 111.90 -18.36 3.00 N 85 1 CD m LYS 127 ? ? CE m LYS 127 ? ? NZ m LYS 127 ? ? 140.64 111.70 28.94 2.30 N 86 1 CD m LYS 177 ? ? CE m LYS 177 ? ? NZ m LYS 177 ? ? 93.25 111.70 -18.45 2.30 N 87 1 NE m ARG 221 ? ? CZ m ARG 221 ? ? NH1 m ARG 221 ? ? 125.26 120.30 4.96 0.50 N 88 1 NE m ARG 221 ? ? CZ m ARG 221 ? ? NH2 m ARG 221 ? ? 116.77 120.30 -3.53 0.50 N 89 1 NE n ARG 98 ? ? CZ n ARG 98 ? ? NH2 n ARG 98 ? ? 123.67 120.30 3.37 0.50 N 90 1 CB A ARG 77 ? ? CG A ARG 77 ? ? CD A ARG 77 ? ? 128.26 111.60 16.66 2.60 N 91 1 CG A ARG 77 ? ? CD A ARG 77 ? ? NE A ARG 77 ? ? 124.42 111.80 12.62 2.10 N 92 1 NE A ARG 131 ? ? CZ A ARG 131 ? ? NH2 A ARG 131 ? ? 123.88 120.30 3.58 0.50 N 93 1 CB A LYS 187 ? ? CG A LYS 187 ? ? CD A LYS 187 ? ? 131.12 111.60 19.52 2.60 N 94 1 CD A LYS 188 ? ? CE A LYS 188 ? ? NZ A LYS 188 ? ? 95.12 111.70 -16.58 2.30 N 95 1 CD A LYS 201 ? ? CE A LYS 201 ? ? NZ A LYS 201 ? ? 75.28 111.70 -36.42 2.30 N 96 1 CD A LYS 232 ? ? CE A LYS 232 ? ? NZ A LYS 232 ? ? 91.45 111.70 -20.25 2.30 N 97 1 CD B LYS 49 ? ? CE B LYS 49 ? ? NZ B LYS 49 ? ? 126.46 111.70 14.76 2.30 N 98 1 CG C ARG 5 ? ? CD C ARG 5 ? ? NE C ARG 5 ? ? 130.04 111.80 18.24 2.10 N 99 1 CB D LYS 88 ? ? CG D LYS 88 ? ? CD D LYS 88 ? ? 130.70 111.60 19.10 2.60 N 100 1 NE D ARG 119 ? ? CZ D ARG 119 ? ? NH2 D ARG 119 ? ? 116.16 120.30 -4.14 0.50 N 101 1 CA D LYS 182 ? ? CB D LYS 182 ? ? CG D LYS 182 ? ? 127.86 113.40 14.46 2.20 N 102 1 CB D LYS 182 ? ? CG D LYS 182 ? ? CD D LYS 182 ? ? 130.47 111.60 18.87 2.60 N 103 1 CB E ARG 10 ? ? CG E ARG 10 ? ? CD E ARG 10 ? ? 133.07 111.60 21.47 2.60 N 104 1 CG E ARG 10 ? ? CD E ARG 10 ? ? NE E ARG 10 ? ? 126.65 111.80 14.85 2.10 N 105 1 CD E LYS 170 ? ? CE E LYS 170 ? ? NZ E LYS 170 ? ? 132.60 111.70 20.90 2.30 N 106 1 CD E LYS 205 ? ? CE E LYS 205 ? ? NZ E LYS 205 ? ? 91.31 111.70 -20.39 2.30 N 107 1 CA E LYS 211 ? ? CB E LYS 211 ? ? CG E LYS 211 ? ? 99.40 113.40 -14.00 2.20 N 108 1 CD E LYS 246 ? ? CE E LYS 246 ? ? NZ E LYS 246 ? ? 126.14 111.70 14.44 2.30 N 109 1 CD F LYS 218 ? ? CE F LYS 218 ? ? NZ F LYS 218 ? ? 90.24 111.70 -21.46 2.30 N 110 1 CA F GLU 228 ? ? CB F GLU 228 ? ? CG F GLU 228 ? ? 98.14 113.40 -15.26 2.20 N 111 1 CD F LYS 232 ? ? CE F LYS 232 ? ? NZ F LYS 232 ? ? 