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The full-length transcript contains three MS2 aptamer sequences at its 3' end for affinity purification. ; 28 polymer nat 'Small nuclear ribonucleoprotein F' 9734.171 1 ? ? ? ? 29 polymer nat 'Small nuclear ribonucleoprotein E' 10817.601 1 ? ? ? ? 30 polymer nat 'Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3' 13940.308 1 ? ? ? ? 31 polymer nat 'Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1' 13310.653 1 ? ? ? ? 32 polymer nat 'Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2' 13551.928 1 ? ? ? ? 33 polymer nat 'Small nuclear ribonucleoprotein G' 8508.084 1 ? ? ? ? 34 polymer nat ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; 24642.131 1 ? ? ? ? 35 polymer nat 'Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1' 18257.805 1 5.2.1.8 ? ? ? 36 polymer nat 'Serine/arginine repetitive matrix protein 2' 300255.312 1 ? ? ? ? 37 polymer nat 'RING-type E3 ubiquitin-protein ligase PPIL2' 58910.379 1 2.3.2.27 ? ? ? 38 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 12 ? ? ? ? 39 non-polymer syn 'INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE' 660.035 1 ? ? ? ? 40 non-polymer syn "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 523.180 1 ? ? ? ? 41 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 7 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Pre-mRNA-splicing factor SF3b 130 kDa subunit,SF3b130,STAF130,Spliceosome-associated protein 130,SAP 130' 2 'SF3b5,Pre-mRNA-splicing factor SF3b 10 kDa subunit' 3 'Pre-mRNA-splicing factor SF3b 155 kDa subunit,SF3b155,Spliceosome-associated protein 155,SAP 155' 4 'PHD finger-like domain protein 5A,Splicing factor 3B-associated 14 kDa protein,SF3b14b' 5 'Pre-mRNA-splicing factor SF3b 145 kDa subunit,SF3b145,Spliceosome-associated protein 145,SAP 145' 6 'Pre-mRNA-splicing factor SF3b 49 kDa subunit,Spliceosome-associated protein 49,SAP 49' 7 'G-patch domain-containing protein 5,Protein MOS2 homolog,Protein T54' 8 'SF3a66,Spliceosome-associated protein 62,SAP 62' 9 'SF3a60,Spliceosome-associated protein 61,SAP 61' 11 'ATP-dependent RNA helicase #3,DEAH-box protein 16' 13 'Cdc5-like protein,Pombe cdc5-related protein' 15 'Protein EDG-2,Protein G10 homolog' 16 'RNA-binding motif protein 22,Zinc finger CCCH domain-containing protein 16' 17 'PPIase,Cyclophilin-like protein PPIL4,Rotamase PPIL4' 18 'Nucampholin homolog,fSAPb' 19 'Crooked neck homolog,hCrn' 20 'Nuclear protein SkiP,Nuclear receptor coactivator NCoA-62,Ski-interacting protein' 21 'Zinc finger protein 183' 22 '220 kDa U5 snRNP-specific protein,PRP8 homolog,Splicing factor Prp8,p220' 23 'Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 2,SNU114 homolog,hSNU114,U5 snRNP-specific protein,116 kDa,U5-116 kDa' 28 'snRNP-F,Sm protein F,SmF' 29 'snRNP-E,Sm protein E,SmE' 30 'Sm-D3,snRNP core protein D3' 31 'Sm-D1,Sm-D autoantigen,snRNP core protein D1' 32 'Sm-D2,snRNP core protein D2' 33 'snRNP-G,Sm protein G,SmG' 34 ;snRNP-B,Sm protein B/B',SmB/B' ; 35 'PPIase,Rotamase PPIL1' 36 ;300 kDa nuclear matrix antigen,Serine/arginine-rich splicing factor-related nuclear matrix protein of 300 kDa,Ser/Arg-related nuclear matrix protein of 300 kDa,Splicing coactivator subunit SRm300,Tax-responsive enhancer element-binding protein 803,TaxREB803 ; 37 ;CYC4,Cyclophilin-60,Cyclophilin-like protein Cyp-60,Cyp60,hCyP-60,Probable inactive peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 2,PPIase,Rotamase PPIL2 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVV GSDSGRIVILEYQPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEA HKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPG GSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFFFLAQTEQGDIFKITLETDED MVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQIAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDE 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? