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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Hirai, S.' 1 ? primary 'Tomimatsu, K.' 2 ? primary 'Miyawaki-Kuwakado, A.' 3 ? primary 'Takizawa, Y.' 4 ? primary 'Komatsu, T.' 5 ? primary 'Tachibana, T.' 6 ? primary 'Fukushima, Y.' 7 ? primary 'Takeda, Y.' 8 ? primary 'Negishi, L.' 9 ? primary 'Kujirai, T.' 10 ? primary 'Koyama, M.' 11 ? primary 'Ohkawa, Y.' 12 ? primary 'Kurumizaka, H.' 13 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3mm18' 15350.842 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H4' 11676.703 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A type 1-B' 14447.825 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B type 3-A' 14307.559 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'DNA (126-MER)' 44520.383 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'DNA (126-MER)' 44991.660 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage 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5 129 DC n 5 130 DA n 5 131 DG n 5 132 DA n 5 133 DT n 5 134 DA n 5 135 DT n 5 136 DA n 5 137 DT n 5 138 DA n 5 139 DC n 5 140 DA n 5 141 DT n 5 142 DC n 5 143 DG n 5 144 DA n 5 145 DT n 6 1 DA n 6 2 DT n 6 3 DC n 6 4 DG n 6 5 DA n 6 6 DT n 6 7 DG n 6 8 DT n 6 9 DA n 6 10 DT n 6 11 DA n 6 12 DT n 6 13 DA n 6 14 DT n 6 15 DC n 6 16 DT n 6 17 DG n 6 18 DA n 6 19 DC n 6 20 DA n 6 21 DC n 6 22 DG n 6 23 DT n 6 24 DG n 6 25 DC n 6 26 DC n 6 27 DT n 6 28 DG n 6 29 DG n 6 30 DA n 6 31 DG n 6 32 DA n 6 33 DC n 6 34 DT n 6 35 DA n 6 36 DG n 6 37 DG n 6 38 DG n 6 39 DA n 6 40 DG n 6 41 DT n 6 42 DA n 6 43 DA n 6 44 DT n 6 45 DC n 6 46 DC n 6 47 DC n 6 48 DC n 6 49 DT n 6 50 DT n 6 51 DG n 6 52 DG n 6 53 DC n 6 54 DG n 6 55 DG n 6 56 DT n 6 57 DT n 6 58 DA n 6 59 DA n 6 60 DA n 6 61 DA n 6 62 DC n 6 63 DG n 6 64 DC n 6 65 DG n 6 66 DG n 6 67 DG n 6 68 DG n 6 69 DG n 6 70 DA n 6 71 DC n 6 72 DA n 6 73 DG n 6 74 DC n 6 75 DG n 6 76 DC n 6 77 DG n 6 78 DT n 6 79 DA n 6 80 DC n 6 81 DG n 6 82 DT n 6 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 139 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 106 Mouse ? ;Hist1h4a, Hist1h4b, H4-53, Hist1h4c, H4-12, Hist1h4d, Hist1h4f, Hist1h4h, Hist1h4i, Hist1h4j, Hist1h4k, Hist1h4m, Hist2h4a, Hist2h4, Hist4h4 ; ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 133 Mouse ? Hist1h2ab ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 'Biological sequence' 1 129 Mouse ? Hist3h2ba ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 145 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 145 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7VBM 7VBM ? 1 ? 1 2 UNP H4_MOUSE P62806 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A1B_MOUSE C0HKE1 ? 3 ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 4 UNP H2B3A_MOUSE Q9D2U9 ? 4 ;MPEPSRSTPAPKKGSKKAITKAQKKDGKKRKRGRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIASEASR LAHYNKRSTITSREVQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; 1 5 PDB 7VBM 7VBM ? 5 ? 1 6 PDB 7VBM 7VBM ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7VBM A 1 ? 