data_7W1Y # _entry.id 7W1Y # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.365 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7W1Y pdb_00007w1y 10.2210/pdb7w1y/pdb WWPDB D_1300025779 ? ? EMDB EMD-32258 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Human MCM double hexamer bound to DNA' _pdbx_database_related.db_id EMD-32258 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7W1Y _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-11-21 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Li, J.' 1 ? 'Dong, J.' 2 ? 'Dang, S.' 3 ? 'Zhai, Y.' 4 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 186 _citation.language ? _citation.page_first 98 _citation.page_last 111.e21 _citation.title 'The human pre-replication complex is an open complex.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2022.12.008 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36608662 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Li, J.' 1 ? primary 'Dong, J.' 2 ? primary 'Wang, W.' 3 ? primary 'Yu, D.' 4 ? primary 'Fan, X.' 5 ? primary 'Hui, Y.C.' 6 ? primary 'Lee, C.S.K.' 7 ? primary 'Lam, W.H.' 8 ? primary 'Alary, N.' 9 ? primary 'Yang, Y.' 10 ? primary 'Zhang, Y.' 11 ? primary 'Zhao, Q.' 12 ? primary 'Chen, C.L.' 13 ? primary 'Tye, B.K.' 14 ? primary 'Dang, S.' 15 ? primary 'Zhai, Y.' 16 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'DNA replication licensing factor MCM2' 102034.102 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Isoform 2 of DNA replication licensing factor MCM3' 96043.320 2 3.6.4.12 ? ? ? 3 polymer man 'DNA replication licensing factor MCM4' 96684.852 2 3.6.4.12 ? ? ? 4 polymer man 'DNA replication licensing factor MCM5' 82406.633 2 3.6.4.12 ? ? ? 5 polymer man 'DNA replication licensing factor MCM6' 93010.273 2 3.6.4.12 ? ? ? 6 polymer man 'DNA replication licensing factor MCM7' 81411.875 2 3.6.4.12 ? ? ? 7 polymer nat 'DNA (49-MER)' 15302.170 1 ? ? ? ;Since the register of origin DNA engaged with endogenous hMCM-DHs is heterogenous, it is likely that there is a mix of purines and pyrimidines at each nucleotide position. For this reason we could not build the origin DNA sequence with certainty. Instead, two superposed polyA:polyT and polyT:polyA duplexes, in which all atoms is set at 50 % occupancy, were modelled to surrogate for the heterogenous sequences. ; 8 polymer nat 'DNA (49-MER)' 14860.490 1 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 10 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 12 ? ? ? ? 11 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 8 ? ? ? ? 12 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 4 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Minichromosome maintenance protein 2 homolog,Nuclear protein BM28' 2 'DNA polymerase alpha holoenzyme-associated protein P1,P1-MCM3,RLF subunit beta,p102' 3 'CDC21 homolog,P1-CDC21' 4 'CDC46 homolog,P1-CDC46' 5 p105MCM 6 'CDC47 homolog,P1.1-MCM3' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTEGPLEEEEDGEELIGDGMERD YRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQRDREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATED GEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR EHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLP QLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLA DLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFAS IAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYV QRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPS LTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVL KKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLE SFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAF YDSELFRMNKFSHDLKRKMILQQF ; ;MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTEGPLEEEEDGEELIGDGMERD YRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQRDREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATED GEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR EHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLP QLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLA DLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFAS IAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYV QRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPS LTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVL KKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLE SFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAF YDSELFRMNKFSHDLKRKMILQQF ; 2,A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MLPRSPPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLDDEEDQGIYQSK VRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRT LTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKD HQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQMSKDAQPS FSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLL RYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAK AGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDG DAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYS RLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETE DEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQETKESQKVELSESRLKAFKVALLDVF REAHAQSIGMNRLTESINRDSEEPFSSVEIQAALSKMQDDNQVMVSEGIIFLI ; ;MLPRSPPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLDDEEDQGIYQSK VRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRT LTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKD HQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQMSKDAQPS FSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLL RYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAK AGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDG DAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYS RLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETE DEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQETKESQKVELSESRLKAFKVALLDVF REAHAQSIGMNRLTESINRDSEEPFSSVEIQAALSKMQDDNQVMVSEGIIFLI ; 3,B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSSPASTPSRRGSRRGRATPAQTPRSEDARSSPSQRRRGEDSTSTGELQPMPTSPGVDLQSPAAQDVLFSSPPQMHSSAI PLDFDVSSPLTYGTPSSRVEGTPRSGVRGTPVRQRPDLGSAQKGLQVDLQSDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVA 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VNEIFFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRG RIAEPSVCGRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIR VNPRVSNVKSVYKTHIDVIHYRKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGI LLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQT GALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTL LSRFDLIFLLLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKI GSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSRKRKEE LAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRLL ; 4,C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASF DEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASA VRAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGE MPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEE EFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPI GVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNS RCSVLAAANSVFGRWDETKGEDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLK KFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEA LRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGE IQHRMQRKVLYRLK ; ;MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASF DEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASA VRAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGE MPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEE EFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPI GVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNS RCSVLAAANSVFGRWDETKGEDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLK KFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEA LRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGE IQHRMQRKVLYRLK ; 5,D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQ EEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLD CQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQ TAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPST AKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIE ESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEV QPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRLTHYDHVLIELTQAGLKGSTE GSESYEEDPYLVVNPNYLLED ; ;MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQ EEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLD CQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQ TAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPST AKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIE ESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEV QPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRLTHYDHVLIELTQAGLKGSTE GSESYEEDPYLVVNPNYLLED ; 6,E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MALKDYALEKEKVKKFLQEFYQDDELGKKQFKYGNQLVRLAHREQVALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAKLFADA VQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRVIREVRADSVGKL VTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEH SDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT REELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPR SQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNA RCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMR RYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS KDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV ; ;MALKDYALEKEKVKKFLQEFYQDDELGKKQFKYGNQLVRLAHREQVALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAKLFADA VQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRVIREVRADSVGKL VTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEH 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(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) ; TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT S ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 GLU n 1 4 SER n 1 5 SER n 1 6 GLU n 1 7 SER n 1 8 PHE n 1 9 THR n 1 10 MET n 1 11 ALA n 1 12 SER n 1 13 SER n 1 14 PRO n 1 15 ALA n 1 16 GLN n 1 17 ARG n 1 18 ARG n 1 19 ARG n 1 20 GLY n 1 21 ASN n 1 22 ASP n 1 23 PRO n 1 24 LEU n 1 25 THR n 1 26 SER n 1 27 SER n 1 28 PRO n 1 29 GLY n 1 30 ARG n 1 31 SER n 1 32 SER n 1 33 ARG n 1 34 ARG n 1 35 THR n 1 36 ASP n 1 37 ALA n 1 38 LEU n 1 39 THR n 1 40 SER n 1 41 SER n 1 42 PRO n 1 43 GLY n 1 44 ARG n 1 45 ASP n 1 46 LEU n 1 47 PRO n 1 48 PRO n 1 49 PHE n 1 50 GLU n 1 51 ASP n 1 52 GLU n 1 53 SER n 1 54 GLU n 1 55 GLY n 1 56 LEU n 1 57 LEU n 1 58 GLY n 1 59 THR n 1 60 GLU n 1 61 GLY n 1 62 PRO n 1 63 LEU n 1 64 GLU n 1 65 GLU n 1 66 GLU n 1 67 GLU n 1 68 ASP n 1 69 GLY n 1 70 GLU n 1 71 GLU n 1 72 LEU n 1 73 ILE n 1 74 GLY 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5 ;MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQ EEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLD CQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQ TAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPST AKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIE ESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEV QPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRLTHYDHVLIELTQAGLKGSTE GSESYEEDPYLVVNPNYLLED ; 1 6 UNP MCM7_HUMAN P33993 ? 6 ;MALKDYALEKEKVKKFLQEFYQDDELGKKQFKYGNQLVRLAHREQVALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAKLFADA VQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRVIREVRADSVGKL VTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEH SDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT REELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPR SQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNA RCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMR RYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS KDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV ; 1 7 PDB 7W1Y 7W1Y ? 7 ? 1 8 PDB 7W1Y 7W1Y ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7W1Y 2 1 ? 904 ? P49736 1 ? 904 ? 1 904 2 2 7W1Y 3 1 ? 853 ? P25205 1 ? 853 ? -44 808 3 3 7W1Y 4 1 ? 863 ? P33991 1 ? 863 ? 1 863 4 4 7W1Y 5 1 ? 734 ? P33992 1 ? 734 ? 1 734 5 5 7W1Y 6 1 ? 821 ? Q14566 1 ? 821 ? 1 821 6 6 7W1Y 7 1 ? 719 ? P33993 1 ? 719 ? 1 719 7 1 7W1Y A 1 ? 904 ? P49736 1 ? 904 ? 1 904 8 2 7W1Y B 1 ? 853 ? P25205 1 ? 853 ? -44 808 9 3 7W1Y C 1 ? 863 ? P33991 1 ? 863 ? 1 863 10 4 7W1Y D 1 ? 734 ? P33992 1 ? 734 ? 1 734 11 5 7W1Y E 1 ? 821 ? Q14566 1 ? 821 ? 1 821 12 6 7W1Y F 1 ? 719 ? P33993 1 ? 719 ? 1 719 13 7 7W1Y O 1 ? 49 ? 7W1Y 1 ? 49 ? 1 49 14 8 7W1Y S 1 ? 49 ? 7W1Y -49 ? -1 ? -49 -1 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7W1Y _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7W1Y _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.013 ? 67948 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.974 ? 92212 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 27.343 ? 10059 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.060 ? 10431 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 11602 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7W1Y _struct.title 'Human MCM double hexamer bound to natural DNA duplex (polyAT/polyTA)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7W1Y _struct_keywords.text 'replication, CELL CYCLE-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 7 ? N N N 8 ? O N N 9 ? P N N 10 ? Q N N 11 ? R N N 10 ? S N N 11 ? T N N 9 ? U N N 10 ? V N N 11 ? W N N 9 ? X N N 10 ? Y N N 12 ? Z N N 9 ? AA N N 10 ? BA N N 12 ? CA N N 9 ? DA N N 10 ? EA N N 11 ? FA N N 9 ? GA N N 10 ? HA N N 11 ? IA N N 10 ? JA N N 11 ? KA N N 9 ? LA N N 10 ? MA N N 11 ? NA N N 9 ? OA N N 10 ? PA N N 12 ? QA N N 9 ? RA N N 10 ? SA N N 12 ? TA N N 9 ? UA N N 10 ? VA N N 11 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 181 ? MET A 188 ? 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ASP F 311 ALA F 316 1 ? 6 HELX_P HELX_P310 BI4 THR L 320 ? GLU L 329 ? THR F 320 GLU F 329 1 ? 10 HELX_P HELX_P311 BI5 ASP L 331 ? SER L 339 ? ASP F 331 SER F 339 1 ? 9 HELX_P HELX_P312 BI6 HIS L 347 ? GLY L 360 ? HIS F 347 GLY F 360 1 ? 14 HELX_P HELX_P313 BI7 ALA L 386 ? ALA L 398 ? ALA F 386 ALA F 398 1 ? 