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAKHHPDLIFCRKQAGVAIGRLCEKCDGKCVICDSYVRPCTLVRICDECNYGSYQGRCVICGGPGVSDAYYCKECTIQEK DRDGCPKIVNLGSSKTDLFYERKKYGFKKR ; ;MAKHHPDLIFCRKQAGVAIGRLCEKCDGKCVICDSYVRPCTLVRICDECNYGSYQGRCVICGGPGVSDAYYCKECTIQEK DRDGCPKIVNLGSSKTDLFYERKKYGFKKR ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MATEHPEPPKAELQLPPPPPPGHYGAWAAQELQAKLAEIGAPIQGNREELVERLQSYTRQTGIVLNRPVLRGEDGDKAAP PPMSAQLPGIPMPPPPLGLPPLQPPPPPPPPPPGLGLGFPMAHPPNLGPPPPLRVGEPVALSEEERLKLAQQQAALLMQQ EERAKQQGDHSLKEHELLEQQKRAAVLLEQERQQEIAKMGTPVPRPPQDMGQIGVRTPLGPRVAAPVGPVGPTPTVLPMG APVPRPRGPPPPPGDENREMDDPSVGPKIPQALEKILQLKESRQEEMNSQQEEEEMETDARSSLGQSASETEEDTVSVSK KEKNRKRRNRKKKKKPQRVRGVSSESSGDREKDSTRSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEIYEPNFIFFKRIFEAFKLTDDVK KEKEKEPEKLDKLENSAAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDV TAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPK MGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPWLIAMQRYG 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'polypeptide(L)' no no ;MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEE DGEMRE ; ;MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEE DGEMRE ; h ? 29 'polypeptide(L)' no no ;MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLK GDNITLLQSVSN ; ;MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLK GDNITLLQSVSN ; i ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNA PMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR ; ;MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNA PMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR ; j ? 31 'polypeptide(L)' no no ;MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLL VDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR ; ;MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLL VDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR ; k ? 32 'polypeptide(L)' no no ;MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKS GKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK ; ;MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKS GKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK ; l ? 33 'polypeptide(L)' no no MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV m ? 34 'polypeptide(L)' no no ;MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSM TVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATAS IAGAPTQYPPGRGGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP ; ;MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSM TVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATAS IAGAPTQYPPGRGGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP ; n ? 35 'polypeptide(L)' no no ;MAAIPPDSWQPPNVYLETSMGIIVLELYWKHAPKTCKNFAELARRGYYNGTKFHRIIKDFMIQGGDPTGTGRGGASIYGK QFEDELHPDLKFTGAGILAMANAGPDTNGSQFFVTLAPTQWLDGKHTIFGRVCQGIGMVNRVGMVETNSQDRPVDDVKII KAYPSG ; ;MAAIPPDSWQPPNVYLETSMGIIVLELYWKHAPKTCKNFAELARRGYYNGTKFHRIIKDFMIQGGDPTGTGRGGASIYGK QFEDELHPDLKFTGAGILAMANAGPDTNGSQFFVTLAPTQWLDGKHTIFGRVCQGIGMVNRVGMVETNSQDRPVDDVKII KAYPSG ; p ? 36 'polypeptide(L)' no no ;MYNGIGLPTPRGSGTNGYVQRNLSLVRGRRGERPDYKGEEELRRLEAALVKRPNPDILDHERKRRVELRCLELEEMMEEQ GYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREA KQPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKS KDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPASGRRGEGDAPFSEPGTTSTQR PSSPETATKQPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPT RDRSPPKSPEKLPQSSSSESSPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKNRSHGRAKRDKSHSHTPSRR MGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRPGWSRSRNTQRRGRSRSARRG 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SSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESDSSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGS SPEVKDKPRAAPRAQSGSDSSPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKT KSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSRSSRRRRSASSPRTKTTSRRG RSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRG RSRTPPTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSR RRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSP VTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRKRSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSA SGSSSDRSRSATPPATRNHSGSRTPPVALNSSRMSCFSRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGP GPRIPDHQRTSVPENHAQSRIALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSLRTAPAANLASRIPAASAAAM NLASARTPAIPTAVNLADSRTPAAAAAMNLASPRTAVAPSAVNLADPRTPTAPAVNLAGARTPAALAALSLTGSGTPPTA ANYPSSSRTPQAPASANLVGPRSAHATAPVNIAGSRTAAALAPASLTSARMAPALSGANLTSPRVPLSAYERVSGRTSPP LLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLPPAQDQPRSPVPSAFSDQSRCLIAQTTPVAGSQSLSSGAV 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SPEVKDKPRAAPRAQSGSDSSPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKT KSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSRSSRRRRSASSPRTKTTSRRG RSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRG RSRTPPTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSR RRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSP VTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRKRSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSA SGSSSDRSRSATPPATRNHSGSRTPPVALNSSRMSCFSRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGP GPRIPDHQRTSVPENHAQSRIALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSLRTAPAANLASRIPAASAAAM NLASARTPAIPTAVNLADSRTPAAAAAMNLASPRTAVAPSAVNLADPRTPTAPAVNLAGARTPAALAALSLTGSGTPPTA ANYPSSSRTPQAPASANLVGPRSAHATAPVNIAGSRTAAALAPASLTSARMAPALSGANLTSPRVPLSAYERVSGRTSPP LLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLPPAQDQPRSPVPSAFSDQSRCLIAQTTPVAGSQSLSSGAV ATTTSSAGDHNGMLSVPAPGVPHSDVGEPPASTGAQQPSALAALQPAKERRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSS SDSEGSSLPVQPEVALKRVPSPTPAPKEAVREGRPPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS SSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGERRSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPVERRRPSPQPSPRDQQSSSSERGSR RGQRGDSRSPSHKRRRETPSPRPMRHRSSRSP ; q ? 37 'polypeptide(L)' no no ;MGKRQHQKDKMYITCAEYTHFYGGKKPDLPQTNFRRLPFDHCSLSLQPFVYPVCTPDGIVFDLLNIVPWLKKYGTNPSNG EKLDGRSLIKLNFSKNSEGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAVRTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIITLQD PTNLDKFNVSNFYHVKNNMKIIDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEILAATMKAPEKKKVDKLNAAH YSTGKVSASFTSTAMVPETTHEAAAIDEDVLRYQFVKKKGYVRLHTNKGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTI FHRSIRNFVIQGGDPTGTGTGGESYWGKPFKDEFRPNLSHTGRGILSMANSGPNSNRSQFFITFRSCAYLDKKHTIFGRV VGGFDVLTAMENVESDPKTDRPKEEIRIDATTVFVDPYEEADAQIAQERKTQLKVAPETKVKSSQPQAGSQGPQTFRQGV GKYINPAATKRAAEEEPSTSATVPMSKKKPSRGFGDFSSW ; ;MGKRQHQKDKMYITCAEYTHFYGGKKPDLPQTNFRRLPFDHCSLSLQPFVYPVCTPDGIVFDLLNIVPWLKKYGTNPSNG EKLDGRSLIKLNFSKNSEGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAVRTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIITLQD PTNLDKFNVSNFYHVKNNMKIIDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEILAATMKAPEKKKVDKLNAAH YSTGKVSASFTSTAMVPETTHEAAAIDEDVLRYQFVKKKGYVRLHTNKGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTI FHRSIRNFVIQGGDPTGTGTGGESYWGKPFKDEFRPNLSHTGRGILSMANSGPNSNRSQFFITFRSCAYLDKKHTIFGRV VGGFDVLTAMENVESDPKTDRPKEEIRIDATTVFVDPYEEADAQIAQERKTQLKVAPETKVKSSQPQAGSQGPQTFRQGV GKYINPAATKRAAEEEPSTSATVPMSKKKPSRGFGDFSSW ; u ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PHE n 1 3 LEU n 1 4 TYR n 1 5 ASN n 1 6 LEU n 1 7 THR n 1 8 LEU n 1 9 GLN n 1 10 ARG n 1 11 ALA n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 ILE n 1 15 SER n 1 16 PHE n 1 17 ALA n 1 18 ILE n 1 19 HIS n 1 20 GLY n 1 21 ASN n 1 22 PHE n 1 23 SER n 1 24 GLY n 1 25 THR n 1 26 LYS n 1 27 GLN n 1 28 GLN n 1 29 GLU n 1 30 ILE n 1 31 VAL n 1 32 VAL n 1 33 SER n 1 34 ARG n 1 35 GLY n 1 36 LYS n 1 37 ILE n 1 38 LEU n 1 39 GLU n 1 40 LEU n 1 41 LEU n 1 42 ARG n 1 43 PRO n 1 44 ASP n 1 45 PRO n 1 46 ASN n 1 47 THR n 1 48 GLY n 1 49 LYS n 1 50 VAL n 1 51 HIS n 1 52 THR n 1 53 LEU n 1 54 LEU n 1 55 THR n 1 56 VAL n 1 57 GLU n 1 58 VAL n 1 59 PHE n 1 60 GLY n 1 61 VAL n 1 62 ILE n 1 63 ARG n 1 64 SER n 1 65 LEU n 1 66 MET n 1 67 ALA n 1 68 PHE n 1 69 ARG n 1 70 LEU n 1 71 THR n 1 72 GLY n 1 73 GLY n 1 74 THR n 1 75 LYS n 1 76 ASP n 1 77 TYR n 1 78 ILE n 1 79 VAL n 1 80 VAL n 1 81 GLY n 1 82 SER n 1 83 ASP n 1 84 SER n 1 85 GLY n 1 86 ARG n 1 87 ILE n 1 88 VAL n 1 89 ILE n 1 90 LEU n 1 91 GLU n 1 92 TYR n 1 93 GLN n 1 94 PRO n 1 95 SER n 1 96 LYS n 1 97 ASN n 1 98 MET n 1 99 PHE n 1 100 GLU n 1 101 LYS n 1 102 ILE n 1 103 HIS n 1 104 GLN n 1 105 GLU n 1 106 THR n 1 107 PHE n 1 108 GLY n 1 109 LYS n 1 110 SER n 1 111 GLY n 1 112 CYS n 1 113 ARG n 1 114 ARG n 1 115 ILE n 1 116 VAL n 1 117 PRO n 1 118 GLY n 1 119 GLN n 1 120 PHE n 1 121 LEU n 1 122 ALA n 1 123 VAL n 1 124 ASP n 1 125 PRO n 1 126 LYS n 1 127 GLY n 1 128 ARG n 1 129 ALA n 1 130 VAL n 1 131 MET n 1 132 ILE n 1 133 SER n 1 134 ALA n 1 135 ILE n 1 136 GLU n 1 137 LYS n 1 138 GLN n 1 139 LYS n 1 140 LEU n 1 141 VAL n 1 142 TYR n 1 143 ILE n 1 144 LEU n 1 145 ASN n 1 146 ARG n 1 147 ASP n 1 148 ALA n 1 149 ALA n 1 150 ALA n 1 151 ARG n 1 152 LEU