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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7VBY 7VBY ? 1 ? 1 2 UNP TOM6_HUMAN Q96B49 ? 2 MASSTVPVSAAGSANETPEIPDNVGDWLRGVYRFATDRNDFRRNLILNLGLFAAGVWLARNLSDIDLMAPQPGV 1 3 UNP TOM5_HUMAN Q8N4H5 ? 3 MFRIEGLAPKLDPEEMKRKMREDVISSIRNFLIYVALLRVTPFILKKLDSI 1 4 UNP TOM7_HUMAN Q9P0U1 ? 4 MVKLSKEAKQRLQQLFKGSQFAIRWGFIPLVIYLGFKRGADPGMPEPTVLSLLWG 1 5 UNP TOM22_HUMAN Q9NS69 ? 5 ;MAAAVAAAGAGEPQSPDELLPKGDAEKPEEELEEDDDEELDETLSERLWGLTEMFPERVRSAAGATFDLSLFVAQKMYRF SRAALWIGTTSFMILVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNTGLSGGMPGALPSLPGKI ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7VBY B 1 ? 828 ? 7VBY 1 ? 828 ? 1 828 2 2 7VBY A 1 ? 74 ? 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'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PC1 non-polymer . 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE 3-SN-PHOSPHATIDYLCHOLINE 'C44 H88 N O8 P' 790.145 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UND non-polymer . UNDECANE 'LIPID FRAGMENT' 'C11 H24' 156.308 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7VBY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7VBY _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 8494 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.593 ? 11403 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 25.081 ? 1655 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 1257 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1364 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7VBY _struct.title 'Tom core complex with Tom20 and Tom22 subunits.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7VBY _struct_keywords.text 'Tom complex, Tom20, Cryo-EM, TRANSLOCASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLOCASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 2 ? E N N 4 ? F N N 3 ? G N N 1 ? H N N 5 ? I N N 5 ? J N N 4 ? K N N 6 ? L N N 6 ? M N N 6 ? N N N 7 ? O N N 7 ? P N N 6 ? Q N N 7 ? R N N 6 ? S N N 7 ? T N N 7 ? U N N 7 ? V N N 6 ? W N N 6 ? X N N 6 ? Y N N 7 ? Z N N 7 ? AA N N 7 ? BA N N 6 ? CA N N 7 ? DA N N 6 ? EA N N 6 ? FA N N 7 ? GA N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 HIS A 87 ? GLU A 92 ? HIS B 87 GLU B 92 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 308 ? ALA A 310 ? PRO B 308 ALA B 310 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP B 26 ? ASP B 37 ? ASP A 26 ASP A 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP B 40 ? ASN B 61 ? ASP A 40 ASN A 61 1 ? 22 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU C 14 ? LEU C 48 ? GLU D 14 LEU D 48 1 ? 35 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP D 26 ? ASP D 37 ? ASP F 26 ASP F 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP D 40 ? ASN D 61 ? ASP F 40 ASN F 61 1 ? 22 HELX_P HELX_P8 AA8 SER E 5 ? GLY E 39 ? SER G 5 GLY G 39 1 ? 35 HELX_P HELX_P9 AA9 THR E 48 ? LEU E 53 ? THR G 48 LEU G 53 5 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 GLU F 15 ? LEU F 48 ? GLU E 15 LEU E 48 1 ? 34 HELX_P HELX_P11 AB2 HIS G 87 ? GLU G 92 ? HIS I 87 GLU I 92 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO G 308 ? ALA G 310 ? PRO I 308 ALA I 310 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 GLY H 64 ? VAL H 96 ? GLY H 64 VAL H 96 1 ? 33 HELX_P HELX_P14 AB5 VAL H 96 ? GLN H 118 ? VAL H 96 GLN H 118 1 ? 23 HELX_P HELX_P15 AB6 ALA I 63 ? VAL I 96 ? ALA C 63 VAL C 96 1 ? 34 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL I 96 ? GLN I 118 ? VAL C 96 GLN C 118 1 ? 