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L N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP POLS_GETV Q5Y388 ? 1 ;YEHTATIPNVVGFPYKAHIERNGFSPMTLQLEVLGTSLEPTLNLEYITCEYKTVVPSPYIKCCGTSECRSMERPDYQCQV YTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQLSEAYVDRSDVCKHDHAAAYKAHTAAMKATIRISYGNLNQTTTAFVNGEHTVTVGGSR FTFGPISTAWTPFDNKIVVYKNDVYNQDFPPYGSGQPGRFGDIQSRTVESKDLYANTALKLSRPSSGTVHVPYTQTPSGF KYWIKERGTSLNDKAPFGCVIKTNPVRAENCAVGNIPVSMDIPDTAFTRVIDAPAVTNLECQVAVCTHSSDFGGIATLTF KTDKPGKCAVHSHSNVATIQEAAVDIKTDGKITLHFSTASASPAFKVSVCSAKTTCMAACEPPKDHIVPYGASHNNQVFP DMSGTAMTWVQRVAGGLGGLTLAAVAVLILVTCVTMRR ; 816 2 UNP POLS_GETV Q5Y388 ? 2 ;SVTKHFNVYKATKPYLAYCADCGDGQFCYSPVAIEKIRDEASDGMIKIQVAAQIGINKGGTHEHNKIRYIAGHDMKEANR DSLQVHTSGVCAIRGTMGHFIVAYCPPGDELKVQFQDAESHTQACKVQYKHAPAPVGREKFTVRPHFGIEVPCTTYQLTT APTEEEIDMHTPPDIPDITLLSQQSGNVKITAGGKTIRYNCTCGSGNVGTTSSDKTINSCKIAQCHAAVTNHDKWQYTSS FVPRADQLSRKGKVHVPFPLTNSTCRVPVARAPGVTYGKRELTVKLHPDHPTLLTYRSLGADPRPYEEWIDRYVERTIPV TEDGIEYRWGNNPPVRLWAQLTTEGKPHGWPHEIILYYYGLYPAATIAAVSAAGLAVVLSLLASCYMFATARRKCLTPYA LTPGAVVPVTLGVLCCAPRAHA ; 333 3 UNP POLS_GETV Q5Y388 ? 3 ;MNYIPTQTFYGRRWRPRPAYRPWRVPMQPAPPMVIPELQTPIVQAQQMQQLISAVSALTTKQNGKAPKKPKKKPQKAKAK KNEQQKKNENKKPPPKQKNPAKKKKPGKRERMCMKIENDCIFEVKLDGKVTGYACLVGDKVMKPAHVKGVIDNPDLAKLT YKKSSKYDLECAQIPVHMKSDASKYTHEKPEGHYNWHHGAVQYSGGRFTIPTGAGKPGDSGRPIFDNKGRVVAIVLGGAN EGARTALSVVTWTKDMVTRYTPEGTEEW ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7VGA A 1 ? 438 ? Q5Y388 816 ? 1253 ? 1 438 2 2 7VGA B 1 ? 422 ? Q5Y388 333 ? 754 ? 1 422 3 3 7VGA C 1 ? 268 ? Q5Y388 1 ? 268 ? 1 268 4 1 7VGA D 1 ? 438 ? Q5Y388 816 ? 1253 ? 1 438 5 2 7VGA E 1 ? 422 ? Q5Y388 333 ? 754 ? 1 422 6 3 7VGA F 1 ? 268 ? Q5Y388 1 ? 268 ? 1 268 7 1 7VGA G 1 ? 438 ? Q5Y388 816 ? 1253 ? 1 438 8 2 7VGA H 1 ? 422 ? Q5Y388 333 ? 754 ? 1 422 9 3 7VGA I 1 ? 268 ? Q5Y388 1 ? 268 ? 1 268 10 1 7VGA J 1 ? 438 ? Q5Y388 816 ? 1253 ? 1 438 11 2 7VGA K 1 ? 422 ? Q5Y388 333 ? 754 ? 1 422 12 3 7VGA L 1 ? 268 ? Q5Y388 1 ? 268 ? 1 268 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7VGA SER A 239 ? UNP Q5Y388 GLY 1054 conflict 239 1 2 7VGA GLU B 4 ? UNP Q5Y388 LYS 336 variant 4 2 2 7VGA GLU B 323 ? UNP Q5Y388 ASP 655 variant 323 3 4 7VGA SER D 239 ? UNP Q5Y388 GLY 1054 conflict 239 4 5 7VGA GLU E 4 ? UNP Q5Y388 LYS 336 variant 4 5 5 7VGA GLU E 323 ? UNP Q5Y388 ASP 655 variant 323 6 7 7VGA SER G 239 ? UNP Q5Y388 GLY 1054 conflict 239 7 8 7VGA GLU H 4 ? UNP Q5Y388 LYS 336 variant 4 8 8 7VGA GLU H 323 ? UNP Q5Y388 ASP 655 variant 323 9 10 7VGA SER J 239 ? UNP Q5Y388 GLY 1054 conflict 239 10 11 7VGA GLU K 4 ? UNP Q5Y388 LYS 336 variant 4 11 11 7VGA GLU K 323 ? UNP Q5Y388 ASP 655 variant 323 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 720-meric 720 2 'icosahedral asymmetric unit' ? dodecameric 12 3 'icosahedral pentamer' ? 60-meric 60 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 72-meric 72 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? dodecameric 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? -0.52573116 0.00000000 -0.85065078 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 -0.85065078 0.00000000 0.52573116 0.00000 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.67082037 -0.16245990 -0.72360681 0.00000 0.68819099 0.50000000 0.52573107 0.00000 0.27639319 -0.85065080 0.44721362 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? 0.13819654 0.42532536 -0.89442722 0.00000 0.95105652 -0.30901699 -0.00000005 0.00000 -0.27639323 -0.85065083 -0.44721353 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? 