131.94 111.70 20.24 2.30 N 112 1 CD G LYS 57 ? ? CE G LYS 57 ? ? NZ G LYS 57 ? ? 134.33 111.70 22.63 2.30 N 113 1 CD G LYS 63 ? ? CE G LYS 63 ? ? NZ G LYS 63 ? ? 130.76 111.70 19.06 2.30 N 114 1 CB G LYS 66 ? ? CG G LYS 66 ? ? CD G LYS 66 ? ? 92.70 111.60 -18.90 2.60 N 115 1 N G ASP 71 ? ? CA G ASP 71 ? ? C G ASP 71 ? ? 90.64 111.00 -20.36 2.70 N 116 1 CD 1 LYS 18 ? ? CE 1 LYS 18 ? ? NZ 1 LYS 18 ? ? 77.06 111.70 -34.64 2.30 N 117 1 CA 1 GLU 85 ? ? CB 1 GLU 85 ? ? CG 1 GLU 85 ? ? 127.33 113.40 13.93 2.20 N 118 1 CD 1 LYS 130 ? ? CE 1 LYS 130 ? ? NZ 1 LYS 130 ? ? 130.21 111.70 18.51 2.30 N 119 1 CD 1 LYS 149 ? ? CE 1 LYS 149 ? ? NZ 1 LYS 149 ? ? 128.35 111.70 16.65 2.30 N 120 1 NE 1 ARG 152 ? ? CZ 1 ARG 152 ? ? NH1 1 ARG 152 ? ? 123.31 120.30 3.01 0.50 N 121 1 CA 1 ARG 183 ? ? CB 1 ARG 183 ? ? CG 1 ARG 183 ? ? 98.88 113.40 -14.52 2.20 N 122 1 CB 1 ARG 183 ? ? CG 1 ARG 183 ? ? CD 1 ARG 183 ? ? 129.44 111.60 17.84 2.60 N 123 1 CG 1 ARG 183 ? ? CD 1 ARG 183 ? ? NE 1 ARG 183 ? ? 136.01 111.80 24.21 2.10 N 124 1 NE 1 ARG 183 ? ? CZ 1 ARG 183 ? ? NH1 1 ARG 183 ? ? 126.30 120.30 6.00 0.50 N 125 1 CG 1 ARG 194 ? ? CD 1 ARG 194 ? ? NE 1 ARG 194 ? ? 127.35 111.80 15.55 2.10 N 126 1 CD 2 LYS 58 ? ? CE 2 LYS 58 ? ? NZ 2 LYS 58 ? ? 94.12 111.70 -17.58 2.30 N 127 1 NE 2 ARG 65 ? ? CZ 2 ARG 65 ? ? NH2 2 ARG 65 ? ? 123.52 120.30 3.22 0.50 N 128 1 CB 2 LEU 109 ? ? CG 2 LEU 109 ? ? CD1 2 LEU 109 ? ? 94.82 111.00 -16.18 1.70 N 129 1 CB 2 LEU 109 ? ? CG 2 LEU 109 ? ? CD2 2 LEU 109 ? ? 136.52 111.00 25.52 1.70 N 130 1 CD 2 LYS 118 ? ? CE 2 LYS 118 ? ? NZ 2 LYS 118 ? ? 131.30 111.70 19.60 2.30 N 131 1 CB 2 LEU 167 ? ? CG 2 LEU 167 ? ? CD1 2 LEU 167 ? ? 92.42 111.00 -18.58 1.70 N 132 1 CB 2 LYS 182 ? ? CG 2 LYS 182 ? ? CD 2 LYS 182 ? ? 127.65 111.60 16.05 2.60 N 133 1 CD 2 LYS 211 ? ? CE 2 LYS 211 ? ? NZ 2 LYS 211 ? ? 97.41 111.70 -14.29 2.30 N 134 1 CG 2 ARG 217 ? ? CD 2 ARG 217 ? ? NE 2 ARG 217 ? ? 98.29 111.80 -13.51 2.10 N 135 1 NE 2 ARG 217 ? ? CZ 2 ARG 217 ? ? NH1 2 ARG 217 ? ? 117.03 120.30 -3.27 0.50 N 136 1 CB 2 ASP 251 ? ? CG 2 ASP 251 ? ? OD1 2 ASP 251 ? ? 112.39 118.30 -5.91 0.90 N 137 1 CA 2 ILE 252 ? ? CB 2 ILE 252 ? ? CG1 2 ILE 252 ? ? 