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EMDB EMD-26261 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB . 7U0I unspecified PDB . 7U0G unspecified EMDB 'structure of a nucleosome' EMD-26261 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7U0J _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-02-18 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Lian, T.' 1 ? 'Guan, R.' 2 ? 'Bai, Y.' 3 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Mol.Cell _citation.journal_id_ASTM MOCEFL _citation.journal_id_CSD 2168 _citation.journal_id_ISSN 1097-2765 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 83 _citation.language ? _citation.page_first 1970 _citation.page_last 1982.e6 _citation.title 'Structural mechanism of LIN28B nucleosome targeting by OCT4.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2023.05.030 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37327775 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Guan, R.' 1 ? primary 'Lian, T.' 2 ? primary 'Zhou, B.R.' 3 ? primary 'Wheeler, D.' 4 ? primary 'Bai, Y.' 5 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7U0J _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7U0J _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3.1' 15437.167 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A type 2-C' 14017.428 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B type 2-E' 13951.239 2 ? ? ? ? 5 polymer syn 'DNA (162-MER)' 50398.344 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'DNA (162-MER)' 49595.680 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'Single-chain variable fragment' 29030.146 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Histone H3/a,Histone H3/b,Histone H3/c,Histone H3/d,Histone H3/f,Histone H3/h,Histone H3/i,Histone H3/j,Histone H3/k,Histone H3/l' 3 'H2A-clustered histone 20,Histone H2A-GL101,Histone H2A/q' 4 'H2B-clustered histone 21,Histone H2B-GL105,Histone H2B.q,H2B/q' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHKAKSK ; ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHKAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DG)(DT)(DG)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DC) (DA)(DG)(DT)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DG) (DA)(DA)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DG) (DA)(DT)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT) (DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DG) (DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DT)(DC)(DA) (DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DG) (DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DG)(DA) (DC)(DA) ; ;AGTGGTATTAACATATCCTCAGTGGTGAGTATTAACATGGAACTTACTCCAACAATACAGATGCTGAATAAATGTAGTCT AAGTGAAGGAAGAAGGAAAGGTGGGAGCTGCCATCACTCAGAATTGTCCAGCAGGGATTGTGCAAGCTTGTGAATAAAGA CA ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG) (DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT) (DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC) (DA)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DC) (DT)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC) (DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DT)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DG) (DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA) (DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA) (DC)(DT) ; ;TGTCTTTATTCACAAGCTTGCACAATCCCTGCTGGACAATTCTGAGTGATGGCAGCTCCCACCTTTCCTTCTTCCTTCAC TTAGACTACATTTATTCAGCATCTGTATTGTTGGAGTAAGTTCCATGTTAATACTCACCACTGAGGATATGTTAATACCA CT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MKSSHHHHHHENLYFQSNAMEVQLQQSGPELVEPGTSVKMPCKASGYTFTSYTIQWVKQTPRQGLEWIGYIYPYNAGTKY NEKFKGKATLTSDKSSSTVYMELSSLTSEDSAVYYCARKSSRLRSTLDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSMDIKM TQSPSSMHASLGERVTITCKASQDIRSYLSWYQQKPWKSPKTLIYYATSLADGVPSRFSGSGSGQDFSLTINNLESDDTA TYYCLQHGESPYTFGSGTKLEIKRA ; ;MKSSHHHHHHENLYFQSNAMEVQLQQSGPELVEPGTSVKMPCKASGYTFTSYTIQWVKQTPRQGLEWIGYIYPYNAGTKY NEKFKGKATLTSDKSSSTVYMELSSLTSEDSAVYYCARKSSRLRSTLDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSMDIKM TQSPSSMHASLGERVTITCKASQDIRSYLSWYQQKPWKSPKTLIYYATSLADGVPSRFSGSGSGQDFSLTINNLESDDTA TYYCLQHGESPYTFGSGTKLEIKRA ; K,N ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN 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LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 THR n 2 56 ARG n 2 57 GLY n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 VAL n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 ASN n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 ASP n 2 70 ALA n 2 71 VAL n 2 72 THR n 2 73 TYR n 2 74 THR