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_citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Vasanthakumar, T.' 1 ? primary 'Keon, K.A.' 2 ? primary 'Bueler, S.A.' 3 ? primary 'Jaskolka, M.C.' 4 ? primary 'Rubinstein, J.L.' 5 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'H(+)-transporting two-sector ATPase' 67796.508 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'Vacuolar proton pump subunit B' 57815.023 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit E' 26508.393 3 ? ? ? ? 4 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit G' 12738.706 3 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit D' 29235.023 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit F' 13479.170 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit C' 44241.352 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit H' 54482.609 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'V-type proton ATPase 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subunit,V-ATPase 95 kDa subunit,Vacuolar pH protein 1,Vacuolar proton pump a subunit,Vacuolar proton translocating ATPase subunit a 1 ; 11 ;V-ATPase subunit c'',V-ATPase 22 kDa proteolipid subunit,Vacuolar proton pump c'' subunit ; 12 'V-ATPase subunit d,V-ATPase 39 kDa subunit,V-ATPase subunit M39,Vacuolar proton pump subunit d' 13 'V-ATPase subunit e,Low dye-binding protein 10,Vacuolar proton pump subunit e' 15 'V-ATPase subunit c,Guanine nucleotide exchange factor 2,V-ATPase 16 kDa proteolipid subunit 1,Vacuolar proton pump c subunit' 16 ;V-ATPase subunit c',Proteolipid protein VMA11,Trifluoperazine resistance protein 3,V-ATPase 16 kDa proteolipid subunit 2,Vacuolar proton pump c' subunit ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGL TVGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYG SVFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRV LDALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVGCGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVA NTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAEALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAV ALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLDKKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFP VLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQK AVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD ; ;MAGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGL TVGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYG SVFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRV LDALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVGCGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVA NTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAEALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAV ALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLDKKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFP VLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQK AVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD ; A,C,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; B,D,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; G,I,K ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKAEAGVQGEL AEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; ;MSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKAEAGVQGEL AEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; H,J,L ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; M ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; N ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; O ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MGATKILMDSTHFNEIRSIIRSRSVAWDALARSEELSEIDASTAKALESILVKKNIGDGLSSSNNAHSGFKVNGKTLIPL IHLLSTSDNEDCKKSVQNLIAELLSSDKYGDDTVKFFQEDPKQLEQLFDVSLKGDFQTVLISGFNVVSLLVQNGLHNVKL VEKLLKNNNLINILQNIEQMDTCYVCIRLLQELAVIPEYRDVIWLHEKKFMPTLFKILQRATDSQLATRIVATNSNHLGI QLQYHSLLLIWLLTFNPVFANELVQKYLSDFLDLLKLVKITIKEKVSRLCISIILQCCSTRVKQHKKVIKQLLLLGNALP TVQSLSERKYSDEELRQDISNLKEILENEYQELTSFDEYVAELDSKLLCWSPPHVDNGFWSDNIDEFKKDNYKIFRQLIE LLQAKVRNGDVNAKQEKIIIQVALNDITHVVELLPESIDVLDKTGGKADIMELLNHSDSRVKYEALKATQAIIGYTFK ; ;MGATKILMDSTHFNEIRSIIRSRSVAWDALARSEELSEIDASTAKALESILVKKNIGDGLSSSNNAHSGFKVNGKTLIPL IHLLSTSDNEDCKKSVQNLIAELLSSDKYGDDTVKFFQEDPKQLEQLFDVSLKGDFQTVLISGFNVVSLLVQNGLHNVKL VEKLLKNNNLINILQNIEQMDTCYVCIRLLQELAVIPEYRDVIWLHEKKFMPTLFKILQRATDSQLATRIVATNSNHLGI QLQYHSLLLIWLLTFNPVFANELVQKYLSDFLDLLKLVKITIKEKVSRLCISIILQCCSTRVKQHKKVIKQLLLLGNALP TVQSLSERKYSDEELRQDISNLKEILENEYQELTSFDEYVAELDSKLLCWSPPHVDNGFWSDNIDEFKKDNYKIFRQLIE LLQAKVRNGDVNAKQEKIIIQVALNDITHVVELLPESIDVLDKTGGKADIMELLNHSDSRVKYEALKATQAIIGYTFK ; P ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAEKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHD IKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDS TSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFS HGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIF EILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIA QYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYN DIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHL YFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLM ALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTI EFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRL HWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDMEVAVASASSSASS ; ;MAEKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHD IKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDS TSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFS HGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIF EILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIA QYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYN DIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHL YFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLM ALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTI EFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRL HWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDMEVAVASASSSASS ; a ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MVFGQLYALFIFTLSCCISKTVQADSSKESSSFISFDKESNWDTISTISSTADVISSVDSAIAVFEFDNFSLLDNLMIDE EYPFFNRFFANDVSLTVHDDSPLNISQSLSPIMEQFTVDELPESASDLLYEYSLDDKSIVLFKFTSDAYDLKKLDEFIDS 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ILE m 54 LEU m 78 1 ? 25 HELX_P HELX_P295 BG7 ALA CA 83 ? SER CA 120 ? ALA m 83 SER m 120 1 ? 38 HELX_P HELX_P296 BG8 GLN CA 122 ? ARG CA 124 ? GLN m 122 ARG m 124 5 ? 3 HELX_P HELX_P297 BG9 LEU CA 125 ? GLN CA 156 ? LEU m 125 GLN m 156 1 ? 32 HELX_P HELX_P298 BH1 TYR DA 8 ? CYS DA 43 ? TYR n 8 CYS n 43 1 ? 36 HELX_P HELX_P299 BH2 ARG DA 46 ? ASP DA 48 ? ARG n 46 ASP n 48 5 ? 3 HELX_P HELX_P300 BH3 LEU DA 49 ? ILE DA 54 ? LEU n 49 ILE n 54 1 ? 6 HELX_P HELX_P301 BH4 ILE DA 54 ? LEU DA 78 ? ILE n 54 LEU n 78 1 ? 25 HELX_P HELX_P302 BH5 ALA DA 83 ? GLN DA 122 ? ALA n 83 GLN n 122 1 ? 40 HELX_P HELX_P303 BH6 ARG DA 124 ? GLN DA 156 ? ARG n 124 GLN n 156 1 ? 33 HELX_P HELX_P304 BH7 TYR EA 14 ? THR EA 50 ? TYR o 14 THR o 50 1 ? 37 HELX_P HELX_P305 BH8 LYS EA 52 ? GLU EA 54 ? LYS o 52 GLU o 54 5 ? 3 HELX_P HELX_P306 BH9 LEU EA 55 ? LEU EA 60 ? LEU o 55 LEU o 60 1 ? 6 HELX_P HELX_P307 BI1 LEU EA 60 ? GLY EA 82 ? LEU o 60 GLY o 82 1 ? 23 HELX_P HELX_P308 BI2 THR EA 91 ? MET EA 128 ? THR o 91 MET o 128 1 ? 38 HELX_P HELX_P309 BI3 ARG EA 132 ? GLU EA 164 ? ARG o 132 GLU o 164 1 ? 33 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 404 A . ? SER 403 A PRO 405 A ? PRO 404 A 1 -0.75 2 PHE 452 A . ? PHE 451 A PRO 453 A ? PRO 452 A 1 5.78 3 TYR 370 B . ? 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