92.41 111.00 -18.59 1.90 N 138 1 CB 3 LEU 63 ? ? CG 3 LEU 63 ? ? CD2 3 LEU 63 ? ? 121.89 111.00 10.89 1.70 N 139 1 CB 3 TYR 69 ? ? CG 3 TYR 69 ? ? CD1 3 TYR 69 ? ? 124.93 121.00 3.93 0.60 N 140 1 CD 3 LYS 77 ? ? CE 3 LYS 77 ? ? NZ 3 LYS 77 ? ? 90.25 111.70 -21.45 2.30 N 141 1 CA 3 LYS 118 ? ? CB 3 LYS 118 ? ? CG 3 LYS 118 ? ? 128.80 113.40 15.40 2.20 N 142 1 CB 3 LEU 172 ? ? CG 3 LEU 172 ? ? CD2 3 LEU 172 ? ? 124.90 111.00 13.90 1.70 N 143 1 CA 4 MET 1 ? ? CB 4 MET 1 ? ? CG 4 MET 1 ? ? 89.85 113.30 -23.45 1.70 N 144 1 CG 4 MET 1 ? ? SD 4 MET 1 ? ? CE 4 MET 1 ? ? 81.93 100.20 -18.27 1.60 N 145 1 N 4 MET 1 ? ? CA 4 MET 1 ? ? C 4 MET 1 ? ? 94.55 111.00 -16.45 2.70 N 146 1 CG1 4 ILE 4 ? ? CB 4 ILE 4 ? ? CG2 4 ILE 4 ? ? 93.84 111.40 -17.56 2.20 N 147 1 CD 4 LYS 19 ? ? CE 4 LYS 19 ? ? NZ 4 LYS 19 ? ? 137.72 111.70 26.02 2.30 N 148 1 CD 4 LYS 90 ? ? CE 4 LYS 90 ? ? NZ 4 LYS 90 ? ? 95.77 111.70 -15.93 2.30 N 149 1 CA 4 LYS 109 ? ? CB 4 LYS 109 ? ? CG 4 LYS 109 ? ? 97.62 113.40 -15.78 2.20 N 150 1 CB 4 LYS 109 ? ? CG 4 LYS 109 ? ? CD 4 LYS 109 ? ? 128.67 111.60 17.07 2.60 N 151 1 CG 4 LYS 109 ? ? CD 4 LYS 109 ? ? CE 4 LYS 109 ? ? 132.41 111.90 20.51 3.00 N 152 1 CD 4 LYS 110 ? ? CE 4 LYS 110 ? ? NZ 4 LYS 110 ? ? 93.12 111.70 -18.58 2.30 N 153 1 CA 4 LEU 163 ? ? CB 4 LEU 163 ? ? CG 4 LEU 163 ? ? 129.27 115.30 13.97 2.30 N 154 1 CB 4 LEU 163 ? ? CG 4 LEU 163 ? ? CD1 4 LEU 163 ? ? 124.97 111.00 13.97 1.70 N 155 1 CB 4 LEU 163 ? ? CG 4 LEU 163 ? ? CD2 4 LEU 163 ? ? 98.33 111.00 -12.67 1.70 N 156 1 NE 4 ARG 171 ? ? CZ 4 ARG 171 ? ? NH1 4 ARG 171 ? ? 123.82 120.30 3.52 0.50 N 157 1 CG 5 ARG 82 ? ? CD 5 ARG 82 ? ? NE 5 ARG 82 ? ? 124.68 111.80 12.88 2.10 N 158 1 CD 5 LYS 107 ? ? CE 5 LYS 107 ? ? NZ 5 LYS 107 ? ? 129.56 111.70 17.86 2.30 N 159 1 NE 5 ARG 148 ? ? CZ 5 ARG 148 ? ? NH2 5 ARG 148 ? ? 116.27 120.30 -4.03 0.50 N 160 1 CD 5 LYS 156 ? ? CE 5 LYS 156 ? ? NZ 5 LYS 156 ? ? 130.15 111.70 18.45 2.30 N 161 1 NE 5 ARG 181 ? ? CZ 5 ARG 181 ? ? NH1 5 ARG 181 ? ? 115.87 120.30 -4.43 0.50 N 162 1 NE 5 ARG 181 ? ? CZ 5 ARG 181 ? ? NH2 5 ARG 181 ? ? 125.57 120.30 5.27 0.50 N 163 1 CD 5 LYS 182 ? ? CE 5 LYS 182 ? ? NZ 5 LYS 182 ? ? 129.62 111.70 17.92 2.30 N 164 1 NE 5 ARG 196 ? ? CZ 5 ARG 196 ? ? NH1 5 ARG 196 ? ? 