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_entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 894 human ? 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UNK I 8 UNK I 14 5 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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D CYS 968 D ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 92 A . ? ASP 73 A PRO 93 A ? PRO 74 A 1 -2.57 2 ASP 92 B . ? ASP 73 B PRO 93 B ? 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AF8 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF7 3 4 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASP A 26 ? 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LEU A 261 THR A 262 AA6 1 LEU A 289 ? TRP A 294 ? LEU A 270 TRP A 275 AA6 2 LEU A 301 ? THR A 306 ? LEU A 282 THR A 287 AA6 3 ILE A 312 ? ASP A 316 ? ILE A 293 ASP A 297 AA6 4 ILE A 333 ? VAL A 337 ? ILE A 314 VAL A 318 AA7 1 SER A 346 ? TRP A 349 ? SER A 327 TRP A 330 AA7 2 ARG A 356 ? VAL A 360 ? ARG A 337 VAL A 341 AA7 3 MET A 366 ? THR A 370 ? MET A 347 THR A 351 AA8 1 ILE A 375 ? ALA A 378 ? ILE A 356 ALA A 359 AA8 2 LEU A 385 ? CYS A 389 ? LEU A 366 CYS A 370 AA8 3 LEU A 393 ? GLU A 398 ? LEU A 374 GLU A 379 AA8 4 PHE E 2 ? ILE E 7 ? PHE E 2 ILE E 7 AA9 1 VAL A 752 ? SER A 755 ? VAL A 733 SER A 736 AA9 2 HIS C 716 ? CYS C 719 ? HIS C 716 CYS C 719 AB1 1 GLY A 852 ? HIS A 854 ? GLY A 833 HIS A 835 AB1 2 PHE A 843 ? CYS A 846 ? PHE A 824 CYS A 827 AB1 3 LEU C 753 ? TRP C 756 ? LEU C 753 TRP C 756 AB1 4 GLY C 763 ? GLY C 764 ? GLY C 763 GLY C 764 AB2 1 ASP B 26 ? TRP B 29 ? ASP B 7 TRP B 10 AB2 2 ARG B 36 ? CYS B 40 ? ARG B 17 CYS B 21 AB2 3 LEU B 44 ? SER B 51 ? LEU B 25 SER B 32 AB2 4 SER B 68 ? ASN B 76 ? SER B 49 ASN B 57 AB2 5 SER B 61 ? ARG B 63 ? SER B 42 ARG B 44 AB3 1 MET B 82 ? TRP B 87 ? MET B 63 TRP B 68 AB3 2 LEU B 96 ? GLN B 101 ? LEU B 77 GLN B 82 AB3 3 VAL B 106 ? SER B 110 ? VAL B 87 SER B 91 AB3 4 GLU B 126 ? PHE B 127 ? GLU B 107 PHE B 108 AB4 1 CYS B 135 ? TRP B 140 ? CYS B 116 TRP B 121 AB4 2 TRP B 147 ? LEU B 152 ? TRP B 128 LEU B 133 AB4 3 VAL B 161 ? ASP B 165 ? VAL B 142 ASP B 146 AB4 4 TYR B 198 ? LEU B 200 ? TYR B 179 LEU B 181 AB5 1 LEU B 209 ? TRP B 211 ? LEU B 190 TRP B 192 AB5 2 LEU B 218 ? GLY B 222 ? LEU B 199 GLY B 203 AB5 3 ASN B 226 ? ASP B 231 ? ASN B 207 ASP B 212 AB5 4 ASN B 234 ? ASN B 242 ? ASN B 215 ASN B 223 AB6 1 GLN B 247 ? VAL B 251 ? GLN B 228 VAL B 232 AB6 2 ARG B 258 ? TYR B 263 ? ARG B 239 TYR B 244 AB6 3 GLN B 266 ? ASP B 271 ? GLN B 247 ASP B 252 AB6 4 LEU B 280 ? THR B 281 ? LEU B 261 THR B 262 AB7 1 LEU B 289 ? TRP B 294 ? LEU B 270 TRP B 275 AB7 2 LEU B 301 ? THR B 306 ? LEU B 282 THR B 287 AB7 3 ILE B 312 ? ASP B 316 ? ILE B 293 ASP B 297 AB7 4 ILE B 333 ? VAL B 337 ? ILE B 314 VAL B 318 AB8 1 SER B 346 ? TRP B 349 ? SER B 327 TRP B 330 AB8 2 MET B 357 ? VAL B 360 ? MET B 338 VAL B 341 AB8 3 MET B 366 ? PHE B 369 ? MET B 347 PHE B 350 AB9 1 SER B 376 ? ALA B 378 ? SER B 357 ALA B 359 AB9 2 LEU B 385 ? ALA B 388 ? LEU B 366 ALA B 369 AB9 3 LEU B 393 ? GLU B 398 ? LEU B 374 GLU B 379 AB9 4 PHE F 2 ? ILE F 7 ? PHE F 2 ILE F 7 AC1 1 SER B 762 ? ILE B 763 ? SER B 743 ILE B 744 AC1 2 VAL B 752 ? CYS B 756 ? VAL B 733 CYS B 737 AC1 3 ILE D 896 ? TYR D 901 ? ILE D 896 TYR D 901 AC1 4 GLU D 908 ? VAL D 909 ? GLU D 908 VAL D 909 AC2 1 HIS B 851 ? HIS B 854 ? HIS B 832 HIS B 835 AC2 2 PHE B 843 ? CYS B 846 ? PHE B 824 CYS B 827 AC2 3 SER D 934 ? PHE D 937 ? SER D 934 PHE D 937 AC2 4 GLY D 944 ? HIS D 946 ? GLY D 944 HIS D 946 AC3 1 MET C 21 ? HIS C 24 ? MET C 21 HIS C 24 AC3 2 SER C 322 ? LEU C 327 ? SER C 322 LEU C 327 AC3 3 ASP C 310 ? SER C 318 ? ASP C 310 SER C 318 AC3 4 THR C 300 ? HIS C 307 ? THR C 300 HIS C 307 AC4 1 ALA C 