n 1 153 THR n 1 154 ILE n 1 155 SER n 1 156 SER n 1 157 PRO n 1 158 LEU n 1 159 GLU n 1 160 ALA n 1 161 HIS n 1 162 LYS n 1 163 ALA n 1 164 ASN n 1 165 THR n 1 166 LEU n 1 167 VAL n 1 168 TYR n 1 169 HIS n 1 170 VAL n 1 171 VAL n 1 172 GLY n 1 173 VAL n 1 174 ASP n 1 175 VAL n 1 176 GLY n 1 177 PHE n 1 178 GLU n 1 179 ASN n 1 180 PRO n 1 181 MET n 1 182 PHE n 1 183 ALA n 1 184 CYS n 1 185 LEU n 1 186 GLU n 1 187 MET n 1 188 ASP n 1 189 TYR n 1 190 GLU n 1 191 GLU n 1 192 ALA n 1 193 ASP n 1 194 ASN n 1 195 ASP n 1 196 PRO n 1 197 THR n 1 198 GLY n 1 199 GLU n 1 200 ALA n 1 201 ALA n 1 202 ALA n 1 203 ASN n 1 204 THR n 1 205 GLN n 1 206 GLN n 1 207 THR n 1 208 LEU n 1 209 THR n 1 210 PHE n 1 211 TYR n 1 212 GLU n 1 213 LEU n 1 214 ASP n 1 215 LEU n 1 216 GLY n 1 217 LEU n 1 218 ASN n 1 219 HIS n 1 220 VAL n 1 221 VAL n 1 222 ARG n 1 223 LYS n 1 224 TYR n 1 225 SER n 1 226 GLU n 1 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37 ;MGKRQHQKDKMYITCAEYTHFYGGKKPDLPQTNFRRLPFDHCSLSLQPFVYPVCTPDGIVFDLLNIVPWLKKYGTNPSNG EKLDGRSLIKLNFSKNSEGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAVRTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIITLQD PTNLDKFNVSNFYHVKNNMKIIDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEILAATMKAPEKKKVDKLNAAH YSTGKVSASFTSTAMVPETTHEAAAIDEDVLRYQFVKKKGYVRLHTNKGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTI FHRSIRNFVIQGGDPTGTGTGGESYWGKPFKDEFRPNLSHTGRGILSMANSGPNSNRSQFFITFRSCAYLDKKHTIFGRV VGGFDVLTAMENVESDPKTDRPKEEIRIDATTVFVDPYEEADAQIAQERKTQLKVAPETKVKSSQPQAGSQGPQTFRQGV GKYINPAATKRAAEEEPSTSATVPMSKKKPSRGFGDFSSW ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7QTT A 1 ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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PRO b 925 PRO b 927 5 ? 3 HELX_P HELX_P321 BJ6 HIS W 928 ? LYS W 941 ? HIS b 928 LYS b 941 1 ? 14 HELX_P HELX_P322 BJ7 PRO BA 7 ? LEU BA 14 ? PRO h 7 LEU h 14 1 ? 8 HELX_P HELX_P323 BJ8 GLN CA 16 ? ARG CA 28 ? GLN i 16 ARG i 28 1 ? 13 HELX_P HELX_P324 BJ9 PRO DA 6 ? ALA DA 13 ? PRO j 6 ALA j 13 1 ? 8 HELX_P HELX_P325 BK1 LEU EA 3 ? LEU EA 10 ? LEU k 3 LEU k 10 1 ? 8 HELX_P HELX_P326 BK2 PRO FA 28 ? THR FA 40 ? PRO l 28 THR l 40 1 ? 13 HELX_P HELX_P327 BK3 ALA IA 32 ? ARG IA 45 ? ALA p 32 ARG p 45 1 ? 14 HELX_P HELX_P328 BK4 GLY IA 135 ? MET IA 144 ? GLY p 135 MET p 144 1 ? 10 HELX_P HELX_P329 BK5 PRO JA 55 ? GLU JA 72 ? PRO q 55 GLU q 72 1 ? 18 HELX_P HELX_P330 BK6 GLY JA 81 ? GLU JA 100 ? GLY q 81 GLU q 100 1 ? 20 HELX_P HELX_P331 BK7 LEU KA 63 ? VAL KA 67 ? LEU u 63 VAL u 67 1 ? 5 HELX_P HELX_P332 BK8 TYR KA 128 ? LYS KA 137 ? TYR u 128 LYS u 137 1 ? 10 HELX_P HELX_P333 BK9 ASN KA 201 ? PHE KA 215 ? ASN u 201 PHE u 215 1 ? 15 HELX_P HELX_P334 BL1 ASP KA 234 ? ALA KA 238 ? ASP u 234 ALA u 238 5 ? 5 HELX_P HELX_P335 BL2 GLY KA 244 ? SER KA 252 ? GLY u 244 SER u 252 1 ? 9 HELX_P HELX_P336 BL3 THR KA 300 ? LYS KA 313 ? THR u 300 LYS u 313 1 ? 14 HELX_P HELX_P337 BL4 GLY KA 403 ? ASN KA 412 ? GLY u 403 ASN u 412 1 ? 10 HELX_P HELX_P338 BL5 ASP KA 436 ? THR KA 451 ? 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D CYS 72 D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc11 metalc ? ? D CYS 75 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? D CYS 75 D ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc12 metalc ? ? D CYS 85 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? D CYS 85 D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc13 metalc ? ? H CYS 56 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? I CYS 56 I ZN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc14 metalc ? ? H CYS 59 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? I CYS 59 I ZN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc15 metalc ? ? H HIS 72 NE2 ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? I HIS 72 I ZN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? metalc16 metalc ? ? H HIS 78 ND1 ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? I HIS 78 I ZN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? metalc17 metalc ? ? H HIS 78 NE2 ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? I HIS 78 I ZN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? ? metalc18 metalc ? ? I CYS 408 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? J CYS 408 J ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc19 metalc ? ? I CYS 411 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? J CYS 411 J ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc20 metalc ? ? I HIS 425 ND1 ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? J HIS 425 J ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? ? metalc21 metalc ? ? I HIS 431 ND1 ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? J HIS 431 J ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? ? metalc22 metalc ? ? O CYS 101 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? T CYS 101 T ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc23 metalc ? ? O CYS 101 SG ? ? ? 1_555 SA ZN . ZN ? ? T CYS 101 T ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc24 metalc ? ? O CYS 102 SG ? ? ? 1_555 SA ZN . ZN ? ? T CYS 102 T ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? ? metalc25 metalc ? ? O CYS 105 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? T CYS 105 T ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? ? metalc26 metalc ? ? O CYS 105 SG ? ? ? 1_555 SA ZN . ZN ? ? T CYS 105 T ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? ? metalc27 metalc ? ? O CYS 117 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? T CYS 117 T ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc28 metalc ? ? O CYS 119 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? T CYS 119 T ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc29 metalc ? ? O CYS 119 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? T CYS 119 T ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc30 metalc ? ? O CYS 134 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? T CYS 134 T ZN 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc31 metalc ? ? O CYS 137 SG ? ? ? 1_555 SA ZN . ZN ? ? T CYS 137 T ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc32 metalc ? ? O CYS 139 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? T CYS 139 T ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc33 metalc ? ? O CYS 142 SG ? ? ? 1_555 RA ZN . ZN ? ? T CYS 142 T ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? ? metalc34 metalc ? ? P CYS 24 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? U CYS 24 U ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc35 metalc ? ? P CYS 27 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? U CYS 27 U ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc36 metalc ? ? P CYS 45 SG ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? U CYS 45 U ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc37 metalc ? ? P CYS 48 SG ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? U CYS 48 U ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? ? metalc38 metalc ? ? P CYS 71 SG ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? U CYS 71 U ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc39 metalc ? ? P CYS 74 SG ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? U CYS 74 U ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc40 metalc ? ? P CYS 81 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? U CYS 81 U ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc41 metalc ? ? P CYS 84 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? U CYS 84 U ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc42 metalc ? ? P CYS 165 SG ? ? ? 1_555 VA ZN . ZN ? ? U CYS 165 U ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc43 metalc ? ? P CYS 173 SG ? ? ? 1_555 VA ZN . ZN ? ? U CYS 173 U ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc44 metalc ? ? P CYS 179 SG ? ? ? 1_555 VA ZN . ZN ? ? U CYS 179 U ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc45 metalc ? ? P HIS 183 NE2 ? ? ? 1_555 VA ZN . ZN ? ? U HIS 183 U ZN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? metalc46 metalc ? ? U CYS 202 SG ? ? ? 1_555 WA ZN . ZN ? ? Z CYS 202 Z ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.310 ? ? metalc47 metalc ? ? U CYS 211 SG ? ? ? 1_555 WA ZN . ZN ? ? Z CYS 211 Z ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc48 metalc ? ? U CYS 217 SG ? ? ? 1_555 WA ZN . ZN ? ? Z CYS 217 Z ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc49 metalc ? ? U HIS 221 NE2 ? ? ? 