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6 ;MSMQQVQHCVAEVLRLDPQEKPDWSSGYLKKLTNATSILYNTSLNKVMLKQDEEVARCHICAYIASQKMNEKHMPDLCYY IDSIPLEPKKAKHLMNLFRQSLSNSSPMKQFAWTPSPKKNKRSPVKNGGRFTSSDPKELRNQLFGTPTKVRKSQNNDSFV IPELPPMQTNESPSITRRKLAFEEDEDEDEEEPGNDGLSLKSHSNKSITGTRNVDSDEYENHESDPTSEEEPLGVQESRS GRTKQNKAVGKPQSELKTAKALRKRGRIPNSLLVKKYCKMTTEEIIRLCNDFELPREVAYKIVDEYNINASRLVCPWQLV CGLVLNCTFIVFNERRRKDPRIDHFIVSKMCSLMLTSKVDDVIECVKLVKELIIGEKWFRDLQIRYDDFDGIRYDEIIFR KLGSMLQTTNILVTDDQYNIWKKRIEMDLALTEPL ; 1 7 GB CP007814.1 1039022860 ? 7 ;ATCTTTACATCTTGTTATTTTACAGATTTTATGTTTAGATCTTTTATGCTTGCTTTTCAAAAGGCCTGCAGGCAAGTGCA CAAA ; 461829 8 GB CP007814.1 1039022860 ? 8 ;TTTGTGCACTTGCCTGCAGGCCTTTTGAAAAGCAAGCATAAAAGATCTAAACATAAAATCTGTAAAATAACAAGATGTAA AGAT ; 461746 9 UNP CDC6_YEAST P09119 ? 9 ;MSAIPITPTKRIRRNLFDDAPATPPRPLKRKKLQFTDVTPESSPEKLQFGSQSIFLRTKALLQKSSELVNLNSSDGALPA RTAEYEQVMNFLAKAISEHRSDSLYITGPPGTGKTAQLDMIIRQKFQSLPLSLSTPRSKDVLRHTNPNLQNLSWFELPDG RLESVAVTSINCISLGEPSSIFQKIFDSFQDLNGPTLQIKNMQHLQKFLEPYHKKTTFVVVLDEMDRLLHANTSETQSVR TILELFLLAKLPTVSFVLIGMANSLDMKDRFLSRLNLDRGLLPQTIVFQPYTAEQMYEIVIQKMSSLPTIIFQPMAIKFA AKKCAGNTGDLRKLFDVLRGSIEIYELEKRFLLSPTRGSLNSAQVPLTPTTSPVKKSYPEPQGKIGLNYIAKVFSKFVNN NSTRTRIAKLNIQQKLILCTIIQSLKLNSDATIDESFDHYIKAITKTDTLAPLQRNEFLEICTILETCGLVSIKKTKCKG KTKRFVDKIDVDLDMREFYDEMTKISILKPFLH ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7TJJ A 4 ? 917 ? 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'expression tag' 0 3 4 7TJJ SER D 1 ? UNP P54791 ? ? 'expression tag' -2 4 4 7TJJ ASN D 2 ? UNP P54791 ? ? 'expression tag' -1 5 4 7TJJ ALA D 3 ? UNP P54791 ? ? 'expression tag' 0 6 9 7TJJ SER I 1 ? UNP P09119 ? ? 'expression tag' -2 7 9 7TJJ ASN I 2 ? UNP P09119 ? ? 'expression tag' -1 8 9 7TJJ ALA I 3 ? UNP P09119 ? ? 'expression tag' 0 9 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7TJJ _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7TJJ _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 25215 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.942 ? 34421 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.068 ? 9534 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.055 ? 3919 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 4023 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7TJJ _struct.title 'S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7TJJ _struct_keywords.text 'initiator, helicase loader, AAA+ ATPase, REPLICATION-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords REPLICATION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 10 ? M N N 11 ? N N N 10 ? O N N 11 ? P N N 10 ? Q N N 11 ? R N N 12 ? S N N 12 ? T N N 12 ? U N N 12 ? V N N 12 ? W N N 12 ? X N N 12 ? Y N N 12 ? Z N N 12 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 377 ? ARG A 381 ? PRO A 374 ARG A 378 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 390 ? LEU A 394 ? ASP A 387 LEU A 391 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 PHE A 426 ? LEU A 433 ? PHE A 423 LEU A 430 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU A 456 ? SER A 472 ? GLU A 453 SER A 469 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 487 ? GLN A 505 ? GLY A 484 GLN A 502 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU A 519 ? MET A 521 ? LEU A 516 MET A 518 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 THR A 525 ? SER A 536 ? THR A 522 SER A 533 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 541 ? ARG A 555 ? THR A 538 ARG A 552 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO A 557 ? LYS A 561 ? PRO A 554 LYS A 558 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU A 571 ? VAL A 575 ? LEU A 568 VAL A 572 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 GLN A 579 ? TRP A 588 ? GLN A 576 TRP A 585 1 ? 10 HELX_P HELX_P12 AB3 THR A 589 ? TYR A 591 ? THR A 586 TYR A 588 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP A 606 ? GLN A 611 ? ASP A 603 GLN A 608 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY A 613 ? GLY A 621 ? GLY A 610 GLY A 618 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 THR A 631 ? LEU A 643 ? THR A 628 LEU A 640 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 688 ? SER A 703 ? SER A 685 SER A 700 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP A 705 ? GLY A 729 ? ASP A 702 GLY A 726 1 ? 25 HELX_P HELX_P18 AB9 HIS A 777 ? GLU A 787 ? 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