139 ? 7VBM -3 ? 135 ? -3 135 2 2 7VBM B 4 ? 106 ? 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'expression tag' -1 3 3 7VBM GLY C 1 ? UNP C0HKE1 ? ? 'expression tag' -3 4 3 7VBM SER C 2 ? UNP C0HKE1 ? ? 'expression tag' -2 5 3 7VBM HIS C 3 ? UNP C0HKE1 ? ? 'expression tag' -1 6 4 7VBM GLY D 1 ? UNP Q9D2U9 ? ? 'expression tag' -3 7 4 7VBM SER D 2 ? UNP Q9D2U9 ? ? 'expression tag' -2 8 4 7VBM HIS D 3 ? UNP Q9D2U9 ? ? 'expression tag' -1 9 6 7VBM GLY F 1 ? UNP P62806 ? ? 'expression tag' -3 10 6 7VBM SER F 2 ? UNP P62806 ? ? 'expression tag' -2 11 6 7VBM HIS F 3 ? UNP P62806 ? ? 'expression tag' -1 12 7 7VBM GLY G 1 ? UNP C0HKE1 ? ? 'expression tag' -3 13 7 7VBM SER G 2 ? UNP C0HKE1 ? ? 'expression tag' -2 14 7 7VBM HIS G 3 ? UNP C0HKE1 ? ? 'expression tag' -1 15 8 7VBM GLY H 1 ? UNP Q9D2U9 ? ? 'expression tag' -3 16 8 7VBM SER H 2 ? UNP Q9D2U9 ? ? 'expression tag' -2 17 8 7VBM HIS H 3 ? UNP Q9D2U9 ? ? 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'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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J N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 67 ? GLN A 80 ? ARG A 63 GLN A 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 GLN A 89 ? ALA A 118 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P3 AA3 MET A 124 ? ARG A 136 ? MET A 120 ARG A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP B 28 ? ILE B 33 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 THR B 34 ? GLY B 46 ? THR B 30 GLY B 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU B 53 ? ALA B 80 ? 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ASN F 25 ILE F 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 THR F 34 ? GLY F 46 ? THR F 30 GLY F 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU F 53 ? ALA F 80 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P23 AC5 THR F 86 ? GLY F 98 ? THR F 82 GLY F 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 THR G 20 ? ALA G 25 ? THR G 16 ALA G 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 PRO G 30 ? LYS G 40 ? PRO G 26 LYS G 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY G 50 ? ASP G 76 ? GLY G 46 ASP G 72 1 ? 27 HELX_P HELX_P27 AC9 ILE G 83 ? ASN G 93 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP G 94 ? LEU G 101 ? ASP G 90 LEU G 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 TYR H 41 ? HIS H 53 ? TYR H 37 HIS H 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 SER H 59 ? ASN H 88 ? SER H 55 ASN H 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P31 AD4 THR H 94 ? LEU H 106 ? THR H 90 LEU H 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO H 107 ? SER H 128 ? PRO H 103 SER H 124 1 ? 22 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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I DC -56 J DG 56 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? I DC 17 N4 ? ? ? 1_555 J DG 129 O6 ? ? I DC -56 J DG 56 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? I DC 17 O2 ? ? ? 