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17 ;MVGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGH FGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQ LVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVGSWKKDRATGDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLP VPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGR PVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTQLVRNGPNEHP GAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSPYNA DFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVI PTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQ VCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVR FLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFV ENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEK QSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNI RRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQ AFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLNTFHFAGVASKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYL EPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLLDEEAEQSFDQQSPWLLRLELDRA AMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVRPKSLDAETEAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIE RVVMMKYDRKVPSPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDG SYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGA FDVMIDEESLVKYMPEQKITEIEDGQDGGVTPYSNESGLVNADLDVKDELMFSPLVDSGSNDAMAGGFTAYGGADYGEAT SPFGAYGEAPTSPGFGVSSPGFSPTSPTYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSP TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP SYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPGYSPGSPAYSPKQDEQKHNENENSR ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7UIG a 1 ? 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Q12321 1 ? 566 ? 1 566 2 2 7UIG d 1 ? 284 ? Q12343 1 ? 284 ? 1 284 3 3 7UIG f 1 ? 295 ? P38782 1 ? 295 ? 1 295 4 4 7UIG g 1 ? 222 ? Q08278 1 ? 222 ? 1 222 5 5 7UIG h 1 ? 223 ? P38304 1 ? 223 ? 1 223 6 6 7UIG i 1 ? 149 ? P33308 1 ? 149 ? 1 149 7 7 7UIG j 1 ? 157 ? Q06213 1 ? 157 ? 1 157 8 8 7UIG k 1 ? 115 ? Q99278 1 ? 115 ? 1 115 9 9 7UIG n 1 ? 1082 ? P19263 1 ? 1082 ? 1 1082 10 10 7UIG q 1 ? 687 ? P32569 1 ? 687 ? 1 687 11 11 7UIG r 1 ? 307 ? P32585 1 ? 307 ? 1 307 12 12 7UIG s 1 ? 220 ? P25046 1 ? 220 ? 1 220 13 13 7UIG t 1 ? 210 ? P34162 1 ? 210 ? 1 210 14 14 7UIG u 1 ? 140 ? P47822 1 ? 140 ? 1 140 15 15 7UIG v 1 ? 121 ? P32570 1 ? 121 ? 1 121 16 16 7UIG w 1 ? 127 ? P38633 1 ? 127 ? 1 127 17 17 7UIG z 1 ? 1733 ? P04050 1 ? 1733 ? -1559 173 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7UIG _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7UIG _struct.title 'Mediator-PIC Early (Mediator A)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7UIG _struct_keywords.text ;Divergent transcription, Mediator, RNA Polymerase II, PIC, Pre-Initiation, Activation, Transcription Factor, Gal4, Gal4VP16, TRANSCRIPTION ; _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 6 ? LYS A 22 ? SER a 6 LYS a 22 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 27 ? LEU A 38 ? THR a 27 LEU a 38 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 102 ? LYS A 110 ? ASN a 102 LYS a 110 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 114 ? SER A 131 ? LEU a 114 SER a 131 1 ? 18 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 163 ? ASN A 182 ? ASP a 163 ASN a 182 1 ? 20 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 279 ? GLU A 281 ? SER a 279 GLU a 281 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO A 297 ? ASN A 305 ? PRO a 297 ASN a 305 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 331 ? LEU A 335 ? SER a 331 LEU a 335 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 336 ? VAL A 351 ? ASP a 336 VAL a 351 1 ? 16 HELX_P HELX_P10 AB1 VAL A 351 ? THR A 361 ? VAL a 351 THR a 361 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP A 550 ? SER A 566 ? ASP a 550 SER a 566 1 ? 