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_refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0036 ? 27730 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4990 ? 38116 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0398 ? 4374 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0039 ? 4430 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.0669 ? 4742 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 7W0A _struct.title 'dmDicer2-LoqsPD-dsRNA Dimer status' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7W0A _struct_keywords.text 'Ribonuclease, RNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 1 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A1ZAW0_DROME A1ZAW0 ? 1 ;MEDVEIKPRGYQLRLVDHLTKSNGIVYLPTGSGKTFVAILVLKRFSQDFDKPIESGGKRALFMCNTVELARQQAMAVRRC TNFKVGFYVGEQGVDDWTRGMWSDEIKKNQVLVGTAQVFLDMVTQTYVALSSLSVVIIDECHHGTGHHPFREFMRLFTIA NQTKLPRVVGLTGVLIKGNEITNVATKLKELEITYRGNIITVSDTKEMENVMLYATKPTEVMVSFPHQEQVLTVTRLISA EIEKFYVSLDLMNIGVQPIRRSKSLQCLRDPSKKSFVKQLFNDFLYQMKEYGIYAASIAIISLIVEFDIKRRQAETLSVK LMHRTALTLCEKIRHLLVQKLQDMTYDDDDDNVNTEEVIMNFSTPKVQRFLMSLKVSFADKDPKDICCLVFVERRYTCKC IYGLLLNYIQSTPELRNVLTPQFMVGRNNISPDFESVLERKWQKSAIQQFRDGNANLMICSSVLEEGIDVQACNHVFILD PVKTFNMYVQSKGRARTTEAKFVLFTADKEREKTIQQIYQYRKAHNDIAEYLKDRVLEKTEPELYEIKGHFQDDIDPFTN ENGAVLLPNNALAILHRYCQTIPTDAFGFVIPWFHVLQEDERDRIFGVSAKGKHVISINMPVNCMLRDTIYSDPMDNVKT AKISAAFKACKVLYSLGELNERFVPKTLKERVASIADVHFEHWNKYGDSVTATVNKADKSKDRTYKTECPLEFYDALPRV GEICYAYEIFLEPQFESCEYTEHMYLNLQTPRNYAILLRNKLPRLAEMPLFSNQGKLHVRVANAPLEVIIQNSEQLELLH QFHGMVFRDILKIWHPFFVLDRRSKENSYLVVPLILGAGEQKCFDWELMTNFRRLPQSHGSNVQQREQQPAPRPEDFEGK IVTQWYANYDKPMLVTKVHRELTPLSYMEKNQQDKTYYEFTMSKYGNRIGDVVHKDKFMIEVRDLTEQLTFYVHNRGKFN AKSKAKMKVILIPELCFNFNFPGDLWLKLIFLPSILNRMYFLLHAEALRKRFNTYLNLHLLPFNGTDYMPRPLEIDYSLK RNVDPLGNVIPTEDIEEPKSLLEPMPTKSIEASVANLEITEFENPWQKYMEPVDLSRNLLSTYPVELDYYYHFSVGNVCE MNEMDFEDKEYWAKNQFHMPTGNIYGNRTPAKTNANVPALMPSKPTVRGKVKPLLILQKTVSKEHITPAEQGEFLAAITA SSAADVFDMERLEILGDSFLKLSATLYLASKYSDWNEGTLTEVKSKLVSNRNLLFCLIDADIPKTLNTIQFTPRYTWLPP GISLPHNVLALWRENPEFAKIIGPHNLRDLALGDEESLVKGNCSDINYNRFVEGCRANGQSFYAGADFSSEVNFCVGLVT IPNKVIADTLEALLGVIVKNYGLQHAFKMLEYFKICRADIDKPLTQLLNLELGGKKMRANVNTTEIDGFLINHYYLEKNL GYTFKDRRYLLQALTHPSYPTNRITGSYQELEFIGDAILDFLISAYIFENNTKMNPGALTDLRSALVNNTTLACICVRHR LHFFILAENAKLSEIISKFVNFQESQGHRVTNYVRILLEEADVQPTPLDLDDELDMTELPHANKCISQEAEKGVPPKGEF NMSTNVDVPKALGDVLEALIAAVYLDCRDLQRTWEVIFNLFEPELQEFTRKVPINHIRQLVEHKHAKPVFSSPIVEGETV MVSCQFTCMEKTIKVYGFGSNKDQAKLSAAKHALQQLSKCDA ; 1 2 UNP M9MRT5_DROME M9MRT5 ? 2 ;MDQENFHGSSLPQQLQNLHIQPQQASPNPVQTGFAPRRHYNNLVGLGNGNAVSGSPVKGAPLGQRHVKLKKEKISAQVAQ LSQPGQLQLSDVGDPALAGGSGLQGGVGLMGVILPSDEALKFVSETDANGLAMKTPVSILQELLSRRGITPGYELVQIEG AIHEPTFRFRVSFKDKDTPFTAMGAGRSKKEAKHAAARALIDKLIGAQLPESPSSSAGPSVTGLTVAGSGGDGNANATGG GDASDKTVGNPIGWLQEMCMQRRWPPPSYETETEVGLPHERLFTIACSILNYREMGKGKSKKIAKRLAAHRMWMRLQETP IDSGKISDSICGELEGEVSIIQDIDRYEQVSKDFEFIKI ; 1 3 PDB 7W0A 7W0A ? 3 ? 1 4 PDB 7W0A 7W0A ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7W0A A 1 ? 1722 ? A1ZAW0 1 ? 1722 ? 1 1722 2 2 7W0A B 1 ? 359 ? M9MRT5 1 ? 359 ? 1 359 3 3 7W0A C 1 ? 31 ? 7W0A 0 ? 30 ? 0 30 4 4 7W0A D 1 ? 32 ? 7W0A 21 ? 52 ? 21 52 5 2 7W0A F 1 ? 359 ? M9MRT5 1 ? 359 ? 1 359 6 3 7W0A G 1 ? 31 ? 7W0A 0 ? 30 ? 0 30 7 4 7W0A H 1 ? 32 ? 7W0A 21 ? 52 ? 21 52 8 1 7W0A E 1 ? 1722 ? A1ZAW0 1 ? 1722 ? 1 1722 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7W0A ASN A 1217 ? UNP A1ZAW0 ASP 1217 'engineered mutation' 1217 1 1 7W0A ASN A 1476 ? UNP A1ZAW0 ASP 1476 'engineered mutation' 1476 2 8 7W0A ASN E 1217 ? UNP A1ZAW0 ASP 1217 'engineered mutation' 1217 3 8 7W0A ASN E 1476 ? UNP A1ZAW0 ASP 1476 'engineered mutation' 1476 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 9 ? 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ASN A 570 GLN A 580 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 GLN A 598 ? GLY A 607 ? GLN A 598 GLY A 607 1 ? 10 HELX_P HELX_P31 AD4 VAL A 608 ? LYS A 611 ? VAL A 608 LYS A 611 5 ? 4 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN A 637 ? LEU A 656 ? ASN A 637 LEU A 656 1 ? 20 HELX_P HELX_P33 AD6 THR A 667 ? PHE A 680 ? THR A 667 PHE A 680 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 GLU A 681 ? GLY A 687 ? GLU A 681 GLY A 687 5 ? 7 HELX_P HELX_P35 AD8 THR A 693 ? ALA A 697 ? THR A 693 ALA A 697 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 THR A 741 ? GLN A 749 ? THR A 741 GLN A 749 1 ? 9 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN A 792 ? ILE A 810 ? ASN A 792 ILE A 810 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP A 845 ? PHE A 852 ? ASP A 845 PHE A 852 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN A 862 ? GLN A 869 ? ASN A 862 GLN A 869 1 ? 8 HELX_P HELX_P40 AE4 ARG A 873 ? GLU A 878 ? ARG A 873 GLU A 878 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 THR A 916 ? GLY A 930 ? THR A 916 GLY A 930 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 AE6 ASN A 960 ? MET A 967 ? ASN A 960 MET A 967 1 ? 8 HELX_P HELX_P43 AE7 ILE A 972 ? CYS A 976 ? 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N N 156 CYS OXT HXT sing N N 157 G OP3 P sing N N 158 G OP3 HOP3 sing N N 159 G P OP1 doub N N 160 G P OP2 sing N N 161 G P "O5'" sing N N 162 G OP2 HOP2 sing N N 163 G "O5'" "C5'" sing N N 164 G "C5'" "C4'" sing N N 165 G "C5'" "H5'" sing N N 166 G "C5'" "H5''" sing N N 167 G "C4'" "O4'" sing N N 168 G "C4'" "C3'" sing N N 169 G "C4'" "H4'" sing N N 170 G "O4'" "C1'" sing N N 171 G "C3'" "O3'" sing