1_555 J DG 129 N2 ? ? I DC -56 J DG 56 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? I DG 18 N1 ? ? ? 1_555 J DC 128 N3 ? ? I DG -55 J DC 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? I DG 18 N2 ? ? ? 1_555 J DC 128 O2 ? ? I DG -55 J DC 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? I DG 18 O6 ? ? ? 1_555 J DC 128 N4 ? ? I DG -55 J DC 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? I DA 19 N1 ? ? ? 1_555 J DT 127 N3 ? ? I DA -54 J DT 54 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? I DG 20 N1 ? ? ? 1_555 J DC 126 N3 ? ? I DG -53 J DC 53 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? I DG 20 N2 ? ? ? 1_555 J DC 126 O2 ? ? I DG -53 J DC 53 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? I DG 20 O6 ? ? ? 1_555 J DC 126 N4 ? ? I DG -53 J DC 53 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? I DG 21 N1 ? ? ? 1_555 J DC 125 N3 ? ? I DG -52 J DC 52 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? I DG 21 N2 ? ? ? 1_555 J DC 125 O2 ? ? I DG -52 J DC 52 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? I DG 21 O6 ? ? ? 1_555 J DC 125 N4 ? ? I DG -52 J DC 52 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? I DC 22 N3 ? ? ? 1_555 J DG 124 N1 ? ? I DC -51 J DG 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? I DC 22 N4 ? ? ? 1_555 J DG 124 O6 ? ? I DC -51 J DG 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? I DC 22 O2 ? ? ? 1_555 J DG 124 N2 ? ? I DC -51 J DG 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? I DC 23 N3 ? ? ? 1_555 J DG 123 N1 ? ? I DC -50 J DG 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? I DC 23 N4 ? ? ? 1_555 J DG 123 O6 ? ? I DC -50 J DG 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? I DC 23 O2 ? ? ? 1_555 J DG 123 N2 ? ? I DC -50 J DG 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? I DG 24 N1 ? ? ? 1_555 J DC 122 N3 ? ? I DG -49 J DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? I DG 24 N2 ? ? ? 1_555 J DC 122 O2 ? ? I DG -49 J DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? I DG 24 O6 ? ? ? 1_555 J DC 122 N4 ? ? I DG -49 J DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? I DC 25 N3 ? ? ? 1_555 J DG 121 N1 ? ? I DC -48 J DG 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? I DC 25 N4 ? ? ? 1_555 J DG 121 O6 ? ? I DC -48 J DG 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? I DC 25 O2 ? ? ? 1_555 J DG 121 N2 ? ? I DC -48 J DG 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? I DT 26 N3 ? ? ? 1_555 J DA 120 N1 ? ? I DT -47 J DA 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? I DT 26 O4 ? ? ? 1_555 J DA 120 N6 ? ? I DT -47 J DA 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? I DC 27 N3 ? ? ? 1_555 J DG 119 N1 ? ? I DC -46 J DG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? I DC 27 N4 ? ? ? 1_555 J DG 119 O6 ? ? I DC -46 J DG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? I DC 27 O2 ? ? ? 1_555 J DG 119 N2 ? ? I DC -46 J DG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? I DA 28 N1 ? ? ? 1_555 J DT 118 N3 ? ? I DA -45 J DT 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? I DA 28 N6 ? ? ? 1_555 J DT 118 O4 ? ? I DA -45 J DT 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? I DA 29 N1 ? ? ? 1_555 J DT 117 N3 ? ? I DA -44 J DT 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? I DA 29 N6 ? ? ? 1_555 J DT 117 O4 ? ? I DA -44 J DT 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? I DT 30 N3 ? ? ? 1_555 J DA 116 N1 ? ? I DT -43 J DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? I DC 35 N4 ? ? ? 1_555 J DG 111 O6 ? ? I DC -38 J DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? I DC 35 O2 ? ? ? 1_555 J DG 111 N2 ? ? I DC -38 J DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? I DG 36 N1 ? ? ? 1_555 J DC 110 N3 ? ? I DG -37 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog65 hydrog ? ? I DG 36 N2 ? ? ? 1_555 J DC 110 O2 ? ? I DG -37 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog66 hydrog ? ? I DG 36 O6 ? ? ? 1_555 J DC 110 N4 ? ? I DG -37 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog67 hydrog ? ? I DT 37 N3 ? ? ? 1_555 J DA 109 N1 ? ? I DT -36 J DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog68 hydrog ? ? I DT 37 O4 ? ? ? 1_555 J DA 109 N6 ? ? I DT -36 J DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog69 hydrog ? ? I DA 38 N1 ? ? ? 1_555 J DT 108 N3 ? ? I DA -35 J DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog70 hydrog ? ? I DA 38 N6 ? ? ? 1_555 J DT 108 O4 ? ? 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J -47 ? 19 1 1 I DG 121 1_555 J DC 25 1_555 -0.242 -0.278 -1.240 -13.236 -6.640 4.019 110 I_DG48:DC-48_J I 48 ? J -48 ? 19 1 1 I DC 122 1_555 J DG 24 1_555 0.162 -0.256 -0.754 -8.060 2.237 -1.683 111 I_DC49:DG-49_J I 49 ? J -49 ? 19 1 1 I DA 123 1_555 J DT 23 1_555 0.080 -0.131 0.449 0.491 0.213 -4.605 112 I_DA50:DT-50_J I 50 ? J -50 ? 20 1 1 I DC 124 1_555 J DG 22 1_555 0.191 -0.243 0.681 3.073 2.212 0.266 113 I_DC51:DG-51_J I 51 ? J -51 ? 19 1 1 I DG 125 1_555 J DC 21 1_555 -0.203 -0.149 0.392 1.866 -0.500 -0.345 114 I_DG52:DC-52_J I 52 ? J -52 ? 19 1 1 I DT 126 1_555 J DA 20 1_555 -0.012 -0.138 0.416 1.369 -2.784 2.913 115 I_DT53:DA-53_J I 53 ? J -53 ? 20 1 1 I DG 127 1_555 J DC 19 1_555 -0.200 -0.136 0.080 -1.430 -6.006 -0.361 116 I_DG54:DC-54_J I 54 ? J -54 ? 19 1 1 I DT 128 1_555 J DA 18 1_555 -0.033 -0.101 -0.056 -2.116 -5.975 0.000 117 I_DT55:DA-55_J I 55 ? J -55 ? 20 1 1 I DC 129 1_555 J DG 17 1_555 0.149 -0.146 0.054 -3.146 -0.141 -2.906 118 I_DC56:DG-56_J I 56 ? 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J -60 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DC 9 1_555 J DG 137 1_555 I DC 10 1_555 J DG 136 1_555 -2.444 -0.075 3.325 -2.691 0.541 38.288 -0.185 3.367 3.481 0.824 4.096 38.383 1 II_DC-64DC-63:DG63DG64_JJ I -64 ? J 64 ? I -63 ? J 63 ? 1 I DC 10 1_555 J DG 136 1_555 I DC 11 1_555 J DG 135 1_555 0.428 0.743 4.372 0.198 -4.081 36.696 1.903 -0.640 4.270 -6.457 -0.314 36.914 2 II_DC-63DC-62:DG62DG63_JJ I -63 ? J 63 ? I -62 ? J 62 ? 1 I DC 11 1_555 J DG 135 1_555 I DG 12 1_555 J DC 134 1_555 -1.260 2.691 3.326 -1.791 3.038 37.823 3.725 1.694 3.577 4.674 2.756 37.981 3 II_DC-62DG-61:DC61DG62_JJ I -62 ? J 62 ? I -61 ? J 61 ? 