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UNP Q79PF4 SER 431 'engineered mutation' 431 5 3 7S66 ALA C 432 ? UNP Q79PF4 THR 432 'engineered mutation' 432 6 4 7S66 GLU D 431 ? UNP Q79PF4 SER 431 'engineered mutation' 431 7 4 7S66 ALA D 432 ? UNP Q79PF4 THR 432 'engineered mutation' 432 8 5 7S66 GLU E 431 ? UNP Q79PF4 SER 431 'engineered mutation' 431 9 5 7S66 ALA E 432 ? UNP Q79PF4 THR 432 'engineered mutation' 432 10 6 7S66 GLU F 431 ? UNP Q79PF4 SER 431 'engineered mutation' 431 11 6 7S66 ALA F 432 ? UNP Q79PF4 THR 432 'engineered mutation' 432 12 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 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B ATP 901 B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.822 ? ? metalc11 metalc ? ? M ATP . O2G ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? B ATP 903 B MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc12 metalc ? ? M ATP . O1B ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? B ATP 903 B MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc13 metalc ? ? C THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? C THR 53 C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.771 ? ? metalc14 metalc ? ? C THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? C THR 295 C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? metalc15 metalc ? ? O ATP . O1G ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? C ATP 901 C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? ? metalc16 metalc ? ? O ATP . O3B ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? C ATP 901 C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? ? metalc17 metalc ? ? Q ATP . O2G ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? C ATP 903 C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc18 metalc ? ? Q ATP . O1B ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? C ATP 903 C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc19 metalc ? ? D THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? 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E ATP 901 E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? ? metalc29 metalc ? ? Y ATP . O2G ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? E ATP 903 E MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc30 metalc ? ? Y ATP . O1B ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? E ATP 903 E MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc31 metalc ? ? F THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? F THR 53 F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.770 ? ? metalc32 metalc ? ? F THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F THR 295 F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? metalc33 metalc ? ? AA ATP . O1G ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F ATP 901 F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? ? metalc34 metalc ? ? AA ATP . O3B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F ATP 901 F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? ? metalc35 metalc ? ? CA ATP . O2G ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? F ATP 903 F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc36 metalc ? ? CA ATP . O1B ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? F ATP 903 F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 9 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 9 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 9 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 9 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 9 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 9 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 9 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 9 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 9 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 9 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 9 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 9 ? AD3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA2 8 9 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA4 8 9 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA7 8 9 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? anti-parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AA9 8 9 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB3 6 7 ? anti-parallel AB3 7 8 ? anti-parallel AB3 8 9 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB5 6 7 ? anti-parallel AB5 7 8 ? anti-parallel AB5 8 9 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? parallel AB8 5 6 ? parallel AB8 6 7 ? anti-parallel AB8 7 8 ? anti-parallel AB8 8 9 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC1 6 7 ? anti-parallel AC1 7 8 ? anti-parallel AC1 8 9 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC4 6 7 ? anti-parallel AC4 7 8 ? anti-parallel AC4 8 9 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? parallel AC6 6 7 ? anti-parallel AC6 7 8 ? anti-parallel AC6 8 9 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? parallel AC9 6 7 ? anti-parallel AC9 7 8 ? anti-parallel AC9 8 9 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD2 5 6 ? parallel AD2 6 7 ? anti-parallel AD2 7 8 ? anti-parallel AD2 8 9 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 20 ? 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THR B 409 THR B 415 AA9 5 ILE B 283 ? GLY B 288 ? ILE B 283 GLY B 288 AA9 6 THR B 436 ? ILE B 445 ? THR B 436 ILE B 445 AA9 7 GLU B 448 ? MET B 458 ? GLU B 448 MET B 458 AA9 8 ARG B 468 ? SER B 473 ? ARG B 468 SER B 473 AA9 9 GLY B 476 ? SER B 482 ? GLY B 476 SER B 482 AB1 1 PHE B 486 ? GLU B 487 ? PHE B 486 GLU B 487 AB1 2 THR B 495 ? ARG B 496 ? THR B 495 ARG B 496 AB2 1 LYS C 20 ? MET C 21 ? LYS C 20 MET C 21 AB2 2 LEU C 36 ? PRO C 37 ? LEU C 36 PRO C 37 AB3 1 LEU C 103 ? ASP C 107 ? LEU C 103 ASP C 107 AB3 2 GLY C 71 ? THR C 75 ? GLY C 71 THR C 75 AB3 3 ARG C 141 ? ILE C 144 ? ARG C 141 ILE C 144 AB3 4 THR C 177 ? THR C 181 ? THR C 177 THR C 181 AB3 5 SER C 41 ? GLY C 46 ? SER C 41 GLY C 46 AB3 6 ASN C 203 ? GLU C 212 ? ASN C 203 GLU C 212 AB3 7 ARG C 215 ? LEU C 225 ? ARG C 215 LEU C 225 AB3 8 GLU C 234 ? THR C 240 ? GLU C 234 THR C 240 AB3 9 GLY C 243 ? ILE C 246 ? GLY C 243 ILE C 246 AB4 1 ARG C 262 ? VAL C 263 ? ARG C 262 VAL C 263 AB4 2 PHE C 278 ? PHE C 279 ? 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C-flat ? ? # loop_ _em_vitrification.id _em_vitrification.specimen_id _em_vitrification.chamber_temperature _em_vitrification.cryogen_name _em_vitrification.details _em_vitrification.humidity _em_vitrification.instrument _em_vitrification.entry_id _em_vitrification.citation_id _em_vitrification.method _em_vitrification.temp _em_vitrification.time_resolved_state 1 1 277.15 ETHANE ;Grids with applied sample were manually blotted with filter paper (Whatman No.1) for 3 seconds in a 4 C cold room before plunge freezing in liquid ethane cooled by liquid nitrogen. ; 95 'HOMEMADE PLUNGER' 7S66 ? ? ? ? 2 2 277.15 ETHANE ;Grids with applied sample were manually blotted with filter paper (Whatman No.1) for 3 seconds in a 4 C cold room before plunge freezing in liquid ethane cooled by liquid nitrogen. ; 95 'HOMEMADE PLUNGER' 7S66 ? ? ? ? # _em_experiment.entry_id 7S66 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7S66 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C6 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 N A GLY 291 ? ? 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D MET 6 109 1 Y 1 D THR 7 ? D THR 7 110 1 Y 1 D SER 8 ? D SER 8 111 1 Y 1 D PRO 9 ? D PRO 9 112 1 Y 1 D ASN 10 ? D ASN 10 113 1 Y 1 D ASN 11 ? D ASN 11 114 1 Y 1 D ASN 12 ? D ASN 12 115 1 Y 1 D SER 13 ? D SER 13 116 1 Y 1 D VAL 499 ? D VAL 499 117 1 Y 1 D ASP 500 ? D ASP 500 118 1 Y 1 D GLU 501 ? D GLU 501 119 1 Y 1 D LYS 502 ? D LYS 502 120 1 Y 1 D SER 503 ? D SER 503 121 1 Y 1 D GLU 504 ? D GLU 504 122 1 Y 1 D LEU 505 ? D LEU 505 123 1 Y 1 D SER 506 ? D SER 506 124 1 Y 1 D ARG 507 ? D ARG 507 125 1 Y 1 D ILE 508 ? D ILE 508 126 1 Y 1 D VAL 509 ? D VAL 509 127 1 Y 1 D ARG 510 ? D ARG 510 128 1 Y 1 D GLY 511 ? D GLY 511 129 1 Y 1 D VAL 512 ? D VAL 512 130 1 Y 1 D GLN 513 ? D GLN 513 131 1 Y 1 D GLU 514 ? D GLU 514 132 1 Y 1 D LYS 515 ? D LYS 515 133 1 Y 1 D GLY 516 ? D GLY 516 134 1 Y 1 D PRO 517 ? D PRO 517 135 1 Y 1 D GLU 518 ? D GLU 518 136 1 Y 1 D SER 519 ? D SER 519 137 1 Y 1 E MET 1 ? E MET 1 138 1 Y 1 E THR 2 ? E THR 2 139 1 Y 1 E SER 3 ? E SER 3 140 1 Y 1 E ALA 4 ? E ALA 4 141 1 Y 1 E GLU 5 ? E GLU 5 142 1 Y 1 E MET 6 ? E MET 6 143 1 Y 1 E THR 7 ? E THR 7 144 1 Y 1 E SER 8 ? E SER 8 145 1 Y 1 E PRO 9 ? E PRO 9 146 1 Y 1 E ASN 10 ? E ASN 10 147 1 Y 1 E ASN 11 ? E ASN 11 148 1 Y 1 E ASN 12 ? E ASN 12 149 1 Y 1 E SER 13 ? E SER 13 150 1 Y 1 E VAL 499 ? E VAL 499 151 1 Y 1 E ASP 500 ? E ASP 500 152 1 Y 1 E GLU 501 ? E GLU 501 153 1 Y 1 E LYS 502 ? E LYS 502 154 1 Y 1 E SER 503 ? E SER 503 155 1 Y 1 E GLU 504 ? E GLU 504 156 1 Y 1 E LEU 505 ? E LEU 505 157 1 Y 1 E SER 506 ? E SER 506 158 1 Y 1 E ARG 507 ? E ARG 507 159 1 Y 1 E ILE 508 ? E ILE 508 160 1 Y 1 E VAL 509 ? E VAL 509 161 1 Y 1 E ARG 510 ? E ARG 510 162 1 Y 1 E GLY 511 ? E GLY 511 163 1 Y 1 E VAL 