1_555 WA ZN . ZN ? ? Z HIS 221 Z ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? ? metalc50 metalc ? ? W THR 143 OG1 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? b THR 143 b MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? ? metalc51 metalc ? ? YA GTP . O1G ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? b GTP 1500 b MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? ? metalc52 metalc ? ? YA GTP . O3B ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? b GTP 1500 b MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? ? metalc53 metalc ? ? YA GTP . O2B ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? b GTP 1500 b MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.910 ? ? metalc54 metalc ? ? YA GTP . O3A ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? b GTP 1500 b MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? ? metalc55 metalc ? ? YA GTP . O2A ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? b GTP 1500 b MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? ? metalc56 metalc ? ? X A 48 OP1 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? d A 48 d MG 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? ? metalc57 metalc ? ? X A 53 OP1 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? d A 53 d MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? metalc58 metalc ? ? X A 53 OP2 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? d A 53 d MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.280 ? ? metalc59 metalc ? ? X G 54 OP2 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? d G 54 d MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? ? metalc60 metalc ? ? X C 55 OP1 ? ? ? 1_555 EB MG . MG ? ? d C 55 d MG 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? ? metalc61 metalc ? ? X G 71 OP1 ? ? ? 1_555 EB MG . MG ? ? d G 71 d MG 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? ? metalc62 metalc ? ? X G 72 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? d G 72 d MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? ? metalc63 metalc ? ? X U 74 OP2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? d U 74 d MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? ? metalc64 metalc ? ? X U 74 OP1 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? d U 74 d MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? ? metalc65 metalc ? ? X G 75 OP1 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? d G 75 d MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? ? metalc66 metalc ? ? X G 75 OP2 ? ? ? 1_555 DB MG . MG ? ? d G 75 d MG 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.140 ? ? hydrog1 hydrog ? ? X G 1 N1 ? ? ? 1_555 X C 19 N3 ? ? d G 1 d C 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? X G 1 N2 ? ? ? 1_555 X C 19 O2 ? ? d G 1 d C 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? X G 1 O6 ? ? ? 1_555 X C 19 N4 ? ? d G 1 d C 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? X U 2 N3 ? ? ? 1_555 X A 18 N1 ? ? d U 2 d A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? X U 2 O4 ? ? ? 1_555 X A 18 N6 ? ? d U 2 d A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? X G 3 N1 ? ? ? 1_555 X C 17 N3 ? ? d G 3 d C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? X G 3 N2 ? ? ? 1_555 X C 17 O2 ? ? d G 3 d C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? X G 3 O6 ? ? ? 1_555 X C 17 N4 ? ? d G 3 d C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? X C 4 N3 ? ? ? 1_555 X G 16 N1 ? ? d C 4 d G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? X C 4 N4 ? ? ? 1_555 X G 16 O6 ? ? d C 4 d G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? X C 4 O2 ? ? ? 1_555 X G 16 N2 ? ? d C 4 d G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? X U 5 N3 ? ? ? 1_555 X A 15 N1 ? ? d U 5 d A 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? X U 5 O4 ? ? ? 1_555 X A 15 N6 ? ? d U 5 d A 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? X G 7 N1 ? ? ? 1_555 X C 14 N3 ? ? d G 7 d C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? X G 7 N2 ? ? ? 1_555 X C 14 O2 ? ? d G 7 d C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? X G 7 O6 ? ? ? 1_555 X C 14 N4 ? ? d G 7 d C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog232 hydrog ? ? Z G 52 N1 ? ? ? 1_555 Z C 61 O2 ? ? f G 52 f C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog233 hydrog ? ? Z U 53 N3 ? ? ? 