1 I DG 12 1_555 J DC 134 1_555 I DG 13 1_555 J DC 133 1_555 -0.907 -0.129 2.970 -4.191 6.093 32.997 -1.131 0.935 2.989 10.562 7.265 33.793 4 II_DG-61DG-60:DC60DC61_JJ I -61 ? J 61 ? I -60 ? J 60 ? 1 I DG 13 1_555 J DC 133 1_555 I DG 15 1_555 J DC 131 1_555 0.909 -1.698 6.479 1.726 24.399 59.726 -3.612 -0.714 5.514 23.466 -1.660 64.110 5 II_DG-60DG-58:DC58DC60_JJ I -60 ? J 60 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DG 15 1_555 J DC 131 1_555 I DC 16 1_555 J DG 130 1_555 -0.447 0.498 3.190 -2.455 1.539 32.989 0.619 0.378 3.233 2.703 4.314 33.113 6 II_DG-58DC-57:DG57DC58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DC 16 1_555 J DG 130 1_555 I DC 17 1_555 J DG 129 1_555 0.306 2.106 3.856 -2.593 1.156 41.152 2.843 -0.765 3.886 1.642 3.683 41.245 7 II_DC-57DC-56:DG56DG57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DC 17 1_555 J DG 129 1_555 I DG 18 1_555 J DC 128 1_555 -0.152 1.826 3.752 0.176 -2.525 39.629 3.020 0.247 3.633 -3.719 -0.260 39.706 8 II_DC-56DG-55:DC55DG56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DG 18 1_555 J DC 128 1_555 I DA 19 1_555 J DT 127 1_555 -0.604 0.991 3.907 -4.496 -0.435 37.014 1.619 0.228 3.939 -0.682 7.050 37.279 9 II_DG-55DA-54:DT54DC55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 I DA 19 1_555 J DT 127 1_555 I DG 20 1_555 J DC 126 1_555 -0.290 1.386 3.216 -4.190 2.838 41.998 1.630 -0.027 3.311 3.942 5.821 42.288 10 II_DA-54DG-53:DC53DT54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 I DG 20 1_555 J DC 126 1_555 I DG 21 1_555 J DC 125 1_555 0.100 0.047 3.155 -2.741 3.459 32.247 -0.499 -0.641 3.124 6.191 4.906 32.539 11 II_DG-53DG-52:DC52DC53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? 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J 47 ? 1 I DT 26 1_555 J DA 120 1_555 I DC 27 1_555 J DG 119 1_555 0.455 1.966 3.558 3.873 -5.799 44.072 3.154 -0.224 3.313 -7.671 -5.123 44.593 17 II_DT-47DC-46:DG46DA47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DC 27 1_555 J DG 119 1_555 I DA 28 1_555 J DT 118 1_555 -0.405 2.057 3.799 0.832 -7.392 42.774 3.580 0.637 3.407 -10.044 -1.130 43.386 18 II_DC-46DA-45:DT45DG46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 28 1_555 J DT 118 1_555 I DA 29 1_555 J DT 117 1_555 -0.772 0.670 3.593 -3.885 0.604 36.901 0.963 0.636 3.663 0.950 6.117 37.103 19 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 29 1_555 J DT 117 1_555 I DT 30 1_555 J DA 116 1_555 0.131 -0.630 3.540 -5.321 -0.259 22.641 -1.467 -2.303 3.425 -0.648 13.317 23.251 20 II_DA-44DT-43:DA43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 I DT 30 1_555 J DA 116 1_555 I DT 31 1_555 J DA 115 1_555 -0.340 0.102 3.280 -0.376 4.932 44.878 -0.310 0.410 3.275 6.437 0.490 45.135 21 II_DT-43DT-42:DA42DA43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 I DT 31 1_555 J DA 115 1_555 I DG 32 1_555 J DC 114 1_555 1.297 0.097 3.490 8.222 30.811 29.663 -3.331 -0.834 2.731 46.513 -12.412 43.289 22 II_DT-42DG-41:DC41DA42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 I DG 32 1_555 J DC 114 1_555 I DG 33 1_555 J DC 113 1_555 -0.463 0.132 2.978 -1.626 6.215 27.485 -1.061 0.600 2.958 12.858 3.365 28.211 23 II_DG-41DG-40:DC40DC41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? J 40 ? 