17 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN B 32 ? VAL B 40 ? ASN d 32 VAL d 40 1 ? 9 HELX_P HELX_P13 AB4 VAL B 40 ? ARG B 62 ? VAL d 40 ARG d 62 1 ? 23 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN B 66 ? GLU B 89 ? ASN d 66 GLU d 89 1 ? 24 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN B 92 ? LEU B 128 ? ASN d 92 LEU d 128 1 ? 37 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU B 132 ? ILE B 148 ? GLU d 132 ILE d 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN B 149 ? LYS B 165 ? ASN d 149 LYS d 165 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA B 184 ? GLY B 191 ? ALA d 184 GLY d 191 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY B 191 ? HIS B 199 ? GLY d 191 HIS d 199 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 SER C 13 ? PHE C 20 ? SER f 13 PHE f 20 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN C 26 ? GLU C 33 ? ASN f 26 GLU f 33 1 ? 8 HELX_P HELX_P22 AC4 SER C 41 ? ASN C 56 ? SER f 41 ASN f 56 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA C 89 ? TYR C 97 ? ALA f 89 TYR f 97 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 AC6 TYR C 97 ? MET C 108 ? TYR f 97 MET f 108 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 ILE C 166 ? ILE C 192 ? ILE f 166 ILE f 192 1 ? 27 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO D 18 ? PHE D 23 ? PRO g 18 PHE g 23 5 ? 6 HELX_P HELX_P27 AC9 THR D 24 ? LYS D 43 ? THR g 24 LYS g 43 1 ? 20 HELX_P HELX_P28 AD1 TYR D 112 ? ASN D 140 ? TYR g 112 ASN g 140 1 ? 29 HELX_P HELX_P29 AD2 PRO D 141 ? MET D 143 ? PRO g 141 MET g 143 5 ? 3 HELX_P HELX_P30 AD3 TYR D 144 ? ARG D 166 ? TYR g 144 ARG g 166 1 ? 23 HELX_P HELX_P31 AD4 SER D 170 ? GLY D 213 ? SER g 170 GLY g 213 1 ? 44 HELX_P HELX_P32 AD5 GLN E 31 ? SER E 55 ? 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O TYR f 161 AA7 1 2 N GLU C 193 ? N GLU f 193 O HIS C 201 ? O HIS f 201 AA8 1 2 N ALA D 78 ? N ALA g 78 O SER D 81 ? O SER g 81 AA9 1 2 N LYS I 272 ? N LYS n 272 O ARG I 275 ? O ARG n 275 AA9 2 3 N PHE I 278 ? N PHE n 278 O ILE I 286 ? O ILE n 286 AA9 3 4 N GLN I 287 ? N GLN n 287 O ASP I 301 ? O ASP n 301 AB1 1 2 N ASN I 403 ? N ASN n 403 O THR I 412 ? O THR n 412 AB1 2 3 N VAL I 413 ? N VAL n 413 O ILE I 427 ? O ILE n 427 AB1 3 4 N GLY I 430 ? N GLY n 430 O ILE I 439 ? O ILE n 439 AB1 4 5 N LEU I 440 ? N LEU n 440 O TYR I 457 ? O TYR n 457 AB2 1 2 N GLN I 490 ? N GLN n 490 O LEU I 500 ? O LEU n 500 AB2 2 3 N LEU I 503 ? N LEU n 503 O ALA I 511 ? O ALA n 511 AB2 3 4 N LYS I 516 ? N LYS n 516 O TYR I 525 ? O TYR n 525 AB3 1 2 N SER I 575 ? N SER n 575 O ARG I 628 ? O ARG n 628 AB3 2 3 N ARG I 623 ? N ARG n 623 O ILE I 642 ? O ILE n 642 AB3 3 4 N TYR I 637 ? N TYR n 637 O GLY I 656 ? O GLY n 656 AB3 4 5 N VAL I 659 ? N VAL n 659 O ASN I 666 ? O ASN n 666 AB3 4 6 N VAL I 651 ? 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1 MET 1 1 ? ? ? a . n A 1 2 VAL 2 2 ? ? ? a . n A 1 3 GLU 3 3 ? ? ? a . n A 1 4 GLY 4 4 ? ? ? a . n A 1 5 ASP 5 5 ? ? ? a . n A 1 6 SER 6 6 6 SER SER a . n A 1 7 TYR 7 7 7 TYR TYR a . n A 1 8 VAL 8 8 8 VAL VAL a . n A 1 9 GLU 9 9 9 GLU GLU a . n A 1 10 THR 10 10 10 THR THR a . n A 1 11 LEU 11 11 11 LEU LEU a . n A 1 12 ASP 12 12 12 ASP ASP a . n A 1 13 SER 13 13 13 SER SER a . n A 1 14 MET 14 14 14 MET MET a . n A 1 15 ILE 15 15 15 ILE ILE a . n A 1 16 GLU 16 16 16 GLU GLU a . n A 1 17 LEU 17 17 17 LEU LEU a . n A 1 18 PHE 18 18 18 PHE PHE a . n A 1 19 LYS 19 19 19 LYS LYS a . n A 1 20 ASP 20 20 20 ASP ASP a . n A 1 21 TYR 21 21 21 TYR TYR a . n A 1 22 LYS 22 22 22 LYS LYS a . n A 1 23 PRO 23 23 23 PRO PRO a . n A 1 24 GLY 24 24 24 GLY GLY a . n A 1 25 SER 25 25 25 SER SER a . n A 1 26 ILE 26 26 26 ILE ILE a . n A 1 27 THR 27 27 27 THR THR a . n A 1 28 LEU 28 28 28 LEU LEU a . n A 1 29 GLU 29 29 29 GLU GLU a . n A 1 30 ASN 30 30 30 ASN ASN a . n A 1 31 ILE 31 31 31 ILE ILE a . n A 1 32 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