1_555 Z C 61 O2 ? ? f U 53 f C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-C MISPAIR' ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? Z U 54 O2 ? ? ? 1_555 Z A 59 N6 ? ? f U 54 f A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? Z U 54 O2 ? ? ? 1_555 Z U 60 N3 ? ? f U 54 f U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? Z C 70 N3 ? ? ? 1_555 Z G 82 N1 ? ? f C 70 f G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? Z C 70 N4 ? ? ? 1_555 Z G 82 O6 ? ? f C 70 f G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog238 hydrog ? ? Z C 70 O2 ? ? ? 1_555 Z G 82 N2 ? ? f C 70 f G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog239 hydrog ? ? Z C 70 O2 ? ? ? 1_555 Z A 83 N6 ? ? f C 70 f A 83 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog240 hydrog ? ? Z C 71 N3 ? ? ? 1_555 Z G 81 N1 ? ? f C 71 f G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 405 A . ? SER 405 A PRO 406 A ? PRO 406 A 1 -3.09 2 ASN 916 A . ? ASN 916 A PRO 917 A ? PRO 917 A 1 -1.09 3 THR 717 C . ? THR 717 C PRO 718 C ? PRO 718 C 1 0.14 4 THR 1010 C . ? 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anti-parallel AE7 4 5 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? parallel AG1 4 5 ? anti-parallel AG1 5 6 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG5 1 2 ? parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? parallel AG6 3 4 ? parallel AG6 4 5 ? parallel AG6 5 6 ? parallel AG6 6 7 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG8 3 4 ? anti-parallel AG8 4 5 ? anti-parallel AG8 5 6 ? 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? ? 6FF4 1 2 ? ? ? 6FF7 1 3 ? ? ? 5Z57 1 4 ? ? ? 6QDV # _em_3d_reconstruction.entry_id 7QTT _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 146157 _em_3d_reconstruction.resolution 3.1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'All solutions were sterile filtered using a 0.22um vacuum filtration unit.' _em_buffer.pH 7.9 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ;The spliceosome complex was assembled in vitro in the HeLa nuclear extract on a model pre-mRNA substrate (MINX) tagged with three MS2 aptamer sequences for affinity purification. ; _em_entity_assembly.name 'Late human activated spliceosome arrested with a dominant-negative mutant of the splicing helicase Aquarius (Aquarius K829A)' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list ;1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37 ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 7QTT _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 40 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7QTT _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? 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The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane. ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7QTT _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7QTT _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7QTT _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CA D CYS 46 ? ? 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KA TRP 520 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM HEPES '(4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid)' 1 2 120 mM NaCl 'Sodium Chloride' 1 3 1.5 mM 'Mg(CH3COO)2' 'Magnesium Acetate' 1 4 2 '% (w/v)' C3H8O3 Glycerol # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 45.47 _em_image_recording.average_exposure_time 9 _em_image_recording.details ;Automated data acquisition for dataset 1 (untilted, 5229 micrographs) and dataset 2 (tilted, 25 degrees, 4784 micrographs) was performed with FEI EPU software package at a nominal magnification of 130,000 (1.05 A per pixel). Micrographs for these two datasets, dose fractionated over 40 frames, were collected at a dose rate of 5.04 or 5.06 e/A2/s-1 over 9 s, resulting in a total dose of 45.38 and 45.55 e/A2, respectively. ; _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 10013 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Quantum LS' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 30 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.details ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 734691 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? Warp ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Warp ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot 0.9.6 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.1 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.1 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION 3.1 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION 3.1 1 ? ? 