512 ? E VAL 512 164 1 Y 1 E GLN 513 ? E GLN 513 165 1 Y 1 E GLU 514 ? E GLU 514 166 1 Y 1 E LYS 515 ? E LYS 515 167 1 Y 1 E GLY 516 ? E GLY 516 168 1 Y 1 E PRO 517 ? E PRO 517 169 1 Y 1 E GLU 518 ? E GLU 518 170 1 Y 1 E SER 519 ? E SER 519 171 1 Y 1 F MET 1 ? F MET 1 172 1 Y 1 F THR 2 ? F THR 2 173 1 Y 1 F SER 3 ? F SER 3 174 1 Y 1 F ALA 4 ? F ALA 4 175 1 Y 1 F GLU 5 ? F GLU 5 176 1 Y 1 F MET 6 ? F MET 6 177 1 Y 1 F THR 7 ? F THR 7 178 1 Y 1 F SER 8 ? F SER 8 179 1 Y 1 F PRO 9 ? F PRO 9 180 1 Y 1 F ASN 10 ? F ASN 10 181 1 Y 1 F ASN 11 ? F ASN 11 182 1 Y 1 F ASN 12 ? F ASN 12 183 1 Y 1 F SER 13 ? F SER 13 184 1 Y 1 F VAL 499 ? F VAL 499 185 1 Y 1 F ASP 500 ? F ASP 500 186 1 Y 1 F GLU 501 ? F GLU 501 187 1 Y 1 F LYS 502 ? F LYS 502 188 1 Y 1 F SER 503 ? F SER 503 189 1 Y 1 F GLU 504 ? F GLU 504 190 1 Y 1 F LEU 505 ? F LEU 505 191 1 Y 1 F SER 506 ? F SER 506 192 1 Y 1 F ARG 507 ? F ARG 507 193 1 Y 1 F ILE 508 ? F ILE 508 194 1 Y 1 F VAL 509 ? F VAL 509 195 1 Y 1 F ARG 510 ? F ARG 510 196 1 Y 1 F GLY 511 ? F GLY 511 197 1 Y 1 F VAL 512 ? F VAL 512 198 1 Y 1 F GLN 513 ? F GLN 513 199 1 Y 1 F GLU 514 ? F GLU 514 200 1 Y 1 F LYS 515 ? F LYS 515 201 1 Y 1 F GLY 516 ? F GLY 516 202 1 Y 1 F PRO 517 ? F PRO 517 203 1 Y 1 F GLU 518 ? F GLU 518 204 1 Y 1 F SER 519 ? F SER 519 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C4H11NO3 Tris 1 2 150 mM NaCl 'Sodium chloride' 1 3 1 mM C10H16N5O13P3 'Adenosine triphosphate' 1 4 1 mM MgCl2 'Magnesium chloride' 1 5 1 mM C9H15O6P TCEP 2 6 20 mM C4H11NO3 Tris 2 7 150 mM NaCl 'Sodium chloride' 2 8 1 mM C10H16N5O13P3 'Adenosine triphosphate' 2 9 1 mM C9H15O6P TCEP 2 10 1 mM MgCl2 'Magnesium chloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details 'CTF Refinement performed in Relion' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.350 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 32046 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Synechococcus elongatus' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 866768 _em_entity_assembly_recombinant.organism ;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ; _em_entity_assembly_recombinant.plasmid pET-28b _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # loop_ _em_image_recording.id _em_image_recording.imaging_id _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image _em_image_recording.average_exposure_time _em_image_recording.details _em_image_recording.detector_mode _em_image_recording.film_or_detector_model _em_image_recording.num_diffraction_images _em_image_recording.num_grids_imaged _em_image_recording.num_real_images 1 1 48 8 'Tilted dataset' COUNTING 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' ? 1 1137 2 2 51 9 'Thin carbon dataset' COUNTING 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' ? 1 8405 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 2016826 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? RELION 3.0 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'MODEL REFINEMENT' ? Coot ? ? 1 ? 11 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 12 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 14 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon ? ? ? 2 15 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0 1 ? ? 16 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 17 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0 1 ? ? 18 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 19 CLASSIFICATION ? RELION 3.0 1 ? ? 20 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 21 RECONSTRUCTION ? RELION 3.0 1 ? ? 22 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # loop_ _em_specimen.id _em_specimen.experiment_id _em_specimen.concentration _em_specimen.details _em_specimen.embedding_applied _em_specimen.shadowing_applied _em_specimen.staining_applied _em_specimen.vitrification_applied 1 1 1.5 'Specimen was imaged at a 40 degree tilt.' NO NO NO YES 2 1 0.2 ;Sample was applied to holey C-flat grids, which previously had thin carbon floated on them. Grids were also pretreated with 0.1 % (w/v) poly-L-lysine hydrobromine (Polysciences). ; NO NO NO YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute on Aging (NIH/NIA)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number R21GM142196 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 ATP ? ? ATP ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 MG ? ? MG ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 2 "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ATP 3 'MAGNESIUM ION' MG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #