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EMDB EMD-31815 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Telomeric Dinucleosome in open state' _pdbx_database_related.db_id EMD-31815 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7V9C _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-08-24 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _audit_author.name 'Soman, A.' _audit_author.pdbx_ordinal 1 _audit_author.identifier_ORCID 0000-0003-3522-3661 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nature _citation.journal_id_ASTM NATUAS _citation.journal_id_CSD 0006 _citation.journal_id_ISSN 1476-4687 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 609 _citation.language ? _citation.page_first 1048 _citation.page_last 1055 _citation.title 'Columnar structure of human telomeric chromatin.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-022-05236-5 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36104563 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Soman, A.' 1 ? primary 'Wong, S.Y.' 2 ? primary 'Korolev, N.' 3 ? primary 'Surya, W.' 4 ? primary 'Lattmann, S.' 5 ? primary 'Vogirala, V.K.' 6 ? primary 'Chen, 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;(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT) ; ;GGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGG GTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGT TAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTA GGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTT ; I ? 2 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA) (DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT) (DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA) (DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT) (DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA) (DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT) (DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA) (DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT) (DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA) (DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC) ; ;AACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAA CCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACC CTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCT AACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCC ; J ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E,K,O ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F,L,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; C,G,M,Q ? 6 'polypeptide(L)' no no ;RSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHA VSEGTKAVTKYTSAK ; ;RSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHA VSEGTKAVTKYTSAK ; D,H,N,R ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DG n 1 2 DG n 1 3 DG n 1 4 DT n 1 5 DT n 1 6 DA n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DG n 1 10 DT n 1 11 DT n 1 12 DA n 1 13 DG n 1 14 DG n 1 15 DG n 1 16 DT n 1 17 DT n 1 18 DA n 1 19 DG n 1 20 DG n 1 21 DG n 1 22 DT n 1 23 DT n 1 24 DA n 1 25 DG n 1 26 DG n 1 27 DG n 1 28 DT n 1 29 DT n 1 30 DA n 1 31 DG n 1 32 DG n 1 33 DG n 1 34 DT n 1 35 DT n 1 36 DA n 1 37 DG n 1 38 DG n 1 39 DG n 1 40 DT n 1 41 DT n 1 42 DA n 1 43 DG n 1 44 DG n 1 45 DG n 1 46 DT n 1 47 DT n 1 48 DA n 1 49 DG n 1 50 DG n 1 51 DG n 1 52 DT n 1 53 DT n 1 54 DA n 1 55 DG n 1 56 DG n 1 57 DG n 1 58 DT n 1 59 DT n 1 60 DA n 1 61 DG n 1 62 DG n 1 63 DG n 1 64 DT n 1 65 DT n 1 66 DA n 1 67 DG n 1 68 DG n 1 69 DG n 1 70 DT n 1 71 DT n 1 72 DA n 1 73 DG n 1 74 DG n 1 75 DG n 1 76 DT n 1 77 DT n 1 78 DA n 1 79 DG n 1 80 DG n 1 81 DG n 1 82 DT n 1 83 DT n 1 84 DA n 1 85 DG n 1 86 DG n 1 87 DG n 1 88 DT n 1 89 DT n 1 90 DA n 1 91 DG n 1 92 DG n 1 93 DG n 1 94 DT n 1 95 DT n 1 96 DA n 1 97 DG n 1 98 DG n 1 99 DG n 1 100 DT n 1 101 DT n 1 102 DA n 1 103 DG n 1 104 DG n 1 105 DG n 1 106 DT n 1 107 DT n 1 108 DA n 1 109 DG n 1 110 DG n 1 111 DG n 1 112 DT n 1 113 DT n 1 114 DA n 1 115 DG n 1 116 DG n 1 117 DG n 1 118 DT n 1 119 DT n 1 120 DA n 1 121 DG n 1 122 DG n 1 123 DG n 1 124 DT n 1 125 DT n 1 126 DA n 1 127 DG n 1 128 DG n 1 129 DG n 1 130 DT n 1 131 DT n 1 132 DA n 1 133 DG n 1 134 DG n 1 135 DG n 1 136 DT n 1 137 DT n 1 138 DA n 1 139 DG n 1 140 DG n 1 141 DG n 1 142 DT n 1 143 DT n 1 144 DA n 1 145 DG n 1 146 DG n 1 147 DG n 1 148 DT n 1 149 DT n 1 150 DA n 1 151 DG n 1 152 DG n 1 153 DG n 1 154 DT n 1 155 DT n 1 156 DA n 1 157 DG n 1 158 DG n 1 159 DG n 1 160 DT n 1 161 DT n 1 162 DA n 1 163 DG n 1 164 DG n 1 165 DG n 1 166 DT n 1 167 DT n 1 168 DA n 1 169 DG n 1 170 DG n 1 171 DG n 1 172 DT n 1 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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 275 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7V9C 7V9C ? 