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EMDB EMD-24712 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2022-03-30 2 'Structure model' 1 1 2022-04-13 3 'Structure model' 1 2 2022-04-27 4 'Structure model' 1 3 2024-06-05 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' citation 4 4 'Structure model' chem_comp_atom 5 4 'Structure model' chem_comp_bond 6 4 'Structure model' em_3d_fitting_list 7 4 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 2 2 'Structure model' '_citation.title' 3 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 4 3 'Structure model' '_citation.page_first' 5 3 'Structure model' '_citation.page_last' 6 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.accession_code' 7 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id' 8 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.source_name' 9 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.type' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7RWA _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-08-19 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-24710 'other EM volume' EMDB . 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'purified with a C-terminal GST tag, removed with PreScission Protease' 2 polymer man 'AP-2 complex subunit beta' 66953.195 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'AP-2 complex subunit mu' 49726.641 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'AP-2 complex subunit sigma' 17038.688 2 ? ? ? ? 5 polymer syn 'Trans-Golgi network integral membrane protein TGN38 peptide' 1810.152 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;100 kDa coated vesicle protein C,Adaptor protein complex AP-2 subunit alpha-2,Adaptor-related protein complex 2 subunit alpha-2,Alpha-adaptin C,Alpha2-adaptin,Clathrin assembly protein complex 2 alpha-C large chain,Plasma membrane adaptor HA2/AP2 adaptin alpha C subunit ; 2 ;AP105B,Adaptor protein complex AP-2 subunit beta,Adaptor-related protein complex 2 subunit beta,Beta-2-adaptin,Beta-adaptin,Clathrin assembly protein complex 2 beta large chain,Plasma membrane adaptor HA2/AP2 adaptin beta subunit ; 3 ;AP-2 mu chain,Adaptor protein complex AP-2 subunit mu,Adaptor-related protein 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KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFNLLHSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKATIQ DVLRSDSQLKNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGGSGLEVLFQ ; A,a ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQ PDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQG FLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQE IKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQ TKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEVVLSEKPLISEETDLIEPTLL DELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRK ; ;MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQ PDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQG FLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQE IKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQ TKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEVVLSEKPLISEETDLIEPTLL DELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRK ; B,b ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFE FLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIG WRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQS IAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKI EVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLK VRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC ; ;MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFE FLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIG WRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQS IAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKI EVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLK VRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC ; M,m ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MIRFILIQNRAGKTRLAKWYMQFDDDEKQKLIEEVHAVVTVRDAKHTNFVEFRNFKIIYRRYAGLYFCICVDVNDNNLAY LEAIHNFVEVLNEYFHNVCELDLVFNFYKVYTVVDEMFLAGEIRETSQTKVLKQLLMLQSLE ; ;MIRFILIQNRAGKTRLAKWYMQFDDDEKQKLIEEVHAVVTVRDAKHTNFVEFRNFKIIYRRYAGLYFCICVDVNDNNLAY LEAIHNFVEVLNEYFHNVCELDLVFNFYKVYTVVDEMFLAGEIRETSQTKVLKQLLMLQSLE ; S,s ? 