128.17 120.30 7.87 0.50 N 165 1 NE 5 ARG 196 ? ? CZ 5 ARG 196 ? ? NH2 5 ARG 196 ? ? 112.57 120.30 -7.73 0.50 N 166 1 NE 6 ARG 36 ? ? CZ 6 ARG 36 ? ? NH1 6 ARG 36 ? ? 123.65 120.30 3.35 0.50 N 167 1 N 6 ASP 40 ? ? CA 6 ASP 40 ? ? C 6 ASP 40 ? ? 93.07 111.00 -17.93 2.70 N 168 1 NE 6 ARG 46 ? ? CZ 6 ARG 46 ? ? NH1 6 ARG 46 ? ? 127.23 120.30 6.93 0.50 N 169 1 NE 6 ARG 46 ? ? CZ 6 ARG 46 ? ? NH2 6 ARG 46 ? ? 113.34 120.30 -6.96 0.50 N 170 1 NE 6 ARG 75 ? ? CZ 6 ARG 75 ? ? NH1 6 ARG 75 ? ? 124.09 120.30 3.79 0.50 N 171 1 CG 6 LYS 127 ? ? CD 6 LYS 127 ? ? CE 6 LYS 127 ? ? 93.54 111.90 -18.36 3.00 N 172 1 CD 6 LYS 127 ? ? CE 6 LYS 127 ? ? NZ 6 LYS 127 ? ? 140.62 111.70 28.92 2.30 N 173 1 CD 6 LYS 177 ? ? CE 6 LYS 177 ? ? NZ 6 LYS 177 ? ? 93.25 111.70 -18.45 2.30 N 174 1 NE 6 ARG 221 ? ? CZ 6 ARG 221 ? ? NH1 6 ARG 221 ? ? 125.27 120.30 4.97 0.50 N 175 1 NE 6 ARG 221 ? ? CZ 6 ARG 221 ? ? NH2 6 ARG 221 ? ? 116.74 120.30 -3.56 0.50 N 176 1 CG 7 ARG 136 ? ? CD 7 ARG 136 ? ? NE 7 ARG 136 ? ? 99.02 111.80 -12.78 2.10 N 177 1 OE1 W GLU 124 ? ? CD W GLU 124 ? ? OE2 W GLU 124 ? ? 115.60 123.30 -7.70 1.20 N 178 1 OE1 W GLU 194 ? ? CD W GLU 194 ? ? OE2 W GLU 194 ? ? 112.76 123.30 -10.54 1.20 N 179 1 CA V GLN 88 ? ? CB V GLN 88 ? ? CG V GLN 88 ? ? 130.75 113.40 17.35 2.20 N 180 1 CB V GLN 88 ? ? CG V GLN 88 ? ? CD V GLN 88 ? ? 128.35 111.60 16.75 2.60 N 181 1 NE V ARG 100 ? ? CZ V ARG 100 ? ? NH2 V ARG 100 ? ? 116.45 120.30 -3.85 0.50 N 182 1 NE V ARG 194 ? ? CZ V ARG 194 ? ? NH1 V ARG 194 ? ? 123.58 120.30 3.28 0.50 N 183 1 NE V ARG 194 ? ? CZ V ARG 194 ? ? NH2 V ARG 194 ? ? 117.27 120.30 -3.03 0.50 N 184 1 CD V LYS 205 ? ? CE V LYS 205 ? ? NZ V LYS 205 ? ? 90.58 111.70 -21.12 2.30 N 185 1 CD V LYS 208 ? ? CE V LYS 208 ? ? NZ V LYS 208 ? ? 95.51 111.70 -16.19 2.30 N 186 1 CB V LYS 259 ? ? CG V LYS 259 ? ? CD V LYS 259 ? ? 95.86 111.60 -15.74 2.60 N 187 1 CG V LYS 259 ? ? CD V LYS 259 ? ? CE V LYS 259 ? ? 176.79 111.90 64.89 3.00 N 188 1 CD V LYS 259 ? ? CE V LYS 259 ? ? NZ V LYS 259 ? ? 91.23 111.70 -20.47 2.30 N 189 1 CA V GLU 286 ? ? CB V GLU 286 ? ? CG V GLU 286 ? ? 127.16 113.40 13.76 2.20 N 190 1 CA V VAL 303 ? ? CB V VAL 303 ? ? CG2 V VAL 303 ? ? 