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EMD-24874 'other EM volume' EMDB 'CryoEM structure of modular PKS holo-Lsd14 bound to antibody fragment 1B2, composite structure' EMD-24875 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7S6D _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-09-13 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Bagde, S.R.' 1 0000-0001-9800-9326 'Kim, C.-Y.' 2 0000-0003-3744-7802 'Fromme, J.C.' 3 0000-0002-8837-0473 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? 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;LFAIPLVVPFYSHSALDVVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLLHSNGYNYLDWYLQKPGQSPQLLIYLGSNRASGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQSLQTPRLTFGPGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNN FYPRGAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;LFAIPLVVPFYSHSALDVVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLLHSNGYNYLDWYLQKPGQSPQLLIYLGSNRASGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQSLQTPRLTFGPGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNN FYPRGAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; G,F ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 VAL n 1 3 THR n 1 4 ASP n 1 5 SER n 1 6 GLU n 1 7 LYS n 1 8 VAL n 1 9 ALA n 1 10 GLU n 1 11 TYR n 1 12 LEU n 1 13 ARG n 1 14 ARG n 1 15 ALA n 1 16 THR n 1 17 LEU n 1 18 ASP n 1 19 LEU n 1 20 ARG n 1 21 ALA n 1 22 ALA n 1 23 ARG n 1 24 GLN n 1 25 ARG n 1 26 ILE n 1 27 ARG n 1 28 GLU n 1 29 LEU n 1 30 GLU n 1 31 SER n 1 32 GLU n 1 33 PRO n 1 34 ILE n 1 35 ALA n 1 36 ILE n 1 37 ILE n 1 38 GLY 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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 31 ? ? eryA ? ? ? ? ? ? 'Saccharopolyspora erythraea' 1836 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? BAP1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 2 sample 'Biological sequence' 32 1649 ? ? lsd14 ? ? ? ? ? ? 'Streptomyces lasalocidi' 324833 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? BAP1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 249 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? 'BL21(DE3)' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 236 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? 'BL21(DE3)' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ERYA2_SACER Q03132 ? 1 TDSEKVAEYLRRATLDLRAARQRIRELES 2 2 UNP B6ZK67_STRLS B6ZK67 ? 1 ;EPIAIIGMACRLPGGVDSPEGLWELVDSGTDAIAGFPLDRGWDVEGMYDPDAEAPGKTYVKEAGFLYDAGEFDAGFFGIS PREAVSMDPQQRLMLEASWEAFERAGLDPARQRGTATGVFVGATATGYVSPAAEVPEGAEGFAITGNMTAVTSGRISYTL GLQGPAVTIDTACSSSLVALHLACQSLRQGECTTALAGGVTVMPTPTAFTEFSRQRGLAPDGRCKSFAAAADGTNWAEGV AVLVVERLSDARRNGHRVLAVVRGTAINQDGASNGLSAPNDLAQERVIRSALDNAGLTASDVDAVEAHGTGTTLGDPIEA QALLAAYGHERPAHRPLRVGSLKSNIGHAGPAAGVAGVIKMVMAMRHGVLPRSLHIDEPTPQVDWSSGAVTLLTEPVDWP DSDRPRRAGVSAFGISGTNAHVILEQAPTQDPQQPAPPVPAAPWLLSAKTPAALRAQARRLHTHLARHPHPDPTDIAHAL ATTRTPHEHRAALVTDDHGTRGPALAALAEGAPDACLISGTALSKGRTVFVFPGQGSQWTGMGRELLHTSPEFAAYIAEC ETALNDFVDWSLTDVLRGTEGAPGYDRVDVVQPALFAVMVSLARLWQHHGIHPDAVIGHSQGEIAAAHIAGALSLQDAAR