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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.6077 ? 66093 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0460 ? 7405 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0047 ? 8452 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.4984 ? 17188 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 7V05 _struct.title 'Complex of Plasmodium falciparum circumsporozoite protein with 850 Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7V05 _struct_keywords.text 'antibody, malaria, Plasmodium falciparum, circumsporozoite protein, ANTIMICROBIAL PROTEIN, IMMUNE SYSTEM-CELL INVASION complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'ANTIMICROBIAL PROTEIN,IMMUNE SYSTEM/CELL INVASION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 1 ? 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CA N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7V05 7V05 ? 1 ? 1 2 PDB 7V05 7V05 ? 2 ? 1 3 UNP CSP_PLAF7 Q7K740 ? 3 ;FQEYQCYGSSSNTRVLNELNYDNAGTNLYNELEMNYYGKQENWYSLKKNSRSLGENDDGNNEDNEKLRKPKHKKLKQPAD GNPDPNANPNVDPNANPNVDPNANPNVDPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNAN PNANPNANPNANPNANPNVDPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNAN PNANPNANPNANPNKNNQGNGQGHNMPNDPNRNVDENANANSAVKNNNNEEPSDKHIKEYLNKIQNSLSTEWSPCSVTCG NGIQVRIKPGSANKPKDELDYANDIEKKICKMEKCSSVFNVVNSS ; 20 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7V05 A 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 2 2 7V05 a 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 3 1 7V05 B 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 4 2 7V05 b 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 5 1 7V05 C 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 6 2 7V05 c 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 7 1 7V05 D 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 8 2 7V05 d 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 9 1 7V05 E 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 10 2 7V05 e 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 11 1 7V05 F 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 12 2 7V05 f 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 13 1 7V05 G 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 14 2 7V05 g 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 15 1 7V05 H 1 ? 226 ? 7V05 1 ? 216 ? 1 216 16 2 7V05 h 1 ? 213 ? 7V05 1 ? 213 ? 1 213 17 3 7V05 X 1 ? 365 ? 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'expression tag' 267 10 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 29-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 29 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 28 ? 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AR1 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? 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The actual sequence of this protein is: FQEYQCYGSSSNTRVLNELNYDNAGTNLYNELEMNYYGKQENWYSLKKNSRSLGENDDGN NEDNEKLRKPKHKKLKQPADGNPDPNANPNVDPNANPNVDPNANPNVDPNANPNANPNAN PNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNVD PNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNANPNAN PNANPNANPNANPNKNNQGNGQGHNMPNDPNRNVDENANANSAVKNNNNEEPSDKHIKEY LNKIQNSLSTEWSPCSVTCGNGIQVRIKPGSANKPKDELDYANDIEKKICKMEKCSSVFN VVQSSPHHHHHH ; _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 O _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 a _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 TYR _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 185 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 OH _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 a _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 TYR _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 191 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 2.19 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER A 100 E ? -146.43 -159.93 2 1 ASP A 144 ? ? 61.61 64.20 3 1 SER a 30 ? ? 57.15 -125.70 4 1 ALA a 51 ? ? 68.54 -21.76 5 1 TYR a 94 ? ? 56.99 -148.04 6 1 SER B 100 E ? -146.27 -159.87 7 1 ASP B 144 ? ? 62.30 62.72 8 1 SER b 30 ? ? 57.36 -126.06 9 1 ALA b 51 ? ? 68.92 -21.55 10 1 TYR b 94 ? ? 56.83 -147.51 11 1 ASP C 144 ? ? 62.38 63.15 12 1 SER c 30 ? ? 57.37 -126.92 13 1 ALA c 51 ? ? 68.86 -21.98 14 1 TYR c 94 ? ? 56.73 -147.41 15 1 ASP D 144 ? ? 61.88 62.89 16 1 SER d 30 ? ? 57.23 -126.45 17 1 ALA d 51 ? ? 68.59 -22.16 18 1 TYR d 94 ? ? 56.89 -147.56 19 1 ASP E 144 ? ? 61.13 63.35 20 1 SER e 30 ? ? 57.39 -126.68 21 1 ALA e 51 ? ? 68.72 -21.90 22 1 TYR e 94 ? ? 57.15 -147.76 23 1 ASP F 144 ? ? 61.68 63.10 24 1 SER f 30 ? ? 56.93 -126.56 25 1 ALA f 51 ? ? 68.74 -21.82 26 1 TYR f 94 ? ? 57.16 -147.53 27 1 ASP G 144 ? ? 61.93 63.45 28 1 SER g 30 ? ? 57.25 -126.78 29 1 ALA g 51 ? ? 68.78 -21.64 30 1 TYR g 94 ? ? 57.11 -147.58 31 1 ASP H 144 ? ? 61.92 63.07 32 1 SER h 30 ? ? 57.17 -126.75 33 1 ALA h 51 ? ? 68.91 -21.64 34 1 TYR h 94 ? ? 56.83 -147.55 35 1 ASN X 29 ? ? -87.75 46.35 36 1 ALA X 38 ? ? -105.00 -165.25 37 1 ASN X 69 ? ? -92.17 55.76 38 1 ALA X 70 ? ? -102.53 -160.49 39 1 ALA X 86 ? ? -113.03 -164.51 40 1 ASN X 93 ? ? -94.26 48.34 41 1 ASN X 101 ? ? -97.98 38.85 42 1 ASN X 105 ? ? -114.49 -168.87 43 1 ALA X 110 ? ? -89.45 -159.24 44 1 ASP I 144 ? ? 62.05 63.15 45 1 SER i 30 ? ? 57.14 -126.68 46 1 ALA i 51 ? ? 68.77 -21.85 47 1 TYR i 94 ? ? 57.13 -148.06 48 1 ASP J 144 ? ? 61.27 63.85 49 1 SER j 30 ? ? 57.83 -125.57 50 1 ALA j 51 ? ? 68.42 -21.61 51 1 TYR j 94 ? ? 57.32 -147.32 52 1 ASP K 144 ? ? 62.14 62.90 53 1 SER k 30 ? ? 56.49 -127.21 54 1 ALA k 51 ? ? 68.60 -21.43 55 1 TYR k 94 ? ? 57.23 -147.11 56 1 ASP L 144 ? ? 61.72 62.74 57 1 SER l 30 ? ? 57.23 -126.93 58 1 ALA l 51 ? ? 67.87 -21.67 59 1 TYR l 94 ? ? 57.10 -147.12 60 1 ASP M 144 ? ? 62.14 62.39 61 1 SER m 30 ? ? 57.65 -126.66 62 1 ALA m 51 ? ? 68.59 -21.80 63 1 TYR m 94 ? ? 57.01 -147.47 64 1 ASP N 144 ? ? 61.23 63.50 65 1 SER n 30 ? ? 56.97 -126.29 66 1 ALA n 51 ? ? 68.91 -21.58 67 1 TYR n 94 ? ? 56.98 -147.51 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z # _em_3d_fitting.entry_id 7V05 _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7V05 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 165747 _em_3d_reconstruction.resolution 3.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 ? 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