13 HELX_P HELX_P314 BI8 SER L 410 ? LEU L 414 ? SER F 410 LEU F 414 5 ? 5 HELX_P HELX_P315 BI9 GLY L 432 ? ALA L 437 ? GLY F 432 ALA F 437 1 ? 6 HELX_P HELX_P316 BJ1 GLU L 446 ? MET L 450 ? GLU F 446 MET F 450 5 ? 5 HELX_P HELX_P317 BJ2 ALA L 451 ? GLN L 465 ? ALA F 451 GLN F 465 1 ? 15 HELX_P HELX_P318 BJ3 SER L 500 ? GLN L 506 ? SER F 500 GLN F 506 1 ? 7 HELX_P HELX_P319 BJ4 PRO L 508 ? ARG L 514 ? PRO F 508 ARG F 514 1 ? 7 HELX_P HELX_P320 BJ5 ASP L 526 ? SER L 544 ? ASP F 526 SER F 544 1 ? 19 HELX_P HELX_P321 BJ6 ASP L 555 ? GLU L 568 ? ASP F 555 GLU F 568 1 ? 14 HELX_P HELX_P322 BJ7 PRO L 574 ? SER L 576 ? PRO F 574 SER F 576 5 ? 3 HELX_P HELX_P323 BJ8 LEU L 577 ? SER L 595 ? LEU F 577 SER F 595 1 ? 19 HELX_P HELX_P324 BJ9 SER L 602 ? ARG L 620 ? SER F 602 ARG F 620 1 ? 19 HELX_P HELX_P325 BK1 GLU L 626 ? ASP L 642 ? GLU F 626 ASP F 642 1 ? 17 HELX_P HELX_P326 BK2 SER L 643 ? LEU L 645 ? SER F 643 LEU F 645 5 ? 3 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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MG ? ? ? 1_555 S ATP . O2G ? ? 3 MG 1100 3 ATP 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.855 ? ? metalc11 metalc ? ? C CYS 306 SG ? ? ? 1_555 T ZN . ZN ? ? 4 CYS 306 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc12 metalc ? ? C CYS 309 SG ? ? ? 1_555 T ZN . ZN ? ? 4 CYS 309 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc13 metalc ? ? C CYS 328 SG ? ? ? 1_555 T ZN . ZN ? ? 4 CYS 328 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc14 metalc ? ? C CYS 331 SG ? ? ? 1_555 T ZN . ZN ? ? 4 CYS 331 4 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc15 metalc ? ? C SER 517 OG ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? 4 SER 517 4 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.836 ? ? metalc16 metalc ? ? U MG . MG ? ? ? 1_555 V ATP . O3B ? ? 4 MG 902 4 ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.360 ? ? metalc17 metalc ? ? U MG . MG ? ? ? 1_555 V ATP . O1B ? ? 4 MG 902 4 ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? ? metalc18 metalc ? ? D CYS 172 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 5 CYS 172 5 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? ? metalc19 metalc ? ? D CYS 175 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 5 CYS 175 5 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc20 metalc ? ? D CYS 197 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 5 CYS 197 5 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc21 metalc ? ? D CYS 207 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 5 CYS 207 5 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc22 metalc ? ? D SER 388 OG ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? 5 SER 388 5 MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? metalc23 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 Y ADP . O2B ? ? 5 MG 802 5 ADP 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.891 ? ? metalc24 metalc ? ? E CYS 158 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 6 CYS 158 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc25 metalc ? ? E CYS 161 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 6 CYS 161 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.310 ? ? metalc26 metalc ? ? E CYS 180 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 6 CYS 180 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc27 metalc ? ? E CYS 185 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 6 CYS 185 6 ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? ? metalc28 metalc ? ? E SER 403 OG ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? 6 SER 403 6 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? ? metalc29 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 BA ADP . O2B ? ? 6 MG 902 6 ADP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc30 metalc ? ? F CYS 184 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 184 7 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc31 metalc ? ? F CYS 187 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 187 7 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc32 metalc ? ? F CYS 206 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 206 7 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? ? metalc33 metalc ? ? F CYS 211 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? 7 CYS 211 7 ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? ? metalc34 metalc ? ? F SER 388 OG ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? 7 SER 388 7 MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? ? metalc35 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ATP . O1G ? ? 