121.61 110.90 10.71 1.50 N 191 1 N V LYS 306 ? ? CA V LYS 306 ? ? C V LYS 306 ? ? 90.54 111.00 -20.46 2.70 N 192 1 CB T ASP 138 ? ? CG T ASP 138 ? ? OD1 T ASP 138 ? ? 127.88 118.30 9.58 0.90 N 193 1 CB T ASP 138 ? ? CG T ASP 138 ? ? OD2 T ASP 138 ? ? 108.02 118.30 -10.28 0.90 N 194 1 NE T ARG 186 ? ? CZ T ARG 186 ? ? NH1 T ARG 186 ? ? 124.35 120.30 4.05 0.50 N 195 1 NE T ARG 186 ? ? CZ T ARG 186 ? ? NH2 T ARG 186 ? ? 116.22 120.30 -4.08 0.50 N 196 1 OE1 X GLU 41 ? ? CD X GLU 41 ? ? OE2 X GLU 41 ? ? 114.13 123.30 -9.17 1.20 N 197 1 CG X GLU 41 ? ? CD X GLU 41 ? ? OE1 X GLU 41 ? ? 132.64 118.30 14.34 2.00 N 198 1 CB X PHE 48 ? ? CG X PHE 48 ? ? CD2 X PHE 48 ? ? 116.28 120.80 -4.52 0.70 N 199 1 CB X PHE 48 ? ? CG X PHE 48 ? ? CD1 X PHE 48 ? ? 125.14 120.80 4.34 0.70 N 200 1 CB Y LYS 18 ? ? CG Y LYS 18 ? ? CD Y LYS 18 ? ? 133.42 111.60 21.82 2.60 N 201 1 CG Y ARG 83 ? ? CD Y ARG 83 ? ? NE Y ARG 83 ? ? 128.21 111.80 16.41 2.10 N 202 1 NE Y ARG 83 ? ? CZ Y ARG 83 ? ? NH1 Y ARG 83 ? ? 124.11 120.30 3.81 0.50 N 203 1 NE Y ARG 83 ? ? CZ Y ARG 83 ? ? NH2 Y ARG 83 ? ? 117.24 120.30 -3.06 0.50 N 204 1 CD Z LYS 7 ? ? CE Z LYS 7 ? ? NZ Z LYS 7 ? ? 126.89 111.70 15.19 2.30 N 205 1 CA Z GLN 9 ? ? CB Z GLN 9 ? ? CG Z GLN 9 ? ? 128.24 113.40 14.84 2.20 N 206 1 CA Z LYS 30 ? ? CB Z LYS 30 ? ? CG Z LYS 30 ? ? 129.39 113.40 15.99 2.20 N 207 1 OE1 Z GLU 33 ? ? CD Z GLU 33 ? ? OE2 Z GLU 33 ? ? 102.02 123.30 -21.28 1.20 N 208 1 CG Z GLU 33 ? ? CD Z GLU 33 ? ? OE1 Z GLU 33 ? ? 141.38 118.30 23.08 2.00 N 209 1 CG Z GLU 33 ? ? CD Z GLU 33 ? ? OE2 Z GLU 33 ? ? 98.24 118.30 -20.06 2.00 N 210 1 CB Z LEU 63 ? ? CG Z LEU 63 ? ? CD2 Z LEU 63 ? ? 125.20 111.00 14.20 1.70 N 211 1 CD Z LYS 76 ? ? CE Z LYS 76 ? ? NZ Z LYS 76 ? ? 97.76 111.70 -13.94 2.30 N 212 1 C Z ALA 84 ? ? N Z VAL 85 ? ? CA Z VAL 85 ? ? 137.12 121.70 15.42 2.50 Y 213 1 C Z VAL 85 ? ? N Z PRO 86 ? ? CD Z PRO 86 ? ? 107.14 128.40 -21.26 2.10 Y 214 1 CB Z PHE 91 ? ? CG Z PHE 91 ? ? CD2 Z PHE 91 ? ? 116.30 120.80 -4.50 0.70 N 215 1 CB Z ASP 104 ? ? CG Z ASP 104 ? ? OD1 Z ASP 104 ? ? 124.78 118.30 6.48 0.90 N 216 1 CB Z ASP 104 ? ? CG Z ASP 104 ? ? 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CG Z LEU 374 ? ? CD2 Z LEU 374 ? ? 