N N 172 G "C3'" "C2'" sing N N 173 G "C3'" "H3'" sing N N 174 G "O3'" "HO3'" sing N N 175 G "C2'" "O2'" sing N N 176 G "C2'" "C1'" sing N N 177 G "C2'" "H2'" sing N N 178 G "O2'" "HO2'" sing N N 179 G "C1'" N9 sing N N 180 G "C1'" "H1'" sing N N 181 G N9 C8 sing Y N 182 G N9 C4 sing Y N 183 G C8 N7 doub Y N 184 G C8 H8 sing N N 185 G N7 C5 sing Y N 186 G C5 C6 sing N N 187 G C5 C4 doub Y N 188 G C6 O6 doub N N 189 G C6 N1 sing N N 190 G N1 C2 sing N N 191 G N1 H1 sing N N 192 G C2 N2 sing N N 193 G C2 N3 doub N N 194 G N2 H21 sing N N 195 G N2 H22 sing N N 196 G N3 C4 sing N N 197 GLN N CA 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N N 241 GLY C OXT sing N N 242 GLY OXT HXT sing N N 243 HIS N CA sing N N 244 HIS N H sing N N 245 HIS N H2 sing N N 246 HIS CA C sing N N 247 HIS CA CB sing N N 248 HIS CA HA sing N N 249 HIS C O doub N N 250 HIS C OXT sing N N 251 HIS CB CG sing N N 252 HIS CB HB2 sing N N 253 HIS CB HB3 sing N N 254 HIS CG ND1 sing Y N 255 HIS CG CD2 doub Y N 256 HIS ND1 CE1 doub Y N 257 HIS ND1 HD1 sing N N 258 HIS CD2 NE2 sing Y N 259 HIS CD2 HD2 sing N N 260 HIS CE1 NE2 sing Y N 261 HIS CE1 HE1 sing N N 262 HIS NE2 HE2 sing N N 263 HIS OXT HXT sing N N 264 ILE N CA sing N N 265 ILE N H sing N N 266 ILE N H2 sing N N 267 ILE CA C sing N N 268 ILE CA CB sing N N 269 ILE CA HA sing N N 270 ILE C O doub N N 271 ILE C OXT sing N N 272 ILE CB CG1 sing N N 273 ILE CB CG2 sing N N 274 ILE CB HB sing N N 275 ILE CG1 CD1 sing N N 276 ILE CG1 HG12 sing N N 277 ILE CG1 HG13 sing N N 278 ILE CG2 HG21 sing N N 279 ILE CG2 HG22 sing N N 280 ILE CG2 HG23 sing N N 281 ILE CD1 HD11 sing N N 282 ILE CD1 HD12 sing N N 283 ILE CD1 HD13 sing N N 284 ILE OXT HXT sing N N 285 LEU N CA sing N N 286 LEU N H sing N N 287 LEU N H2 sing N N 288 LEU CA C sing N N 289 LEU CA CB sing N N 290 LEU CA HA sing N N 291 LEU C O doub N N 292 LEU C OXT sing N N 293 LEU CB CG sing N N 294 LEU CB HB2 sing N N 295 LEU CB HB3 sing N N 296 LEU CG CD1 sing N N 297 LEU CG CD2 sing N N 298 LEU CG HG sing N N 299 LEU CD1 HD11 sing N N 300 LEU CD1 HD12 sing N N 301 LEU CD1 HD13 sing N N 302 LEU CD2 HD21 sing N N 303 LEU CD2 HD22 sing N N 304 LEU CD2 HD23 sing N N 305 LEU OXT HXT sing N N 306 LYS N CA sing N N 307 LYS N H sing N N 308 LYS N H2 sing N N 309 LYS CA C sing N N 310 LYS CA CB sing N N 311 LYS CA HA sing N N 312 LYS C O doub N N 313 LYS C OXT sing N N 314 LYS CB CG sing N N 315 LYS CB HB2 sing N N 316 LYS CB HB3 sing N N 317 LYS CG CD sing N N 318 LYS CG HG2 sing N N 319 LYS CG HG3 sing N N 320 LYS CD CE sing N N 321 LYS CD HD2 sing N N 322 LYS CD HD3 sing N N 323 LYS CE NZ sing N N 324 LYS CE HE2 sing N N 325 LYS CE 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