1 ? 1 2 PDB 7V9C 7V9C ? 2 ? 1 3 UNP H31_HUMAN P68431 ? 3 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 4 UNP H4_HUMAN P62805 ? 4 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 5 UNP H2A1B_HUMAN P04908 ? 5 ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 6 UNP H2B1K_HUMAN O60814 ? 6 ;RSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHA VSEGTKAVTKYTSAK ; 32 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7V9C I 1 ? 275 ? 7V9C 1 ? 275 ? 1 275 2 2 7V9C J 1 ? 275 ? 7V9C 1 ? 275 ? 1 275 3 3 7V9C A 1 ? 136 ? 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A DG 43 O6 ? ? ? 1_555 B DC 233 N4 ? ? I DG 43 J DC 233 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DG 45 N1 ? ? ? 1_555 B DC 231 O2 ? ? I DG 45 J DC 231 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DG 45 N2 ? ? ? 1_555 B DC 232 O2 ? ? I DG 45 J DC 232 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DG 51 N3 ? ? ? 1_555 B DC 226 N4 ? ? I DG 51 J DC 226 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DT 52 N3 ? ? ? 1_555 B DA 223 N1 ? ? I DT 52 J DA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A DT 52 O4 ? ? ? 1_555 B DA 223 N6 ? ? I DT 52 J DA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DT 53 O4 ? ? ? 1_555 B DT 222 N3 ? ? I DT 53 J DT 222 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DT 53 N3 ? ? ? 1_555 B DA 223 N1 ? ? I DT 53 J DA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A DT 53 O4 ? ? ? 1_555 B DA 223 N6 ? ? I DT 53 J DA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A DA 54 N1 ? ? ? 1_555 B DT 222 N3 ? ? I DA 54 J DT 222 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A DA 54 N6 ? ? ? 1_555 B DT 222 O4 ? ? I DA 54 J DT 222 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A DG 55 N1 ? ? ? 1_555 B DC 221 N3 ? ? I DG 55 J DC 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A DG 55 N2 ? ? ? 1_555 B DC 221 O2 ? ? I DG 55 J DC 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A DG 55 O6 ? ? ? 1_555 B DC 221 N4 ? ? I DG 55 J DC 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A DT 59 N3 ? ? ? 1_555 B DT 216 O4 ? ? I DT 59 J DT 216 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A DG 61 N2 ? ? ? 1_555 B DC 215 N3 ? ? I DG 61 J DC 215 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? A DG 63 N1 ? ? ? 1_555 B DA 212 N1 ? ? I DG 63 J DA 212 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? A DG 63 O6 ? ? ? 1_555 B DA 212 N6 ? ? 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'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog96 hydrog ? ? A DT 118 N3 ? ? ? 1_555 B DC 159 O2 ? ? I DT 118 J DC 159 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog97 hydrog ? ? A DG 123 N2 ? ? ? 1_555 B DC 153 N3 ? ? I DG 123 J DC 153 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog98 hydrog ? ? A DT 124 O2 ? ? ? 1_555 B DA 152 N6 ? ? I DT 124 J DA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog99 hydrog ? ? A DT 124 O2 ? ? ? 1_555 B DC 153 N4 ? ? I DT 124 J DC 153 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog100 hydrog ? ? A DG 127 N1 ? ? ? 1_555 B DT 150 O2 ? ? I DG 127 J DT 150 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog101 hydrog ? ? A DG 127 O6 ? ? ? 1_555 B DT 150 N3 ? ? I DG 127 J DT 150 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog102 hydrog ? ? A DG 128 N2 ? ? ? 1_555 B DC 149 O2 ? ? I DG 128 J DC 149 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog103 hydrog ? ? A DA 132 N1 ? ? ? 1_555 B DT 144 N3 ? ? I DA 132 J DT 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog104 hydrog ? ? 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A DT 185 O2 ? ? ? 1_555 B DA 91 N6 ? ? I DT 185 J DA 91 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog130 hydrog ? ? A DG 187 N2 ? ? ? 1_555 B DC 88 N3 ? ? I DG 187 J DC 88 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog131 hydrog ? ? A DG 187 N2 ? ? ? 1_555 B DC 89 N3 ? ? I DG 187 J DC 89 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog132 hydrog ? ? A DG 188 N1 ? ? ? 