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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5951 ? 9233 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0446 ? 998 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0046 ? 1182 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.1216 ? 933 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 7V80 _struct.title 'Local refinement of SARS-CoV-2 S-Beta variant (B.1.351) RBD and Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) ectodomain' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7V80 _struct_keywords.text 'SARS-CoV-2, Spike protein, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-HYDROLASE complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/HYDROLASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 334 ? ASN A 340 ? PRO A 337 ASN A 343 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 AA2 TYR A 362 ? SER A 368 ? TYR A 365 SER A 371 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 382 ? ASP A 386 ? THR A 385 ASP A 389 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 401 ? ARG A 405 ? GLY A 404 ARG A 408 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 435 ? SER A 440 ? SER A 438 SER A 443 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE B 21 ? ASN B 53 ? 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PRO F 583 PHE F 588 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 PHE B 588 ? LYS B 596 ? PHE F 588 LYS F 596 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 333 SG ? ? ? 1_555 A CYS 358 SG ? ? A CYS 336 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 376 SG ? ? ? 1_555 A CYS 429 SG ? ? A CYS 379 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 388 SG ? ? ? 1_555 A CYS 522 SG ? ? A CYS 391 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 477 SG ? ? ? 1_555 A CYS 485 SG ? ? A CYS 480 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 133 SG ? ? ? 1_555 B CYS 141 SG ? ? F CYS 133 F CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 344 SG ? ? ? 1_555 B CYS 361 SG ? ? F CYS 344 F CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? B CYS 530 SG ? ? ? 1_555 B CYS 542 SG ? ? F CYS 530 F CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? covale1 covale one ? A ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 331 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 343 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 53 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? F ASN 53 F NAG 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 90 ND2 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? F ASN 90 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? F ASN 103 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? F ASN 322 F NAG 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 432 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? F ASN 432 F NAG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 546 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? F ASN 546 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale9 covale both ? C NAG . O4 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale10 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale11 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASN A 351 ? ILE A 355 ? 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N ILE A 358 O VAL A 392 ? O VAL A 395 AA1 2 3 N ILE A 399 ? N ILE A 402 O TYR A 505 ? O TYR A 508 AA1 3 4 O LEU A 510 ? O LEU A 513 N CYS A 429 ? N CYS A 432 AA1 4 5 O ALA A 432 ? O ALA A 435 N THR A 373 ? N THR A 376 AA2 1 2 N TYR A 450 ? N TYR A 453 O GLN A 490 ? O GLN A 493 AA3 1 2 N VAL B 132 ? N VAL F 132 O LEU B 142 ? O LEU F 142 AA4 1 2 N LEU B 262 ? N LEU F 262 O VAL B 488 ? O VAL F 488 AA5 1 2 N TRP B 349 ? N TRP F 349 O ARG B 357 ? O ARG F 357 # _atom_sites.entry_id 7V80 _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 4 ? ? ? 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