122.73 111.00 11.73 1.70 N 229 1 N Z SER 376 ? ? CA Z SER 376 ? ? C Z SER 376 ? ? 128.19 111.00 17.19 2.70 N 230 1 CB Z LEU 430 ? ? CG Z LEU 430 ? ? CD1 Z LEU 430 ? ? 99.46 111.00 -11.54 1.70 N 231 1 CB Z TYR 441 ? ? CG Z TYR 441 ? ? CD2 Z TYR 441 ? ? 117.24 121.00 -3.76 0.60 N 232 1 OE1 Z GLU 468 ? ? CD Z GLU 468 ? ? OE2 Z GLU 468 ? ? 112.31 123.30 -10.99 1.20 N 233 1 CA Z LEU 471 ? ? CB Z LEU 471 ? ? CG Z LEU 471 ? ? 131.29 115.30 15.99 2.30 N 234 1 CB Z LEU 471 ? ? CG Z LEU 471 ? ? CD2 Z LEU 471 ? ? 100.64 111.00 -10.36 1.70 N 235 1 CB Z PHE 497 ? ? CG Z PHE 497 ? ? CD2 Z PHE 497 ? ? 115.20 120.80 -5.60 0.70 N 236 1 CB Z PHE 497 ? ? CG Z PHE 497 ? ? CD1 Z PHE 497 ? ? 125.26 120.80 4.46 0.70 N 237 1 N Z ALA 498 ? ? CA Z ALA 498 ? ? CB Z ALA 498 ? ? 98.07 110.10 -12.03 1.40 N 238 1 CA Z GLU 504 ? ? CB Z GLU 504 ? ? CG Z GLU 504 ? ? 127.03 113.40 13.63 2.20 N 239 1 CA Z GLU 557 ? ? CB Z GLU 557 ? ? CG Z GLU 557 ? ? 127.97 113.40 14.57 2.20 N 240 1 OE1 Z GLU 592 ? ? CD Z GLU 592 ? ? OE2 Z GLU 592 ? ? 115.83 123.30 -7.47 1.20 N 241 1 NE Z ARG 759 ? ? CZ Z ARG 759 ? ? NH1 Z ARG 759 ? ? 116.57 120.30 -3.73 0.50 N 242 1 NE Z ARG 759 ? ? CZ Z ARG 759 ? ? NH2 Z ARG 759 ? ? 124.26 120.30 3.96 0.50 N 243 1 N Z ASP 802 ? ? CA Z ASP 802 ? ? CB Z ASP 802 ? ? 98.11 110.60 -12.49 1.80 N 244 1 CB Z LEU 900 ? ? CG Z LEU 900 ? ? CD1 Z LEU 900 ? ? 124.07 111.00 13.07 1.70 N 245 1 CB Z TYR 902 ? ? CG Z TYR 902 ? ? CD2 Z TYR 902 ? ? 115.95 121.00 -5.05 0.60 N 246 1 CB N ASP 33 ? ? CG N ASP 33 ? ? OD1 N ASP 33 ? ? 123.97 118.30 5.67 0.90 N 247 1 CB N TYR 109 ? ? CG N TYR 109 ? ? CD2 N TYR 109 ? ? 116.96 121.00 -4.04 0.60 N 248 1 CG N LYS 146 ? ? CD N LYS 146 ? ? CE N LYS 146 ? ? 132.58 111.90 20.68 3.00 N 249 1 CD N LYS 146 ? ? CE N LYS 146 ? ? NZ N LYS 146 ? ? 91.00 111.70 -20.70 2.30 N 250 1 CB N PHE 365 ? ? CG N PHE 365 ? ? CD2 N PHE 365 ? ? 115.10 120.80 -5.70 0.70 N 251 1 CB N PHE 365 ? ? 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OD1 O ASP 88 ? ? 132.61 118.30 14.31 0.90 N 275 1 CB O ASP 88 ? ? CG O ASP 88 ? ? 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? -155.82 -46.95 266 1 GLU Z 468 ? ? 44.77 72.36 267 1 ALA Z 498 ? ? 17.20 -99.85 268 1 ALA Z 513 ? ? 