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GFP was cleaved to yield the full-length Pks13. ; 2 non-polymer syn 'UNKNOWN LIGAND' 312.530 2 ? ? ? ;The fatty acid ligand designated as UNL (unknown ligand) is a divided population of fatty acids of formula C55H106O2 and C40H78O2 as confirmed by mass spectrometry. ; 3 water nat water 18.015 390 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type 'polypeptide(L)' _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;MDENHSDSNLPEGTEPAGRPAPRTDMTVNEMREWLRNWVANATGQSADAIDESTPMVELGLSSRDAVAMASDIEDLTGVT LTATVAFRHPTIESLATVIIEGEPEPEPYDEDEDWSRTRDVEDIAIVGVATRFPGDLNTPDEMWEALLEGKDCVTDLPED RWTEFLDEPRIAERVKKARTRGGYLTDIKGFDSEFFALSKMEADNIDPQQRMALELTWEALEHARIPASSLRGESVGVYI GSSTNDYSFLAMSDPSIAHPYAITGTASSIIANRVSYFYDFRGPSVAVDTACSSSLVATHQGVQALRAGEADVAIVGGVN ALVTPLVTVGFDEVGGVLAPDGRIKSFSSDADGYARSEGGGMLVLKRISDARRDGDQILAVIAGSAVNHDGRSNGLLAPN PDAQAEVLRKAYKDAGINPRDVDYIEAHGTGTILGDPIEADALGRIVGKGRPADKPALLGAVKSNLGHLESAAGAASLAK 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LEU A 523 VAL A 528 5 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU A 614 ? GLU A 634 ? GLU A 589 GLU A 609 1 ? 21 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU A 648 ? SER A 665 ? LEU A 623 SER A 640 1 ? 18 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 665 ? ALA A 670 ? SER A 640 ALA A 645 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 672 ? ARG A 682 ? SER A 647 ARG A 657 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP A 696 ? GLU A 709 ? ASP A 671 GLU A 684 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY A 742 ? ASN A 749 ? GLY A 717 ASN A 724 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN A 749 ? GLY A 768 ? ASN A 724 GLY A 743 1 ? 20 HELX_P HELX_P28 AD1 SER A 770 ? ASP A 777 ? SER A 745 ASP A 752 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 TYR A 789 ? HIS A 812 ? TYR A 764 HIS A 787 1 ? 24 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY A 825 ? ALA A 833 ? GLY A 800 ALA A 808 1 ? 9 HELX_P HELX_P31 AD4 SER A 837 ? LEU A 859 ? SER A 812 LEU A 834 1 ? 23 HELX_P HELX_P32 AD5 SER A 873 ? PHE A 881 ? SER A 848 PHE A 856 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO A 903 ? SER A 916 ? PRO A 878 SER A 891 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 THR A 932 ? ASP A 936 ? THR A 907 ASP A 911 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU A 938 ? LEU A 946 ? LEU A 913 LEU A 921 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP A 977 ? HIS A 987 ? ASP A 952 HIS A 962 1 ? 11 HELX_P HELX_P37 AE1 TYR A 990 ? ASN A 1001 ? TYR A 965 ASN A 976 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 AE2 VAL A 1014 ? ALA A 1026 ? VAL A 989 ALA A 1001 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP A 1042 ? HIS A 1057 ? ASP A 1017 HIS A 1032 1 ? 16 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP A 1062 ? PHE A 1067 ? ASP A 1037 PHE A 1042 5 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 THR B 139 ? GLY B 150 ? THR B 114 GLY B 125 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU B 168 ? ALA B 178 ? GLU B 143 ALA B 153 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 AE7 SER B 199 ? ASN B 205 ? SER B 174 ASN B 180 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP B 207 ? ALA B 224 ? ASP B 182 ALA B 199 1 ? 