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EMD-14244 'other EM volume' EMDB 'elongated Cascade complex from type I-A CRISPR-Cas system' EMD-14245 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7R2K _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-02-04 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hu, C.' 1 0000-0003-4509-4840 'Ni, D.' 2 0000-0002-3193-6077 'Nam, K.H.' 3 0000-0003-3268-354X 'Terns, M.' 4 ? 'Stahlberg, H.' 5 0000-0002-1185-4592 'Ke, A.' 6 0000-0001-5957-7822 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural snapshots for an atypic type I CRISPR-Cas system' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Ni, D.' 1 0000-0002-3193-6077 primary 'Hu, C.' 2 0000-0003-4509-4840 primary 'Nam, K.H.' 3 0000-0003-3268-354X primary 'Terns, M.' 4 ? primary 'Stahlberg, H.' 5 0000-0002-1185-4592 primary 'Ke, A.' 6 0000-0001-5957-7822 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7R2K _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? 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ION' 58.693 2 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 5 _entity_name_com.name 'CRISPR-associated ss-nucleic acid exo- and endonuclease Cas3-HD' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;ELTGFEPYDYQLRAWEKIREIMNNGGKVIIEVPTAGGKTETAVMPFFAGIYNNNWPVARLVYVLPTRSLVEKQAERLRNL VYKLLQLKGKSKEEAEKLARELVVVEYGLEKTHAFLGWVVVTTWDAFLYGLAAHRTVGNRFTFPAGAIAQSLVIFDEVQM YQDESMYMPRLLSLVVGILEEANVPLVIMSATIPSKLREMIAGDTEVITVDKNDKNKPSKGNVKVRLVEGDITDVLNDIK KILKNGKKVLVVRNTVRKAVETYQVLKKKLNDTLANPSDALLIHSRFTIGDRREKERALDSARLIVATQVVEAGLDLPNV GLVVTDIAPLDALIQRIGRCARRPGEEGEGIILIPVENCIEHEKIVRGLSELMEKIGEDTVVFAVVTSTNEYDRVVEIHY GEGKKNFVYVGDIDTARRVLEKKRSKKLPKDLYIIPYSVSPYPDPLVLLTTYDELSKIGEYLADTTKARKALDRVYKFHY ENNIVPKEFASAYIYFKELKLFSAPPEYEKRSRPELYVLLYPMNIEKNERVEDKVIDNLETARIIRISYSVKEWKKSDVV 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EQLSNPKDLRKLAVSLALWAFASWNNCP ; C,E,F,G,H,I,J ? 3 polydeoxyribonucleotide no no '(DT)(DA)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)' TACAAGGGA D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MYVRISGRIRLNAHSLNAQGGGGTNYIEITKTKVTVRTENGWTVVEVPAITGNMLKHWHFVGFVDYFKTTPYGVNLTERA LRYNGTRFGQGETTATKANGATVQLNDEATIIKELADADVHGFLAPKTGRRRVSLVKASFILPTEDFIKEVEGERLITAI KHNRVDVDEKGAIGSSKEGTAQMLFSREYATGLYGFSIVLDLGLVGIPQGLPVKFEENQPRPNIVIDPNERKARIESALK ALIPMLSGYIGANLARSFPVFKVEELVAIASEGPIPALVHGFYEDYIEANRSIIKNARALGFNIEVFTYNVDLGEDIEAT KVSSVEELVANLVKMV ; ;MYVRISGRIRLNAHSLNAQGGGGTNYIEITKTKVTVRTENGWTVVEVPAITGNMLKHWHFVGFVDYFKTTPYGVNLTERA LRYNGTRFGQGETTATKANGATVQLNDEATIIKELADADVHGFLAPKTGRRRVSLVKASFILPTEDFIKEVEGERLITAI KHNRVDVDEKGAIGSSKEGTAQMLFSREYATGLYGFSIVLDLGLVGIPQGLPVKFEENQPRPNIVIDPNERKARIESALK ALIPMLSGYIGANLARSFPVFKVEELVAIASEGPIPALVHGFYEDYIEANRSIIKNARALGFNIEVFTYNVDLGEDIEAT KVSSVEELVANLVKMV ; K,L,M,N,O,P,R,T,V,W ? 5 'polypeptide(L)' no no ;SCKAFQGQTLREHIEAMLAAWEIVKNKYIPSIIRVMKTVGVKFTEEDADKFMKTLIILHDVGKCSEVYQKHLSNNEPLRG 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AUUGAAAGUUGUAGUAUGCGGUCCUUGCGGCUGAGAGCACUUCAGGAGUUGCCCGCG AUUGAAAGUUGUAGUAUGCGGUCCUUGCGGCUGAGAGCACUUCAGGAGUUGCCCGCG U ? 8 polydeoxyribonucleotide no no '(DT)(DC)(DC)(DC)' TCCC X ? 