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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.518 ? 5061 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.220 ? 509 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 597 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 668 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7V0M _struct.title 'Local refinement of ankyrin-1 (N-terminal half), class 1 of erythrocyte ankyrin-1 complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7V0M _struct_keywords.text 'Membrane Protein, ankyrin complex, Erythrocyte, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ANK1_HUMAN P16157 ? 1 ;MPYSVGFREADAATSFLRAARSGNLDKALDHLRNGVDINTCNQNGLNGLHLASKEGHVKMVVELLHKEIILETTTKKGNT ALHIAALAGQDEVVRELVNYGANVNAQSQKGFTPLYMAAQENHLEVVKFLLENGANQNVATEDGFTPLAVALQQGHENVV AHLINYGTKGKVRLPALHIAARNDDTRTAAVLLQNDPNPDVLSKTGFTPLHIAAHYENLNVAQLLLNRGASVNFTPQNGI TPLHIASRRGNVIMVRLLLDRGAQIETKTKDELTPLHCAARNGHVRISEILLDHGAPIQAKTKNGLSPIHMAAQGDHLDC VRLLLQYDAEIDDITLDHLTPLHVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLLKTGASIDAV TESGLTPLHVASFMGHLPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVAKYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHCAARI GHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAAREGHVETVLALLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAELLLERDA HPNAAGKNGLTPLHVAVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTPLHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSANAESVQGVTPLH LAAQEGHAEMVALLLSKQANGNLGNKSGLTPLHLVAQEGHVPVADVLIKHGVMVDATTRMGYTPLHVASHYGNIKLVKFL LQHQADVNAKTKLGYSPLHQAAQQGHTDIVTLLLKNGASPNEVSSDGTTPLAIAKRLGYISVTDVLKVVTDETSFVLVSD KHRMSFPETVDEILDVSEDEGEELISFKAERRDSRDVDEEKELLDFVPKLDQVVESPAIPRIPCAMPETVVIRSEEQEQA SKEYDEDSLIPSSPATETSDNISPVASPVHTGFLVSFMVDARGGSMRGSRHNGLRVVIPPRTCAAPTRITCRLVKPQKLS TPPPLAEEEGLASRIIALGPTGAQFLSPVIVEIPHFASHGRGDRELVVLRSENGSVWKEHRSRYGESYLDQILNGMDEEL GSLEELEKKRVCRIITTDFPLYFVIMSRLCQDYDTIGPEGGSLKSKLVPLVQATFPENAVTKRVKLALQAQPVPDELVTK LLGNQATFSPIVTVEPRRRKFHRPIGLRIPLPPSWTDNPRDSGEGDTTSLRLLCSVIGGTDQAQWEDITGTTKLVYANEC ANFTTNVSARFWLSDCPRTAEAVNFATLLYKELTAVPYMAKFVIFAKMNDPREGRLRCYCMTDDKVDKTLEQHENFVEVA RSRDIEVLEGMSLFAELSGNLVPVKKAAQQRSFHFQSFRENRLAMPVKVRDSSREPGGSLSFLRKAMKYEDTQHILCHLN ITMPPCAKGSGAEDRRRTPTPLALRYSILSESTPGSLSGTEQAEMKMAVISEHLGLSWAELARELQFSVEDINRIRVENP NSLLEQSVALLNLWVIREGQNANMENLYTALQSIDRGEIVNMLEGSGRQSRNLKPDRRHTDRDYSLSPSQMNGYSSLQDE LLSPASLGCALSSPLRADQYWNEVAVLDAIPLAATEHDTMLEMSDMQVWSAGLTPSLVTAEDSSLECSKAEDSDATGHEW KLEGALSEEPRGPELGSLELVEDDTVDSDATNGLIDLLEQEEGQRSEEKLPGSKRQDDATGAGQDSENEVSLVSGHQRGQ ARITHSPTVSQVTERSQDRLQDWDADGSIVSYLQDAAQGSWQEEVTQGPHSFQGTSTMTEGLEPGGSQEYEKVLVSVSEH TWTEQPEAESSQADRDRRQQGQEEQVQEAKNTFTQVVQGNEFQNIPGEQVTEEQFTDEQGNIVTKKIIRKVVRQIDLSSA DAAQEHEEVTVEGPLEDPSELEVDIDYFMKHSKDHTSTPNP ; 1 2 UNP B3AT_HUMAN P02730 ? 2 ;MEELQDDYEDMMEENLEQEEYEDPDIPESQMEEPAAHDTEATATDYHTTSHPGTHKVYVELQELVMDEKNQELRWMEAAR WVQLEENLGENGAWGRPHLSHLTFWSLLELRRVFTKGTVLLDLQETSLAGVANQLLDRFIFEDQIRPQDREELLRALLLK HSHAGELEALGGVKPAVLTRSGDPSQPLLPQHSSLETQLFCEQGDGGTEGHSPSGILEKIPPDSEATLVLVGRADFLEQP VLGFVRLQEAAELEAVELPVPIRFLFVLLGPEAPHIDYTQLGRAAATLMSERVFRIDAYMAQSRGELLHSLEGFLDCSLV LPPTDAPSEQALLSLVPVQRELLRRRYQSSPAKPDSSFYKGLDLNGGPDDPLQQTGQLFGGLVRDIRRRYPYYLSDITDA FSPQVLAAVIFIYFAALSPAITFGGLLGEKTRNQMGVSELLISTAVQGILFALLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFFSFCE TNGLEYIVGRVWIGFWLILLVVLVVAFEGSFLVRFISRYTQEIFSFLISLIFIYETFSKLIKIFQDHPLQKTYNYNVLMV PKPQGPLPNTALLSLVLMAGTFFFAMMLRKFKNSSYFPGKLRRVIGDFGVPISILIMVLVDFFIQDTYTQKLSVPDGFKV SNSSARGWVIHPLGLRSEFPIWMMFASALPALLVFILIFLESQITTLIVSKPERKMVKGSGFHLDLLLVVGMGGVAALFG MPWLSATTVRSVTHANALTVMGKASTPGAAAQIQEVKEQRISGLLVAVLVGLSILMEPILSRIPLAVLFGIFLYMGVTSL SGIQLFDRILLLFKPPKYHPDVPYVKRVKTWRMHLFTGIQIICLAVLWVVKSTPASLALPFVLILTVPLRRVLLPLIFRN VELQCLDADDAKATFDEEEGRDEYDEVAMPV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7V0M A 1 ? 1881 ? P16157 1 ? 1881 ? 1 1881 2 2 7V0M W 1 ? 911 ? P02730 1 ? 911 ? 1 911 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 11 ? GLY A 23 ? ASP A 11 GLY A 23 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 24 ? GLY A 35 ? ASN A 24 GLY A 35 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 47 ? GLY A 56 ? ASN A 47 GLY A 56 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 HIS A 57 ? LYS A 67 ? HIS A 57 LYS A 67 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 80 ? GLY A 89 ? THR A 80 GLY A 89 1 ? 