1 I DG 33 1_555 J DC 113 1_555 I DT 34 1_555 J DA 112 1_555 0.027 0.156 3.121 -7.701 4.579 33.556 -0.410 -1.177 3.036 7.761 13.052 34.698 24 II_DG-40DT-39:DA39DC40_JJ I -40 ? J 40 ? I -39 ? J 39 ? 1 I DT 34 1_555 J DA 112 1_555 I DC 35 1_555 J DG 111 1_555 0.401 0.154 3.077 -0.021 3.183 41.943 -0.096 -0.561 3.079 4.439 0.030 42.058 25 II_DT-39DC-38:DG38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? J 38 ? 1 I DC 35 1_555 J DG 111 1_555 I DG 36 1_555 J DC 110 1_555 0.413 0.305 3.148 1.148 5.422 31.799 -0.388 -0.544 3.168 9.803 -2.076 32.266 26 II_DC-38DG-37:DC37DG38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DG 36 1_555 J DC 110 1_555 I DT 37 1_555 J DA 109 1_555 -0.015 0.797 3.835 -0.457 -1.662 37.471 1.494 -0.047 3.797 -2.585 0.711 37.509 27 II_DG-37DT-36:DA36DC37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DT 37 1_555 J DA 109 1_555 I DA 38 1_555 J DT 108 1_555 -0.852 2.063 3.512 -0.771 -2.666 45.200 2.931 1.035 3.405 -3.465 1.002 45.281 28 II_DT-36DA-35:DT35DA36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DA 38 1_555 J DT 108 1_555 I DG 39 1_555 J DC 107 1_555 -0.171 0.971 3.248 -3.052 1.247 31.089 1.565 -0.262 3.285 2.318 5.673 31.259 29 II_DA-35DG-34:DC34DT35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? J 34 ? 1 I DG 39 1_555 J DC 107 1_555 I DA 40 1_555 J DT 106 1_555 -1.405 1.367 3.757 -6.755 -0.280 39.741 2.023 1.137 3.925 -0.408 9.851 40.289 30 II_DG-34DA-33:DT33DC34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? J 33 ? 1 I DA 40 1_555 J DT 106 1_555 I DC 41 1_555 J DG 105 1_555 0.603 -0.365 3.203 -9.592 5.339 29.458 -1.621 -2.814 2.770 10.069 18.090 31.395 31 II_DA-33DC-32:DG32DT33_JJ I -33 ? J 33 ? I -32 ? J 32 ? 1 I DC 41 1_555 J DG 105 1_555 I DG 43 1_555 J DC 103 1_555 0.608 -0.832 6.124 3.042 16.960 64.955 -1.989 -0.330 5.798 15.510 -2.782 66.959 32 II_DC-32DG-30:DC30DG32_JJ I -32 ? J 32 ? I -30 ? J 30 ? 1 I DG 43 1_555 J DC 103 1_555 I DC 44 1_555 J DG 102 1_555 0.417 -0.086 3.347 3.452 3.720 36.740 -0.647 -0.180 3.347 5.867 -5.444 37.077 33 II_DG-30DC-29:DG29DC30_JJ I -30 ? J 30 ? I -29 ? J 29 ? 1 I DC 44 1_555 J DG 102 1_555 I DC 46 1_555 J DG 100 1_555 0.367 1.254 7.007 4.213 2.352 72.667 0.892 -0.013 7.049 1.982 -3.552 72.805 34 II_DC-29DC-27:DG27DG29_JJ I -29 ? J 29 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 46 1_555 J DG 100 1_555 I DT 47 1_555 J DA 99 1_555 -0.907 -0.400 3.423 -0.207 0.240 32.117 -0.768 1.600 3.426 0.434 0.373 32.118 35 II_DC-27DT-26:DA26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DT 47 1_555 J DA 99 1_555 I DA 48 1_555 J DT 98 1_555 0.796 1.315 3.650 4.378 -3.688 40.683 2.320 -0.605 3.585 -5.274 -6.260 41.067 36 II_DT-26DA-25:DT25DA26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? 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J 20 ? 