9 'polypeptide(L)' no no ;FNEFKTPQIDPIFDLYVAYGYVVSLIRGGAKEATLIPHGASYLIQTDVSNEEFRHGLVDALSSMLSLHIALARHSPREGG KLVSDADFSAGANINNVYWDSVPRNLEKLMKDLEKKRSVKGTATIPITLMPSAGKYMLKHFGVQGGNPIKVDLLNYALAW VGFHYYTPYIKYAKGDTTWIHIYQIAPVEEVDMISILSLKDLKMHLPHYYESNLDFLINRRLALLYHLLHSEALELFTEK EFVIHSYTLERSGNNQAIRSFEEEEIGKLMDFLWKLKRRDFYHAIKFIDDLLKKATEGALALIDAIMNERLEGFYTALKL GKKAGVVSSREIVAALEDIIC ; ;FNEFKTPQIDPIFDLYVAYGYVVSLIRGGAKEATLIPHGASYLIQTDVSNEEFRHGLVDALSSMLSLHIALARHSPREGG KLVSDADFSAGANINNVYWDSVPRNLEKLMKDLEKKRSVKGTATIPITLMPSAGKYMLKHFGVQGGNPIKVDLLNYALAW VGFHYYTPYIKYAKGDTTWIHIYQIAPVEEVDMISILSLKDLKMHLPHYYESNLDFLINRRLALLYHLLHSEALELFTEK EFVIHSYTLERSGNNQAIRSFEEEEIGKLMDFLWKLKRRDFYHAIKFIDDLLKKATEGALALIDAIMNERLEGFYTALKL GKKAGVVSSREIVAALEDIIC ; Y ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLU n 1 2 LEU n 1 3 THR n 1 4 GLY n 1 5 PHE n 1 6 GLU n 1 7 PRO n 1 8 TYR n 1 9 ASP n 1 10 TYR n 1 11 GLN n 1 12 LEU n 1 13 ARG n 1 14 ALA n 1 15 TRP n 1 16 GLU n 1 17 LYS n 1 18 ILE n 1 19 ARG n 1 20 GLU n 1 21 ILE n 1 22 MET n 1 23 ASN n 1 24 ASN n 1 25 GLY n 1 26 GLY n 1 27 LYS n 1 28 VAL n 1 29 ILE n 1 30 ILE n 1 31 GLU n 1 32 VAL n 1 33 PRO n 1 34 THR n 1 35 ALA n 1 36 GLY n 1 37 GLY n 1 38 LYS n 1 39 THR n 1 40 GLU n 1 41 THR n 1 42 ALA n 1 43 VAL n 1 44 MET n 1 45 PRO n 1 46 PHE n 1 47 PHE n 1 48 ALA n 1 49 GLY n 1 50 ILE n 1 51 TYR n 1 52 ASN n 1 53 ASN n 1 54 ASN n 1 55 TRP n 1 56 PRO n 1 57 VAL n 1 58 ALA n 1 59 ARG n 1 60 LEU n 1 61 VAL n 1 62 TYR n 1 63 VAL n 1 64 LEU n 1 65 PRO n 1 66 THR n 1 67 ARG n 1 68 SER n 1 69 LEU n 1 70 VAL n 1 71 GLU n 1 72 LYS n 1 73 GLN n 1 74 ALA n 1 75 GLU n 1 76 ARG n 1 77 LEU n 1 78 ARG n 1 79 ASN n 1 80 LEU n 1 81 VAL n 1 82 TYR n 1 83 LYS n 1 84 LEU n 1 85 LEU n 1 86 GLN n 1 87 LEU n 1 88 LYS n 1 89 GLY n 1 90 LYS n 1 91 SER n 1 92 LYS n 1 93 GLU n 1 94 GLU n 1 95 ALA n 1 96 GLU n 1 97 LYS n 1 98 LEU n 1 99 ALA n 1 100 ARG n 1 101 GLU n 1 102 LEU n 1 103 VAL n 1 104 VAL n 1 105 VAL n 1 106 GLU n 1 107 TYR n 1 108 GLY n 1 109 LEU n 1 110 GLU n 1 111 LYS n 1 112 THR n 1 113 HIS n 1 114 ALA n 1 115 PHE n 1 116 LEU n 1 117 GLY n 1 118 TRP n 1 119 VAL n 1 120 VAL n 1 121 VAL n 1 122 THR n 1 123 THR n 1 124 TRP n 1 125 ASP n 1 126 ALA n 1 127 PHE n 1 128 LEU n 1 129 TYR n 1 130 GLY n 1 131 LEU n 1 132 ALA n 1 133 ALA n 1 134 HIS n 1 135 ARG n 1 136 THR n 1 137 VAL n 1 138 GLY n 1 139 ASN n 1 140 ARG n 1 141 PHE n 1 142 THR n 1 143 PHE n 1 144 PRO n 1 145 ALA n 1 146 GLY n 1 147 ALA n 1 148 ILE n 1 149 ALA n 1 150 GLN n 1 151 SER n 1 152 LEU n 1 153 VAL n 1 154 ILE n 1 155 PHE n 1 156 ASP n 1 157 GLU n 1 158 VAL n 1 159 GLN n 1 160 MET n 1 161 TYR n 1 162 GLN n 1 163 ASP n 1 164 GLU n 1 165 SER n 1 166 MET n 1 167 TYR n 1 168 MET n 1 169 PRO n 1 170 ARG n 1 171 LEU n 1 172 LEU n 1 173 SER n 1 174 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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 651 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 3 1 sample 1 9 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 57 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 4 ? 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