7 MG 802 7 ATP 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? ? metalc36 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ATP . O1B ? ? 7 MG 802 7 ATP 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.823 ? ? metalc37 metalc ? ? G CYS 329 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 329 A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc38 metalc ? ? G CYS 332 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 332 A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? ? metalc39 metalc ? ? G CYS 352 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 352 A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc40 metalc ? ? G CYS 355 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? A CYS 355 A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc41 metalc ? ? G SER 530 OG ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A SER 530 A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.000 ? ? metalc42 metalc ? ? GA MG . MG ? ? ? 1_555 HA ATP . O1B ? ? A MG 1002 A ATP 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc43 metalc ? ? GA MG . MG ? ? ? 1_555 HA ATP . O2G ? ? A MG 1002 A ATP 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? ? metalc44 metalc ? ? H SER 397 OG ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? B SER 352 B MG 1100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? ? metalc45 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 JA ATP . O2B ? ? B MG 1100 B ATP 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.150 ? ? metalc46 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 JA ATP . O3G ? ? B MG 1100 B ATP 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.864 ? ? metalc47 metalc ? ? I CYS 306 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? C CYS 306 C ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc48 metalc ? ? I CYS 309 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? C CYS 309 C ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc49 metalc ? ? I CYS 328 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? C CYS 328 C ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc50 metalc ? ? I CYS 331 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? C CYS 331 C ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc51 metalc ? ? I SER 517 OG ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? C SER 517 C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.845 ? ? metalc52 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 MA ATP . O3G ? ? C MG 902 C ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? ? metalc53 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 MA ATP . O2B ? ? C MG 902 C ATP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? ? metalc54 metalc ? ? J CYS 172 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? D CYS 172 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc55 metalc ? ? J CYS 175 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? D CYS 175 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.310 ? ? metalc56 metalc ? ? J CYS 197 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? D CYS 197 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc57 metalc ? ? J CYS 207 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? D CYS 207 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? ? metalc58 metalc ? ? J SER 388 OG ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? D SER 388 D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? ? metalc59 metalc ? ? OA MG . MG ? ? ? 1_555 PA ADP . O1B ? ? D MG 802 D ADP 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? ? metalc60 metalc ? ? K CYS 158 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? E CYS 158 E ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc61 metalc ? ? K CYS 161 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? E CYS 161 E ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc62 metalc ? ? K CYS 180 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? E CYS 180 E ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc63 metalc ? ? K CYS 185 SG ? ? ? 1_555 QA ZN . ZN ? ? E CYS 185 E ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc64 metalc ? ? K SER 403 OG ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? 