29 ? VAL C 34 ? ALA C 29 VAL C 34 AC4 2 GLN C 40 ? GLY C 45 ? GLN C 40 GLY C 45 AC4 3 PHE C 49 ? ILE C 54 ? PHE C 49 ILE C 54 AC4 4 PHE C 59 ? ASN C 64 ? PHE C 59 ASN C 64 AC5 1 CYS C 77 ? TRP C 82 ? CYS C 77 TRP C 82 AC5 2 LEU C 89 ? ALA C 94 ? LEU C 89 ALA C 94 AC5 3 VAL C 99 ? ASN C 103 ? VAL C 99 ASN C 103 AC5 4 GLN C 112 ? PHE C 116 ? GLN C 112 PHE C 116 AC6 1 VAL C 123 ? PHE C 128 ? VAL C 123 PHE C 128 AC6 2 VAL C 135 ? SER C 140 ? VAL C 135 SER C 140 AC6 3 PHE C 144 ? ASP C 149 ? PHE C 144 ASP C 149 AC6 4 SER C 157 ? SER C 160 ? SER C 157 SER C 160 AC7 1 VAL C 166 ? PHE C 171 ? VAL C 166 PHE C 171 AC7 2 THR C 178 ? PHE C 183 ? THR C 178 PHE C 183 AC7 3 ASN C 187 ? ASP C 192 ? ASN C 187 ASP C 192 AC7 4 ARG C 201 ? THR C 204 ? ARG C 201 THR C 204 AC8 1 VAL C 210 ? TRP C 215 ? VAL C 210 TRP C 215 AC8 2 TRP C 222 ? GLY C 227 ? TRP C 222 GLY C 227 AC8 3 MET C 231 ? ASP C 236 ? MET C 231 ASP C 236 AC8 4 LYS C 243 ? GLN C 249 ? LYS C 243 GLN C 249 AC9 1 VAL C 254 ? TRP C 259 ? VAL C 254 TRP C 259 AC9 2 HIS C 266 ? SER C 271 ? HIS C 266 SER C 271 AC9 3 ILE C 278 ? ASP C 282 ? ILE C 278 ASP C 282 AC9 4 ALA C 291 ? PHE C 293 ? ALA C 291 PHE C 293 AD1 1 GLU C 341 ? TYR C 345 ? GLU C 341 TYR C 345 AD1 2 LEU C 351 ? LYS C 356 ? LEU C 351 LYS C 356 AD1 3 SER C 395 ? GLU C 401 ? SER C 395 GLU C 401 AD1 4 VAL G 3 ? ILE G 7 ? VAL G 3 ILE G 7 AD2 1 GLY D 541 ? CYS D 545 ? GLY D 541 CYS D 545 AD2 2 TYR D 549 ? PHE D 553 ? TYR D 549 PHE D 553 AD2 3 LYS D 646 ? ASP D 651 ? LYS D 646 ASP D 651 AD2 4 ILE H 5 ? ASP H 9 ? ILE H 5 ASP H 9 AD3 1 ILE E 15 ? PHE E 20 ? ILE E 15 PHE E 20 AD3 2 ARG E 26 ? SER E 31 ? ARG E 26 SER E 31 AD3 3 SER E 35 ? LYS E 41 ? SER E 35 LYS E 41 AD3 4 TRP E 47 ? LYS E 54 ? TRP E 47 LYS E 54 AD4 1 VAL E 60 ? TRP E 65 ? VAL E 60 TRP E 65 AD4 2 VAL E 73 ? SER E 78 ? VAL E 73 SER E 78 AD4 3 ALA E 83 ? VAL E 90 ? ALA E 83 VAL E 90 AD4 4 SER E 101 ? 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H SER 3 1470 1 Y 1 H PRO 164 ? H PRO 164 1471 1 Y 1 H GLY 165 ? H GLY 165 1472 1 Y 1 H SER 166 ? H SER 166 1473 1 Y 1 H LEU 167 ? H LEU 167 1474 1 Y 1 H ILE 168 ? H ILE 168 1475 1 Y 1 H ASP 169 ? H ASP 169 1476 1 Y 1 H HIS 170 ? H HIS 170 1477 1 Y 1 H PRO 171 ? H PRO 171 1478 1 Y 1 H SER 172 ? H SER 172 1479 1 Y 1 H GLY 173 ? H GLY 173 1480 1 Y 1 H GLN 174 ? H GLN 174 1481 1 Y 1 H LYS 175 ? H LYS 175 1482 1 Y 1 H PRO 176 ? H PRO 176 1483 1 Y 1 H ASP 302 ? H ASP 302 1484 1 Y 1 H VAL 303 ? H VAL 303 1485 1 Y 1 H ASN 304 ? H ASN 304 1486 1 Y 1 H LYS 305 ? H LYS 305 1487 1 Y 1 H GLY 306 ? H GLY 306 1488 1 Y 1 H GLN 307 ? H GLN 307 1489 1 Y 1 H GLY 308 ? H GLY 308 1490 1 Y 1 H SER 309 ? H SER 309 1491 1 Y 1 H VAL 310 ? H VAL 310 1492 1 Y 1 H SER 311 ? H SER 311 1493 1 Y 1 H ALA 312 ? H ALA 312 1494 1 Y 1 H SER 313 ? H SER 313 1495 1 Y 1 H VAL 314 ? H VAL 314 1496 1 Y 1 H THR 315 ? H THR 315 1497 1 Y 1 H GLU 316 ? H GLU 316 1498 1 Y 1 H GLY 317 ? H GLY 317 1499 1 Y 1 H GLN 318 ? H GLN 318 1500 1 Y 1 H GLN 319 ? H GLN 319 1501 1 Y 1 H ASN 320 ? H ASN 320 1502 1 Y 1 H GLU 321 ? H GLU 321 1503 1 Y 1 H GLN 322 ? H GLN 322 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 50 mM ? HEPES 1 2 150 mM ? 'sodium chloride' 1 3 0.1 % ? CHAPS 1 4 50 mM ? L-arginine 1 5 50 mM ? L-glutamate 1 6 2 mM ? 