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EMDB EMD-26334 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2022-08-24 2 'Structure model' 1 1 2023-09-06 3 'Structure model' 1 2 2024-10-30 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Data collection' 4 3 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' chem_comp_atom 2 2 'Structure model' chem_comp_bond 3 2 'Structure model' citation 4 2 'Structure model' citation_author 5 3 'Structure model' em_admin 6 3 'Structure model' pdbx_entry_details 7 3 'Structure model' pdbx_modification_feature # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ASTM' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 5 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 6 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 7 2 'Structure model' '_citation.page_first' 8 2 'Structure model' '_citation.page_last' 9 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 10 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 11 2 'Structure model' '_citation.title' 12 2 'Structure model' '_citation.year' 13 3 'Structure model' '_em_admin.last_update' 14 3 'Structure model' '_pdbx_entry_details.has_protein_modification' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7U4T _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-03-01 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB . 6WM3 unspecified EMDB 'Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7' EMD-26334 'associated EM volume' # loop_ _pdbx_contact_author.id _pdbx_contact_author.email _pdbx_contact_author.name_first _pdbx_contact_author.name_last _pdbx_contact_author.name_mi _pdbx_contact_author.role _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 2 wanglf@whu.edu.cn Longfei Wang ? 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_citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wang, L.' 1 ? primary 'Wu, D.' 2 ? primary 'Robinson, C.V.' 3 0000-0001-7829-5505 primary 'Fu, T.M.' 4 0000-0002-6281-1752 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1' 96512.414 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit C 1' 43999.500 1 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit E 1' 26183.346 3 ? ? ? ? 4 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit G 1' 13781.547 3 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit e 1' 9380.329 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Ribonuclease kappa' 15435.220 1 3.1.-.- ? ? ? 7 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit S1' 52067.480 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Renin receptor' 39045.855 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit' 21418.213 1 ? ? ? ? 10 polymer nat 'V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit' 15743.655 9 ? ? ? ? 11 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit d 1' 40369.949 1 ? ? ? ? 12 polymer nat 'V-type proton ATPase catalytic subunit A' 68379.875 3 7.1.2.2 ? ? ? 13 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit B, brain isoform' 56561.500 3 ? ? ? ? 14 polymer man SidK 65505.297 3 ? ? ? ? 15 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit D' 28311.918 1 ? ? ? ? 16 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit F' 13388.210 1 ? ? ? ? 17 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit H' 55949.949 1 ? ? ? ? 18 polymer nat 'MTOR-associated protein MEAK7' 51056.520 1 ? ? ? ? 19 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 8 ? ? ? ? 20 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;V-ATPase 116 kDa isoform a1,Clathrin-coated vesicle/synaptic vesicle proton pump 116 kDa subunit,Vacuolar adenosine triphosphatase subunit Ac116,Vacuolar proton pump subunit 1,Vacuolar proton translocating ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 ; 2 'V-ATPase subunit C 1,Vacuolar proton pump subunit C 1' 3 'V-ATPase subunit E 1,V-ATPase 31 kDa subunit,p31,Vacuolar proton pump subunit E 1' 4 'V-ATPase subunit G 1,V-ATPase 13 kDa subunit 1,Vacuolar proton pump subunit G 1,Vacuolar proton pump subunit M16' 5 'V-ATPase subunit e 1,V-ATPase 9.2 kDa membrane accessory protein,V-ATPase M9.2 subunit,Vacuolar proton pump subunit e 1' 6 'RNase kappa' 7 'V-ATPase subunit S1,Protein XAP-3,V-ATPase Ac45 subunit,V-ATPase S1 accessory protein,Vacuolar proton pump subunit S1' 8 ;ATPase H(+)-transporting lysosomal accessory protein 