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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 507 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7V0X _struct.title 'Local refinement of ankyrin-1 (C-terminal half), class 1 of erythrocyte ankyrin-1 complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7V0X _struct_keywords.text 'Membrane Protein, ankyrin complex, Erythrocyte, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code ANK1_HUMAN _struct_ref.pdbx_db_accession P16157 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MPYSVGFREADAATSFLRAARSGNLDKALDHLRNGVDINTCNQNGLNGLHLASKEGHVKMVVELLHKEIILETTTKKGNT ALHIAALAGQDEVVRELVNYGANVNAQSQKGFTPLYMAAQENHLEVVKFLLENGANQNVATEDGFTPLAVALQQGHENVV AHLINYGTKGKVRLPALHIAARNDDTRTAAVLLQNDPNPDVLSKTGFTPLHIAAHYENLNVAQLLLNRGASVNFTPQNGI TPLHIASRRGNVIMVRLLLDRGAQIETKTKDELTPLHCAARNGHVRISEILLDHGAPIQAKTKNGLSPIHMAAQGDHLDC VRLLLQYDAEIDDITLDHLTPLHVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLLKTGASIDAV TESGLTPLHVASFMGHLPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVAKYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHCAARI GHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAAREGHVETVLALLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAELLLERDA HPNAAGKNGLTPLHVAVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTPLHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSANAESVQGVTPLH LAAQEGHAEMVALLLSKQANGNLGNKSGLTPLHLVAQEGHVPVADVLIKHGVMVDATTRMGYTPLHVASHYGNIKLVKFL LQHQADVNAKTKLGYSPLHQAAQQGHTDIVTLLLKNGASPNEVSSDGTTPLAIAKRLGYISVTDVLKVVTDETSFVLVSD KHRMSFPETVDEILDVSEDEGEELISFKAERRDSRDVDEEKELLDFVPKLDQVVESPAIPRIPCAMPETVVIRSEEQEQA SKEYDEDSLIPSSPATETSDNISPVASPVHTGFLVSFMVDARGGSMRGSRHNGLRVVIPPRTCAAPTRITCRLVKPQKLS TPPPLAEEEGLASRIIALGPTGAQFLSPVIVEIPHFASHGRGDRELVVLRSENGSVWKEHRSRYGESYLDQILNGMDEEL GSLEELEKKRVCRIITTDFPLYFVIMSRLCQDYDTIGPEGGSLKSKLVPLVQATFPENAVTKRVKLALQAQPVPDELVTK LLGNQATFSPIVTVEPRRRKFHRPIGLRIPLPPSWTDNPRDSGEGDTTSLRLLCSVIGGTDQAQWEDITGTTKLVYANEC ANFTTNVSARFWLSDCPRTAEAVNFATLLYKELTAVPYMAKFVIFAKMNDPREGRLRCYCMTDDKVDKTLEQHENFVEVA RSRDIEVLEGMSLFAELSGNLVPVKKAAQQRSFHFQSFRENRLAMPVKVRDSSREPGGSLSFLRKAMKYEDTQHILCHLN ITMPPCAKGSGAEDRRRTPTPLALRYSILSESTPGSLSGTEQAEMKMAVISEHLGLSWAELARELQFSVEDINRIRVENP NSLLEQSVALLNLWVIREGQNANMENLYTALQSIDRGEIVNMLEGSGRQSRNLKPDRRHTDRDYSLSPSQMNGYSSLQDE LLSPASLGCALSSPLRADQYWNEVAVLDAIPLAATEHDTMLEMSDMQVWSAGLTPSLVTAEDSSLECSKAEDSDATGHEW KLEGALSEEPRGPELGSLELVEDDTVDSDATNGLIDLLEQEEGQRSEEKLPGSKRQDDATGAGQDSENEVSLVSGHQRGQ ARITHSPTVSQVTERSQDRLQDWDADGSIVSYLQDAAQGSWQEEVTQGPHSFQGTSTMTEGLEPGGSQEYEKVLVSVSEH TWTEQPEAESSQADRDRRQQGQEEQVQEAKNTFTQVVQGNEFQNIPGEQVTEEQFTDEQGNIVTKKIIRKVVRQIDLSSA DAAQEHEEVTVEGPLEDPSELEVDIDYFMKHSKDHTSTPNP ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 7V0X _struct_ref_seq.pdbx_strand_id J _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 1881 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession P16157 _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 1881 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1881 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 439 ? 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THR J 670 GLY J 679 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 HIS A 680 ? GLY A 691 ? HIS J 680 GLY J 691 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 703 ? GLY A 712 ? THR J 703 GLY J 712 1 ? 10 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN A 713 ? HIS A 723 ? ASN J 713 HIS J 723 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 736 ? GLY A 745 ? SER J 736 GLY J 745 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 HIS A 746 ? ASN A 756 ? HIS J 746 ASN J 756 1 ? 11 HELX_P HELX_P21 AC3 THR A 769 ? LEU A 777 ? THR J 769 LEU J 777 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 AC4 TYR A 779 ? THR A 790 ? TYR J 779 THR J 790 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ALA J 467 ? ? -125.88 -168.52 2 1 LYS J 525 ? ? -94.87 32.85 3 1 HIS J 723 ? ? -99.31 37.05 4 1 ASN J 761 ? ? 67.64 -2.59 # _em_3d_fitting.entry_id 7V0X _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id A _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 4YZF _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 4YZF # _em_3d_reconstruction.entry_id 7V0X _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 126197 _em_3d_reconstruction.resolution 3.0 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ;Final gel filtration buffer contained 0.05% w/v digitonin, 130 mM KCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, 1 mM ATP, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8 mg/mL, and 0.01% w/v glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification. ; _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'Purified by density gradient centrifugation and size exclusion chromatography from digitonin-solubilized erythrocyte membranes.' _em_entity_assembly.name 'Erythrocyte ankyrin-1 complex' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7V0X _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 1500 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details '4-6 seconds, wait time 30 seconds.' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 7V0X _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7V0X _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 J MET 1 ? 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