10 HELX_P HELX_P6 AA6 GLN A 90 ? TYR A 100 ? GLN A 90 TYR A 100 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 AA7 THR A 113 ? GLU A 121 ? THR A 113 GLU A 121 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 AA8 HIS A 123 ? ASN A 133 ? HIS A 123 ASN A 133 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 THR A 146 ? GLN A 154 ? THR A 146 GLN A 154 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 HIS A 156 ? GLY A 167 ? HIS A 156 GLY A 167 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO A 175 ? ASN A 183 ? PRO A 175 ASN A 183 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 185 ? ASP A 196 ? ASP A 185 ASP A 196 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 THR A 208 ? GLU A 217 ? THR A 208 GLU A 217 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN A 218 ? ARG A 228 ? ASN A 218 ARG A 228 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 AB6 THR A 241 ? GLY A 250 ? THR A 241 GLY A 250 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN A 251 ? ARG A 261 ? ASN A 251 ARG A 261 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 274 ? ASN A 282 ? THR A 274 ASN A 282 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 HIS A 284 ? HIS A 294 ? HIS A 284 HIS A 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 307 ? GLY A 315 ? SER A 307 GLY A 315 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 HIS A 317 ? TYR A 327 ? HIS A 317 TYR A 327 1 ? 11 HELX_P HELX_P21 AC3 THR A 340 ? GLY A 349 ? THR A 340 GLY A 349 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 HIS A 350 ? LYS A 360 ? HIS A 350 LYS A 360 1 ? 11 HELX_P HELX_P23 AC5 THR A 373 ? LYS A 381 ? THR A 373 LYS A 381 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 AC6 HIS A 383 ? THR A 393 ? HIS A 383 THR A 393 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 THR A 406 ? GLY A 415 ? THR A 406 GLY A 415 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 AC8 HIS A 416 ? ARG A 426 ? HIS A 416 ARG A 426 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 THR A 439 ? ALA A 447 ? THR A 439 ALA A 447 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 AD1 HIS A 449 ? ASN A 459 ? HIS A 449 ASN A 459 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU B 4 ? ASP B 7 ? LEU W 4 ASP W 7 5 ? 4 HELX_P HELX_P30 AD3 TYR B 8 ? GLU B 17 ? TYR W 8 GLU W 17 1 ? 10 HELX_P HELX_P31 AD4 GLN B 18 ? GLU B 22 ? GLN W 18 GLU W 22 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _pdbx_validate_torsion.id 1 _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id ASN _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id A _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id 42 _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code ? _pdbx_validate_torsion.label_alt_id ? _pdbx_validate_torsion.phi -78.96 _pdbx_validate_torsion.psi -167.81 # _em_3d_fitting.entry_id 7V0M _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id A _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 4YZF _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 4YZF # _em_3d_reconstruction.entry_id 7V0M _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 126197 _em_3d_reconstruction.resolution 2.7 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ;Final gel filtration buffer contained 0.05% w/v digitonin, 130 mM KCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, 1 mM ATP, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8 mg/mL, and 0.01% w/v glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification. ; _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'Purified by density gradient centrifugation and size exclusion chromatography from digitonin-solubilized erythrocyte membranes.' _em_entity_assembly.name 'Erythrocyte ankyrin-1 complex' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7V0M _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 1500 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details '4-6 seconds, wait time 30 seconds' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7V0M _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7V0M _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7V0M _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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