n 2 75 GLU n 2 76 HIS n 2 77 ALA n 2 78 LYS n 2 79 ARG n 2 80 LYS n 2 81 THR n 2 82 VAL n 2 83 THR n 2 84 ALA n 2 85 MET n 2 86 ASP n 2 87 VAL n 2 88 VAL n 2 89 TYR n 2 90 ALA n 2 91 LEU n 2 92 LYS n 2 93 ARG n 2 94 GLN n 2 95 GLY n 2 96 ARG n 2 97 THR n 2 98 LEU n 2 99 TYR n 2 100 GLY n 2 101 PHE n 2 102 GLY n 2 103 GLY n 3 1 MET n 3 2 SER n 3 3 GLY n 3 4 ARG n 3 5 GLY n 3 6 LYS n 3 7 GLN n 3 8 GLY n 3 9 GLY n 3 10 LYS n 3 11 ALA n 3 12 ARG n 3 13 ALA n 3 14 LYS n 3 15 ALA n 3 16 LYS n 3 17 SER n 3 18 ARG n 3 19 SER n 3 20 SER n 3 21 ARG n 3 22 ALA n 3 23 GLY n 3 24 LEU n 3 25 GLN n 3 26 PHE n 3 27 PRO n 3 28 VAL n 3 29 GLY n 3 30 ARG n 3 31 VAL n 3 32 HIS n 3 33 ARG n 3 34 LEU n 3 35 LEU n 3 36 ARG n 3 37 LYS n 3 38 GLY 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 265 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 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'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7U0J _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7U0J _struct.title 'Structure of 162bp LIN28b nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7U0J _struct_keywords.text 'nucleosome, transcription factor, transcription, CHROMATIN BINDING PROTEIN-DNA complex, TRANSCRIPTION-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? 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I DG 27 N2 ? ? ? 1_555 J DC 136 N3 ? ? I DG 27 J DC 136 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? I DA 28 N1 ? ? ? 1_555 J DT 135 N3 ? ? I DA 28 J DT 135 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? I DA 28 N6 ? ? ? 1_555 J DT 135 O4 ? ? I DA 28 J DT 135 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? I DG 29 N1 ? ? ? 1_555 J DC 134 N3 ? ? I DG 29 J DC 134 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? I DG 29 N2 ? ? ? 1_555 J DC 134 O2 ? ? I DG 29 J DC 134 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? I DG 29 O6 ? ? ? 1_555 J DC 134 N4 ? ? I DG 29 J DC 134 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? I DT 30 N3 ? ? ? 1_555 J DA 133 N1 ? ? I DT 30 J DA 133 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? I DT 30 O4 ? ? ? 1_555 J DA 133 N6 ? ? I DT 30 J DA 133 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? I DA 31 N1 ? ? ? 1_555 J DT 132 N3 ? ? I DA 31 J DT 132 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? I DT 32 N3 ? ? ? 1_555 J DA 131 N1 ? ? I DT 32 J DA 131 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? I DT 32 O4 ? ? ? 1_555 J DA 131 N6 ? ? I DT 32 J DA 131 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? I DT 33 N3 ? ? ? 1_555 J DA 130 N1 ? ? I DT 33 J DA 130 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? I DT 33 O4 ? ? ? 1_555 J DA 130 N6 ? ? I DT 33 J DA 130 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? I DA 34 N1 ? ? ? 1_555 J DT 129 N3 ? ? I DA 34 J DT 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? I DA 34 N6 ? ? ? 1_555 J DT 129 O4 ? ? I DA 34 J DT 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? I DA 35 N1 ? ? ? 1_555 J DT 128 N3 ? ? I DA 35 J DT 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? I DA 35 N6 ? ? ? 1_555 J DT 128 O4 ? ? I DA 35 J DT 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? I DC 36 N3 ? ? ? 1_555 J DG 127 N1 ? ? 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J 4 ? ? 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DA 13 1_555 J DT 150 1_555 I DT 14 1_555 J DA 149 1_555 -1.168 -0.549 2.954 -2.076 4.905 21.770 -3.054 2.311 2.859 12.744 5.394 22.405 1 II_DA13DT14:DA149DT150_JJ I 13 ? J 150 ? I 14 ? J 149 ? 1 I DT 14 1_555 J DA 149 1_555 I DA 15 1_555 J DT 148 1_555 -0.663 1.211 3.327 -2.325 7.475 40.617 0.869 0.675 3.517 10.649 3.313 41.333 2 II_DT14DA15:DT148DA149_JJ I 14 ? J 149 ? I 15 ? J 148 ? 1 I DA 15 1_555 J DT 148 1_555 I DT 16 1_555 J DA 147 1_555 0.354 -0.849 3.160 -0.859 2.362 30.400 -2.063 -0.836 3.075 4.495 1.635 30.502 3 II_DA15DT16:DA147DT148_JJ I 15 ? J 148 ? I 16 ? J 147 ? 1 I DT 16 1_555 J DA 147 1_555 I DC 17 1_555 J DG 146 1_555 -0.735 -0.124 3.220 3.396 1.808 33.072 -0.510 1.833 3.120 3.163 -5.941 33.289 4 II_DT16DC17:DG146DA147_JJ I 16 ? J 147 ? I 17 ? J 146 ? 1 I DC 17 1_555 J DG 146 1_555 I DC 18 1_555 J DG 145 1_555 1.107 -0.591 3.349 -2.039 2.836 27.828 -1.890 -2.766 3.187 5.867 4.219 28.042 5 II_DC17DC18:DG145DG146_JJ I 17 ? J 146 ? I 18 ? J 145 ? 1 I DC 18 1_555 J DG 145 1_555 I DT 19 1_555 J DA 144 1_555 -0.208 -0.271 3.459 -2.348 0.506 41.739 -0.436 0.032 3.462 0.710 3.292 41.805 6 II_DC18DT19:DA144DG145_JJ I 18 ? J 145 ? I 19 ? 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