2,ATPase H(+)-transporting lysosomal-interacting protein 2,ER-localized type I transmembrane adapter,Embryonic liver differentiation factor 10,N14F,Renin/prorenin receptor,Vacuolar ATP synthase membrane sector-associated protein M8-9,V-ATPase M8.9 subunit ; 9 'V-ATPase 21 kDa proteolipid subunit,Vacuolar proton pump 21 kDa proteolipid subunit,hATPL' 10 'V-ATPase 16 kDa proteolipid subunit,Vacuolar proton pump 16 kDa proteolipid subunit' 11 ;V-ATPase subunit d 1,32 kDa accessory protein,V-ATPase 40 kDa accessory protein,V-ATPase AC39 subunit,p39,Vacuolar proton pump subunit d 1 ; 12 'V-ATPase subunit A,V-ATPase 69 kDa subunit,Vacuolar ATPase isoform VA68,Vacuolar proton pump subunit alpha' 13 'V-ATPase subunit B 2,Endomembrane proton pump 58 kDa subunit,HO57,Vacuolar proton pump subunit B 2' 15 'V-ATPase subunit D,V-ATPase 28 kDa accessory protein,Vacuolar proton pump subunit D' 16 'V-ATPase subunit F,V-ATPase 14 kDa subunit,Vacuolar proton pump subunit F' 17 ;V-ATPase subunit H,Nef-binding protein 1,NBP1,Protein VMA13 homolog,V-ATPase 50/57 kDa subunits,Vacuolar proton pump subunit H,Vacuolar proton pump subunit SFD ; 18 'MEAK7,MTOR associated protein,eak-7 homolog,TBC/LysM-associated domain-containing protein 1,TLD domain-containing protein 1' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIM DTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPSEM GRGTPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGF RASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLI AEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFP FLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWS VRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHI YFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLV VVALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEPSEDEVFDFGDTMVHQ AIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFL HALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE ; ;MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIM DTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPSEM GRGTPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGF RASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLI AEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFP FLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWS VRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHI YFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLV VVALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEPSEDEVFDFGDTMVHQ AIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFL HALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE ; R ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATSKNNNLAVTSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVL EDSKDKVQENLLANGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGS LLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLVTLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHK ARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAML LQPNKKTLKKLREVLHELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK ; ;MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATSKNNNLAVTSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVL EDSKDKVQENLLANGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGS LLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLVTLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHK ARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAML LQPNKKTLKKLREVLHELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK ; O ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQAR LKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATK NDVDVQIDQESYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD ; ;MALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQAR LKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATK NDVDVQIDQESYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD ; J,I,H ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQAEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSRGSCSTEVEKETQEK MTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING ; ;MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQAEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSRGSCSTEVEKETQEK MTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING ; M,L,K ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAYHGLTVPLIVMSVFWGFVGFLVPWFIPKGPNRGVIITMLVTCSVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYLKYHW P ; ;MAYHGLTVPLIVMSVFWGFVGFLVPWFIPKGPNRGVIITMLVTCSVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYLKYHW P ; S ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGWLRPGPRPLCPPARASWAFSHRFPSPLAPRRSPTPFFMASLLCCGPKLAACGIVLSAWGVIMLIMLGIFFNVHSAVLI EDVPFTEKDFENGPQNIYNLYEQVSYNCFIAAGLYLLLGGFSFCQVRLNKRKEYMVR ; ;MGWLRPGPRPLCPPARASWAFSHRFPSPLAPRRSPTPFFMASLLCCGPKLAACGIVLSAWGVIMLIMLGIFFNVHSAVLI EDVPFTEKDFENGPQNIYNLYEQVSYNCFIAAGLYLLLGGFSFCQVRLNKRKEYMVR ; T ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MMAAMATARVRMGPRCAQALWRMPWLPVFLSLAAAAAAAAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADTHEGHITSDLQLSTYLDP ALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALDLAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVD LATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASSGLMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDVAVVAGGL GRQLLQKQPVSPVIHPPVSYNDTAPRILFWAQNFSVAYKDQWEDLTPLTFGVQELNLTGSFWNDSFARLSLTYERLFGTT VTFKFILANRLYPVSARHWFTMERLEVHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCEYVSSLSKKGSLLVARTQPSPWQMMLQDF QIQAFNVMGEQFSYASDCASFFSPGIWMGLLTSLFMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPTISLTQIV ; ;MMAAMATARVRMGPRCAQALWRMPWLPVFLSLAAAAAAAAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADTHEGHITSDLQLSTYLDP ALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALDLAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVD LATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASSGLMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDVAVVAGGL GRQLLQKQPVSPVIHPPVSYNDTAPRILFWAQNFSVAYKDQWEDLTPLTFGVQELNLTGSFWNDSFARLSLTYERLFGTT VTFKFILANRLYPVSARHWFTMERLEVHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCEYVSSLSKKGSLLVARTQPSPWQMMLQDF QIQAFNVMGEQFSYASDCASFFSPGIWMGLLTSLFMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPTISLTQIV ; U ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAVFVVLLALVAGVLGNEFSILKSPGSVVFRNGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFHRPRATVMVMV KGVNKLALPPGSVISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQ ENSVLSSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRDASKIL VDALQKFADDMYSLYGGNAVVELVTVKSFDTSLIRKTRTILEAKQAKNPASPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALA VIITSYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD ; ;MAVFVVLLALVAGVLGNEFSILKSPGSVVFRNGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFHRPRATVMVMV KGVNKLALPPGSVISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQ ENSVLSSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRDASKIL VDALQKFADDMYSLYGGNAVVELVTVKSFDTSLIRKTRTILEAKQAKNPASPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALA VIITSYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD ; V ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MTGLALLYSGVFVAFWACALAVGVCYTIFDLGFRFDVAWFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGG VKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFSATDPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLSNLFCGVCVGIVGS GAALADAQNPSLFVKILIVEIFGSAIGLFGVIVAILQTSRVKMGD ; ;MTGLALLYSGVFVAFWACALAVGVCYTIFDLGFRFDVAWFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGG VKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFSATDPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLSNLFCGVCVGIVGS GAALADAQNPSLFVKILIVEIFGSAIGLFGVIVAILQTSRVKMGD ; 0 ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSESKSGPEYASFFAVMGASAAMVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPEQIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSL NDDISLYKSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK ; ;MSESKSGPEYASFFAVMGASAAMVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPEQIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSL NDDISLYKSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK ; 1,2,3,4,5,6,7,8,9 ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MSFFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVV EFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPL AAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKL FPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVK LKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF ; ;MSFFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVV EFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPL AAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKL FPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVK LKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF ; Q ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVL RTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPCKNLRVGSHITGGDIYGIVSENS LIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFTMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPC VQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPV AAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPER 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;MSFIKVGIKMGGLTSEQYHSQVVGKIGYIARCMQTIDPENNLKKIREDYQDVLIWAEKNYRFEEILEASKSGKCPNDLDA LSRRSLILQELLRLVSSISPFKMKLDLIESQYEKMKQHVNLWKSDYHVKLNQLNQLTDYLKNAAPTPKNNFLRAMTSVLQ MQIAQYGITEDNEGINQLFKLGLHLLAMANEKIDEQYHLFKGYVKDQPEESPFEGILPAEDQKILVKTMIDYAMPKLSSK VLQDKLSALSSSDVLTKTLLDSIDRIVKENEKLNALSKVKLGKFGLDIREIEVIYSQALKISPQDALQYTAQQCDAQLLS MAFPDSQNYIIESISNKKVKTIAELIHSKEFIYQIIKTEVFKQVDPNEKIRLQAATELYQLLGRIMDKQINLFTKMNLEQ INEYIQTKTKAILDKIPERVELLTFMGFEIPTFKGIETLMTDISHSQDNETLAIAQEFYTNIKNAKNQLLGDKLIEDITP QDVEKFFNQCSQYGSEAAEKLADNRPVLTKIADILTAIARWAISLIGFNTPPQFLAPTRTCVDQVSDEITKIKLKLEDTL GSLQKVQEESLSL ; ;MSFIKVGIKMGGLTSEQYHSQVVGKIGYIARCMQTIDPENNLKKIREDYQDVLIWAEKNYRFEEILEASKSGKCPNDLDA LSRRSLILQELLRLVSSISPFKMKLDLIESQYEKMKQHVNLWKSDYHVKLNQLNQLTDYLKNAAPTPKNNFLRAMTSVLQ MQIAQYGITEDNEGINQLFKLGLHLLAMANEKIDEQYHLFKGYVKDQPEESPFEGILPAEDQKILVKTMIDYAMPKLSSK VLQDKLSALSSSDVLTKTLLDSIDRIVKENEKLNALSKVKLGKFGLDIREIEVIYSQALKISPQDALQYTAQQCDAQLLS MAFPDSQNYIIESISNKKVKTIAELIHSKEFIYQIIKTEVFKQVDPNEKIRLQAATELYQLLGRIMDKQINLFTKMNLEQ 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? 17 'polypeptide(L)' no no ;MTKMDIRGAVDAAVPTNIIAAKAAEVRANKVNWQSYLQGQMISAEDCEFIQRFEMKRSPEEKQEMLQTEGSQCAKTFINL MTHICKEQTVQYILTMVDDMLQENHQRVSIFFDYARCSKNTAWPYFLPMLNRQDPFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSD LNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTVSSSDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQ YQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDILQESVKEKVTRIILAAFRNFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLEN LEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEV SDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAA ARS ; ;MTKMDIRGAVDAAVPTNIIAAKAAEVRANKVNWQSYLQGQMISAEDCEFIQRFEMKRSPEEKQEMLQTEGSQCAKTFINL MTHICKEQTVQYILTMVDDMLQENHQRVSIFFDYARCSKNTAWPYFLPMLNRQDPFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSD LNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTVSSSDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQ YQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDILQESVKEKVTRIILAAFRNFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLEN LEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEV 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ASN P 379 LEU P 383 5 ? 5 HELX_P HELX_P315 BI9 GLU HA 385 ? ASN HA 387 ? GLU P 385 ASN P 387 5 ? 3 HELX_P HELX_P316 BJ1 TYR HA 388 ? VAL HA 400 ? TYR P 388 VAL P 400 1 ? 13 HELX_P HELX_P317 BJ2 ASP HA 403 ? HIS HA 420 ? ASP P 403 HIS P 420 1 ? 18 HELX_P HELX_P318 BJ3 ARG HA 423 ? GLY HA 432 ? ARG P 423 GLY P 432 1 ? 10 HELX_P HELX_P319 BJ4 GLY HA 432 ? HIS HA 442 ? GLY P 432 HIS P 442 1 ? 11 HELX_P HELX_P320 BJ5 ASP HA 445 ? VAL HA 461 ? ASP P 445 VAL P 461 1 ? 17 HELX_P HELX_P321 BJ6 GLN IA 21 ? SER IA 32 ? GLN W 21 SER W 32 1 ? 12 HELX_P HELX_P322 BJ7 SER IA 46 ? GLY IA 55 ? SER W 46 GLY W 55 1 ? 10 HELX_P HELX_P323 BJ8 GLU IA 56 ? LEU IA 58 ? GLU W 56 LEU W 58 5 ? 3 HELX_P HELX_P324 BJ9 PRO IA 59 ? ARG IA 72 ? PRO W 59 ARG W 72 1 ? 14 HELX_P HELX_P325 BK1 GLN IA 88 ? LYS IA 100 ? GLN W 88 LYS W 100 1 ? 13 HELX_P HELX_P326 BK2 ASN IA 102 ? SER IA 115 ? ASN W 102 SER W 115 1 ? 14 HELX_P HELX_P327 BK3 ALA IA 123 ? GLN IA 145 ? ALA W 123 GLN W 145 1 ? 23 HELX_P HELX_P328 BK4 ASN IA 159 ? SER IA 171 ? ASN W 159 SER W 171 1 ? 13 HELX_P HELX_P329 BK5 GLY IA 183 ? ASP IA 188 ? GLY W 183 ASP W 188 5 ? 6 HELX_P HELX_P330 BK6 ASP IA 192 ? VAL IA 203 ? ASP W 192 VAL W 203 1 ? 12 HELX_P HELX_P331 BK7 VAL IA 203 ? PHE IA 218 ? VAL W 203 PHE W 218 1 ? 16 HELX_P HELX_P332 BK8 ASP IA 247 ? GLN IA 257 ? ASP W 247 GLN W 257 1 ? 11 HELX_P HELX_P333 BK9 LEU IA 258 ? ARG IA 263 ? LEU W 258 ARG W 263 5 ? 6 HELX_P HELX_P334 BL1 SER IA 272 ? GLY IA 276 ? SER W 272 GLY W 276 1 ? 5 HELX_P HELX_P335 BL2 SER IA 278 ? THR IA 287 ? SER W 278 THR W 287 1 ? 10 HELX_P HELX_P336 BL3 ASP IA 430 ? GLY IA 441 ? ASP W 430 GLY W 441 1 ? 12 HELX_P HELX_P337 BL4 SER JA 124 ? LEU JA 128 ? SER F 124 LEU F 128 5 ? 5 HELX_P HELX_P338 BL5 ASN JA 159 ? ARG JA 163 ? ASN F 159 ARG F 163 5 ? 5 HELX_P HELX_P339 BL6 PRO JA 198 ? ALA JA 210 ? PRO F 198 ALA F 210 1 ? 13 HELX_P HELX_P340 BL7 ASP JA 218 ? GLU JA 225 ? 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THR F 472 LEU F 483 1 ? 12 HELX_P HELX_P354 BN3 PRO JA 488 ? LEU JA 492 ? PRO F 488 LEU F 492 5 ? 5 HELX_P HELX_P355 BN4 PRO JA 496 ? TYR JA 504 ? PRO F 496 TYR F 504 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? K CYS 371 SG ? ? ? 1_555 K CYS 418 SG ? ? U CYS 371 U CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? covale1 covale one ? A ASN 488 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? R ASN 488 R NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? I ASN 70 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? S ASN 70 S NAG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? K ASN 261 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? U ASN 261 U NAG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? K ASN 273 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? U ASN 273 U NAG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? K ASN 350 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? U ASN 350 U NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG KA . ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 312 B . ? LEU 312 O PRO 313 B ? PRO 313 O 1 1.51 2 PHE 445 Y . ? PHE 445 A PRO 446 Y ? PRO 446 A 1 -0.42 3 PHE 445 Z . ? PHE 445 B PRO 446 Z ? PRO 446 B 1 -3.49 4 TYR 389 AA . ? TYR 389 D PRO 390 AA ? PRO 390 D 1 -2.39 5 TYR 389 BA . ? TYR 389 E PRO 390 BA ? PRO 390 E 1 -5.86 6 TYR 389 JA . ? TYR 389 F PRO 390 JA ? PRO 390 F 1 -4.24 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 45 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 8 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 8 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 5 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 12 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 4 ? anti-parallel AA1 1 5 ? anti-parallel AA1 2 4 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 1 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 39 ? anti-parallel AA6 5 6 ? parallel AA6 5 7 ? anti-parallel AA6 7 8 ? anti-parallel AA6 8 32 ? anti-parallel AA6 9 10 ? parallel AA6 9 11 ? anti-parallel AA6 11 12 ? anti-parallel AA6 12 25 ? anti-parallel AA6 13 14 ? anti-parallel AA6 13 18 ? anti-parallel AA6 13 43 ? anti-parallel AA6 14 17 ? anti-parallel AA6 15 16 ? anti-parallel AA6 15 18 ? anti-parallel AA6 16 17 ? anti-parallel AA6 16 26 ? anti-parallel AA6 19 20 ? anti-parallel AA6 19 24 ? anti-parallel AA6 19 36 ? anti-parallel AA6 20 23 ? anti-parallel AA6 21 22 ? anti-parallel AA6 21 24 ? anti-parallel AA6 22 23 ? anti-parallel AA6 22 40 ? anti-parallel AA6 25 31 ? anti-parallel AA6 26 27 ? anti-parallel AA6 27 30 ? anti-parallel AA6 28 29 ? anti-parallel AA6 28 31 ? anti-parallel AA6 29 30 ? anti-parallel AA6 32 38 ? anti-parallel AA6 33 34 ? anti-parallel AA6 34 37 ? anti-parallel AA6 35 36 ? anti-parallel AA6 35 38 ? anti-parallel AA6 36 37 ? anti-parallel AA6 39 45 ? anti-parallel AA6 40 41 ? anti-parallel AA6 41 44 ? anti-parallel AA6 42 43 ? anti-parallel AA6 42 45 ? anti-parallel AA6 43 44 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 6 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 3 6 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB1 4 5 ? parallel AB1 5 6 ? parallel AB1 6 7 ? parallel AB1 7 8 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? parallel AB8 5 6 ? parallel AB8 6 7 ? parallel AB8 7 8 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD5 4 5 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? parallel AE2 2 3 ? parallel AE2 3 4 ? parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 12 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 3 12 ? anti-parallel AE5 4 6 ? anti-parallel AE5 5 8 ? anti-parallel AE5 6 7 ? anti-parallel AE5 8 9 ? anti-parallel AE5 9 10 ? anti-parallel AE5 10 11 ? anti-parallel AE5 11 12 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? parallel AE7 2 3 ? parallel AE7 3 4 ? parallel AE7 4 5 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? parallel AF1 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 MET A 10 ? 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