data_7RJA # _entry.id 7RJA # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.353 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7RJA pdb_00007rja 10.2210/pdb7rja/pdb WWPDB D_1000258297 ? ? EMDB EMD-24482 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-24483 'other EM volume' EMDB . EMD-24484 'other EM volume' EMDB . EMD-24485 'other EM volume' EMDB . EMD-24486 'other EM volume' EMDB 'Complex III2 from Candida albicans, inhibitor free' EMD-24482 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7RJA _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-07-20 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Di Trani, J.M.' 1 0000-0003-4764-4009 'Rubinstein, J.L.' 2 0000-0003-0566-2209 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Structure _citation.journal_id_ASTM STRUE6 _citation.journal_id_CSD 2005 _citation.journal_id_ISSN 0969-2126 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 30 _citation.language ? _citation.page_first 129 _citation.page_last ? _citation.title 'Rieske head domain dynamics and indazole-derivative inhibition of Candida albicans complex III.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.str.2021.08.006 _citation.pdbx_database_id_PubMed 34525326 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Di Trani, J.M.' 1 ? primary 'Liu, Z.' 2 ? primary 'Whitesell, L.' 3 ? primary 'Brzezinski, P.' 4 ? primary 'Cowen, L.E.' 5 ? primary 'Rubinstein, J.L.' 6 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7RJA _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7RJA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Ubiquinol--cytochrome-c reductase subunit' 48004.805 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Cytochrome b' 43738.457 2 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Ubiquinol--cytochrome-c reductase catalytic subunit' 32261.389 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 7' 14440.710 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Ubiquinol--cytochrome-c reductase subunit 8' 11125.672 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Ubiquinol--cytochrome-c reductase subunit 6' 16042.014 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Ubiquinol--cytochrome-c reductase subunit 9' 7518.448 2 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial' 23233.385 2 7.1.1.8 ? ? ? 9 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial' 39593.352 2 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' 616.487 4 ? ? ? ? 11 non-polymer syn UBIQUINONE-10 863.343 4 ? ? ? 