18 HELX_P HELX_P45 AE9 PRO B 227 ? ARG B 232 ? PRO B 202 ARG B 207 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 ASN B 245 ? MET B 252 ? ASN B 220 MET B 227 1 ? 8 HELX_P HELX_P47 AF2 PRO B 260 ? ALA B 267 ? PRO B 235 ALA B 242 1 ? 8 HELX_P HELX_P48 AF3 ALA B 267 ? ASP B 280 ? ALA B 242 ASP B 255 1 ? 14 HELX_P HELX_P49 AF4 THR B 290 ? CYS B 292 ? THR B 265 CYS B 267 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 AF5 SER B 293 ? ALA B 308 ? SER B 268 ALA B 283 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 PRO B 325 ? GLY B 335 ? PRO B 300 GLY B 310 1 ? 11 HELX_P HELX_P52 AF7 ILE B 368 ? GLY B 375 ? ILE B 343 GLY B 350 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 AF8 ASN B 400 ? GLY B 416 ? ASN B 375 GLY B 391 1 ? 17 HELX_P HELX_P54 AF9 ASN B 418 ? VAL B 422 ? ASN B 393 VAL B 397 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 LEU B 434 ? VAL B 447 ? LEU B 409 VAL B 422 1 ? 14 HELX_P HELX_P56 AG2 VAL B 462 ? GLY B 467 ? VAL B 437 GLY B 442 1 ? 6 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU B 469 ? SER B 471 ? LEU B 444 SER B 446 5 ? 3 HELX_P HELX_P58 AG4 ALA B 472 ? ASP B 488 ? ALA B 447 ASP B 463 1 ? 17 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP B 504 ? ARG B 509 ? ASP B 479 ARG B 484 1 ? 6 HELX_P HELX_P60 AG6 LEU B 548 ? VAL B 553 ? LEU B 523 VAL B 528 5 ? 6 HELX_P HELX_P61 AG7 GLU B 614 ? GLU B 634 ? GLU B 589 GLU B 609 1 ? 21 HELX_P HELX_P62 AG8 LEU B 648 ? SER B 665 ? 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ASP B 952 HIS B 962 1 ? 11 HELX_P HELX_P77 AI5 TYR B 990 ? ASN B 1001 ? TYR B 965 ASN B 976 1 ? 12 HELX_P HELX_P78 AI6 VAL B 1014 ? ALA B 1026 ? VAL B 989 ALA B 1001 1 ? 13 HELX_P HELX_P79 AI7 ASP B 1042 ? HIS B 1057 ? ASP B 1017 HIS B 1032 1 ? 16 HELX_P HELX_P80 AI8 ASP B 1062 ? PHE B 1067 ? ASP B 1037 PHE B 1042 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? A CYS 292 SG ? ? ? 1_555 C UNL . C1 ? ? A CYS 267 A UNL 1901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.804 ? ? covale2 covale none ? B CYS 292 SG ? ? ? 1_555 D UNL . C1 ? ? B CYS 267 B UNL 1901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 22 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 6 ? 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TYR B 399 GLU B 401 AA1 21 ALA B 457 ? GLY B 460 ? ALA B 432 GLY B 435 AA1 22 LEU B 510 ? VAL B 512 ? LEU B 485 VAL B 487 AA2 1 GLY A 190 ? PHE A 191 ? GLY A 165 PHE A 166 AA2 2 LYS A 1091 ? GLU A 1092 ? LYS A 1066 GLU A 1067 AA3 1 VAL A 640 ? ALA A 646 ? VAL A 615 ALA A 621 AA3 2 SER A 688 ? ALA A 694 ? SER A 663 ALA A 669 AA3 3 VAL A 716 ? ALA A 719 ? VAL A 691 ALA A 694 AA4 1 PHE A 967 ? ILE A 968 ? PHE A 942 ILE A 943 AA4 2 GLY A 957 ? PHE A 959 ? GLY A 932 PHE A 934 AA4 3 ALA A 818 ? GLY A 821 ? ALA A 793 GLY A 796 AA4 4 VAL A 728 ? LEU A 731 ? VAL A 703 LEU A 706 AA4 5 THR A 1005 ? GLU A 1008 ? THR A 980 GLU A 983 AA4 6 GLN A 1032 ? ILE A 1034 ? GLN A 1007 ILE A 1009 AA5 