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anti-parallel AA9 10 11 ? anti-parallel AA9 10 12 ? anti-parallel AA9 12 13 ? anti-parallel AA9 13 15 ? parallel AA9 14 15 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC6 5 6 ? parallel AC6 6 7 ? anti-parallel AC6 7 8 ? anti-parallel AC6 8 9 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD6 1 2 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? parallel AD7 5 6 ? anti-parallel AD7 6 7 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? parallel AD9 3 4 ? parallel AD9 4 5 ? parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? parallel AE4 1 2 ? parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? parallel AE5 6 7 ? anti-parallel AE5 7 8 ? anti-parallel AE5 8 9 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? parallel AE6 3 4 ? parallel AE6 4 5 ? parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? parallel AF1 1 5 ? anti-parallel AF1 1 7 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 2 4 ? anti-parallel AF1 2 5 ? anti-parallel AF1 5 6 ? anti-parallel AF1 6 8 ? parallel AF1 7 8 ? anti-parallel AF2 1 2 ? parallel AF2 2 3 ? parallel AF2 3 4 ? parallel AF2 4 5 ? parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF6 1 2 ? parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 3 ? anti-parallel AF8 2 5 ? anti-parallel AF8 2 7 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 3 5 ? anti-parallel AF8 5 6 ? anti-parallel AF8 6 8 ? parallel AF8 7 8 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? parallel AG1 2 3 ? parallel AG1 3 4 ? parallel AG1 4 5 ? parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 2 ? parallel AG7 1 5 ? anti-parallel AG7 1 7 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG7 2 4 ? anti-parallel AG7 2 5 ? anti-parallel AG7 5 6 ? anti-parallel AG7 6 8 ? parallel AG7 7 8 ? anti-parallel AG8 1 2 ? parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AH1 1 2 ? parallel AH1 2 3 ? parallel AH1 3 4 ? parallel AH1 4 5 ? parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH5 1 2 ? parallel AH6 1 2 ? anti-parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH8 1 2 ? parallel AH8 2 3 ? parallel AH8 3 4 ? parallel AH8 4 5 ? parallel AH9 1 2 ? anti-parallel AI1 1 2 ? anti-parallel AI2 1 2 ? parallel AI3 1 2 ? parallel AI4 1 5 ? anti-parallel AI4 1 7 ? anti-parallel AI4 2 3 ? anti-parallel AI4 2 4 ? anti-parallel AI4 2 5 ? anti-parallel AI4 5 6 ? anti-parallel AI4 6 8 ? parallel AI4 7 8 ? anti-parallel AI5 1 2 ? anti-parallel AI6 1 2 ? parallel AI6 2 3 ? parallel AI6 3 4 ? parallel AI6 4 5 ? parallel AI7 1 2 ? anti-parallel AI8 1 2 ? anti-parallel AI9 1 2 ? parallel AJ1 1 2 ? anti-parallel AJ2 1 2 ? parallel AJ3 1 2 ? parallel AJ3 2 3 ? parallel AJ3 3 4 ? parallel AJ3 4 5 ? parallel AJ4 1 2 ? anti-parallel AJ5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 229 ? ASN A 233 ? SER 2 229 ASN 2 233 AA1 2 HIS A 282 ? SER A 286 ? HIS 2 282 SER 2 286 AA2 1 VAL A 335 ? CYS A 340 ? VAL 2 335 CYS 2 340 AA2 2 LEU A 319 ? CYS A 329 ? LEU 2 319 CYS 2 329 AA2 3 PHE A 361 ? GLN A 379 ? PHE 2 361 GLN 2 379 AA2 4 SER A 393 ? LEU A 399 ? SER 2 393 LEU 2 399 AA2 5 VAL A 438 ? LYS A 446 ? VAL 2 438 LYS 2 446 AA2 6 GLU A 411 ? HIS A 419 ? GLU 2 411 HIS 2 419 AA2 7 GLN A 304 ? CYS A 315 ? GLN 2 304 CYS 2 315 AA2 8 PHE A 361 ? GLN A 379 ? PHE 2 361 GLN 2 379 AA3 1 ALA A 543 ? THR A 547 ? ALA 2 543 THR 2 547 AA3 2 VAL A 583 ? ASP A 587 ? VAL 2 583 ASP 2 587 AA3 3 THR A 625 ? ALA A 630 ? THR 2 625 ALA 2 630 AA3 4 VAL A 519 ? GLY A 523 ? VAL 2 519 GLY 2 523 AA3 5 ILE A 659 ? VAL A 663 ? ILE 2 659 VAL 2 663 AA4 1 TYR A 559 ? ARG A 562 ? TYR 2 559 ARG 2 562 AA4 2 TRP A 569 ? GLU A 572 ? TRP 2 569 GLU 2 572 AA5 1 SER A 608 ? SER A 612 ? SER 2 608 SER 2 612 AA5 2 VAL A 617 ? GLN A 621 ? VAL 2 617 GLN 2 621 AA6 1 ILE A 858 ? PRO A 861 ? ILE 2 858 PRO 2 861 AA6 2 MET A 899 ? 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Gautomatch v0.56 'IMAGE ACQUISITION' ? 2 ? ? 1 EPU 2.10.0 MASKING ? 3 ? ? ? ? ? 'CTF CORRECTION' ? 4 1 ? ? Gctf v1.18 'LAYERLINE INDEXING' ? 5 ? ? ? ? ? 'DIFFRACTION INDEXING' ? 6 ? ? ? ? ? 'MODEL FITTING' ? 7 ? 1 ? 'UCSF Chimera' ? 'MODEL FITTING' ? 8 ? 1 ? Coot ? OTHER ? 9 ? ? ? ? ? 'MODEL REFINEMENT' ? 10 ? 1 ? PHENIX ? 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? 11 1 ? ? cryoSPARC v3.0.1 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? 12 1 ? ? cryoSPARC v3.0.1 CLASSIFICATION ? 13 1 ? ? ? ? RECONSTRUCTION ? 14 1 ? ? cryoSPARC v3.0.1 'VOLUME SELECTION' ? 15 1 1 1 ? ? 'SERIES ALIGNMENT' ? 16 1 1 1 ? ? 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? 17 1 1 1 ? ? 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? 18 1 1 1 ? ? 'SYMMETRY DETERMINATION' ? 19 1 1 1 ? ? 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? 20 1 1 1 ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details 'This sample was monodisperse' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7W1Y 'double helix' 7W1Y 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 M DA 1 1_555 N DT 49 1_555 0.773 0.139 -0.111 1.791 -5.989 -19.011 1 O_DA1:DT-1_S O 1 ? 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