5 'polypeptide(L)' no no CKVTRRPKAADYQRL CKVTRRPKAADYQRL Y,y ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PRO n 1 3 ALA n 1 4 VAL n 1 5 SER n 1 6 LYS n 1 7 GLY n 1 8 ASP n 1 9 GLY n 1 10 MET n 1 11 ARG n 1 12 GLY n 1 13 LEU n 1 14 ALA n 1 15 VAL n 1 16 PHE n 1 17 ILE n 1 18 SER n 1 19 ASP n 1 20 ILE n 1 21 ARG n 1 22 ASN n 1 23 CYS n 1 24 LYS n 1 25 SER n 1 26 LYS n 1 27 GLU n 1 28 ALA n 1 29 GLU n 1 30 ILE n 1 31 LYS n 1 32 ARG n 1 33 ILE n 1 34 ASN n 1 35 LYS n 1 36 GLU n 1 37 LEU n 1 38 ALA n 1 39 ASN n 1 40 ILE n 1 41 ARG n 1 42 SER n 1 43 LYS n 1 44 PHE n 1 45 LYS n 1 46 GLY n 1 47 ASP n 1 48 LYS n 1 49 ALA n 1 50 LEU n 1 51 ASP n 1 52 GLY n 1 53 TYR n 1 54 SER n 1 55 LYS n 1 56 LYS n 1 57 LYS n 1 58 TYR n 1 59 VAL n 1 60 CYS n 1 61 LYS n 1 62 LEU n 1 63 LEU n 1 64 PHE n 1 65 ILE n 1 66 PHE n 1 67 LEU n 1 68 LEU n 1 69 GLY n 1 70 HIS n 1 71 ASP n 1 72 ILE n 1 73 ASP n 1 74 PHE n 1 75 GLY n 1 76 HIS n 1 77 MET n 1 78 GLU n 1 79 ALA n 1 80 VAL n 1 81 ASN n 1 82 LEU n 1 83 LEU n 1 84 SER n 1 85 SER n 1 86 ASN n 1 87 ARG n 1 88 TYR n 1 89 THR n 1 90 GLU n 1 91 LYS n 1 92 GLN n 1 93 ILE n 1 94 GLY n 1 95 TYR n 1 96 LEU n 1 97 PHE n 1 98 ILE n 1 99 SER n 1 100 VAL n 1 101 LEU n 1 102 VAL n 1 103 ASN n 1 104 SER n 1 105 ASN n 1 106 SER n 1 107 GLU n 1 108 LEU n 1 109 ILE n 1 110 ARG n 1 111 LEU n 1 112 ILE n 1 113 ASN n 1 114 ASN n 1 115 ALA n 1 116 ILE n 1 117 LYS n 1 118 ASN n 1 119 ASP n 1 120 LEU n 1 121 ALA n 1 122 SER n 1 123 ARG n 1 124 ASN n 1 125 PRO n 1 126 THR n 1 127 PHE n 1 128 MET n 1 129 GLY n 1 130 LEU n 1 131 ALA n 1 132 LEU n 1 133 HIS n 1 134 CYS n 1 135 ILE n 1 136 ALA n 1 137 ASN n 1 138 VAL n 1 139 GLY n 1 140 SER n 1 141 ARG n 1 142 GLU n 1 143 MET n 1 144 ALA n 1 145 GLU n 1 146 ALA n 1 147 PHE n 1 148 ALA n 1 149 GLY n 1 150 GLU n 1 151 ILE n 1 152 PRO n 1 153 LYS n 1 154 ILE n 1 155 LEU n 1 156 VAL n 1 157 ALA n 1 158 GLY n 1 159 ASP n 1 160 THR n 1 161 MET n 1 162 ASP n 1 163 SER n 1 164 VAL n 1 165 LYS n 1 166 GLN n 1 167 SER n 1 168 ALA n 1 169 ALA n 1 170 LEU n 1 171 CYS n 1 172 LEU n 1 173 LEU n 1 174 ARG n 1 175 LEU n 1 176 TYR n 1 177 ARG n 1 178 THR n 1 179 SER n 1 180 PRO n 1 181 ASP n 1 182 LEU n 1 183 VAL n 1 184 PRO n 1 185 MET n 1 186 GLY n 1 187 ASP n 1 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sing N N 346 TYR CD2 CE2 doub Y N 347 TYR CD2 HD2 sing N N 348 TYR CE1 CZ doub Y N 349 TYR CE1 HE1 sing N N 350 TYR CE2 CZ sing Y N 351 TYR CE2 HE2 sing N N 352 TYR CZ OH sing N N 353 TYR OH HH sing N N 354 TYR OXT HXT sing N N 355 VAL N CA sing N N 356 VAL N H sing N N 357 VAL N H2 sing N N 358 VAL CA C sing N N 359 VAL CA CB sing N N 360 VAL CA HA sing N N 361 VAL C O doub N N 362 VAL C OXT sing N N 363 VAL CB CG1 sing N N 364 VAL CB CG2 sing N N 365 VAL CB HB sing N N 366 VAL CG1 HG11 sing N N 367 VAL CG1 HG12 sing N N 368 VAL CG1 HG13 sing N N 369 VAL CG2 HG21 sing N N 370 VAL CG2 HG22 sing N N 371 VAL CG2 HG23 sing N N 372 VAL OXT HXT sing N N 373 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C8H18N2O4S HEPES 1 2 150 mM NaCl 'Sodium Chloride' 1 3 0.05 % C14H28O6 n-octyl-beta-d-glucoside # _em_ctf_correction.id 1 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