1 GLU A 888 ? ALA A 894 ? GLU A 863 ALA A 869 AA5 2 GLN A 897 ? GLY A 902 ? GLN A 872 GLY A 877 AA5 3 LEU A 866 ? VAL A 870 ? LEU A 841 VAL A 845 AA5 4 ARG A 922 ? PHE A 924 ? ARG A 897 PHE A 899 AA6 1 GLY B 190 ? PHE B 191 ? GLY B 165 PHE B 166 AA6 2 LYS B 1091 ? GLU B 1092 ? LYS B 1066 GLU B 1067 AA7 1 VAL B 640 ? ALA B 646 ? VAL B 615 ALA B 621 AA7 2 SER B 688 ? ALA B 694 ? SER B 663 ALA B 669 AA7 3 VAL B 716 ? ALA B 719 ? VAL B 691 ALA B 694 AA8 1 PHE B 967 ? ILE B 968 ? PHE B 942 ILE B 943 AA8 2 GLY B 957 ? PHE B 959 ? GLY B 932 PHE B 934 AA8 3 ALA B 818 ? GLY B 821 ? ALA B 793 GLY B 796 AA8 4 VAL B 728 ? LEU B 731 ? VAL B 703 LEU B 706 AA8 5 THR B 1005 ? GLU B 1008 ? THR B 980 GLU B 983 AA8 6 GLN B 1032 ? ILE B 1034 ? GLN B 1007 ILE B 1009 AA9 1 GLU B 888 ? ALA B 894 ? GLU B 863 ALA B 869 AA9 2 GLN B 897 ? GLY B 902 ? GLN B 872 GLY B 877 AA9 3 LEU B 866 ? VAL B 870 ? LEU B 841 VAL B 845 AA9 4 ARG B 922 ? PHE B 924 ? 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GFP was cleaved to yield the full-length Pks13. ; 'Mycobacterial polyketide synthase 13' NATURAL COMPLEX 1 ? ? 2 1 'Linked to acyl transferase domain at the C-terminus' 'Ketosynthase domain' NATURAL COMPLEX 1 ? ? 3 1 'linked to ketosynthase domain at the N-terminus' 'Acyl transferase domain' NATURAL COMPLEX 1 ? ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7UK4 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 1500 _em_imaging.nominal_defocus_min 700 _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 283.15 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Full length pks13 was concentrated to 1.5 mg mL-1 for cryo-EM grid preparation. 4.5 uL of sample was applied to freshly glow discharged holey carbon on gold R1.2/1.3 300 mesh Quantifoil grids and blotted for 9 s with Whatman 1 filter paper at max humidity and 10oC in a FEI Mark IV Vitrobot, before vitrification in liquid nitrogen-cooled liquid ethane. ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7UK4 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7UK4 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7UK4 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 THR A 155 ? ? 69.69 -3.97 2 1 ASN A 220 ? ? -101.51 62.93 3 1 GLU A 285 ? ? 63.93 -11.32 4 1 ALA A 286 ? ? -172.66 141.76 5 1 LYS A 320 ? ? -102.77 75.51 6 1 ASP A 327 ? ? -141.96 43.86 7 1 LEU A 706 ? ? -101.72 78.33 8 1 ALA A 707 ? ? -92.92 -154.58 9 1 SER A 798 ? ? 70.84 -17.53 10 1 LEU A 799 ? ? -140.00 -22.20 11 1 GLN A 900 ? ? -98.27 35.38 12 1 HIS A 951 ? ? -93.65 57.57 13 1 ALA A 1052 ? ? 61.82 -2.17 14 1 THR B 155 ? ? 69.69 -3.97 15 1 ASN B 220 ? ? -101.53 62.97 16 1 GLU B 285 ? ? 63.88 -11.32 17 1 ALA B 286 ? ? -172.66 141.76 18 1 LYS B 320 ? ? -102.73 75.50 19 1 ASP B 327 ? ? -141.95 43.86 20 1 LEU B 706 ? ? -101.75 78.28 21 1 ALA B 707 ? ? -92.88 -154.55 22 1 SER B 798 ? ? 70.84 -17.53 23 1 LEU B 799 ? ? -140.00 -22.20 24 1 GLN B 900 ? ? -98.20 35.34 25 1 HIS B 951 ? ? -93.55 57.59 26 1 ALA B 1052 ? ? 61.88 -2.16 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 THR A 265 ? ? 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