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VCAACHSLDRIAWRNLVGVSHTTSEAKAMAEELEYDDEPDDEGKPRKRPGKLADYIPGPYENEQAARAANQGAYPPDLSL IVKARHGGSDYIFSLLTGYPDEPPAGVVLPEGSNYNPYFPGGAIAMGRVLFDDLVEYEDGTPATTSQMAKDVSTFLNWAS EPEHDDRKKWGLKALVVLSSLYLLSIWVKRFKWTPIKNRKFRFDPPKK ; D,N ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MVQSMTSVVKAANFILARPTLSKIITPLAQKFTAYAGYREMGLKFNDLLLEETPIMQTAIKRLPSELNYSRNFRILTAHQ LALSHQLLPAEKAVKPEEDDNYLIPYILEAEKEAFEKAELDNIEVKA ; ;MVQSMTSVVKAANFILARPTLSKIITPLAQKFTAYAGYREMGLKFNDLLLEETPIMQTAIKRLPSELNYSRNFRILTAHQ LALSHQLLPAEKAVKPEEDDNYLIPYILEAEKEAFEKAELDNIEVKA ; G,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAGAPHPHTYMGWWGSLGSPKQKYITQYTISPYAAKPLKGAAYNAVFNTFRRTKNQFLYVAIPFVVVWSIWTRARDYNEY LYTKEGREELERVNV ; ;MAGAPHPHTYMGWWGSLGSPKQKYITQYTISPYAAKPLKGAAYNAVFNTFRRTKNQFLYVAIPFVVVWSIWTRARDYNEY LYTKEGREELERVNV ; F,P ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSFFRDLLESVVPTAYAEEPVEDVEVEQPEDAPEEEVSEETVEEEEEDDEDDDEDDEEEEETADPLDTLREECTKTAACK PFDHHFHECIERVTKEQEEPDYEHKHYKEDCIEEFFHLQHCVNDCVAPRLFNRLK ; ;MSFFRDLLESVVPTAYAEEPVEDVEVEQPEDAPEEEVSEETVEEEEEDDEDDDEDDEEEEETADPLDTLREECTKTAACK PFDHHFHECIERVTKEQEEPDYEHKHYKEDCIEEFFHLQHCVNDCVAPRLFNRLK ; H,R ? 7 'polypeptide(L)' no no MLTVLGRLLERNSIYVATIFGGAFAFQGFFDVAVNKWWEEHNKAKLWKNVKGKFLEGEGEEEDDE MLTVLGRLLERNSIYVATIFGGAFAFQGFFDVAVNKWWEEHNKAKLWKNVKGKFLEGEGEEEDDE I,S ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MSSLAFRTLRNGLGLKSSVRALSTTTTTLSNYQQPDYSSYLNNKSGQGSRNFTYFMVGSMGLLSAAGAKSTVEAFLSSFA ASADVLAMAKVEVKLGAIPEGKNVIIKWQGKPVFIRHRTADEIEEANQVDIKTLRDPQNDADRVKKPEWLIMLGICTHLG CVPIGEAGDFGGWFCPCHGSHYDISGRIRKGPAPLNLEIPEYDFTDDETLLVG ; ;MSSLAFRTLRNGLGLKSSVRALSTTTTTLSNYQQPDYSSYLNNKSGQGSRNFTYFMVGSMGLLSAAGAKSTVEAFLSSFA ASADVLAMAKVEVKLGAIPEGKNVIIKWQGKPVFIRHRTADEIEEANQVDIKTLRDPQNDADRVKKPEWLIMLGICTHLG CVPIGEAGDFGGWFCPCHGSHYDISGRIRKGPAPLNLEIPEYDFTDDETLLVG ; C,M ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MLSRASIRAYSSIPNSVKIAAKESATDLTKLSVIINNAGSKTGKSGVSHLLSKFTFLNNGAKSALRFTRESELLGGTFES KVTRDALILNTTFLKQDLPYYVEALGNVVSNTQFAPHEFNEIVLPTANAETKLANANPAFKGVEKLHEITFRRGLGNPLF YNESTPIKLEEVAQFSKEQFSGENISIVAEGANEEDLTKFVSESAFCYLPSSSSNGAKALPTNTFTGQEARVPSSGASSA LIGIPVKPADFGKYEVLSAAIGTSTLPSTSTPLAQIPGATSHLYKYQDAGLFVISVSGEASQVAQGIKQAKSVAESVSSS ALSEAVKAAELSVALQSTVDSPLNVKVVAEEAPISKFNYVAVGDLDVLPYADEL ; ;MLSRASIRAYSSIPNSVKIAAKESATDLTKLSVIINNAGSKTGKSGVSHLLSKFTFLNNGAKSALRFTRESELLGGTFES KVTRDALILNTTFLKQDLPYYVEALGNVVSNTQFAPHEFNEIVLPTANAETKLANANPAFKGVEKLHEITFRRGLGNPLF YNESTPIKLEEVAQFSKEQFSGENISIVAEGANEEDLTKFVSESAFCYLPSSSSNGAKALPTNTFTGQEARVPSSGASSA LIGIPVKPADFGKYEVLSAAIGTSTLPSTSTPLAQIPGATSHLYKYQDAGLFVISVSGEASQVAQGIKQAKSVAESVSSS ALSEAVKAAELSVALQSTVDSPLNVKVVAEEAPISKFNYVAVGDLDVLPYADEL ; B,L ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ILE n 1 3 ARG n 1 4 GLY n 1 5 SER n 1 6 SER n 1 7 ALA n 1 8 LEU n 1 9 LYS n 1 10 SER n 1 11 LEU n 1 12 THR n 1 13 SER n 1 14 ARG n 1 15 ARG n 1 16 LEU n 1 17 TYR n 1 18 SER n 1 19 THR n 1 20 GLY n 1 21 VAL n 1 22 LYS n 1 23 TYR n 1 24 THR n 1 25 THR n 1 26 LEU n 1 27 SER n 1 28 ASN n 1 29 GLY n 1 30 VAL n 1 31 THR n 1 32 VAL n 1 33 ALA n 1 34 THR n 1 35 GLU n 1 36 THR n 1 37 ASN n 1 38 PRO n 1 39 ALA n 1 40 ALA n 1 41 LYS n 1 42 THR n 1 43 SER n 1 44 SER n 1 45 VAL n 1 46 GLY n 1 47 LEU n 1 48 PHE n 1 49 PHE n 1 50 GLY n 1 51 ALA n 1 52 GLY n 1 53 SER n 1 54 ARG n 1 55 SER n 1 56 GLU n 1 57 HIS n 1 58 SER n 1 59 HIS n 1 60 SER n 1 61 ASN n 1 62 GLY n 1 63 ILE n 1 64 SER n 1 65 ALA n 1 66 LEU n 1 67 THR n 1 68 THR n 1 69 ASN n 1 70 VAL n 1 71 LEU n 1 72 ALA n 1 73 SER n 1 74 GLN n 1 75 SER n 1 76 ALA n 1 77 LYS n 1 78 GLY n 1 79 SER n 1 80 LEU n 1 81 LEU n 1 82 THR n 1 83 ALA n 1 84 LYS n 1 85 ASN n 1 86 ASP n 1 87 ARG n 1 88 GLU n 1 89 PHE n 1 90 ASN n 1 91 GLY n 1 92 ILE n 1 93 ILE n 1 94 ALA n 1 95 GLN n 1 96 THR n 1 97 THR n 1 98 ASN n 1 99 ASP n 1 100 ASN n 1 101 ILE n 1 102 THR n 1 103 GLU n 1 104 ALA n 1 105 GLY n 1 106 LYS n 1 107 LEU n 1 108 ILE n 1 109 ALA n 1 110 SER n 1 111 ILE n 1 112 ALA n 1 113 SER n 1 114 ASN n 1 115 ALA n 1 116 VAL n 1 117 ASP n 1 118 ILE n 1 119 VAL n 1 120 GLU n 1 121 LYS n 1 122 THR n 1 123 ASP n 1 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ASP n 1 208 ALA n 1 209 ILE n 1 210 GLU n 1 211 ALA n 1 212 ASN n 1 213 LEU n 1 214 LYS n 1 215 ILE n 1 216 ALA n 1 217 GLU n 1 218 GLY n 1 219 VAL n 1 220 LYS n 1 221 PRO n 1 222 GLU n 1 223 ILE n 1 224 LYS n 1 225 PRO n 1 226 ALA n 1 227 SER n 1 228 PHE n 1 229 LEU n 1 230 GLY n 1 231 SER n 1 232 GLU n 1 233 VAL n 1 234 ARG n 1 235 MET n 1 236 ARG n 1 237 ASP n 1 238 ASP n 1 239 THR n 1 240 LEU n 1 241 PRO n 1 242 LYS n 1 243 ALA n 1 244 TYR n 1 245 ILE n 1 246 SER n 1 247 ILE n 1 248 ALA n 1 249 VAL n 1 250 HIS n 1 251 GLY n 1 252 GLU n 1 253 GLY n 1 254 LEU n 1 255 ASN n 1 256 SER n 1 257 PRO n 1 258 ASN n 1 259 TYR n 1 260 TYR n 1 261 LEU n 1 262 ALA n 1 263 LYS n 1 264 VAL n 1 265 ALA n 1 266 ALA n 1 267 ALA n 1 268 ILE n 1 269 TYR n 1 270 GLY n 1 271 ASP n 1 272 PHE n 1 273 TYR n 1 274 LEU n 1 275 HIS n 1 276 SER n 1 277 THR n 1 278 ILE n 1 279 ALA n 1 280 LYS n 1 281 PHE n 1 282 THR n 1 283 SER n 1 284 PRO n 1 285 LYS n 1 286 LEU n 1 287 ALA n 1 288 SER n 1 289 ILE n 1 290 VAL 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SER Q 4 ARG Q 18 1 ? 15 HELX_P HELX_P145 AQ1 ARG M 18 ? ALA M 36 ? ARG Q 18 ALA Q 36 1 ? 19 HELX_P HELX_P146 AQ2 TYR M 38 ? GLY M 42 ? TYR Q 38 GLY Q 42 5 ? 5 HELX_P HELX_P147 AQ3 LYS M 44 ? LEU M 49 ? LYS Q 44 LEU Q 49 1 ? 6 HELX_P HELX_P148 AQ4 THR M 53 ? ARG M 62 ? THR Q 53 ARG Q 62 1 ? 10 HELX_P HELX_P149 AQ5 PRO M 64 ? HIS M 85 ? PRO Q 64 HIS Q 85 1 ? 22 HELX_P HELX_P150 AQ6 LEU M 103 ? ASN M 122 ? LEU Q 103 ASN Q 122 1 ? 20 HELX_P HELX_P151 AQ7 PRO N 32 ? ALA N 35 ? PRO P 32 ALA P 35 5 ? 4 HELX_P HELX_P152 AQ8 GLY N 40 ? TYR N 82 ? GLY P 40 TYR P 82 1 ? 43 HELX_P HELX_P153 AQ9 THR N 83 ? GLU N 85 ? THR P 83 GLU P 85 5 ? 3 HELX_P HELX_P154 AR1 GLY N 86 ? VAL N 93 ? GLY P 86 VAL P 93 1 ? 8 HELX_P HELX_P155 AR2 ASP O 64 ? LYS O 75 ? ASP R 64 LYS R 75 1 ? 12 HELX_P HELX_P156 AR3 CYS O 79 ? GLU O 99 ? CYS R 79 GLU R 99 1 ? 21 HELX_P HELX_P157 AR4 PRO O 100 ? LYS O 105 ? PRO R 100 LYS R 105 5 ? 6 HELX_P HELX_P158 AR5 CYS O 111 ? PHE O 131 ? 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TYR L 370 LEU L 374 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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