IVALRSQALLPLAGLGGMTSLALPHDQALQLIQPWGQDLSIASVNGPHSTVVSGTTHALDELHTTCDTQGVRARRIPVDY ASHSAQVESIRDTVLQAATGINPQPTTIPLYSTVTGQPIDGTQLDADYWYTNLRHTVRFEETTRALLGSGHRHFIETTAH PVLALALEETIEATGSDARVTGTLRRDHGDLTQLHTALATAWTHGIDVDWTAVLGDRRTPFELPTYAFQRQRYWLEPGAG VGVPVGGTSAEARFWDAVEDEDLEALVAAIGADGDDASWAGVLPALAGWRRRQREQSALDDLRYKVTWKPTAVADGASAT GTWLVVVPESLAGGGWPVVVARAVDQAGGRPVVLSVDAADGADRSRLGLRIHEALGEGPVPDAVVSLLALDPSALPGLPD VPQALASTAALVQALLDLGLEARLWCVTSGAVSVSGADGPSAPEQAAVWGFGRVAGLEHPHLWAGLVDLPPEADERTAAR LVGVLAGAGGEDQVALRSSGVFVRRLVRAPASEVPAVRSWKPGGTVLVTGGTGGLGRQVARWLARGGADHLLLVSRRGVD APGADELVDELTDLGARVTVAACDVADRDAVQRLLSEQVPSDAPLTAVIHTAAVLDDGVIDSLSPERMEQVLRVKVGGAV HLYELTRESDLSAFVLFSSFGSTFGLPGLGNYAPGNAALEALAEQWRAEGRPATAVGWGTWAGGGMADGGVGERGRTHGI HELEPALATAALEQALERDESSPVIIDIDWERFAVAFHAKRPTRGFELVPEAQAALEAADGGPGPDGGAGDPSELLDRLA ALPDAERDRALLEVVRGNAASVMSHGAMRTATLEAVEPTRAFRDLGFDSLMAVELRNRIGAATGLRLAPTLVFDHPTPEA VVRHLRAELGLEGDGAPDPVFDELDGLERALSSYTPDTDTRVKITKRLESLLWEWTRSEADAPDPVDAADLAAVSDDEMF ELIDRELGSA ; 38 3 PDB 7S6D 7S6D ? 2 ? 1 4 PDB 7S6D 7S6D ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7S6D C 3 ? 31 ? 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UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1654 19 4 7S6D HIS A 1649 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1655 20 5 7S6D MET B 1 ? UNP Q03132 ? ? 'initiating methionine' 7 21 5 7S6D VAL B 2 ? UNP Q03132 ? ? 'expression tag' 8 22 6 7S6D LEU B 1642 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1648 23 6 7S6D GLU B 1643 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1649 24 6 7S6D HIS B 1644 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1650 25 6 7S6D HIS B 1645 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1651 26 6 7S6D HIS B 1646 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1652 27 6 7S6D HIS B 1647 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1653 28 6 7S6D HIS B 1648 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1654 29 6 7S6D HIS B 1649 ? UNP B6ZK67 ? ? 'expression tag' 1655 30 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 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SER F 204 GLU F 209 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? D CYS 24 SG ? ? ? 1_555 D CYS 100 SG ? ? E CYS 24 E CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? D CYS 147 SG ? ? ? 1_555 D CYS 203 SG ? ? E CYS 147 E CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf3 disulf ? ? E CYS 39 SG ? ? ? 1_555 E CYS 109 SG ? ? G CYS 39 G CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf4 disulf ? ? F CYS 24 SG ? ? ? 1_555 F CYS 100 SG ? ? D CYS 24 D CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf5 disulf ? ? F CYS 147 SG ? ? ? 1_555 F CYS 203 SG ? ? D CYS 147 D CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf6 disulf ? ? G CYS 39 SG ? ? ? 