82.63 16.79 269 1 THR Z 611 ? ? -146.38 -4.49 270 1 ASP Z 613 ? ? -140.60 -4.63 271 1 LEU Z 620 ? ? -138.06 -36.09 272 1 LYS Z 728 ? ? 110.81 -161.35 273 1 ASN Z 769 ? ? 60.15 64.66 274 1 GLN Z 789 ? ? 72.11 91.96 275 1 ASP Z 802 ? ? 3.91 -105.03 276 1 GLU Z 806 ? ? -122.43 -70.88 277 1 ALA Z 825 ? ? -177.10 148.94 278 1 GLU Z 841 ? ? -126.49 -96.08 279 1 GLN Z 842 ? ? -161.46 95.54 280 1 THR Z 861 ? ? -143.04 -26.08 281 1 ALA Z 870 ? ? -161.44 6.41 282 1 ALA Z 885 ? ? -146.87 23.21 283 1 LYS Z 896 ? ? -135.02 -86.51 284 1 GLN Z 899 ? ? 81.45 98.07 285 1 MET Z 903 ? ? -104.48 -162.71 286 1 LEU Z 904 ? ? -130.75 -56.72 287 1 ASN Z 926 ? ? 26.19 176.10 288 1 ALA Z 939 ? ? 81.48 -1.94 289 1 GLU Z 961 ? ? -57.36 170.37 290 1 LYS N 86 ? ? 64.72 94.11 291 1 ASP N 87 ? ? 72.81 138.06 292 1 ARG N 88 ? ? 102.07 31.29 293 1 PHE N 97 ? ? -128.07 -65.92 294 1 PHE N 123 ? ? -143.87 25.33 295 1 SER N 148 ? ? 79.11 30.00 296 1 ASP N 175 ? ? -152.16 1.46 297 1 SER N 178 ? ? -164.91 113.56 298 1 GLN N 360 ? ? -146.18 -133.58 299 1 ASN N 361 ? ? -12.60 -169.47 300 1 TRP N 362 ? ? -41.90 -16.21 301 1 ASN N 378 ? ? 68.34 65.51 302 1 ALA N 458 ? ? 70.79 34.60 303 1 MET N 489 ? ? -99.64 30.25 304 1 GLN N 529 ? ? 72.67 -46.20 305 1 GLN N 666 ? ? 41.79 75.16 306 1 ASN N 672 ? ? -172.05 121.41 307 1 ARG N 711 ? ? 61.46 66.05 308 1 TRP N 742 ? ? -167.52 111.98 309 1 GLN N 766 ? ? 64.32 74.47 310 1 TYR N 861 ? ? 177.95 151.58 311 1 MET N 871 ? ? 70.74 46.08 312 1 THR S 44 ? ? -170.41 126.21 313 1 THR S 47 ? ? -98.16 -63.57 314 1 LEU S 69 ? ? -36.80 179.43 315 1 ASP S 84 ? ? -151.00 12.15 316 1 THR S 97 ? ? 79.65 92.38 317 1 SER S 98 ? ? -44.62 154.99 318 1 HIS S 100 ? ? -141.87 -16.76 319 1 ASN S 112 ? ? 66.34 110.69 320 1 SER S 113 ? ? -13.19 123.98 321 1 ALA S 116 ? ? -150.93 1.20 322 1 PHE S 118 ? ? -144.98 32.98 323 1 THR S 131 ? ? -57.85 -9.87 324 1 LEU S 152 ? ? -143.94 -115.56 325 1 GLU S 153 ? 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? -31.86 -81.39 357 1 MET Q 68 ? ? -163.65 -144.03 358 1 ALA Q 89 ? ? 73.19 32.04 359 1 ASP Q 109 ? ? -136.01 -51.47 360 1 SER Q 110 ? ? 143.48 -165.31 361 1 GLU Q 128 ? ? -149.14 -16.31 362 1 LYS Q 149 ? ? 76.37 36.93 363 1 PHE Q 165 ? ? -109.26 43.09 364 1 TYR Q 209 ? ? -155.17 7.77 365 1 LYS Q 230 ? ? 70.47 41.71 366 1 HIS Q 252 ? ? -135.63 -42.90 367 1 TYR Q 286 ? ? -151.63 -0.89 368 1 PHE Q 386 ? ? -136.80 -47.73 369 1 TYR Q 387 ? ? 145.24 -162.68 370 1 GLN Q 405 ? ? 144.39 -166.32 371 1 SER R 36 ? ? -140.25 17.21 372 1 TYR R 70 ? ? -97.92 -90.32 373 1 LEU R 71 ? ? 45.10 115.56 374 1 VAL R 72 ? ? 10.74 27.60 375 1 SER R 77 ? ? -149.42 43.64 376 1 HIS R 81 ? ? -114.24 -154.91 377 1 GLU R 90 ? ? -143.80 -1.14 378 1 GLU R 125 ? ? 74.77 88.49 379 1 LEU R 128 ? ? -94.09 -61.08 380 1 ILE R 280 ? ? -18.12 165.61 381 1 LYS R 375 ? ? 73.21 50.35 382 1 ASN R 395 ? ? -125.51 -160.67 383 1 GLU U 6 ? ? -142.71 -44.28 384 1 GLU U 29 ? ? 71.62 58.03 385 1 ASN U 42 ? ? 88.00 22.23 386 1 TYR U 113 ? ? -132.65 -39.03 387 1 GLN U 127 ? ? 70.71 52.66 388 1 PRO U 133 ? ? -84.10 47.40 389 1 ARG U 179 ? ? 67.77 97.04 390 1 ASN U 216 ? ? -142.57 12.01 391 1 SER O 119 ? ? -145.47 10.20 392 1 ASN O 183 ? ? 71.21 40.82 393 1 ASP O 225 ? ? -140.79 -4.80 394 1 HIS O 283 ? ? -145.47 28.95 395 1 TRP O 392 ? ? -140.63 21.52 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 LEU d 100 ? ? 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L GLY 33 201 1 Y 1 l ALA 34 ? L ALA 34 202 1 Y 1 l SER 35 ? L SER 35 203 1 Y 1 l GLN 36 ? L GLN 36 204 1 Y 1 l PHE 37 ? L PHE 37 205 1 Y 1 l GLN 38 ? L GLN 38 206 1 Y 1 l ARG 39 ? L ARG 39 207 1 Y 1 l LEU 40 ? L LEU 40 208 1 Y 1 l ALA 41 ? L ALA 41 209 1 Y 1 l PRO 42 ? L PRO 42 210 1 Y 1 l SER 43 ? L SER 43 211 1 Y 1 l LEU 44 ? L LEU 44 212 1 Y 1 l THR 45 ? L THR 45 213 1 Y 1 l VAL 46 ? L VAL 46 214 1 Y 1 l PRO 47 ? L PRO 47 215 1 Y 1 l PRO 48 ? L PRO 48 216 1 Y 1 l ILE 49 ? L ILE 49 217 1 Y 1 l ALA 50 ? L ALA 50 218 1 Y 1 l SER 51 ? L SER 51 219 1 Y 1 l PRO 52 ? L PRO 52 220 1 Y 1 l GLN 53 ? L GLN 53 221 1 Y 1 l GLN 54 ? L GLN 54 222 1 Y 1 l PHE 55 ? L PHE 55 223 1 Y 1 l LEU 56 ? L LEU 56 224 1 Y 1 l ARG 57 ? L ARG 57 225 1 Y 1 l ALA 58 ? L ALA 58 226 1 Y 1 l HIS 59 ? L HIS 59 227 1 Y 1 l THR 60 ? L THR 60 228 1 Y 1 l ASP 61 ? L ASP 61 229 1 Y 1 l ASP 62 ? L ASP 62 230 1 Y 1 l SER 63 ? L SER 63 231 1 Y 1 l ARG 64 ? L ARG 64 232 1 Y 1 l ASN 65 ? L ASN 65 233 1 Y 1 l PRO 66 ? 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