13 'VOLUME SELECTION' ? ? ? 1 1 1 14 'SERIES ALIGNMENT' ? ? ? 1 1 1 15 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? ? ? 1 1 1 16 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? ? ? 1 1 1 17 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 18 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 19 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.19.2_4158 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.6 _em_specimen.details ;The Baqr spliceosome was purified by affinity selection and gradient ultracentrifugation and crosslinked with 0.1% (v/v) glutaraldehyde in batch for cryo-EM grid preparation. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7QTT 'double helix' 7QTT 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 X G 1 1_555 X C 19 1_555 -0.080 -0.622 0.379 -3.303 4.760 -0.817 1 d_G1:C19_d d 1 ? d 19 ? 19 1 1 X U 2 1_555 X A 18 1_555 -0.033 -0.192 0.288 4.733 2.042 1.920 2 d_U2:A18_d d 2 ? d 18 ? 20 1 1 X G 3 1_555 X C 17 1_555 -0.124 -0.167 -0.609 -7.735 -5.819 -0.103 3 d_G3:C17_d d 3 ? d 17 ? 19 1 1 X C 4 1_555 X G 16 1_555 0.140 -0.148 -0.238 -0.557 -0.622 -0.645 4 d_C4:G16_d d 4 ? d 16 ? 19 1 1 X U 5 1_555 X A 15 1_555 0.000 -0.145 0.260 2.100 -2.263 -1.332 5 d_U5:A15_d d 5 ? d 15 ? 20 1 1 X G 7 1_555 X C 14 1_555 0.989 -0.462 -1.489 -9.424 -4.857 -4.364 6 d_G7:C14_d d 7 ? d 14 ? 19 1 1 X C 8 1_555 X G 13 1_555 0.116 -0.393 -1.150 -1.117 0.170 -0.609 7 d_C8:G13_d d 8 ? d 13 ? 19 1 1 X A 30 1_555 AA G 74 1_555 -6.614 -4.031 0.671 -15.084 3.699 4.554 8 d_A30:G16_g d 30 ? g 16 ? 11 9 1 X U 31 1_555 AA U 73 1_555 -1.929 -1.972 -0.387 4.849 6.446 -0.392 9 d_U31:U15_g d 31 ? g 15 ? 16 1 1 X U 32 1_555 AA A 72 1_555 0.026 -0.136 -0.248 4.241 -0.470 6.727 10 d_U32:A14_g d 32 ? g 14 ? 20 1 1 X G 33 1_555 AA C 71 1_555 -0.110 -0.286 -0.850 3.845 1.227 -2.432 11 d_G33:C13_g d 33 ? g 13 ? 19 1 1 X G 38 1_555 AA U 68 1_555 -0.126 -0.274 1.004 -31.309 10.784 6.477 12 d_G38:U10_g d 38 ? g 10 ? 28 1 1 X A 39 1_555 AA C 66 1_555 -1.836 0.080 -0.900 -17.554 -27.941 -28.254 13 d_A39:C8_g d 39 ? g 8 ? ? ? 1 X U 40 1_555 AA G 65 1_555 -5.422 0.652 -1.109 -17.441 -17.196 11.680 14 d_U40:G7_g d 40 ? g 7 ? ? ? 1 X A 41 1_555 AA A 64 1_555 -3.261 1.220 -1.494 -8.744 -9.317 34.539 15 d_A41:A6_g d 41 ? g 6 ? ? 1 1 X C 42 1_555 AA G 63 1_555 0.081 -0.340 -1.297 -2.515 -4.255 4.729 16 d_C42:G5_g d 42 ? g 5 ? 19 1 1 X A 43 1_555 AA A 62 1_555 6.236 -0.206 -0.507 -1.342 -3.683 46.171 17 d_A43:A4_g d 43 ? g 4 ? ? 5 1 X G 44 1_555 AA A 61 1_555 6.527 -4.151 0.744 11.485 2.476 2.208 18 d_G44:A3_g d 44 ? g 3 ? 11 9 1 X G 49 1_555 Z C 28 1_555 -0.136 -0.146 -0.552 -8.624 1.514 -1.952 19 d_G49:C28_f d 49 ? f 28 ? 19 1 1 X A 50 1_555 Z U 27 1_555 -0.054 -0.137 -0.239 -2.962 -1.236 2.898 20 d_A50:U27_f d 50 ? f 27 ? 20 1 1 X U 51 1_555 Z A 26 1_555 -0.216 0.232 -0.336 4.477 -1.107 6.336 21 d_U51:A26_f d 51 ? f 26 ? 20 1 1 X U 52 1_555 Z G 25 1_555 1.967 -0.458 -0.111 6.354 -3.149 9.874 22 d_U52:G25_f d 52 ? f 25 ? 28 1 1 X A 53 1_555 Z U 22 1_555 -0.052 -0.024 -0.228 -7.268 -6.194 1.486 23 d_A53:U22_f d 53 ? f 22 ? 20 1 1 X G 54 1_555 Z C 21 1_555 -0.203 -0.168 -0.329 -2.771 -6.253 1.602 24 d_G54:C21_f d 54 ? f 21 ? 19 1 1 X C 55 1_555 Z G 20 1_555 0.150 -0.167 -0.413 1.299 -6.103 0.964 25 d_C55:G20_f d 55 ? f 20 ? 19 1 1 X U 57 1_555 X A 78 1_555 0.047 0.357 0.036 33.130 -43.477 5.758 26 d_U57:A78_d d 57 ? d 78 ? 20 1 1 X G 58 1_555 X C 77 1_555 -0.194 -0.175 -0.163 -3.553 -5.200 -0.693 27 d_G58:C77_d d 58 ? d 77 ? 19 1 1 X G 59 1_555 X A 76 1_555 0.269 1.520 -0.473 11.159 -6.066 -22.028 28 d_G59:A76_d d 59 ? d 76 ? 8 1 1 X C 61 1_555 X G 75 1_555 0.164 -0.196 0.091 -1.997 -1.198 -1.520 29 d_C61:G75_d d 61 ? d 75 ? 19 1 1 X C 62 1_555 X G 72 1_555 0.179 -0.143 -0.223 9.095 -5.475 4.227 30 d_C62:G72_d d 62 ? d 72 ? 19 1 1 X C 63 1_555 X G 71 1_555 0.171 -0.180 -0.349 1.341 -5.003 1.232 31 d_C63:G71_d d 63 ? 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