1_555 G CYS 109 SG ? ? F CYS 39 F CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 155 D . ? GLU 155 E PRO 156 D ? PRO 156 E 1 -13.78 2 THR 115 E . ? THR 115 G PRO 116 E ? PRO 116 G 1 -2.93 3 TYR 162 E . ? TYR 162 G PRO 163 E ? PRO 163 G 1 -0.20 4 GLU 155 F . ? GLU 155 D PRO 156 F ? PRO 156 D 1 -5.88 5 THR 115 G . ? THR 115 F PRO 116 G ? PRO 116 F 1 -3.97 6 TYR 162 G . ? TYR 162 F PRO 163 G ? PRO 163 F 1 -7.18 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 14 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 22 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 6 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 6 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 9 10 ? parallel AA1 10 11 ? parallel AA1 11 12 ? parallel AA1 12 13 ? parallel AA1 13 14 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA3 8 9 ? anti-parallel AA3 9 10 ? parallel AA3 10 11 ? parallel AA3 11 12 ? anti-parallel AA3 12 13 ? parallel AA3 13 14 ? parallel AA3 14 15 ? anti-parallel AA3 15 16 ? anti-parallel AA3 16 17 ? anti-parallel AA3 17 18 ? anti-parallel AA3 18 19 ? anti-parallel AA3 19 20 ? parallel AA3 20 21 ? parallel AA3 21 22 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 1021 ? 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ALA A 341 GLU A 343 AA3 4 ARG B 438 ? SER B 442 ? ARG A 444 SER A 448 AA3 5 THR B 449 ? GLN B 457 ? THR A 455 GLN A 463 AA3 6 ALA B 291 ? GLN B 300 ? ALA A 297 GLN A 306 AA3 7 ILE B 34 ? ARG B 42 ? ILE A 40 ARG A 48 AA3 8 GLY B 270 ? ARG B 278 ? GLY A 276 ARG A 284 AA3 9 THR B 225 ? THR B 232 ? THR A 231 THR A 238 AA3 10 THR B 148 ? GLY B 153 ? THR A 154 GLY A 159 AA3 11 ALA B 197 ? ASP B 201 ? ALA A 203 ASP A 207 AA3 12 ALA C 197 ? ASP C 201 ? ALA B 203 ASP B 207 AA3 13 THR C 148 ? GLY C 153 ? THR B 154 GLY B 159 AA3 14 THR C 225 ? THR C 232 ? THR B 231 THR B 238 AA3 15 GLY C 270 ? ARG C 278 ? GLY B 276 ARG B 284 AA3 16 ILE C 34 ? ARG C 42 ? ILE B 40 ARG B 48 AA3 17 ALA C 291 ? GLN C 300 ? ALA B 297 GLN B 306 AA3 18 THR C 449 ? GLN C 457 ? THR B 455 GLN B 463 AA3 19 ARG C 438 ? PHE C 444 ? ARG B 444 PHE B 450 AA3 20 ALA C 335 ? GLU C 337 ? ALA B 341 GLU B 343 AA3 21 LEU C 368 ? GLY C 371 ? LEU B 374 GLY B 377 AA3 22 VAL C 421 ? LEU C 423 ? VAL B 427 LEU B 429 AA4 1 ALA B 65 ? GLY B 66 ? ALA A 71 GLY A 72 AA4 2 GLU B 93 ? ALA B 94 ? GLU A 99 ALA A 100 AA5 1 GLU B 102 ? PHE B 103 ? GLU A 108 PHE A 109 AA5 2 GLN B 902 ? ARG B 903 ? GLN A 908 ARG A 909 AA6 1 VAL B 400 ? LEU B 401 ? VAL A 406 LEU A 407 AA6 2 VAL B 428 ? ASP B 429 ? VAL A 434 ASP A 435 AA7 1 TRP B 475 ? ALA B 479 ? TRP A 481 ALA A 485 AA7 2 HIS B 520 ? LEU B 524 ? HIS A 526 LEU A 530 AA7 3 LEU B 548 ? THR B 552 ? LEU A 554 THR A 558 AA8 1 LEU B 781 ? TYR B 782 ? LEU A 787 TYR A 788 AA8 2 VAL B 647 ? GLY B 649 ? VAL A 653 GLY A 655 AA8 3 ARG B 558 ? PHE B 563 ? ARG A 564 PHE A 569 AA8 4 HIS B 822 ? GLU B 827 ? HIS A 828 GLU A 833 AA8 5 ARG B 850 ? GLY B 853 ? ARG A 856 GLY A 859 AA9 1 LEU B 710 ? GLY B 717 ? LEU A 716 GLY A 723 AA9 2 SER B 720 ? THR B 726 ? SER A 726 THR A 732 AA9 3 GLY B 687 ? LEU B 692 ? GLY A 693 LEU A 698 AA9 4 ARG B 745 ? ARG B 746 ? ARG A 751 ARG A 752 AB1 1 ALA C 65 ? GLY C 66 ? ALA B 71 GLY B 72 AB1 2 GLU C 93 ? ALA C 94 ? GLU B 99 ALA B 100 AB2 1 GLU C 102 ? PHE