'magnesium chloride' 1 7 2 mM ? dithiothreitol # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 1.1 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell HEK-293T _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 2 _em_image_processing.details ;Movie frames were weighted according to electron dose and particle movement. Please note that the two datasets collected at (1) UMass and (2) MIT.nano were eventually pixel-size-matched and merged into a single dataset. ; # loop_ _em_image_recording.id _em_image_recording.imaging_id _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image _em_image_recording.average_exposure_time _em_image_recording.details _em_image_recording.detector_mode _em_image_recording.film_or_detector_model _em_image_recording.num_diffraction_images _em_image_recording.num_grids_imaged _em_image_recording.num_real_images _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram 1 1 44 2.4 ;Movie stacks were recorded in super-resolution counting mode at the UMass Medical School's Cryo-EM Core Facility in Worcester, Massachusetts, USA. 30 frames per stack. ; ? 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' ? 1 4103 ? 2 1 47 4.0 'Movie stacks were recorded in super-resolution counting mode at MIT.nano in Cambridge, Massachusetts, USA. 30 frames per stack.' ? 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' ? 2 28792 ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Bioquantum' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.details ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;The reported particle number is the sum of particles from two datasets, including parallel picking strategies. See details in the methods section of Valenstein and Rogala et al (2022). ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 7237873 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' 'UMass dataset' SerialEM 3.8.0 ? ? 1 3 'IMAGE ACQUISITION' 'MIT.nano dataset' EPU 2.7.0 ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? Gctf 1.06 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? Coot 0.9.7 ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.16 ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.20.1 ? 1 ? 12 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0 1 ? ? 13 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.1 1 ? ? 14 CLASSIFICATION ? RELION 3.1 1 ? ? 15 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 3.2.0 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 3.0 _em_specimen.details '95% pure, monodisperse protein complex. Partial loss of a few subunits observed. Contaminating CCT chaperonin present.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' 'K99 CA255926' 1 'Tuberous Sclerosis Association' 'United States' 2018-F01 2 'Other private' ? 'Charles King Trust' 3 'Lustgarten Foundation' 'United States' ? 4 'Department of Defense (DOD, United States)' 'United States' TS200035 5 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'T32 GM007753' 6 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' 'F30 CA228229' 7 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' 'F31 CA180271' 8 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'F31 GM121093' 9 'Other private' ? 'Koch Institute Graduate Fellowship' 10 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' 'R01 CA103866' 11 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' 'R01 CA129105' 12 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'R01 AI047389' 13 'Department of Defense (DOD, United States)' 'United States' W81XWH-21-1-0260 14 'Other private' ? 'Leo Foundation' 15 'American Cancer Society' 'United States' ? 16 'Howard Hughes Medical Institute (HHMI)' 'United States' ? 17 # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 8 _pdbx_entity_nonpoly.name 'ZINC ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id ZN # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ;Peak elution of the recombinant protein complex matches that of the endogenous GATOR2. Elution volume of 8.5 mL from a TSKgel G4000SWxl column corresponds to a large MDa-size particle. ; 2 1 'electron microscopy' 'Clear intact C2-symmetric particles, 30x20 nm in size.' #