23 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS J 6 ? TRP J 25 ? LYS J 6 TRP J 25 1 ? 20 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY J 26 ? GLY J 39 ? GLY J 26 GLY J 39 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 THR J 48 ? LEU J 53 ? THR J 48 LEU J 53 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 21 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 20 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 9 10 ? anti-parallel AA1 10 11 ? anti-parallel AA1 11 12 ? anti-parallel AA1 12 13 ? anti-parallel AA1 13 14 ? parallel AA1 14 15 ? anti-parallel AA1 15 16 ? anti-parallel AA1 16 17 ? anti-parallel AA1 17 18 ? anti-parallel AA1 18 19 ? anti-parallel AA1 19 20 ? anti-parallel AA1 20 21 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA3 8 9 ? anti-parallel AA3 9 10 ? anti-parallel AA3 10 11 ? anti-parallel AA3 11 12 ? anti-parallel AA3 12 13 ? anti-parallel AA3 13 14 ? anti-parallel AA3 14 15 ? anti-parallel AA3 15 16 ? anti-parallel AA3 16 17 ? anti-parallel AA3 17 18 ? anti-parallel AA3 18 19 ? anti-parallel AA3 19 20 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU A 193 ? TYR A 194 ? GLU B 193 TYR B 194 AA1 2 PHE A 199 ? ASP A 209 ? PHE B 199 ASP B 209 AA1 3 SER A 214 ? SER A 224 ? SER B 214 SER B 224 AA1 4 LEU A 229 ? ARG A 240 ? LEU B 229 ARG B 240 AA1 5 GLU A 243 ? THR A 255 ? GLU B 243 THR B 255 AA1 6 TRP A 259 ? GLY A 266 ? TRP B 259 GLY B 266 AA1 7 GLY A 269 ? SER A 279 ? GLY B 269 SER B 279 AA1 8 LEU A 282 ? SER A 291 ? LEU B 282 SER B 291 AA1 9 ASP A 296 ? LEU A 307 ? ASP B 296 LEU B 307 AA1 10 LEU A 312 ? ASP A 319 ? LEU B 312 ASP B 319 AA1 11 ILE A 323 ? LEU A 332 ? ILE B 323 LEU B 332 AA1 12 LEU A 337 ? ASN A 346 ? LEU B 337 ASN B 346 AA1 13 LYS A 351 ? THR A 359 ? LYS B 351 THR B 359 AA1 14 GLY A 100 ? SER A 110 ? GLY B 100 SER B 110 AA1 15 PHE A 113 ? LEU A 121 ? PHE B 113 LEU B 121 AA1 16 ASN A 128 ? VAL A 136 ? ASN B 128 VAL B 136 AA1 17 VAL A 149 ? ASP A 155 ? VAL B 149 ASP B 155 AA1 18 LEU A 160 ? HIS A 166 ? LEU B 160 HIS B 166 AA1 19 SER A 174 ? GLN A 181 ? SER B 174 GLN B 181 AA1 20 LYS A 184 ? VAL A 190 ? LYS B 184 VAL B 190 AA1 21 PHE A 199 ? ASP A 209 ? PHE B 199 ASP B 209 AA2 1 GLN A 140 ? SER A 142 ? GLN B 140 SER B 142 AA2 2 GLU A 145 ? ALA A 146 ? GLU B 145 ALA B 146 AA3 1 GLY G 100 ? SER G 110 ? GLY I 100 SER I 110 AA3 2 PHE G 113 ? LEU G 121 ? PHE I 113 LEU I 121 AA3 3 ASN G 128 ? VAL G 136 ? ASN I 128 VAL I 136 AA3 4 VAL G 149 ? ASP G 155 ? VAL I 149 ASP I 155 AA3 5 LEU G 160 ? HIS G 166 ? LEU I 160 HIS I 166 AA3 6 LEU G 172 ? GLN G 181 ? LEU I 172 GLN I 181 AA3 7 LYS G 184 ? TYR G 194 ? LYS I 184 TYR I 194 AA3 8 PHE G 199 ? ASP G 209 ? PHE I 199 ASP I 209 AA3 9 SER G 214 ? THR G 226 ? SER I 214 THR I 226 AA3 10 LEU G 229 ? ARG G 239 ? LEU I 229 ARG I 239 AA3 11 GLU G 244 ? THR G 255 ? GLU I 244 THR I 255 AA3 12 TRP G 259 ? GLY G 266 ? TRP I 259 GLY I 266 AA3 13 GLY G 269 ? LYS G 277 ? GLY I 269 LYS I 277 AA3 14 LEU G 282 ? SER G 291 ? LEU I 282 SER I 291 AA3 15 ASP G 296 ? LEU G 307 ? ASP I 296 LEU I 307 AA3 16 LEU G 312 ? ASP G 319 ? LEU I 312 ASP I 319 AA3 17 ILE G 323 ? LEU G 332 ? ILE I 323 LEU I 332 AA3 18 LEU G 337 ? ASN G 346 ? LEU I 337 ASN I 346 AA3 19 LYS G 351 ? THR G 359 ? LYS I 351 THR I 359 AA3 20 GLY G 100 ? SER G 110 ? GLY I 100 SER I 110 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N TYR A 194 ? 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