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A LEU 92 A TRP 712 ? ? 1 2 2 B LEU 14 . B TRP 634 . B LEU 92 B TRP 712 ? ? 2 3 3 A LEU 14 . A ALA 635 . A LEU 92 A ALA 713 ? ? 2 4 4 C LEU 14 . C ALA 635 . C LEU 92 C ALA 713 ? ? 3 5 5 A TRP 107 . A TRP 634 . A TRP 185 A TRP 712 ? ? 3 6 6 D TRP 107 . D TRP 634 . D TRP 185 D TRP 712 ? ? 4 7 7 B LEU 14 . B ALA 635 . B LEU 92 B ALA 713 ? ? 4 8 8 C LEU 14 . C ALA 635 . C LEU 92 C ALA 713 ? ? 5 9 9 B TRP 107 . B TRP 634 . B TRP 185 B TRP 712 ? ? 5 10 10 D TRP 107 . D TRP 634 . D TRP 185 D TRP 712 ? ? 6 11 11 C TRP 107 . C TRP 634 . C TRP 185 C TRP 712 ? ? 6 12 12 D TRP 107 . D TRP 634 . D TRP 185 D TRP 712 ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 'Local NCS retraints between domains: 1 2' 2 'Local NCS retraints between domains: 3 4' 3 'Local NCS retraints between domains: 5 6' 4 'Local NCS retraints between domains: 7 8' 5 'Local NCS retraints between domains: 9 10' 6 'Local NCS retraints between domains: 11 12' # _struct.entry_id 7QQG _struct.title 'Crystal structure of MYORG bound to 1-deoxygalactonojirimycin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7QQG _struct_keywords.text 'GH31, Glycoside hydrolase, MYORG, NET37, galactosidase, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? 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'expression tag' 79 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? dimeric 2 2 author_defined_assembly ? dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,D,E,F,G,L,M,N,O,P,Y,Z,AA,BA,EA 2 1 B,C,H,I,J,K,Q,R,S,T,U,V,W,X,CA,DA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details SEC-MALLS # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 43 ? 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GLU A 570 ALA A 582 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO A 514 ? TYR A 518 ? PRO A 592 TYR A 596 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP A 519 ? LEU A 536 ? ASP A 597 LEU A 614 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU A 536 ? GLY A 552 ? LEU A 614 GLY A 630 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO A 558 ? ILE A 562 ? PRO A 636 ILE A 640 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP A 566 ? ILE A 572 ? ASP A 644 ILE A 650 1 ? 7 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP B 43 ? ASP B 45 ? ASP B 121 ASP B 123 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP B 210 ? PHE B 223 ? ASP B 288 PHE B 301 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA B 231 ? ARG B 236 ? ALA B 309 ARG B 314 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 THR B 242 ? GLY B 247 ? THR B 320 GLY B 325 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 ARG B 248 ? VAL B 250 ? ARG B 326 VAL B 328 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP B 251 ? HIS B 265 ? ASP B 329 HIS B 343 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN B 294 ? ALA B 305 ? ASN B 372 ALA B 383 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG B 323 ? GLU B 331 ? ARG B 401 GLU B 409 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 HIS B 359 ? SER B 378 ? 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GLY D 530 ARG D 532 5 ? 3 HELX_P HELX_P72 AH9 SER D 455 ? LEU D 466 ? SER D 533 LEU D 544 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 AI1 GLU D 492 ? ALA D 504 ? GLU D 570 ALA D 582 1 ? 13 HELX_P HELX_P74 AI2 PRO D 514 ? TYR D 518 ? PRO D 592 TYR D 596 5 ? 5 HELX_P HELX_P75 AI3 ASP D 519 ? LEU D 536 ? ASP D 597 LEU D 614 1 ? 18 HELX_P HELX_P76 AI4 LEU D 536 ? THR D 549 ? LEU D 614 THR D 627 1 ? 14 HELX_P HELX_P77 AI5 PRO D 558 ? ILE D 562 ? PRO D 636 ILE D 640 5 ? 5 HELX_P HELX_P78 AI6 ASP D 566 ? ILE D 572 ? ASP D 644 ILE D 650 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 47 SG ? ? ? 1_555 A CYS 56 SG ? ? A CYS 125 A CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 80 SG ? ? ? 1_555 A CYS 206 SG ? ? A CYS 158 A CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 47 SG ? ? ? 1_555 B CYS 56 SG ? ? B CYS 125 B CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 80 SG ? ? ? 1_555 B CYS 206 SG ? ? B CYS 158 B CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 47 SG ? ? ? 1_555 C CYS 56 SG ? ? C CYS 125 C CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 80 SG ? ? ? 1_555 C CYS 206 SG ? ? C CYS 158 C CYS 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? covale1 covale one ? A ASN 162 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 240 A NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 172 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 250 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 268 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 346 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 294 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 372 A NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 320 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 398 A NAG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 433 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 511 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 162 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 240 B NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 172 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 250 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 268 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 346 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 294 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 372 B NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 433 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 511 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? C ASN 162 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 240 C NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 172 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 250 C NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 268 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 346 C NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 433 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? C ASN 511 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? D ASN 268 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? D ASN 346 D NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? D ASN 320 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? D ASN 398 D NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale18 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale19 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale20 covale both ? F NAG . O6 ? ? ? 1_555 F FUC . C1 ? ? F NAG 1 F FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale21 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale22 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? ? covale23 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale24 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? covale25 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TRP 118 A . ? TRP 196 A PRO 119 A ? PRO 197 A 1 0.40 2 ASP 276 A . ? ASP 354 A MET 277 A ? MET 355 A 1 -6.89 3 THR 615 A . ? THR 693 A PRO 616 A ? 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AC6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA3 6 7 ? parallel AA3 7 8 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA8 7 8 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? parallel AA9 7 8 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB5 6 7 ? anti-parallel AB5 7 8 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB6 6 7 ? parallel AB6 7 8 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? parallel AC3 6 7 ? parallel AC3 7 8 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 15 ? 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