1 I DC 53 1_555 J DG 93 1_555 I DG 54 1_555 J DC 92 1_555 0.080 -0.037 3.287 4.475 13.399 34.833 -1.826 0.466 3.057 21.329 -7.123 37.506 42 II_DC-20DG-19:DC19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DG 54 1_555 J DC 92 1_555 I DC 55 1_555 J DG 91 1_555 -0.185 -0.631 3.289 1.550 1.315 31.213 -1.418 0.635 3.247 2.441 -2.876 31.278 43 II_DG-19DC-18:DG18DC19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DC 55 1_555 J DG 91 1_555 I DT 56 1_555 J DA 90 1_555 -0.301 -0.355 3.302 1.781 3.616 35.285 -1.112 0.755 3.232 5.941 -2.927 35.507 44 II_DC-18DT-17:DA17DG18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DT 56 1_555 J DA 90 1_555 I DT 57 1_555 J DA 89 1_555 1.708 0.561 3.616 7.781 -5.416 34.620 1.805 -1.491 3.772 -8.897 -12.781 35.857 45 II_DT-17DT-16:DA16DA17_JJ I -17 ? J 17 ? I -16 ? J 16 ? 1 I DT 57 1_555 J DA 89 1_555 I DA 58 1_555 J DT 88 1_555 -0.954 1.186 3.549 -2.184 -2.773 37.745 2.209 1.166 3.504 -4.275 3.366 37.903 46 II_DT-16DA-15:DT15DA16_JJ I -16 ? J 16 ? I -15 ? 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J -5 ? 1 I DC 78 1_555 J DG 68 1_555 I DC 79 1_555 J DG 67 1_555 0.259 1.738 3.194 0.863 -1.367 39.014 2.759 -0.287 3.139 -2.046 -1.291 39.047 67 II_DC5DC6:DG-6DG-5_JJ I 5 ? J -5 ? I 6 ? J -6 ? 1 I DC 79 1_555 J DG 67 1_555 I DC 80 1_555 J DG 66 1_555 -0.632 2.172 3.683 -5.680 -5.020 42.707 3.480 0.246 3.470 -6.828 7.726 43.343 68 II_DC6DC7:DG-7DG-6_JJ I 6 ? J -6 ? I 7 ? J -7 ? 1 I DC 80 1_555 J DG 66 1_555 I DC 81 1_555 J DG 65 1_555 -0.413 0.805 3.329 -5.655 2.603 34.103 0.937 -0.208 3.402 4.393 9.543 34.650 69 II_DC7DC8:DG-8DG-7_JJ I 7 ? J -7 ? I 8 ? J -8 ? 1 I DC 81 1_555 J DG 65 1_555 I DG 82 1_555 J DC 64 1_555 -0.048 -0.067 2.952 -5.817 9.347 35.238 -1.250 -0.636 2.816 14.994 9.331 36.865 70 II_DC8DG9:DC-9DG-8_JJ I 8 ? J -8 ? I 9 ? J -9 ? 1 I DG 82 1_555 J DC 64 1_555 I DC 83 1_555 J DG 63 1_555 0.517 -0.666 3.664 -2.154 2.404 31.684 -1.699 -1.378 3.563 4.389 3.932 31.844 71 II_DG9DC10:DG-10DC-9_JJ I 9 ? J -9 ? I 10 ? 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J -20 ? 1 I DG 93 1_555 J DC 53 1_555 I DC 94 1_555 J DG 52 1_555 0.200 -1.088 3.196 0.472 3.984 32.078 -2.629 -0.279 3.044 7.174 -0.851 32.322 82 II_DG20DC21:DG-21DC-20_JJ I 20 ? J -20 ? I 21 ? J -21 ? 1 I DC 94 1_555 J DG 52 1_555 I DC 95 1_555 J DG 51 1_555 0.467 -0.741 3.258 3.501 4.623 29.719 -2.343 -0.196 3.142 8.906 -6.745 30.267 83 II_DC21DC22:DG-22DG-21_JJ I 21 ? J -21 ? I 22 ? J -22 ? 1 I DC 95 1_555 J DG 51 1_555 I DA 96 1_555 J DT 50 1_555 -0.449 -0.576 3.142 -0.548 8.264 31.085 -2.432 0.720 2.904 15.087 1.001 32.143 84 II_DC22DA23:DT-23DG-22_JJ I 22 ? J -22 ? I 23 ? J -23 ? 1 I DA 96 1_555 J DT 50 1_555 I DA 97 1_555 J DT 49 1_555 0.111 -1.053 3.230 1.881 3.478 32.218 -2.478 0.122 3.103 6.238 -3.373 32.454 85 II_DA23DA24:DT-24DT-23_JJ I 23 ? J -23 ? I 24 ? J -24 ? 1 I DA 97 1_555 J DT 49 1_555 I DG 98 1_555 J DC 48 1_555 0.358 -0.461 3.541 4.682 -1.835 31.516 -0.474 0.280 3.576 -3.351 -8.551 31.904 86 II_DA24DG25:DC-25DT-24_JJ I 24 ? J -24 ? I 25 ? 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