1_555 B DA 86 N1 ? ? I DG 188 J DA 86 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog133 hydrog ? ? A DG 188 N2 ? ? ? 1_555 B DC 87 O2 ? ? I DG 188 J DC 87 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog134 hydrog ? ? A DG 188 N2 ? ? ? 1_555 B DC 88 N3 ? ? I DG 188 J DC 88 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog135 hydrog ? ? A DG 193 N2 ? ? ? 1_555 B DC 83 O2 ? ? I DG 193 J DC 83 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog136 hydrog ? ? A DG 194 N2 ? ? ? 1_555 B DC 81 N3 ? ? I DG 194 J DC 81 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog137 hydrog ? ? A DT 196 O2 ? ? ? 1_555 B DA 80 N6 ? ? I DT 196 J DA 80 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog138 hydrog ? ? A DG 205 N2 ? ? ? 1_555 B DC 70 O2 ? ? I DG 205 J DC 70 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog139 hydrog ? ? A DG 213 N2 ? ? ? 1_555 B DA 61 N1 ? ? I DG 213 J DA 61 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog140 hydrog ? ? A DT 214 O2 ? ? ? 1_555 B DA 61 N6 ? ? I DT 214 J DA 61 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog141 hydrog ? ? A DT 215 O4 ? ? ? 1_555 B DC 58 N4 ? ? I DT 215 J DC 58 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog142 hydrog ? ? A DT 215 O2 ? ? ? 1_555 B DC 59 N4 ? ? I DT 215 J DC 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog143 hydrog ? ? A DA 216 N1 ? ? ? 1_555 B DC 59 N4 ? ? I DA 216 J DC 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog144 hydrog ? ? A DG 217 N1 ? ? ? 1_555 B DC 57 O2 ? ? I DG 217 J DC 57 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog145 hydrog ? ? A DG 224 N1 ? ? ? 1_555 B DT 48 O4 ? ? I DG 224 J DT 48 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog146 hydrog ? ? 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A DG 273 N2 ? ? ? 1_555 B DC 3 O2 ? ? I DG 273 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? 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O ILE R 86 # _atom_sites.entry_id 7V9C _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 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J 3 ? ? 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DG 1 1_555 B DC 275 1_555 A DG 2 1_555 B DC 274 1_555 0.891 1.561 6.320 10.099 2.082 47.251 1.587 0.462 6.430 2.562 -12.427 48.300 1 II_DG1DG2:DC274DC275_JJ I 1 ? J 275 ? I 2 ? J 274 ? 1 A DG 2 1_555 B DC 274 1_555 A DG 3 1_555 B DC 273 1_555 -0.702 3.236 3.603 -1.809 1.768 43.750 4.146 0.748 3.749 2.370 2.426 43.819 2 II_DG2DG3:DC273DC274_JJ I 2 ? J 274 ? I 3 ? J 273 ? 1 A DG 3 1_555 B DC 273 1_555 A DA 6 1_555 B DA 272 1_555 -0.135 1.257 6.282 9.456 21.396 60.887 -0.626 0.921 6.295 20.327 -8.984 64.822 3 II_DG3DA6:DA272DC273_JJ I 3 ? J 273 ? I 6 ? J 272 ? 1 A DT 11 1_555 B DA 265 1_555 A DA 12 1_555 B DT 264 1_555 -2.348 0.541 4.277 -21.032 15.313 22.510 -3.030 -1.437 4.493 29.317 40.265 34.275 4 II_DT11DA12:DT264DA265_JJ I 11 ? J 265 ? I 12 ? J 264 ? 1 A DA 12 1_555 B DT 264 1_555 A DG 13 1_555 B DC 263 1_555 0.700 0.477 3.240 -2.551 1.746 46.030 0.461 -1.109 3.214 2.230 3.258 46.128 5 II_DA12DG13:DC263DT264_JJ I 12 ? J 264 ? I 13 ? J 263 ? 1 A DG 20 1_555 B DT 258 1_555 A DG 21 1_555 B DC 257 1_555 1.212 -0.477 3.268 2.048 2.217 37.545 -1.028 -1.610 3.295 3.437 -3.175 37.662 6 II_DG20DG21:DC257DT258_JJ I 20 ? J 258 ? I 21 ? J 257 ? 1 A DG 21 1_555 B DC 257 1_555 A DT 22 1_555 B DC 256 1_555 -0.084 0.435 2.864 0.762 7.774 36.560 -0.233 0.220 2.890 12.221 -1.197 37.357 7 II_DG21DT22:DC256DC257_JJ I 21 ? J 257 ? I 22 ? J 256 ? 1 A DT 22 1_555 B DC 256 1_555 A DT 23 1_555 B DA 254 1_555 1.017 1.402 5.390 11.589 19.995 27.024 -3.172 1.502 5.243 35.636 -20.655 35.418 8 II_DT22DT23:DA254DC256_JJ I 22 ? J 256 ? I 23 ? J 254 ? 1 A DG 26 1_555 B DT 252 1_555 A DG 27 1_555 B DC 251 1_555 -0.575 -1.443 3.581 1.102 2.380 27.109 -3.703 1.518 3.419 5.062 -2.343 27.233 9 II_DG26DG27:DC251DT252_JJ I 26 ? J 252 ? I 27 ? J 251 ? 1 A DT 34 1_555 B DC 243 1_555 A DT 35 1_555 B DA 242 1_555 1.343 1.001 2.709 4.938 10.107 21.928 -0.568 -1.726 3.090 24.597 -12.017 24.613 10 II_DT34DT35:DA242DC243_JJ I 34 ? J 243 ? I 35 ? J 242 ? 1 A DT 41 1_555 B DA 235 1_555 A DA 42 1_555 B DT 234 1_555 1.599 -1.023 5.351 13.834 12.841 7.321 -13.152 6.482 2.388 46.934 -50.564 20.233 11 II_DT41DA42:DT234DA235_JJ I 41 ? J 235 ? I 42 ? 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