C 103 ? GLU B 108 PHE B 109 AB2 2 GLN C 902 ? ARG C 903 ? GLN B 908 ARG B 909 AB3 1 VAL C 400 ? LEU C 401 ? VAL B 406 LEU B 407 AB3 2 VAL C 428 ? ASP C 429 ? VAL B 434 ASP B 435 AB4 1 TRP C 475 ? ALA C 479 ? TRP B 481 ALA B 485 AB4 2 HIS C 520 ? LEU C 524 ? HIS B 526 LEU B 530 AB4 3 LEU C 548 ? THR C 552 ? LEU B 554 THR B 558 AB5 1 GLN C 788 ? ILE C 790 ? GLN B 794 ILE B 796 AB5 2 LEU C 781 ? SER C 783 ? LEU B 787 SER B 789 AB5 3 ALA C 646 ? GLY C 649 ? ALA B 652 GLY B 655 AB5 4 ARG C 558 ? PHE C 563 ? ARG B 564 PHE B 569 AB5 5 HIS C 822 ? GLU C 827 ? HIS B 828 GLU B 833 AB5 6 ARG C 850 ? GLY C 853 ? ARG B 856 GLY B 859 AB6 1 GLY C 687 ? LEU C 692 ? GLY B 693 LEU B 698 AB6 2 SER C 720 ? THR C 726 ? SER B 726 THR B 732 AB6 3 SER C 711 ? GLY C 717 ? SER B 717 GLY B 723 AB7 1 GLN D 5 ? SER D 9 ? GLN E 5 SER E 9 AB7 2 LEU D 20 ? SER D 27 ? LEU E 20 SER E 27 AB7 3 ILE D 82 ? MET D 87 ? ILE E 82 MET E 87 AB7 4 PHE D 72 ? ASP D 77 ? PHE E 72 ASP E 77 AB8 1 GLY D 12 ? VAL D 14 ? 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PHENIX ? ? ? 1.19.2_4158 2 # _pdbx_entry_details.entry_id 7S6D _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y # _em_3d_fitting.entry_id 7S6D _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details 'Model was rebuilt in coot and refined using phenix.real_space_refine.' _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 1 1 ? ? ? 7S6B 1 2 ? H ? 6C9U 1 3 ? 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F GLY 197 2757 1 Y 1 D THR 198 ? F THR 198 2758 1 Y 1 D LYS 221 ? F LYS 221 2759 1 Y 1 D SER 222 ? F SER 222 2760 1 Y 1 D CYS 223 ? F CYS 223 2761 1 Y 1 D ALA 224 ? F ALA 224 2762 1 Y 1 D ALA 225 ? F ALA 225 2763 1 Y 1 D LEU 226 ? F LEU 226 2764 1 Y 1 D VAL 227 ? F VAL 227 2765 1 Y 1 D PRO 228 ? F PRO 228 2766 1 Y 1 D ARG 229 ? F ARG 229 2767 1 Y 1 D GLY 230 ? F GLY 230 2768 1 Y 1 D SER 231 ? F SER 231 2769 1 Y 1 D ALA 232 ? F ALA 232 2770 1 Y 1 D HIS 233 ? F HIS 233 2771 1 Y 1 D HIS 234 ? F HIS 234 2772 1 Y 1 D HIS 235 ? F HIS 235 2773 1 Y 1 D HIS 236 ? F HIS 236 2774 1 Y 1 D HIS 237 ? F HIS 237 2775 1 Y 1 D HIS 238 ? F HIS 238 2776 1 Y 1 D ALA 239 ? F ALA 239 2777 1 Y 1 D ALA 240 ? F ALA 240 2778 1 Y 1 D ASP 241 ? F ASP 241 2779 1 Y 1 D TYR 242 ? F TYR 242 2780 1 Y 1 D LYS 243 ? F LYS 243 2781 1 Y 1 D ASP 244 ? F ASP 244 2782 1 Y 1 D ASP 245 ? F ASP 245 2783 1 Y 1 D ASP 246 ? F ASP 246 2784 1 Y 1 D ASP 247 ? F ASP 247 2785 1 Y 1 D LYS 248 ? F LYS 248 2786 1 Y 1 D ALA 249 ? 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This sample was incubated at 30C for 15 minutes before applying to cryo-EM grids. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R35GM136258 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 1R01GM138990 2 'National Science Foundation (NSF, United States)' 'United States' DMR-1719875 3 # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 4 _pdbx_entity_nonpoly.name "2'-MONOPHOSPHOADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _pdbx_entity_nonpoly.comp_id ATR # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 #