0.13819654 0.95105652 -0.27639323 0.00000 0.42532536 -0.30901699 -0.85065083 0.00000 -0.89442722 -0.00000005 -0.44721353 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.67082037 0.68819099 0.27639319 0.00000 -0.16245990 0.50000000 -0.85065080 0.00000 -0.72360681 0.52573107 0.44721362 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? 0.44721350 0.00000000 -0.89442724 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 -0.89442724 0.00000000 -0.44721350 0.00000 7 'point symmetry operation' ? ? 0.05278632 0.68819099 -0.72360678 0.00000 -0.68819099 -0.50000000 -0.52573107 0.00000 -0.72360678 0.52573107 0.44721368 0.00000 8 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.95105652 0.00000004 0.00000 -0.95105652 0.30901699 0.00000005 0.00000 0.00000004 -0.00000005 1.00000000 0.00000 9 'point symmetry operation' ? ? 0.86180343 0.42532536 0.27639318 0.00000 -0.42532536 0.30901699 0.85065083 0.00000 0.27639318 -0.85065083 0.44721356 0.00000 10 'point symmetry operation' ? ? 0.94721356 -0.16245990 -0.27639328 0.00000 0.16245990 -0.50000000 0.85065080 0.00000 -0.27639328 -0.85065080 -0.44721356 0.00000 11 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 12 'point symmetry operation' ? ? -0.67082037 0.16245990 0.72360681 0.00000 0.68819099 0.50000000 0.52573107 0.00000 -0.27639319 0.85065080 -0.44721362 0.00000 13 'point symmetry operation' ? ? -0.13819654 -0.42532536 0.89442722 0.00000 0.95105652 -0.30901699 -0.00000005 0.00000 0.27639323 0.85065083 0.44721353 0.00000 14 'point symmetry operation' ? ? -0.13819654 -0.95105652 0.27639323 0.00000 0.42532536 -0.30901699 -0.85065083 0.00000 0.89442722 0.00000005 0.44721353 0.00000 15 'point symmetry operation' ? ? -0.67082037 -0.68819099 -0.27639319 0.00000 -0.16245990 0.50000000 -0.85065080 0.00000 0.72360681 -0.52573107 -0.44721362 0.00000 16 'point symmetry operation' ? ? -0.44721350 0.00000000 0.89442724 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.89442724 0.00000000 0.44721350 0.00000 17 'point symmetry operation' ? ? -0.05278632 -0.68819099 0.72360678 0.00000 -0.68819099 -0.50000000 -0.52573107 0.00000 0.72360678 -0.52573107 -0.44721368 0.00000 18 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.95105652 -0.00000004 0.00000 -0.95105652 0.30901699 0.00000005 0.00000 -0.00000004 0.00000005 -1.00000000 0.00000 19 'point symmetry operation' ? ? -0.86180343 -0.42532536 -0.27639318 0.00000 -0.42532536 0.30901699 0.85065083 0.00000 -0.27639318 0.85065083 -0.44721356 0.00000 20 'point symmetry operation' ? ? -0.94721356 0.16245990 0.27639328 0.00000 0.16245990 -0.50000000 0.85065080 0.00000 0.27639328 0.85065080 0.44721356 0.00000 21 'point symmetry operation' ? 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N ILE L 210 O THR L 245 ? O THR L 245 AB6 4 5 O ALA L 246 ? O ALA L 246 N ALA L 239 ? N ALA L 239 AB7 1 2 N VAL L 249 ? N VAL L 249 O TYR L 260 ? O TYR L 260 # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 O _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 C _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 GLU _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 241 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 CB _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 F _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 SER _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 180 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 2.17 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CB C ASP 255 ? ? 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